Strain Fitness in Pantoea sp. MT58 around IAI47_00025

Experiment: Survival; Treatment=FW106 (pH3.9) with 1 mM Glucose; TreatmentDuration=24hrs; Outgrowth=LBkan50

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Survival; Treatment=FW106 (pH3.9) with 1 mM Glucose; TreatmentDuration=24hrs; Outgrowth=LBkan50
5,768	+				-0.5
5,768	+				-0.2
5,772	+				+1.1
5,772	+				+0.8
5,773	-				+1.2
5,788	+				-0.2
5,789	-				-2.4
5,789	-				+1.1
5,789	-				-0.1
5,884	+				+1.0
5,885	-				-0.3
5,902	+				+1.1
5,903	-				-0.1
5,903	-				+0.4
5,996	+				+0.0
5,997	-				+0.4
6,006	+				-1.1
6,006	+				+0.6
6,006	+				-1.4
6,006	+				+1.7
6,020	+				-0.0
6,031	+				-0.0
6,031	+				-1.8
6,031	+				+0.1
6,031	+				-0.6
6,031	+				-1.0
6,031	+				-1.6
6,031	+				+0.0
6,031	+				-1.7
6,031	+				-1.5
6,031	+				-1.6
6,031	+				-0.4
6,031	+				+0.4
6,031	+				-0.3
6,031	+				+0.1
6,031	+				-0.3
6,031	+				-0.5
6,032	-				+0.6
6,032	-				-1.9
6,032	-				+0.9
6,032	-				+0.6
6,032	-				-3.3
6,032	-				-0.5
6,032	-				+0.1
6,032	-				-1.7
6,032	-				-0.7
6,032	-				-0.6
6,032	-				-0.2
6,032	-				-1.2
6,032	-				+1.2
6,032	-				-0.8
6,032	-				+0.1
6,032	-				-1.6
6,032	-				-0.8
6,032	-				+1.3
6,032	-				-0.1
6,032	-				+0.3
6,032	-				+0.7
6,032	-				-1.2
6,032	-				-0.6
6,038	-				+0.7
6,038	-				+1.7
6,038	-				-1.7
6,040	+				-1.2
6,040	+				-0.0
6,040	+				-1.3
6,040	+				-2.9
6,040	+				-1.0
6,041	-				-2.4
6,041	-				-1.0
6,188	+		IAI47_00025	0.19	+0.7
6,189	-		IAI47_00025	0.19	+0.3
6,189	-		IAI47_00025	0.19	-0.5
6,205	+		IAI47_00025	0.21	+0.7
6,206	-		IAI47_00025	0.21	+0.1
6,224	+		IAI47_00025	0.24	+2.0
6,225	-		IAI47_00025	0.24	+0.1
6,225	-		IAI47_00025	0.24	+1.8
6,231	+		IAI47_00025	0.25	-0.5
6,231	+		IAI47_00025	0.25	-1.9
6,232	-		IAI47_00025	0.25	-1.7
6,308	+		IAI47_00025	0.34	+0.1
6,308	+		IAI47_00025	0.34	-0.8
6,308	+		IAI47_00025	0.34	-0.6
6,308	+		IAI47_00025	0.34	+0.4
6,309	-		IAI47_00025	0.34	+0.7
6,309	-		IAI47_00025	0.34	+0.1
6,309	-		IAI47_00025	0.34	-1.8
6,309	-		IAI47_00025	0.34	-0.3
6,309	-		IAI47_00025	0.34	-0.9
6,309	-		IAI47_00025	0.34	-0.9
6,314	+		IAI47_00025	0.35	-0.7
6,314	+		IAI47_00025	0.35	-2.9
6,314	+		IAI47_00025	0.35	+0.1
6,314	+		IAI47_00025	0.35	+0.2
6,314	+		IAI47_00025	0.35	+1.2
6,314	+		IAI47_00025	0.35	+0.8
6,314	+		IAI47_00025	0.35	+0.1
6,314	+		IAI47_00025	0.35	-2.3
6,315	-		IAI47_00025	0.35	-1.3
6,315	-		IAI47_00025	0.35	+1.0
6,315	-		IAI47_00025	0.35	-0.5
6,315	-		IAI47_00025	0.35	-0.3
6,315	-		IAI47_00025	0.35	-2.1
