Strain Fitness in Pantoea sp. MT58 around IAI47_04345

Experiment: Survival; Treatment=FW106 (pH3.9) with 1 mM Glucose; TreatmentDuration=24hrs; Outgrowth=LBkan50

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Survival; Treatment=FW106 (pH3.9) with 1 mM Glucose; TreatmentDuration=24hrs; Outgrowth=LBkan50
911,359	-				-0.2
911,359	-				-2.4
911,359	-				+0.7
911,368	+				-2.0
911,369	-				+0.6
911,369	-				-1.2
911,369	-				-0.3
911,387	+				+0.1
911,387	+				+0.5
911,387	+				-0.1
911,388	-				+0.4
911,388	-				+0.0
911,388	-				-0.4
911,388	-				-1.1
911,395	+				+0.7
911,395	+				+0.5
911,395	+				+0.1
911,396	-				+1.5
911,396	-				-1.5
911,396	-				+1.4
911,397	+				-0.5
911,398	-				+0.6
911,405	-				-0.5
911,405	-				+0.4
911,449	-				-0.1
911,449	-				-0.4
911,461	+				-1.9
911,461	+				+1.8
911,513	+				-0.2
911,513	+				-2.0
911,514	-				+1.3
911,514	-				+1.1
911,524	+				-1.0
911,524	+				-0.3
911,525	-				+0.4
911,558	+				-0.5
911,597	+				+2.3
911,597	+				-1.8
911,597	+				-0.6
911,597	+				-1.4
911,597	+				-0.6
911,631	-				+0.1
911,656	+				-0.5
911,731	-				-0.2
911,731	-				+0.9
911,731	-				-1.4
911,735	+				+1.7
911,735	+				+1.6
911,735	+				+0.8
911,736	-				+1.6
911,740	+				-1.3
911,740	+				+0.3
911,740	+				-1.1
911,741	-				+0.2
911,741	-				-0.6
911,776	+				-0.7
911,776	+				+0.4
911,776	+				-0.7
911,777	-				-0.0
911,777	-				-0.1
911,777	-				+0.2
911,785	+				-1.2
911,785	+				+1.7
911,785	+				-1.5
911,785	+				-0.2
911,785	+				+0.9
911,786	-				+0.4
911,786	-				-0.9
911,805	+				-1.2
911,806	-				-2.0
911,826	+				-0.4
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-0.0
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-0.3
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-1.7
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-0.1
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-1.9
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+0.7
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-2.2
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-1.1
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.4
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.1
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.5
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-0.6
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-0.9
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-0.5
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-2.4
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.2
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+1.1
911,910	+		IAI47_04340	0.24	+0.6
912,047	+		IAI47_04340	0.48	-0.7
912,048	-		IAI47_04340	0.49	+0.9
912,067	+		IAI47_04340	0.52	+0.7
912,067	+		IAI47_04340	0.52	+0.3
912,084	+		IAI47_04340	0.55	+0.2
912,084	+		IAI47_04340	0.55	-0.4
912,085	-		IAI47_04340	0.55	+0.0
912,085	-		IAI47_04340	0.55	+0.1
912,085	-		IAI47_04340	0.55	+0.0
912,085	-		IAI47_04340	0.55	-2.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.9
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.6
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-1.0
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+1.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-1.5
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.9
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.6
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-1.6
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+2.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+1.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-1.6
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-1.0
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.9
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-1.9
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.0
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-2.3
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+1.2
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+2.4
