Pairwise Alignments

Query, 499 a.a., membrane protein from Burkholderia phytofirmans PsJN

Subject, 463 a.a., hemagglutinin from Ralstonia solanacearum IBSBF1503

 Score =  387 bits (994), Expect = e-112
 Identities = 245/494 (49%), Positives = 294/494 (59%), Gaps = 43/494 (8%)

Query: 7   NTTLRATLIAASVAAMLSLGACGGSGSLSSGTGSSGSGSAGGTLSTTGSGSTGSGGSGSG 66
           N   R T+I+A+VA +L LG C           +SGSG   GTL  + SGS+G+G SGS 
Sbjct: 2   NNIKRVTMISAAVAGLLILGGC-----------ASGSGDTSGTLGGS-SGSSGNGTSGSA 49

Query: 67  AGAGANTTTGSNGSGTGTGTGTGTGTGTGTGTTPVANALGTVVGNTGGVVSDAGSAVTGI 126
            G  A T  GSNG+G+        GT  GT TTP     GT + N G VV+ +GSAV+ I
Sbjct: 50  GGTSAGT--GSNGTGSN-------GTD-GTTTTPALTTAGTTLNNAGSVVTTSGSAVSSI 99

Query: 127 GTVIGSQTLPGVSSQTTQSAGGIVQQVGSAVSTLGNGVSQGLGQLGTGGNAVGTTVSSVG 186
           GT I +  LP V S      G +V+ +G+ VS LG GV  GLG +G+  N +GTTV+S G
Sbjct: 100 GTGIKNANLPLVPSSAQSGLGSVVENLGATVSALGTGVQNGLGSIGSNPNPIGTTVASTG 159

Query: 187 GVVSHVGGAVTDAGNLVTSLGSGPLAPLSAITTPLGGVVNTLGGAVTNGGGTLTTALSTG 246
            VV+ VG  V  AG LV+ LG+  LAPL+ ITTPLGG V  +G AV N G TL TALSTG
Sbjct: 160 NVVTGVGNTVASAGTLVSGLGTDQLAPLAPITTPLGGAVTQVGQAVANAGTTLGTALSTG 219

Query: 247 PVQQVTQTLSTAITPITSMVAATTQTVGNTTGLGAPLNGLLSTVGGGLGKAGALLSATGG 306
           PV+Q+TQ LSTAI P+TS V  +TQT+G TTG GAP N LL T+GG +   G  L+    
Sbjct: 220 PVEQLTQQLSTAIVPLTSQVTGSTQTLGATTGTGAPANSLLGTLGGAIANGGNTLT-NAN 278

Query: 307 NPVTAALGHTVTDTGATVASVGGLL--TGGSGGNPLAPLTSALGGLTGGTSSGPLAPLTS 364
            PV + LG  V   G TVA++GG+      S GNPLAP+T  LG   GG    PL  +T 
Sbjct: 279 VPVVSNLGSVVGAVGNTVAALGGVAYSPNASSGNPLAPITGVLGAAAGG--GNPLGAVTG 336

Query: 365 ALGGLTGGTG-SGPLAPLTSALGGLTGAVGGASSGGSPLAPVTGLLSTVTGSLSGAAGGS 423
            LGGL G TG S PLAP+TS LG    +VGGA+ G S LAPVT  L    GSL  AAGG 
Sbjct: 337 VLGGLGGATGGSSPLAPVTSVLG----SVGGATGGSSLLAPVTSAL----GSLGSAAGGG 388

Query: 424 SGPLAPVTGLLSGVTGALGGVTTTASAAPATTTAAASTNSGAGLSLSTSTGKGTSNNPLA 483
           S PLAPVTG+LS + G  GG   TA A  A+ TA   T      S  TSTG  T   PLA
Sbjct: 389 S-PLAPVTGVLSSIGGTTGG---TALAPVASITAPVGTAVATVGSTLTSTGATT---PLA 441

Query: 484 PVTSLVGGLLGGLG 497
           PVT   G LLG +G
Sbjct: 442 PVTGTAGSLLGTVG 455



 Score = 53.1 bits (126), Expect = 2e-11
 Identities = 54/197 (27%), Positives = 94/197 (47%), Gaps = 24/197 (12%)

Query: 313 LGHTVTDTGATVASVGGLLTGGSGGNPLAPLTSALGGLTGGTSSGPLAPLTSALGGLTGG 372
           LG   + +G T  ++GG  + GS GN          G  GGTS+G  +  T + G  T G
Sbjct: 20  LGGCASGSGDTSGTLGG--SSGSSGN-------GTSGSAGGTSAGTGSNGTGSNG--TDG 68

Query: 373 TGSGPLAPLTSALGGLTGAVGGASSGGSPLAPV-TGLLSTVTGSLSGAAGGSSGPL---- 427
           T + P   LT+A   L  A    ++ GS ++ + TG+ +     +  +A    G +    
Sbjct: 69  TTTTPA--LTTAGTTLNNAGSVVTTSGSAVSSIGTGIKNANLPLVPSSAQSGLGSVVENL 126

Query: 428 -APVTGLLSGVTGALGGVTTTASAAPATTTAAASTNSGAGLSLSTS----TGKGTSN-NP 481
            A V+ L +GV   LG + +  +    T  +  +  +G G +++++    +G GT    P
Sbjct: 127 GATVSALGTGVQNGLGSIGSNPNPIGTTVASTGNVVTGVGNTVASAGTLVSGLGTDQLAP 186

Query: 482 LAPVTSLVGGLLGGLGK 498
           LAP+T+ +GG +  +G+
Sbjct: 187 LAPITTPLGGAVTQVGQ 203