Pairwise Alignments

Query, 467 a.a., ATP synthase subunit beta from Vibrio cholerae E7946 ATCC 55056

Subject, 463 a.a., ATP synthase F1, beta subunit (NCBI ptt file) from Shewanella oneidensis MR-1

 Score =  750 bits (1937), Expect = 0.0
 Identities = 380/468 (81%), Positives = 416/468 (88%), Gaps = 9/468 (1%)

Query: 1   MATGKIVQIIGAVVDVEFPQSEVPSVYDALNVVD--SKERLVLEVQQQLGGGVIRAIVMG 58
           M+TG +VQ+IGAVVDVEFPQ  VP VYDAL +    S   LVLEVQQQLGGGV+R I MG
Sbjct: 1   MSTGTVVQVIGAVVDVEFPQDAVPQVYDALKITGEGSCNGLVLEVQQQLGGGVVRTIAMG 60

Query: 59  SSDGLRRGMTVQNTGAPISVPVGTKTLGRIMNVLGDAIDERGDIGAEEVYSIHRPAPSYE 118
           +SDGLRRG+ V N+G+PISVPVGT TLGRIMNVLGD IDE G IG EE Y IHR APSYE
Sbjct: 61  TSDGLRRGLEVVNSGSPISVPVGTATLGRIMNVLGDPIDEAGAIGEEERYVIHRAAPSYE 120

Query: 119 EQSSATELLETGVKVIDLICPFAKGGKIGLFGGAGVGKTVNMMELINNIALQHSGLSVFA 178
           EQS+ TELLETG+KVIDL+CPFAKGGK+GLFGGAGVGKTVNMMELINNIA  HSGLSVFA
Sbjct: 121 EQSNTTELLETGIKVIDLVCPFAKGGKVGLFGGAGVGKTVNMMELINNIAKAHSGLSVFA 180

Query: 179 GVGERTREGNDFYHEMQEAGVVNVEQPELSKVAMVYGQMNEPPGNRLRVALTGLTMAEKF 238
           GVGERTREGNDFY+EM+++GV       L KVAMVYGQMNEPPGNRLRVALTGLTMAEKF
Sbjct: 181 GVGERTREGNDFYYEMKDSGV-------LDKVAMVYGQMNEPPGNRLRVALTGLTMAEKF 233

Query: 239 RDEGRDVLLFIDNIYRYTLAGTEVSALLGRMPSAVGYQPTLAEEMGVLQERITSTKKGSI 298
           RDEGRDVLLF+DNIYRYTLAGTEVSALLGRMPSAVGYQPTLAEEMGVLQERITSTK GSI
Sbjct: 234 RDEGRDVLLFVDNIYRYTLAGTEVSALLGRMPSAVGYQPTLAEEMGVLQERITSTKTGSI 293

Query: 299 TSVQAVYVPADDLTDPSPATTFAHLDATVVLNRNIAAMGLYPAIDPLDSTSRQLDPLVVG 358
           TSVQAVYVPADDLTDPSPATTFAHLDATVVL+R IA++G+YPA+DPLDSTSRQLDPLVVG
Sbjct: 294 TSVQAVYVPADDLTDPSPATTFAHLDATVVLSRQIASLGIYPAVDPLDSTSRQLDPLVVG 353

Query: 359 QEHYDVARGVQATLQRYKELKDIIAILGMDELSEADKQVVARARKIERFLTQPYHVAEVF 418
           QEHYDVA GVQ  LQRYKELKDIIAILGMDELS+ DK  V+RARKIERFL+QP+HVAEVF
Sbjct: 354 QEHYDVANGVQTVLQRYKELKDIIAILGMDELSDDDKMTVSRARKIERFLSQPFHVAEVF 413

Query: 419 TGDPGVYVPLKETLRGFKGLLAGDYDDIPEQAFMYCGTIDDAIENAKK 466
           TG PG YV LK+T+RGFKG+L+G++D IPEQAF   G+ID+A+E A K
Sbjct: 414 TGSPGKYVSLKDTIRGFKGILSGEFDHIPEQAFYMVGSIDEAVEKANK 461