Pairwise Alignments

Query, 892 a.a., right-handed parallel beta-helix repeat-containing protein from Methanococcus maripaludis S2

Subject, 925 a.a., right-handed parallel beta-helix repeat-containing protein from Methanococcus maripaludis JJ

 Score = 1664 bits (4309), Expect = 0.0
 Identities = 840/925 (90%), Positives = 867/925 (93%), Gaps = 33/925 (3%)

Query: 1   MKIFKVFLVMVILGAISGVFAEDTIIYVNDTHYWYQSGAFFESNNSIQDAVEYVPENGVV 60
           MKIFKVFLVMVILGAISGV AEDT IYVN+THYWYQSGAFFESNNSIQDA+E VPENG+V
Sbjct: 1   MKIFKVFLVMVILGAISGVCAEDTTIYVNNTHYWYQSGAFFESNNSIQDAIENVPENGIV 60

Query: 61  EVTTDLKVSNGIEVNKSNIIIDLKGNKLSGNYEGRGISISGNNVSLKNGVVSNFDYGIVL 120
           EVTTDLKVSNGIE+NKSNIIIDLKGNKLSGNYEGRGISISGNNVSLKNG+VSNFDYGIVL
Sbjct: 61  EVTTDLKVSNGIEINKSNIIIDLKGNKLSGNYEGRGISISGNNVSLKNGIVSNFDYGIVL 120

Query: 121 ENAENCKISNNEVFGNTYDGIYILNSKNNDISENLVYENGVIGIVTSGIFLDGSEFNNIT 180
           ENAENCKISNNEVFGNTYDGIYILNSKNNDISENLVYENGVIGIVTSGIFLDGSEFNNIT
Sbjct: 121 ENAENCKISNNEVFGNTYDGIYILNSKNNDISENLVYENGVIGIVTSGIFLDGSEFNNIT 180

Query: 181 KNTVNNNIYNGIELLNSKNNLISGNNVFENEDNGVFVWNSKNNSIIFNELYQNENNGILT 240
           KNTVNNNIYNGIELLNSKNNLISGN VFENEDNGVFVW+SKNNSIIFNELYQNENNGILT
Sbjct: 181 KNTVNNNIYNGIELLNSKNNLISGNTVFENEDNGVFVWDSKNNSIIFNELYQNENNGILT 240

Query: 241 RESKFNTIESNNIFENDDSGIYSWKSFENTISKNKISKNSEGIILWNSDLNVLFKNKLLN 300
           RES+FN IESNNIFENDDSGIYSWKSFENTISKNKISKNSEGIILWNSDLNVLFKN+LLN
Sbjct: 241 RESEFNNIESNNIFENDDSGIYSWKSFENTISKNKISKNSEGIILWNSDLNVLFKNRLLN 300

Query: 301 NVKSGISIEFGTKYNTIYDNLFNNSLNVRFEDSGKNYWNAPVINESNILEGEFTAGNVWY 360
           NVKSGI +EFGTKYNTIYDNLFNNSLNVRFEDSG+NYWNAP+INESNILEGEFTAGNVWY
Sbjct: 301 NVKSGIFMEFGTKYNTIYDNLFNNSLNVRFEDSGENYWNAPIINESNILEGEFTAGNVWY 360

Query: 361 TPECTGFSQKAMNQDTNGDTLSETYYELNSENIDNIPLAPDSVPPVVSIVSPRENAFFGE 420
           TPE TGFSQKAMNQD+NGDTLSETYYELNSENIDNIPLAPDSVPPVVSIVSPRENAFFGE
Sbjct: 361 TPEGTGFSQKAMNQDSNGDTLSETYYELNSENIDNIPLAPDSVPPVVSIVSPRENAFFGE 420

Query: 421 NETILVDVSVTDNSEIHSVMLEVDNSYKEIMVQNGTTYSKSLDNLDYGAHTIKIYAEDAV 480
           NETILVDVSVTDNSEIHSVMLEVDNSYKEIMVQNGTTYSKSLDNLDYGAHTIKIYA+DAV
Sbjct: 421 NETILVDVSVTDNSEIHSVMLEVDNSYKEIMVQNGTTYSKSLDNLDYGAHTIKIYAKDAV 480

Query: 481 GNVNFFESRVFSISTPDSTPPEVRIISPVSKSYAEGSEVSIKVQITDESDIYSAYAKIDD 540
           GNVN FESRVFSISTPDSTPPEV+IISPVSKSYAEGSEVSIKV+ITDESDIYSAYAKIDD
Sbjct: 481 GNVNSFESRVFSISTPDSTPPEVKIISPVSKSYAEGSEVSIKVKITDESDIYSAYAKIDD 540

Query: 541 YTVDLIESNGYYINILDNLEWGAHTLWIIVTDAAGNSNYNEKVTFDVNEGDITPPEVEII 600
           YTVDLIESNGYYINILDNLEWGAHTLWIIVTDAAGNSNYNEKVTFDVNEGDITPPEVEII
Sbjct: 541 YTVDLIESNGYYINILDNLEWGAHTLWIIVTDAAGNSNYNEKVTFDVNEGDITPPEVEII 600

Query: 601 EPEIGDSFEENVSIKVSATDDSGIDSVKVMLDEKVSFTLTKNSEYYTGTLTDLSYGIHTL 660
           EPEIGDSFEENVS+KVSATDDSGIDSVKVMLDEKVSFTLTK+S YYTGTLTDLSYGIHTL
Sbjct: 601 EPEIGDSFEENVSVKVSATDDSGIDSVKVMLDEKVSFTLTKSSNYYTGTLTDLSYGIHTL 660

Query: 661 RVYAEDNEENINSDEVIQFEIEVPDYSYTKPTTDNTQEPAETSNPENKTTDTPLNNETGE 720
           RVYAEDNEENINSDEVIQFEI+VPDYSYTKP TD+TQEPAETSNPENKTTDTPLNNETGE
Sbjct: 661 RVYAEDNEENINSDEVIQFEIDVPDYSYTKPITDDTQEPAETSNPENKTTDTPLNNETGE 720

Query: 721 ITPNESENESNGEIENNTNESQNSETQNNTDAGDEGNISDNPSENDSPLEHE-------- 772
           ITPNESENESNGEIENNT+ESQN+ETQNNTDA DEGNISDNPSENDSPLE E        
Sbjct: 721 ITPNESENESNGEIENNTDESQNNETQNNTDAEDEGNISDNPSENDSPLEPEDSGSADSG 780

Query: 773 DTSDTEPDNNDEGAEDSGDTTSETGDATGEE-----------------PTETSDDEPSET 815
           DTSDTEPDNNDEGAEDSGD  SETG+ATG+E                  +ETSDDE SET
Sbjct: 781 DTSDTEPDNNDEGAEDSGDNPSETGEATGDESSETSPDDETQSNDETGESETSDDEQSET 840

Query: 816 PPETEDTTGDES--------SDTTSDDNSGGESESNSETEDSETSDDEPSDSSSESESNS 867
           P ETED TGDES        SDTTSDDN GGESESNSETEDSETSDDEPSDSSSESESNS
Sbjct: 841 PSETEDITGDESSETSSGDNSDTTSDDNPGGESESNSETEDSETSDDEPSDSSSESESNS 900

Query: 868 DASPEDNSDGETSDNSPEESGDSVA 892
           D S EDNS  ETSD+SP+ES + VA
Sbjct: 901 DTSSEDNSGSETSDSSPDESENPVA 925