Pairwise Alignments
Query, 533 a.a., hemolysin-like protein from Phaeobacter inhibens DSM 17395
Subject, 610 a.a., VCBS from Synechococcus elongatus PCC 7942
Score = 145 bits (365), Expect = 6e-39
Identities = 143/485 (29%), Positives = 216/485 (44%), Gaps = 68/485 (14%)
Query: 20 DAIT--LVDTLVDTAGETLNGNGGTDSITLNNAGDSLLKFLDTNGVLTYDTTIPGSEHWD 77
D IT L V AG TLN NG + + DSL L V+ D +
Sbjct: 53 DPITFLLAPNQVAPAGFTLNSNGSYSFDQDDTSYDSL--GLGDTQVIAIDYVVK------ 104
Query: 78 LDDDSTSAVS-----TVELNGGINSVTFATGETLTVGTASAGTTALTSAIGGGGNGTADI 132
DS AVS T+ L G ++ T G + + + + S D
Sbjct: 105 ---DSRGAVSQTRTLTINLAGTNDAPTITAGPVVDANSITFTAEDIDS----------DT 151
Query: 133 STARAYEWSGTAVTTNTALNIGANPTDYSLVSVDGIAVGAAN-FSNAD--------GQFN 183
TAR GT +N G+ PT ++ ++D G N F D G
Sbjct: 152 LTARV----GTTNLMPGTVNNGS-PTTSTITALDTALFGELNVFDGTDSVGVGLFVGIGT 206
Query: 184 VNANVVTFTPNTAAIAAQGNVGD---TASFTYDVVVEHNTTGEQSTVSVTYSQEIDYTAG 240
+ A+ +T A+ G GD T + D ++ + G + + + + I+
Sbjct: 207 IGADTLTAIGTNPAVL-YGFEGDDRLTGADQDDTILGGD--GNDTIIEINGNNLIEGNNN 263
Query: 241 NDTFTGTDAVDTENGLAGDDMISGGEGNDSLTGGSGNDTLLGENGNDDLVGDAGVNVLRG 300
ND+ G D NG AG D I GG+G D++ GG GND++ G++GND++ G N + G
Sbjct: 264 NDSIVGGTDSDRINGGAGADTILGGDGADTIDGGLGNDSIFGDSGNDNIRGFGDSNTILG 323
Query: 301 GNGNDELTTSGTDDG-NTLGGGAGSDVIVGNDGDDIIFGGNGDDNVAGSGDATGAAATQN 359
G+GND T GT G N++ GG DVI + GG G+D++ G +A+T N
Sbjct: 324 GSGND--TIEGTIAGSNSIDGGENDDVITEIGFGSTLLGGLGNDSILGF-----SASTIN 376
Query: 360 GLIGGK------GDDIINGGGGDDILRGDL-AGATLTSAGTTTAGDASDDGNDTLRGGDG 412
G G G++ I+GG G+D + + T++ +G T +G +GNDT+ +G
Sbjct: 377 GGDGSDTINVEFGNNTIDGGMGNDSIEIAINPSFTISGSGNTVSG---SNGNDTIIAING 433
Query: 413 NDTLYGDDGNDELRGGAGDDVVNGGAGADMMYVSLGDDIMDGGA-GDDTFILRDDSGETT 471
++ + G++ ND + GG D +NGG GAD + LG D A GD ++G T
Sbjct: 434 SNLIEGNNDNDSIVGGTDSDTINGGTGADTLTGGLGSDTFSFAATGDGIAATSGENGSVT 493
Query: 472 I-NGF 475
NGF
Sbjct: 494 FGNGF 498
Score = 72.4 bits (176), Expect = 5e-17
Identities = 87/381 (22%), Positives = 151/381 (39%), Gaps = 54/381 (14%)
Query: 5 NVATGVNFEFGTTGDDAITLVDTLVDTAGETLNGNGGTDSITLNNAGDSLL------KFL 58
+V G+ GT G D +T + T L G G D +T + D++L +
Sbjct: 195 SVGVGLFVGIGTIGADTLTAIGT----NPAVLYGFEGDDRLTGADQDDTILGGDGNDTII 250
Query: 59 DTNGVLTYDTTIPGSEHWDLDDDSTSAVSTVELNGGINSVTFATGETLTVGTASAGTTAL 118