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.2
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.4
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-2.5
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.7
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+1.0
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.3
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.0
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.4
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.3
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.3
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.2
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.1
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.0
912,128	+		IAI47_04340	0.63	-0.0
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+1.7
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+2.5
912,185	+		IAI47_04340	0.73	-0.2
912,185	+		IAI47_04340	0.73	-0.1
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+0.0
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-0.8
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-0.2
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+1.2
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-0.6
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-1.8
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-0.8
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-1.0
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+0.0
912,195	+		IAI47_04340	0.74	-0.4
912,196	-		IAI47_04340	0.75	-1.9
912,196	-		IAI47_04340	0.75	+0.2
912,196	-		IAI47_04340	0.75	-0.6
912,286	-				-0.4
912,286	-				-1.3
912,297	+				+0.6
912,298	-				+2.1
912,332	+				-1.0
912,333	-				-0.2
912,346	+				-0.8
912,346	+				-0.7
912,346	+				+0.4
912,346	+				-0.0
912,346	+				-1.3
912,346	+				+1.6
912,346	+				+0.0
912,347	-				-1.4
912,347	-				+3.4
912,347	-				-0.7
912,347	-				-0.3
912,347	-				-2.2
912,347	-				-1.0
912,347	-				-0.9
912,350	+				+1.1
912,350	+				-0.0
912,350	+				+2.0
912,350	+				-2.9
912,350	+				+1.9
912,350	+				-0.6
912,350	+				-1.6
912,350	+				+2.9
912,350	+				+0.8
912,350	+				-0.0
912,350	+				+0.3
912,350	+				-0.8
912,350	+				-2.3
912,350	+				+1.7
912,350	+				+0.8
912,350	+				-2.6
912,350	+				+0.2
912,351	-				+1.2
912,351	-				-0.3
912,351	-				-0.2
912,351	-				-0.6
912,351	-				-1.2
912,351	-				+0.1
912,351	-				-0.6
912,351	-				-2.5
912,351	-				+0.2
912,351	-				-1.2
912,351	-				+1.3
912,354	+				-2.4
912,354	+				+0.9
912,355	-				-1.1
912,355	-				+2.1
912,355	-				+1.9
912,355	-				-1.0
912,418	+		IAI47_04345	0.19	+0.9
912,419	-		IAI47_04345	0.19	-1.5
912,419	-		IAI47_04345	0.19	-0.5
912,424	+		IAI47_04345	0.21	+3.6
912,424	+		IAI47_04345	0.21	-0.4
912,425	-		IAI47_04345	0.21	-1.1
912,430	+		IAI47_04345	0.22	+0.7
912,430	+		IAI47_04345	0.22	+0.3
912,430	+		IAI47_04345	0.22	-0.8
912,430	+		IAI47_04345	0.22	-1.0
912,430	+		IAI47_04345	0.22	+0.1
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-0.6
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-1.3
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+0.4
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-0.1
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-1.0
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+0.1
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+0.7
912,456	+		IAI47_04345	0.28	-0.1
912,457	-		IAI47_04345	0.28	+1.4
912,470	-		IAI47_04345	0.31	-0.7
912,470	-		IAI47_04345	0.31	-1.0
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+1.3
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+0.7
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+0.0
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-0.7
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-1.0
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+1.1
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+1.3
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-1.3
