Pairwise Alignments

Query, 1025 a.a., hypothetical protein from Methanococcus maripaludis S2

Subject, 1027 a.a., hypothetical protein from Methanococcus maripaludis JJ

 Score = 1977 bits (5122), Expect = 0.0
 Identities = 1005/1027 (97%), Positives = 1019/1027 (99%), Gaps = 2/1027 (0%)

Query: 1    MYRELSKEELLEKFDEYITSEDIKKRAESTKILGYLGINDIKSRMDNILSLTFENDISIR 60
            MYRELSKEELLEKFDEYITSEDIKKRAESTKILGYLGINDIKSRMDNILSLTFENDISIR
Sbjct: 1    MYRELSKEELLEKFDEYITSEDIKKRAESTKILGYLGINDIKSRMDNILSLTFENDISIR 60

Query: 61   LNLITAFSNILNKFPEVFSELIGCIYYNTEFSNNILSEHAKNEIKALGPEVIERHVEHFR 120
            LNLITAFSNILNKFPEVFSELIGCIYYNTEFSNNILSEHAKNEIKALGPEVIERHVEHFR
Sbjct: 61   LNLITAFSNILNKFPEVFSELIGCIYYNTEFSNNILSEHAKNEIKALGPEVIERHVEHFR 120

Query: 121  NGIYSKNTEERLKSVILLSLISRFSPEYLDKALSEIVMASTYDSSALIQLLALGTLDDFS 180
            NGIYSKNTEERLKSVILLSLISRFSPEYLDKALSEIVMASTYDSSALIQLLALGTLDDFS
Sbjct: 121  NGIYSKNTEERLKSVILLSLISRFSPEYLDKALSEIVMASTYDSSALIQLLALGTLDDFS 180

Query: 181  EINRNFLRYSYLVFNKKMDITPLNKSKTGAEITKSLIRLTVSDEIDGNTINELLKYLSIE 240
            E+NRNFLRYSYLVFNKKMDITPLNKSKTGAEITKSLIRLTVSDEID NTINELLKYLSIE
Sbjct: 181  ELNRNFLRYSYLVFNKKMDITPLNKSKTGAEITKSLIRLTVSDEIDENTINELLKYLSIE 240

Query: 241  NDFCTLLAAISLQNNILKVEKNFEDYPLIFQDQLSKFYKKHPNNVQQLISYSLILDITHS 300
            NDFCTLLAAISLQNNILKVEKNFE+YPLIFQDQLSKFYKKHPNNVQQLISYSLILDITHS
Sbjct: 241  NDFCTLLAAISLQNNILKVEKNFEEYPLIFQDQLSKFYKKHPNNVQQLISYSLILDITHS 300

Query: 301  LNLEIKNVDFEKIFYYLKKNISGKDHISKAFSLIILYLLHKMEKLNLDEEIDEIFDNYPF 360
            LNLEI+NVDFEKIFYYLKKNISGKDHISKAFSLIILYLLHKMEKLNLDEEIDEIFDNYPF
Sbjct: 301  LNLEIENVDFEKIFYYLKKNISGKDHISKAFSLIILYLLHKMEKLNLDEEIDEIFDNYPF 360

Query: 361  ENILKEHPLCYYFGMPLLAEKYNTLPEVDKSPYLIRSLELKMQYMAPTERHHYIKSAEKN 420
            ENILKEHPLCYYFGMPLLAEKYNTLPEVDK+PYLIRSLELKMQYMAPTER HYIKSAEKN
Sbjct: 361  ENILKEHPLCYYFGMPLLAEKYNTLPEVDKNPYLIRSLELKMQYMAPTERQHYIKSAEKN 420

Query: 421  IKSDYWLERYNGAKKIGSALYFDESKEFMDFELVKSIIHDEIYLVRNIGIWILRILVKYN 480
            IKSDYWLERYNGAKKIGSALYFDESKEFM+FELVKSI+HDEIYLVRNIGIWILRILVKYN
Sbjct: 421  IKSDYWLERYNGAKKIGSALYFDESKEFMNFELVKSILHDEIYLVRNIGIWILRILVKYN 480

