Pairwise Alignments

Query, 234 a.a., TrmJ/YjtD family RNA methyltransferase from Methanococcus maripaludis S2

Subject, 234 a.a., TrmJ/YjtD family RNA methyltransferase from Methanococcus maripaludis JJ

 Score =  459 bits (1182), Expect = e-134
 Identities = 229/234 (97%), Positives = 232/234 (99%)

Query: 1   VKTVVILVNPKYGGNLGAIARNMMNFDVEELRIVGTPEILDDEAYIRAVHAKNILNNAKF 60
           +KTVVILVNPKYGGNLGAIARNMMNFDVEELRIVGTPEILDDEAYIRAVHAKNILNNAKF
Sbjct: 1   MKTVVILVNPKYGGNLGAIARNMMNFDVEELRIVGTPEILDDEAYIRAVHAKNILNNAKF 60

Query: 61  YSKLEDAISDIDFTVATTGAVCGDRNVNRVPITPRELAKKHSSISGTLGIVFGREDDGLK 120
           YSKLEDAISDIDFTVATTGAVCGDRNVNRVPITPRELAKKH  I+GTLGIVFGREDDGLK
Sbjct: 61  YSKLEDAISDIDFTVATTGAVCGDRNVNRVPITPRELAKKHFGINGTLGIVFGREDDGLK 120

Query: 121 NEDVELCDILVSVPTSNKYPILNLSHAVSVILYEIYFESFSKDIPYDLNMKNASVDEKNA 180
           NEDVELCDILVSVPTSNKYPILNLSHAVSVILYEIYFESFS+DIPYDLNMKNASVDEKNA
Sbjct: 121 NEDVELCDILVSVPTSNKYPILNLSHAVSVILYEIYFESFSEDIPYDLNMKNASVDEKNA 180

Query: 181 LLRFFNEFVDRSKDVPDYRKDICKTIFKRIVGRAFISGKEANSLICVFKDKCPK 234
           LLRFFNEFVDRSKDVPDYRKDICKTIFKRIVGRAFISGKEANSLICVFKDKCPK
Sbjct: 181 LLRFFNEFVDRSKDVPDYRKDICKTIFKRIVGRAFISGKEANSLICVFKDKCPK 234