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+0.2
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+1.4
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-0.5
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+0.1
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+0.3
912,535	+		IAI47_04345	0.46	+0.9
912,535	+		IAI47_04345	0.46	-1.5
912,604	+		IAI47_04345	0.62	+0.2
912,605	-		IAI47_04345	0.63	-1.2
912,605	-		IAI47_04345	0.63	-1.8
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+2.3
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+0.5
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-2.6
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-0.5
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+1.9
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+1.0
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+1.1
912,626	-		IAI47_04345	0.68	-1.5
912,626	-		IAI47_04345	0.68	+0.6
912,626	-		IAI47_04345	0.68	-0.4
912,626	-		IAI47_04345	0.68	-0.4
912,658	+		IAI47_04345	0.75	+0.2
912,658	+		IAI47_04345	0.75	+0.5
912,659	-		IAI47_04345	0.75	-2.2
912,659	-		IAI47_04345	0.75	+1.4
912,682	+		IAI47_04345	0.81	-0.2
912,682	+		IAI47_04345	0.81	-2.3
912,682	+		IAI47_04345	0.81	+0.4
912,683	-		IAI47_04345	0.81	+0.5
912,714	+		IAI47_04345	0.88	+1.7
912,714	+		IAI47_04345	0.88	+0.9
912,714	+		IAI47_04345	0.88	+0.6
912,714	+		IAI47_04345	0.88	-1.1
912,715	-		IAI47_04345	0.88	+0.6
912,715	-		IAI47_04345	0.88	-0.5
912,715	-		IAI47_04345	0.88	-1.7
912,715	-		IAI47_04345	0.88	-0.9
912,715	-		IAI47_04345	0.88	+0.9
912,716	+		IAI47_04345	0.89	+1.6
912,716	+		IAI47_04345	0.89	-0.9
912,716	+		IAI47_04345	0.89	+0.2
912,716	+		IAI47_04345	0.89	+1.6
912,716	+		IAI47_04345	0.89	+1.1
912,716	+		IAI47_04345	0.89	-1.6
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-0.6
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-0.1
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-1.1
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-0.9
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-0.5
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-0.8
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-1.6
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-1.6
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-1.5
912,717	-		IAI47_04345	0.89	+0.1
912,739	+				-0.7
912,739	+				-0.6
912,739	+				+0.1
912,739	+				+0.9
912,739	+				+0.4
912,740	-				+0.0
912,740	-				-0.1
912,740	-				-1.9
912,746	+				+2.0
912,747	-				-1.4
912,747	-				+1.1
912,747	-				-1.8
912,795	+				+2.2
912,795	+				-1.6
912,795	+				+0.3
912,795	+				-1.1
912,795	+				+0.4
912,795	+				+0.6
912,796	-				-0.2
912,796	-				-2.3
912,796	-				-2.0
912,796	-				-0.2
912,810	+				-0.7
912,818	+				-1.1
912,818	+				-1.6
912,851	+				-2.0
912,851	+				-0.8
912,852	-				-1.7
912,855	+				-2.1
912,855	+				-0.1
912,856	-				-0.5
912,856	-				-1.0
912,856	-				-0.8
912,863	+				-1.0
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-1.0
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-0.5
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-1.3
913,071	+		IAI47_04350	0.17	+1.5
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-2.2
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-2.4
913,071	+		IAI47_04350	0.17	+3.9
913,071	+		IAI47_04350	0.17	+0.8
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-0.3
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-1.9
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-2.0
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-1.5
913,072	-		IAI47_04350	0.17	+0.1
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-0.5
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-1.2
913,072	-		IAI47_04350	0.17	+0.3
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-1.1
913,146	+		IAI47_04350	0.22	-0.6
913,146	+		IAI47_04350	0.22	-0.1
913,147	-		IAI47_04350	0.22	+0.0
913,147	-		IAI47_04350	0.22	-0.2
913,176	+		IAI47_04350	0.24	-0.9
