Pairwise Alignments

Query, 892 a.a., right-handed parallel beta-helix repeat-containing protein from Methanococcus maripaludis S2

Subject, 482 a.a., CAP domain-containing protein from Methanococcus maripaludis JJ

 Score = 89.0 bits (219), Expect = 6e-22
 Identities = 46/121 (38%), Positives = 75/121 (61%), Gaps = 3/121 (2%)

Query: 774 TSDTEPDNNDEGAEDSGDTTSETG-DATGEEPTETSDDEPSETPPE-TEDTTGDESSDTT 831
           T DT  DN D  +ED+ DT+SE   D + E+ T+TS ++ ++T  E   DT+ ++++DT+
Sbjct: 100 TVDTSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTS 159

Query: 832 SDDNSGGESESNSETEDSETSDDEPSDSS-SESESNSDASPEDNSDGETSDNSPEESGDS 890
           S+DN+   SE N++T   + +D    D++ + SE N+D S EDN+D  + DN+   S D 
Sbjct: 160 SEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDY 219

Query: 891 V 891
           V
Sbjct: 220 V 220



 Score = 80.9 bits (198), Expect = 2e-19
 Identities = 44/122 (36%), Positives = 74/122 (60%), Gaps = 10/122 (8%)

Query: 763 SENDSPLEHEDTSDT-EPDNNDEGAEDSGDTTSETG-DATGEEPTETSDDEPSETPPE-T 819
           SE+++    ED +DT   DN D  +ED+ DT+SE   D + E+ T+TS ++ ++T  E  
Sbjct: 104 SEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDN 163

Query: 820 EDTTGDESSDTTSDDNSGGESESNSETEDSETSDDEPSDSSSESESNSDASPEDNSDGET 879
            DT+ ++++DT+S+DN+   SE N++T   + +D       + SE N+D S EDN+D  +
Sbjct: 164 TDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTD-------TSSEDNTDTSSEDNTDTSS 216

Query: 880 SD 881
            D
Sbjct: 217 ED 218



 Score = 75.9 bits (185), Expect = 5e-18
 Identities = 39/118 (33%), Positives = 74/118 (62%), Gaps = 4/118 (3%)

Query: 736 NNTNESQNSETQNNTDAGDEGNISDNPSENDSPLEHEDTSDT-EPDNNDEGAEDSGDTTS 794
           + + ++ ++ +++NTD   E N +D  SE+++    ED +DT   DN D  +ED+ DT+S
Sbjct: 102 DTSEDNTDTSSEDNTDTSSEDN-TDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSS 160

Query: 795 ETG-DATGEEPTETSDDEPSETPPE-TEDTTGDESSDTTSDDNSGGESESNSETEDSE 850
           E   D + E+ T+TS ++ ++T  E   DT+ ++++DT+S+DN+   SE N++T   +
Sbjct: 161 EDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSED 218



 Score = 70.9 bits (172), Expect = 2e-16
 Identities = 51/156 (32%), Positives = 86/156 (55%), Gaps = 14/156 (8%)

Query: 682 EVPDYSYTKPTTDNTQEPAETSNPENKTTDTPLNNETGEITPNESENESNGEIENNTNES 741
           EV  Y+  K T+    +  E+      T DT  +N     T   SE+ ++   E+NT+ S
Sbjct: 74  EVKAYAPLKKTSSKI-DLLESRYVPVTTVDTSEDN-----TDTSSEDNTDTSSEDNTDTS 127

Query: 742 QNSETQNNTDAGDEGNISDNPSENDSPLEHEDTSDTEP-DNNDEGAEDSGDTTSETG-DA 799
               +++NTD   E N +D  SE+++    ED +DT   DN D  +ED+ DT+SE   D 
Sbjct: 128 ----SEDNTDTSSEDN-TDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDT 182

Query: 800 TGEEPTETSDDEPSETPPE-TEDTTGDESSDTTSDD 834
           + E+ T+TS ++ ++T  E   DT+ ++++DT+S+D
Sbjct: 183 SSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSED 218



