Pairwise Alignments

Query, 216 a.a., flagellin from Methanococcus maripaludis S2

Subject, 216 a.a., flagellin from Methanococcus maripaludis JJ

 Score =  401 bits (1030), Expect = e-117
 Identities = 209/216 (96%), Positives = 214/216 (99%)

Query: 1   MKITEFMKSKKGASGIGTLIVFIAMVLVAAVAASVLINTSGFLQQKASTTGKDSTEQVAS 60
           MKITEFMK+KKGASGIGTLIVFIAMVLVAAVAASVLINTSG+LQQKASTTGKDSTEQVAS
Sbjct: 1   MKITEFMKNKKGASGIGTLIVFIAMVLVAAVAASVLINTSGYLQQKASTTGKDSTEQVAS 60

Query: 61  GLQIMGISGYQAGTANANITKLAIYITPNAGSAAIDMNQVVLTLSDGTTKTVTKYDTTAY 120
           GLQIMGISGYQ G+A ANITKLAIYITPNAGSAAIDMNQVVLTLSDG+TKTVTKYDTTAY
Sbjct: 61  GLQIMGISGYQDGSAGANITKLAIYITPNAGSAAIDMNQVVLTLSDGSTKTVTKYDTTAY 120

Query: 121 TNLTAGGDLYNTTTVNWSKLADTTEFGIVEIQDADLSFTSSAPVINKGDIVAIIVSGVSF 180
           TNLTAGGDLYNTTTVNWSKLADTTEFGIVEIQDADLSFTSSAPVINKGDIVAIIVSGVSF
Sbjct: 121 TNLTAGGDLYNTTTVNWSKLADTTEFGIVEIQDADLSFTSSAPVINKGDIVAIIVSGVSF 180

Query: 181 DTRMEISGTVQPEFGAPGVISFTTPSTFTEKVVSLQ 216
           DTRMEISG+VQPEFGAPGVISFTTPSTFTEKVVSLQ
Sbjct: 181 DTRMEISGSVQPEFGAPGVISFTTPSTFTEKVVSLQ 216