Strain Fitness in Pantoea sp. MT58 around IAI47_04340

Experiment: Survival; Treatment=FW106 (pH3.9) with 1 mM Glucose; TreatmentDuration=24hrs; Outgrowth=LBkan50

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Survival; Treatment=FW106 (pH3.9) with 1 mM Glucose; TreatmentDuration=24hrs; Outgrowth=LBkan50
911,027	+				-0.2
911,027	+				-0.1
911,037	+				+1.1
911,037	+				+0.4
911,037	+				+0.4
911,059	+				+1.0
911,059	+				-1.2
911,059	+				-1.2
911,059	+				+0.4
911,059	+				+0.3
911,059	+				+0.7
911,063	+				-0.6
911,063	+				+0.2
911,063	+				+0.2
911,078	+				+0.2
911,087	+				+0.7
911,087	+				-0.7
911,093	+				-0.6
911,093	+				-0.0
911,093	+				-0.6
911,093	+				-1.8
911,093	+				+1.4
911,093	+				+3.2
911,180	+				+1.4
911,180	+				+0.2
911,181	-				-0.3
911,181	-				-1.1
911,204	+				+1.1
911,204	+				+1.3
911,222	-				-1.5
911,233	+				+0.1
911,233	+				-0.1
911,233	+				-1.1
911,234	-				-1.1
911,234	-				+0.8
911,252	-		IAI47_04335	0.10	-3.4
911,252	-		IAI47_04335	0.10	+0.2
911,252	-		IAI47_04335	0.10	+1.4
911,265	-		IAI47_04335	0.27	-2.0
911,265	-		IAI47_04335	0.27	+0.7
911,270	-		IAI47_04335	0.34	-0.6
911,270	-		IAI47_04335	0.34	+0.6
911,270	-		IAI47_04335	0.34	-2.2
911,334	+				+2.3
911,359	-				+0.6
911,359	-				-1.0
911,359	-				-0.3
911,368	+				+2.2
911,369	-				-0.1
911,369	-				+0.7
911,369	-				+0.4
911,387	+				-0.5
911,387	+				+0.4
911,387	+				-2.4
911,388	-				-0.3
911,388	-				+1.6
911,388	-				-0.1
911,388	-				+0.9
911,395	+				-2.0
911,395	+				+0.4
911,395	+				+0.6
911,396	-				+1.4
911,396	-				-0.8
911,396	-				+3.5
911,397	+				+0.6
911,398	-				-1.3
911,405	-				-2.1
911,405	-				+0.5
911,449	-				-1.3
911,449	-				-0.1
911,461	+				-1.5
911,461	+				+1.2
911,513	+				-0.3
911,513	+				+0.0
911,514	-				-0.8
911,514	-				-1.7
911,524	+				-1.2
911,524	+				+0.1
911,525	-				-0.1
911,558	+				-1.3
911,597	+				+0.2
911,597	+				+0.2
911,597	+				+1.0
911,597	+				-0.9
911,597	+				+1.7
911,631	-				+0.3
911,656	+				-0.1
911,731	-				-2.1
911,731	-				-0.3
911,731	-				-0.3
911,735	+				-0.4
911,735	+				-0.1
911,735	+				-0.4
911,736	-				+0.4
911,740	+				-1.5
911,740	+				+0.0
911,740	+				+2.2
911,741	-				-1.0
911,741	-				-0.4
911,776	+				+0.8
911,776	+				+0.4
911,776	+				+0.1
911,777	-				+1.0
911,777	-				-0.5
911,777	-				-0.6
911,785	+				-1.8
911,785	+				+1.1
911,785	+				+0.9
911,785	+				+1.5
911,785	+				-0.3
911,786	-				-0.8
911,786	-				-0.5
911,805	+				-0.8
911,806	-				-0.6
911,826	+				+0.7
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-0.5
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-3.0
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-1.3
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-0.3
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+2.0
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+0.0
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-1.8
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+0.0
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-0.8
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-1.8
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.2
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-0.2
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-0.2
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+1.2
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.3
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.0
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-1.3
911,910	+		IAI47_04340	0.24	+0.6
912,047	+		IAI47_04340	0.48	-0.9
912,048	-		IAI47_04340	0.49	-1.1
912,067	+		IAI47_04340	0.52	-1.3
912,067	+		IAI47_04340	0.52	-0.6
912,084	+		IAI47_04340	0.55	+0.9
912,084	+		IAI47_04340	0.55	-0.1
912,085	-		IAI47_04340	0.55	-0.2
912,085	-		IAI47_04340	0.55	+0.4
912,085	-		IAI47_04340	0.55	-1.9
912,085	-		IAI47_04340	0.55	-1.7
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.6
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+2.0
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.0
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+3.3
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.5
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.0
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.0
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-1.3
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.5
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.6
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.3
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-2.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.3
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.6
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.2
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.8
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.3
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.6
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.0
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.6
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.7
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.2
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.1
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.0
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.0
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.8