Query: 481  IKLPERIILEVIHDLNSPYWELRFEYYLLLNELLEKRPELLTEFNTASKIKSILGSHYVN 540
            IKLPERIILEVIHDLNSPYWELRFEYYLLLNELLEKRPELLTEFNTASKIKSILGSHYVN
Sbjct: 481  IKLPERIILEVIHDLNSPYWELRFEYYLLLNELLEKRPELLTEFNTASKIKSILGSHYVN 540

Query: 541  ENYPPFKIAIKSILDKILKNLENTPKKFQDELSGELYSEQLFENPVTSAAFLEKLKINLD 600
            ENYPPFKIAIKSILDKILKNLENTPKKFQ+ELSGELYSEQLFENPVTSAAFLEKLKINLD
Sbjct: 541  ENYPPFKIAIKSILDKILKNLENTPKKFQEELSGELYSEQLFENPVTSAAFLEKLKINLD 600

Query: 601  SYILKNDEKNILKVLTFLKTHESKVDCSYLLEELVKLKDNYPDANYFLNNIKNRYKLIPK 660
            SYILKNDEKNILKVLTFLKTHESKVDCSYLLEELVKLKD Y DANYFLNNIKNRYKLIPK
Sbjct: 601  SYILKNDEKNILKVLTFLKTHESKVDCSYLLEELVKLKDTYQDANYFLNNIKNRYKLIPK 660

Query: 661  PLEIRILNSLNNPIPEYKKDGLEEIITYLNEGFKINNGIGLKIKEILVMYRDEKLTDLCI 720
            PLEIRILNSLNNPIPEYKKDGLEEIITYLNEGFKINNGIGLKIKEILVMYRDEKLTDLCI
Sbjct: 661  PLEIRILNSLNNPIPEYKKDGLEEIITYLNEGFKINNGIGLKIKEILVMYRDEKLTDLCI 720

Query: 721  NILNLQNDIESKRLIFEKREFDTHLNDLKEIKEKSDENIKQMSTEELYVKLSSQLHKTSE 780
            NILNLQ DIESKRLIFEKREFDTHLNDLK+IKEKSDENIK+M+TEELYVKLSSQLHKTSE
Sbjct: 721  NILNLQKDIESKRLIFEKREFDTHLNDLKDIKEKSDENIKKMTTEELYVKLSSQLHKTSE 780

Query: 781  YDYQSINFNDILYFLSDYSKRPSVILTTMILKILKNVITDPNSNILNSPDIDNPKVLENL 840
            YDYQSINFNDILYFLSDYSKRPSVILTTMILKILKNVITDPNSNILNSPDIDNPKVLENL
Sbjct: 781  YDYQSINFNDILYFLSDYSKRPSVILTTMILKILKNVITDPNSNILNSPDIDNPKVLENL 840

Query: 841  YYLIYSTDYEILSKNAIILTVEIVKNKPEWLLRNITNVSKN--KNWPLFLNSLLDYPDNK 898
            YYLIYSTDYEILSKNAIILTVEIVK+KPEWLLRNITNVS+N  KNWPLFLNSLLDYPD+K
Sbjct: 841  YYLIYSTDYEILSKNAIILTVEIVKHKPEWLLRNITNVSENKSKNWPLFLNSLLDYPDDK 900

Query: 899  VLGETINAFNYYAKNSNSFDLSAEFLEKLVNRLDTSNWENFKKIVKVLGNYEMDEKMLNR 958
            VL ETINAFNYYAKNSNSFDLS+EFLEKLVNRLDTSNWENFKKIVKVLGNYEMDEKMLNR
Sbjct: 901  VLEETINAFNYYAKNSNSFDLSSEFLEKLVNRLDTSNWENFKKIVKVLGNYEMDEKMLNR 960

Query: 959  FSKLLLEKIENSNDDSKLILLRFFKIQDISRLNSNLVAQLLNLKNSKNYDIKRDIEEIES 1018
            FSKLLLEKIENSNDDSKLILLRFFKIQDISRLNSNLVAQLLNLKNSKNYDIKRDIEEIES
Sbjct: 961  FSKLLLEKIENSNDDSKLILLRFFKIQDISRLNSNLVAQLLNLKNSKNYDIKRDIEEIES 1020

Query: 1019 MKIKLRG 1025
            MKIKLRG
Sbjct: 1021 MKIKLRG 1027