Pairwise Alignments

Query, 682 a.a., hypothetical protein from Methanococcus maripaludis S2

Subject, 667 a.a., surface protein, anchor region from Methanococcus maripaludis JJ

 Score = 1278 bits (3308), Expect = 0.0
 Identities = 655/685 (95%), Positives = 657/685 (95%), Gaps = 21/685 (3%)

Query: 1   MKKIYTVLLVFALVSCLSIVSADSIPQFPHTFYGDVTINELPATGTLKVLVNGVESEQVQ 60
           MKKIYTVLLVFALVSCLSIVSADSIPQFPHTFYGDVTINELPATGTLKVLVNGVESEQV 
Sbjct: 1   MKKIYTVLLVFALVSCLSIVSADSIPQFPHTFYGDVTINELPATGTLKVLVNGVESEQVP 60

Query: 61  VTDGEFGKGLFDAKLVVNGASGDQITFSFESEGYTLDSDYKIYLIDSEQYVSEIDFVSGG 120
           VTDGEFGKGLFDAKLVVNGASGDQITFSFESEGYTLDSDYKIYLIDSEQYVSEIDFVSGG
Sbjct: 61  VTDGEFGKGLFDAKLVVNGASGDQITFSFESEGYTLDSDYKIYLIDSEQYVSEIDFVSGG 120

Query: 121 YTEILLEFTGTGDGGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTG 180
           YTEILLEFTGTGD                   GDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTG
Sbjct: 121 YTEILLEFTGTGD------------------VGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTG 162

Query: 181 DTGDTGDTGNGEELPLNPGVFYGLVYLDESLASSTLNLYVDGVLQDSIGIENGVFGGEGA 240
           DTGDTGDTGNGE+LPLNPGVFYGLVYLDESLASSTLNLYVDGVLQDSIGIENGVFGGEGA
Sbjct: 163 DTGDTGDTGNGEQLPLNPGVFYGLVYLDESLASSTLNLYVDGVLQDSIGIENGVFGGEGA 222

Query: 241 LDDKLIATGYDGNSNVVTFSLVSGGETYSSFTAELSDATYEDELPYIEGVHYVVLTFSET 300
           LDDKLIATGYDGNSNVVTFSLVSGGETYSSFTAELSDATYEDELPYIEGVHYVVLTFSET
Sbjct: 223 LDDKLIATGYDGNSNVVTFSLVSGGETYSSFTAELSDATYEDELPYIEGVHYVVLTFSET 282

Query: 301 ADTGNGEELPLNPDVFYGLVYLDESLASSTLNLYVDGVLQDSIGIENGVFGGEGALDDKL 360
           ADTGNGEELPLNP VFYG+ YLDESLASSTLNLYVDGVLQDSIGIENGVFGGEGALDDKL
Sbjct: 283 ADTGNGEELPLNPGVFYGMAYLDESLASSTLNLYVDGVLQDSIGIENGVFGGEGALDDKL 342

Query: 361 IATGYDGNSNVVTFSLVSGGETYSSFTAELSDATYEDELPYIEGVHYVVLTFSEIADTGD 420
           IATGYDGNSNVVTFSLVSGGETYSSFTAELSDATYEDELPYIEGVHYVVLTFSE ADTGD
Sbjct: 343 IATGYDGNSNVVTFSLVSGGETYSSFTAELSDATYEDELPYIEGVHYVVLTFSETADTGD 402

Query: 421 TGDSGDTGNINSSEQLPLNPDIFYGMVYLDEALASSTLNLYVDGALQNSIGIENGVFGGE 480
           TGD GDTGNINSSEQLPLNPDIFYGMVYLDEALASSTLNLYVDGALQNSIGIENGVFGGE
Sbjct: 403 TGDGGDTGNINSSEQLPLNPDIFYGMVYLDEALASSTLNLYVDGALQNSIGIENGVFGGE 462

Query: 481 GPLDNKLIATGYDGNSNVVTFSLVSGGETYSSFTAELSDATYEDELPYIEGVHYVVLTFS 540
           GPLDNKLIATGYDGNSNVVTFSLVSGGETYSSFTAELSDATYEDELPYIEGVHYVVLTFS
Sbjct: 463 GPLDNKLIATGYDGNSNVVTFSLVSGGETYSSFTAELSDATYEDELPYIEGVHYVVLTFS 522

Query: 541 ETA---DTGDTGDTSDSGSSSGGGGGGSSRSSSSSSSSIISSSDSSETPVTTSVPKTSSS 597
           ETA   DTGDTGDTSDSGSSSGGGGGGSSRSSSS SSSIISSSDSSETPVTTSVPKTSSS
Sbjct: 523 ETADTGDTGDTGDTSDSGSSSGGGGGGSSRSSSSGSSSIISSSDSSETPVTTSVPKTSSS 582

Query: 598 GTSTDSSSNTVESSENVGPDTTQDSPDDTLDYGSDSNETGVVLQQESPLGGINMYLALAA 657
           GTSTDSSSNTVESSENVGPDTTQDSPDDTLDYGSDSNETGVVLQQESPLGGINMYLALAA
Sbjct: 583 GTSTDSSSNTVESSENVGPDTTQDSPDDTLDYGSDSNETGVVLQQESPLGGINMYLALAA 642

Query: 658 ILLILIALAAAWYQSKEKPEVVPQQ 682
           ILLILIALAAAWYQSKEKPEVVPQQ
Sbjct: 643 ILLILIALAAAWYQSKEKPEVVPQQ 667