913,176	+		IAI47_04350	0.24	+0.0
913,177	-		IAI47_04350	0.24	-1.0
913,193	-		IAI47_04350	0.25	+1.1
913,193	-		IAI47_04350	0.25	+1.1
913,213	-		IAI47_04350	0.26	-2.8
913,288	+		IAI47_04350	0.31	+0.8
913,289	-		IAI47_04350	0.31	+0.5
913,289	-		IAI47_04350	0.31	-1.4
913,289	-		IAI47_04350	0.31	-0.0
913,289	-		IAI47_04350	0.31	-0.9
913,291	-		IAI47_04350	0.31	+0.0
913,291	-		IAI47_04350	0.31	-1.4
913,291	-		IAI47_04350	0.31	-0.5
913,291	-		IAI47_04350	0.31	-1.5
913,291	-		IAI47_04350	0.31	-0.2
913,363	-		IAI47_04350	0.35	-0.6
913,363	-		IAI47_04350	0.35	-0.8
913,363	-		IAI47_04350	0.35	+0.3
913,363	-		IAI47_04350	0.35	-3.4
913,363	-		IAI47_04350	0.35	+0.2
913,363	-		IAI47_04350	0.35	-0.9
913,375	+		IAI47_04350	0.36	+0.0
913,375	+		IAI47_04350	0.36	-1.1
913,376	-		IAI47_04350	0.36	-0.9
913,393	-		IAI47_04350	0.37	-1.0
913,396	+		IAI47_04350	0.37	-1.3
913,396	+		IAI47_04350	0.37	-1.4
913,396	+		IAI47_04350	0.37	+0.2
913,396	+		IAI47_04350	0.37	+1.6
913,397	-		IAI47_04350	0.37	-1.9
913,397	-		IAI47_04350	0.37	+0.1
913,400	-		IAI47_04350	0.38	+0.1
913,400	-		IAI47_04350	0.38	-0.5
913,418	+		IAI47_04350	0.39	-0.6
913,418	+		IAI47_04350	0.39	+0.5
913,418	+		IAI47_04350	0.39	+0.5
913,418	+		IAI47_04350	0.39	-2.9
913,419	-		IAI47_04350	0.39	-0.3
913,419	-		IAI47_04350	0.39	-1.7
913,419	-		IAI47_04350	0.39	-1.4
913,419	-		IAI47_04350	0.39	+1.0
913,419	-		IAI47_04350	0.39	-1.6
913,419	-		IAI47_04350	0.39	-1.1
913,419	-		IAI47_04350	0.39	-2.5
913,423	+		IAI47_04350	0.39	+0.6
913,423	+		IAI47_04350	0.39	-1.1
913,423	+		IAI47_04350	0.39	+0.3
913,423	+		IAI47_04350	0.39	-2.3
913,424	-		IAI47_04350	0.39	-1.0
913,424	-		IAI47_04350	0.39	-0.1
913,424	-		IAI47_04350	0.39	-1.9
913,424	-		IAI47_04350	0.39	-0.2
913,424	-		IAI47_04350	0.39	-1.4
913,424	-		IAI47_04350	0.39	-1.2
913,424	-		IAI47_04350	0.39	+0.5
913,424	-		IAI47_04350	0.39	-2.6
913,424	-		IAI47_04350	0.39	-2.6
913,424	-		IAI47_04350	0.39	-1.3
913,509	+		IAI47_04350	0.44	+1.4
913,509	+		IAI47_04350	0.44	-1.2
913,509	+		IAI47_04350	0.44	-1.8
913,510	-		IAI47_04350	0.44	-1.2
913,510	-		IAI47_04350	0.44	+0.8
913,510	-		IAI47_04350	0.44	-1.2
913,510	-		IAI47_04350	0.44	+0.6
913,510	-		IAI47_04350	0.44	+0.4
913,526	-		IAI47_04350	0.45	-2.0
913,526	-		IAI47_04350	0.45	-0.1
913,526	-		IAI47_04350	0.45	-0.2
913,553	+		IAI47_04350	0.47	-0.3
913,554	-		IAI47_04350	0.47	-0.7
913,567	-		IAI47_04350	0.48	+1.4
913,567	-		IAI47_04350	0.48	-0.2
913,596	+		IAI47_04350	0.50	-0.1
913,612	+		IAI47_04350	0.51	+1.0
913,612	+		IAI47_04350	0.51	-0.1
913,612	+		IAI47_04350	0.51	-2.5
913,612	+		IAI47_04350	0.51	-1.6
913,612	+		IAI47_04350	0.51	-0.6
913,612	+		IAI47_04350	0.51	-2.0
913,613	-		IAI47_04350	0.51	-1.4
913,613	-		IAI47_04350	0.51	+0.9
913,613	-		IAI47_04350	0.51	-0.6
913,613	-		IAI47_04350	0.51	-0.7
913,613	-		IAI47_04350	0.51	-1.0
913,613	-		IAI47_04350	0.51	-1.1
913,657	+		IAI47_04350	0.54	-0.9
913,657	+		IAI47_04350	0.54	-2.0
913,657	+		IAI47_04350	0.54	-1.2
913,658	-		IAI47_04350	0.54	-0.2
913,658	-		IAI47_04350	0.54	-1.4
913,658	-		IAI47_04350	0.54	-2.5
913,658	-		IAI47_04350	0.54	+0.2
913,658	-		IAI47_04350	0.54	+0.6
913,658	-		IAI47_04350	0.54	+0.5
913,658	-		IAI47_04350	0.54	-0.0
913,658	-		IAI47_04350	0.54	-0.6
913,658	-		IAI47_04350	0.54	-0.2
913,689	+		IAI47_04350	0.56	-0.4
913,689	+		IAI47_04350	0.56	+1.2
913,690	-		IAI47_04350	0.56	+2.1
913,710	+		IAI47_04350	0.57	-1.6
913,710	+		IAI47_04350	0.57	+0.1
913,710	+		IAI47_04350	0.57	-0.2
913,710	+		IAI47_04350	0.57	+0.8
913,710	+		IAI47_04350	0.57	-1.4
913,711	-		IAI47_04350	0.57	-1.4
913,711	-		IAI47_04350	0.57	-1.2
913,711	-		IAI47_04350	0.57	-0.5
913,738	+		IAI47_04350	0.59	+0.1
913,738	+		IAI47_04350	0.59	-1.2
913,738	+		IAI47_04350	0.59	-1.2
913,738	+		IAI47_04350	0.59	-1.3
913,738	+		IAI47_04350	0.59	-2.4
913,739	-		IAI47_04350	0.59	-0.6
913,755	+		IAI47_04350	0.60	-1.0
913,764	+		IAI47_04350	0.60	-2.0
913,764	+		IAI47_04350	0.60	-0.9
913,764	+		IAI47_04350	0.60	-0.5