 Score = 67.8 bits (164), Expect = 1e-15
 Identities = 45/142 (31%), Positives = 80/142 (56%), Gaps = 14/142 (9%)

Query: 680 EIEVPDYSYTKPTT-DNTQEPAETSNPENKTTDTPLNNETGEITPNESENESNGEIENNT 738
           +I++ +  Y   TT D +++  +TS+ +N  T +  N +T       SE+ ++   E+NT
Sbjct: 87  KIDLLESRYVPVTTVDTSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTS------SEDNTDTSSEDNT 140

Query: 739 NESQNSETQNNTDAGDEGNISDNPSENDSPLEHEDTSDTEP-DNNDEGAEDSGDTTSETG 797
           + S    +++NTD   E N +D  SE+++    ED +DT   DN D  +ED+ DT+SE  
Sbjct: 141 DTS----SEDNTDTSSEDN-TDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDN 195

Query: 798 -DATGEEPTETSDDEPSETPPE 818
            D + E+ T+TS ++ ++T  E
Sbjct: 196 TDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSE 217



 Score = 56.6 bits (135), Expect = 3e-12
 Identities = 40/133 (30%), Positives = 68/133 (51%), Gaps = 20/133 (15%)

Query: 664 AEDNEENINSDEVIQFEIEVPDYSYTKPTTDNTQEPAETSNPENKTTDTPLNNETGEITP 723
           +EDN +  + D          D S    T  ++++  +TS+ +N  T +  N +T     
Sbjct: 104 SEDNTDTSSEDNT--------DTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNTDT----- 150

Query: 724 NESENESNGEIENNTNESQNSETQNNTDAGDEGNISDNPSENDSPLEHEDTSDT-EPDNN 782
             SE+ ++   E+NT+ S    +++NTD   E N +D  SE+++    ED +DT   DN 
Sbjct: 151 -SSEDNTDTSSEDNTDTS----SEDNTDTSSEDN-TDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSEDNT 204

Query: 783 DEGAEDSGDTTSE 795
           D  +ED+ DT+SE
Sbjct: 205 DTSSEDNTDTSSE 217



 Score = 42.4 bits (98), Expect = 7e-08
 Identities = 61/242 (25%), Positives = 97/242 (40%), Gaps = 46/242 (19%)

Query: 603 EIGDSFEENVSIK---VSATDDSGIDSVKVMLDEK--VSFTLTKNSEYYTGTL----TDL 653
           E+   F+ N+  K   V A       S K+ L E   V  T    SE  T T     TD 
Sbjct: 59  ELNSPFKNNMGYKTFEVKAYAPLKKTSSKIDLLESRYVPVTTVDTSEDNTDTSSEDNTDT 118

Query: 654 SYGIHTLRVYAEDNEENINSDEVIQFEIEVPDYSYTKPTTDNTQEPAETSNPENKTTDTP 713
           S   +T    +EDN +  + D                 T  ++++  +TS+ +N  T + 
Sbjct: 119 SSEDNT-DTSSEDNTDTSSEDN----------------TDTSSEDNTDTSSEDNTDTSSE 161

Query: 714 LNNETGEITPNESENESNGEIENNTNESQNSETQNNTDAGDEGNISDNPSENDSPLEHED 773
            N +T       SE+ ++   E+NT+ S    +++NTD   E N +D  SE+++    ED
Sbjct: 162 DNTDT------SSEDNTDTSSEDNTDTS----SEDNTDTSSEDN-TDTSSEDNTDTSSED 210

Query: 774 TSDTE-------PDNNDEGAEDSGDTTSETGDATGEEPT--ETSDDEPSETPPETEDTTG 824
            +DT        P    +  + S      T +   EEP   E   +EP    P  E+   
Sbjct: 211 NTDTSSEDYVYLPSKITQSPKTSLYIIKTTPEPVVEEPVVEEPVVEEPVVEEPVVEEPVV 270

Query: 825 DE 826
           +E
Sbjct: 271 EE 272