+ NG + I G+ + +D + +NGG + T G+ G ++
Sbjct: 251 EING----NNLIEGNNN---NDSIVGGTDSDRINGGAGADTILGGDGADTIDGGLGNDSI 303
Query: 119 TSAIGGGGNGTADISTARAYEWSGTAVTTNTALNIGANPTDYSLVSVDGIAVGAANFSNA 178
G GN R + S NT L N T ++G G+ +
Sbjct: 304 ---FGDSGN-----DNIRGFGDS------NTILGGSGNDT------IEGTIAGSNSIDGG 343
Query: 179 DGQFNVNANVVTFTPNTAAIAAQGNVGDTASFTYDVVVEHNTTGEQSTVSVTYSQE-IDY 237
+ N +V+T + + G +G+ + + + G T++V + ID
Sbjct: 344 E-----NDDVITEIGFGSTLL--GGLGNDSILGFSASTINGGDGSD-TINVEFGNNTIDG 395
Query: 238 TAGNDT--------FTGTDAVDTENGLAGDDMISGGEGNDSLTGGSGNDTLLGENGNDDL 289
GND+ FT + + +T +G G+D I G++ + G + ND+++G +D +
Sbjct: 396 GMGNDSIEIAINPSFTISGSGNTVSGSNGNDTIIAINGSNLIEGNNDNDSIVGGTDSDTI 455
Query: 290 VGDAGVNVLRGGNGNDELTTSGTDDGNTLGGGAGSDVIVGNDGDDIIFGGNGDDNVAGSG 349
G G + L GG G+D + + T DG G V GN D I + D + G+
Sbjct: 456 NGGTGADTLTGGLGSDTFSFAATGDGIAATSGENGSVTFGNGFDYITDFESIDSIIVGTD 515
Query: 350 DATGAAATQNGLIGGKGDDII 370
T ++ I G G+ +I
Sbjct: 516 GFTIQSSVGTAFIDGDGNYVI 536
Score = 44.7 bits (104), Expect = 1e-08
Identities = 84/362 (23%), Positives = 141/362 (38%), Gaps = 57/362 (15%)
Query: 26 DTLVDTAG-ETLNGNGGTDSITLNNAGDSLLKFLDTNGVL------TYDTTIPGSEHWD- 77
DT++ G +T++G G DSI ++ D++ F D+N +L T + TI GS D
Sbjct: 283 DTILGGDGADTIDGGLGNDSIFGDSGNDNIRGFGDSNTILGGSGNDTIEGTIAGSNSIDG 342
Query: 78 --LDDDSTSAVSTVELNGGINSVTFATGETLTVGTASAGTT-----ALTSAIGGGGNGTA 130
DD T L GG+ + + T+ T + GG GN +
Sbjct: 343 GENDDVITEIGFGSTLLGGLGNDSILGFSASTINGGDGSDTINVEFGNNTIDGGMGNDSI 402
Query: 131 DISTARAYEWSGTAVTTNTALNIGANPTDYSLVSVDGIAVGAANFSNADGQFNVNANVVT 190
+I+ ++ SG+ T + G+N D ++++++G + N N +++ T
Sbjct: 403 EIAINPSFTISGSGNTVS-----GSNGND-TIIAINGSNLIEGNNDNDSIVGGTDSD--T 454
Query: 191 FTPNTAAIAAQGNVG-DTASFTYDVVVEHNTTGEQSTVSVTYSQEIDYTAGNDTFTGTDA 249
T A G +G DT SF TG+ ++ T + T GN
Sbjct: 455 INGGTGADTLTGGLGSDTFSFA--------ATGDG--IAATSGENGSVTFGN-------- 496
Query: 250 VDTENGLAGDDMISGGEGNDSLTGGSGNDTLLGENGNDDLVGDAGVNVLRGGNGNDELTT 309
G D I+ E DS+ G+ T+ G + GD ++ G +D
Sbjct: 497 --------GFDYITDFESIDSIIVGTDGFTIQSSVGTAFIDGDGNYVIVSVGMISDIFAI 548
Query: 310 SGTDDGNTLGGGAGSDVIVGNDGDDIIFGGNGDDNVAGSGDATGAAATQNGL-IGGKGDD 368
+G T D +G+ +++ + A GD A T L IGG D
Sbjct: 549 AGVLTDTTF---ESRDPGMGDSFTELLLFKASN---AMMGDVITATTTPETLIIGGSALD 602
Query: 369 II 370
++
Sbjct: 603 ML 604