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.7
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+1.0
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.7
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.9
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+1.2
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+1.0
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-2.3
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.6
912,128	+		IAI47_04340	0.63	-0.1
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+0.7
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+1.7
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+0.4
912,185	+		IAI47_04340	0.73	-1.0
912,185	+		IAI47_04340	0.73	-0.3
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-0.4
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+0.2
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-0.4
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-1.6
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-1.4
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+1.2
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-0.6
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+0.4
912,195	+		IAI47_04340	0.74	-1.1
912,196	-		IAI47_04340	0.75	-2.5
912,196	-		IAI47_04340	0.75	+1.0
912,196	-		IAI47_04340	0.75	-1.8
912,286	-				-1.0
912,286	-				-0.3
912,297	+				-0.5
912,298	-				+0.2
912,332	+				-1.7
912,333	-				-0.8
912,346	+				-0.5
912,346	+				-1.0
912,346	+				-0.8
912,346	+				-0.1
912,346	+				+0.4
912,346	+				+0.4
912,346	+				-0.3
912,347	-				+0.4
912,347	-				+0.7
912,347	-				-0.7
912,347	-				-0.2
912,347	-				+0.2
912,347	-				-0.6
912,347	-				+0.4
912,350	+				-0.1
912,350	+				+2.2
912,350	+				+2.2
912,350	+				+2.2
912,350	+				+0.2
912,350	+				-0.3
912,350	+				-1.2
912,350	+				+1.5
912,350	+				+1.2
912,350	+				+0.8
912,350	+				-0.6
912,350	+				+0.8
912,350	+				-1.0
912,350	+				+0.0
912,350	+				-0.7
912,350	+				-0.5
912,350	+				-0.1
912,351	-				+0.2
912,351	-				-1.5
912,351	-				+0.2
912,351	-				-0.8
912,351	-				+0.2
912,351	-				-0.7
912,351	-				+0.4
912,351	-				+0.3
912,351	-				+0.3
912,351	-				+0.6
912,351	-				+0.9
912,354	+				-0.4
912,354	+				-0.3
912,355	-				-1.0
912,355	-				-1.7
912,355	-				-1.1
912,355	-				-0.6
912,418	+		IAI47_04345	0.19	+0.2
912,419	-		IAI47_04345	0.19	-0.1
912,419	-		IAI47_04345	0.19	-0.1
912,424	+		IAI47_04345	0.21	+1.2
912,424	+		IAI47_04345	0.21	+1.2
912,425	-		IAI47_04345	0.21	-0.7
912,430	+		IAI47_04345	0.22	-0.5
912,430	+		IAI47_04345	0.22	-0.7
912,430	+		IAI47_04345	0.22	-1.0
912,430	+		IAI47_04345	0.22	+0.7
912,430	+		IAI47_04345	0.22	+0.5
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+2.1
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+0.1
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-0.1
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+0.4
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+1.7
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-0.5
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+0.3
912,456	+		IAI47_04345	0.28	-0.5
912,457	-		IAI47_04345	0.28	+1.3
912,470	-		IAI47_04345	0.31	-0.1
912,470	-		IAI47_04345	0.31	-2.6
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-0.7
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+0.0
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-0.3
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-0.3
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+2.4
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-0.6
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+0.5
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+0.6
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+0.6
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-0.3
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+0.7
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+0.5
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+0.2
912,535	+		IAI47_04345	0.46	-0.0
912,535	+		IAI47_04345	0.46	-1.1
912,604	+		IAI47_04345	0.62	-0.7
912,605	-		IAI47_04345	0.63	+1.5
912,605	-		IAI47_04345	0.63	-0.1
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+2.1
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-1.4
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-2.2
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+1.7
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-0.3
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-0.1
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+0.7
912,626	-		IAI47_04345	0.68	-1.1
912,626	-		IAI47_04345	0.68	+0.8
912,626	-		IAI47_04345	0.68	-0.0
912,626	-		IAI47_04345	0.68	-1.6
912,658	+		IAI47_04345	0.75	-2.8
912,658	+		IAI47_04345	0.75	+1.5
912,659	-		IAI47_04345	0.75	-0.8
912,659	-		IAI47_04345	0.75	-0.9
912,682	+		IAI47_04345	0.81	-1.2
912,682	+		IAI47_04345	0.81	-2.0
912,682	+		IAI47_04345	0.81	+2.2
912,683	-		IAI47_04345	0.81	-1.7
912,714	+		IAI47_04345	0.88	+2.1
912,714	+		IAI47_04345	0.88	+1.9
912,714	+		IAI47_04345	0.88	-0.6
912,714	+		IAI47_04345	0.88	-0.7
912,715	-		IAI47_04345	0.88	+1.2
912,715	-		IAI47_04345	0.88	-0.1
912,715	-		IAI47_04345	0.88	-0.0
912,715	-		IAI47_04345	0.88	+0.2
912,715	-		IAI47_04345	0.88	+1.1
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