Pairwise Alignments

Query, 731 a.a., methyl-accepting chemotaxis protein from Methanococcus maripaludis S2

Subject, 731 a.a., methyl-accepting chemotaxis protein from Methanococcus maripaludis JJ

 Score = 1341 bits (3471), Expect = 0.0
 Identities = 708/731 (96%), Positives = 724/731 (99%)

Query: 1   MKLGTKKIGTKLLIFSIITVIIPIAILGIVSNNTITQDMKEQSADKLESSNEMANTIMDS 60
           MKLGTKKIGTKLLIFSIITVIIPIAILGIVSNNTITQDMKEQSADKLESSNEMANTIMDS
Sbjct: 1   MKLGTKKIGTKLLIFSIITVIIPIAILGIVSNNTITQDMKEQSADKLESSNEMANTIMDS 60

Query: 61  RFTELCTLAEYASYTQGVKTSIKTGNVDDLELRAETLKSASNADLVIFTGNGGSTIASSS 120
           RFTELCTLAEYASYTQGVKTSIKTGNVDDLELRAETLKSASNADLVIFTGNGGSTIASSS
Sbjct: 61  RFTELCTLAEYASYTQGVKTSIKTGNVDDLELRAETLKSASNADLVIFTGNGGSTIASSS 120

Query: 121 GEGITLDSTILKVSKSSEKSGFEKIPEQTALKFSDADVTGTDSALSIVVAYPIYDDAGTL 180
           GEGITLDSTILKVSKSSEKSGFEKIPEQTALKFSDADVTGTDSALSIVVAYPIYDDAGTL
Sbjct: 121 GEGITLDSTILKVSKSSEKSGFEKIPEQTALKFSDADVTGTDSALSIVVAYPIYDDAGTL 180

Query: 181 GYVAFIDVLNNDHTLVDSIKASTGDESTLFLENYRISTSVVSGNSRAVGTTASDVVYNTV 240
           GYVAFIDVLNNDH LVDSIKASTGDESTLFLENYRISTSVVSGNSRAVGTTASDVVYNTV
Sbjct: 181 GYVAFIDVLNNDHALVDSIKASTGDESTLFLENYRISTSVVSGNSRAVGTTASDVVYNTV 240

Query: 241 VKENTEFMGSANVVGQSFLTKYVPLKDSNGATIGMVFVGTPEAQFTQLVNNARNNTIIIA 300
           VKENTEFMGSANVVGQSFLTKYVPLKDSNGATIGM+FVGTPEAQFTQ+VNNARNNTIIIA
Sbjct: 241 VKENTEFMGSANVVGQSFLTKYVPLKDSNGATIGMLFVGTPEAQFTQMVNNARNNTIIIA 300

Query: 301 LFGLLIAVVISLVSSRSITKPINQLEDGVHKFGSGDYDHTINVKTGDELEELANSFNKMA 360
           LFGLLIAVVISL+SSRSITKP+NQLEDGVHKFGSG+YDHTI VKTGDELE+LA+SFNKMA
Sbjct: 301 LFGLLIAVVISLISSRSITKPLNQLEDGVHKFGSGNYDHTITVKTGDELEDLADSFNKMA 360

Query: 361 KDIKELHSMLDADKLSLAKTLKEIFDIMDHLAEGDFSVRADENRHKNKLQKTINHAIENV 420
            DIKELHS+LDADKLSLA TLKEIF++M+HLAEGDFS+RADENR +NKLQKTINHAIENV
Sbjct: 361 NDIKELHSILDADKLSLANTLKEIFEVMNHLAEGDFSIRADENRERNKLQKTINHAIENV 420

Query: 421 SKMMENLKSEITVLSDELEDVGEGLKRAKETSEQVTDAANQVATAAADQSAKLQDTSDEL 480
           SKMMENLKSEITVLS ELEDV EGLKRAKETSEQVTDAANQVATAAADQSAKLQDTSD+L
Sbjct: 421 SKMMENLKSEITVLSGELEDVSEGLKRAKETSEQVTDAANQVATAAADQSAKLQDTSDDL 480

Query: 481 EKTAKAADMVYNDAEQSVDSAIEVKDNSETGVKKVENAIDTMQKITNVIDELGKSIQELG 540
           EKTAKAADMVYNDAEQSVDSAIEVKDNSETGVKKVENAIDTMQKITNVIDELGKSIQELG
Sbjct: 481 EKTAKAADMVYNDAEQSVDSAIEVKDNSETGVKKVENAIDTMQKITNVIDELGKSIQELG 540

Query: 541 EESKKINEVTVLIKDVAEQTGLLALNASIEAARAGDAGKGFAVVASEIKSLAEEIKKSVE 600
           EESKKINEVTVLIKDVAEQTGLLALNASIEAARAGDAGKGFAVVASEIKSLAEEIKKSVE
Sbjct: 541 EESKKINEVTVLIKDVAEQTGLLALNASIEAARAGDAGKGFAVVASEIKSLAEEIKKSVE 600

Query: 601 DINRTINGINKKVETTIDLGLAGRDEVDRGVVAIDEVNSAFMKIKESVETSAKMIAQIKD 660
           DINRTINGINKKVETTIDLGLAGRDEVDRGVVAIDEVNSAFMKIKESVETSAKMIAQIKD
Sbjct: 601 DINRTINGINKKVETTIDLGLAGRDEVDRGVVAIDEVNSAFMKIKESVETSAKMIAQIKD 660

Query: 661 NAKNASNNTQEALRNVQDIASISEEFAATAEELTASSEEQNRAVEEIDASAEKMMEISRK 720
           NAKNASNNTQEALRNVQDIASISEEFAATAEELTASSEEQNRAVEEIDASAE+MM+ISRK
Sbjct: 661 NAKNASNNTQEALRNVQDIASISEEFAATAEELTASSEEQNRAVEEIDASAERMMDISRK 720

Query: 721 LAEDADEFKTK 731
           LAEDADEFKTK
Sbjct: 721 LAEDADEFKTK 731