6,315	-		IAI47_00025	0.35	+1.5
6,315	-		IAI47_00025	0.35	+1.5
6,375	+		IAI47_00025	0.42	+0.8
6,375	+		IAI47_00025	0.42	+0.1
6,375	+		IAI47_00025	0.42	+0.1
6,375	+		IAI47_00025	0.42	+0.3
6,375	+		IAI47_00025	0.42	-1.4
6,375	+		IAI47_00025	0.42	-0.3
6,375	+		IAI47_00025	0.42	+0.4
6,375	+		IAI47_00025	0.42	-0.2
6,375	+		IAI47_00025	0.42	-0.2
6,375	+		IAI47_00025	0.42	+1.5
6,375	+		IAI47_00025	0.42	-0.8
6,375	+		IAI47_00025	0.42	-0.9
6,375	+		IAI47_00025	0.42	-2.0
6,375	+		IAI47_00025	0.42	-1.8
6,375	+		IAI47_00025	0.42	+0.3
6,376	-		IAI47_00025	0.42	-1.3
6,376	-		IAI47_00025	0.42	+0.8
6,376	-		IAI47_00025	0.42	-2.5
6,376	-		IAI47_00025	0.42	+0.2
6,376	-		IAI47_00025	0.42	+1.0
6,376	-		IAI47_00025	0.42	-1.9
6,376	-		IAI47_00025	0.42	-1.4
6,376	-		IAI47_00025	0.42	+0.5
6,376	-		IAI47_00025	0.42	+0.2
6,376	-		IAI47_00025	0.42	+1.3
6,376	-		IAI47_00025	0.42	-0.7
6,376	-		IAI47_00025	0.42	-0.7
6,377	+		IAI47_00025	0.43	+1.7
6,377	+		IAI47_00025	0.43	-0.8
6,377	+		IAI47_00025	0.43	-1.2
6,377	+		IAI47_00025	0.43	-1.6
6,377	+		IAI47_00025	0.43	-1.0
6,377	+		IAI47_00025	0.43	-1.6
6,377	+		IAI47_00025	0.43	+1.3
6,377	+		IAI47_00025	0.43	+0.1
6,377	+		IAI47_00025	0.43	-0.1
6,377	+		IAI47_00025	0.43	-2.5
6,377	+		IAI47_00025	0.43	-0.6
6,377	+		IAI47_00025	0.43	+0.8
6,378	-		IAI47_00025	0.43	-1.5
6,378	-		IAI47_00025	0.43	+0.7
6,378	-		IAI47_00025	0.43	-0.5
6,378	-		IAI47_00025	0.43	+0.1
6,378	-		IAI47_00025	0.43	-0.9
6,378	-		IAI47_00025	0.43	-2.6
6,388	+		IAI47_00025	0.44	+0.7
6,388	+		IAI47_00025	0.44	-0.8
6,389	-		IAI47_00025	0.44	-1.1
6,404	+		IAI47_00025	0.46	+0.1
6,404	+		IAI47_00025	0.46	-1.5
6,404	+		IAI47_00025	0.46	+0.1
6,404	+		IAI47_00025	0.46	-0.9
6,404	+		IAI47_00025	0.46	+0.0
6,405	-		IAI47_00025	0.46	-0.2
6,405	-		IAI47_00025	0.46	-1.5
6,405	-		IAI47_00025	0.46	+1.9
6,405	-		IAI47_00025	0.46	-1.5
6,405	-		IAI47_00025	0.46	+0.4
6,405	-		IAI47_00025	0.46	-1.5
6,405	-		IAI47_00025	0.46	+0.4
6,563	+		IAI47_00025	0.66	-1.6
6,563	+		IAI47_00025	0.66	-0.9
6,563	+		IAI47_00025	0.66	-1.2
6,563	+		IAI47_00025	0.66	-1.3
6,563	+		IAI47_00025	0.66	-1.1
6,563	+		IAI47_00025	0.66	-0.8
6,563	+		IAI47_00025	0.66	-2.2
6,563	+		IAI47_00025	0.66	+1.5
6,563	+		IAI47_00025	0.66	+1.4
6,564	-		IAI47_00025	0.66	+0.5
6,564	-		IAI47_00025	0.66	-1.0
6,564	-		IAI47_00025	0.66	-0.5
6,564	-		IAI47_00025	0.66	+0.7
6,564	-		IAI47_00025	0.66	-0.6
6,564	-		IAI47_00025	0.66	+1.0
6,564	-		IAI47_00025	0.66	+0.1
6,564	-		IAI47_00025	0.66	-1.9
6,564	-		IAI47_00025	0.66	-0.6
6,564	-		IAI47_00025	0.66	-0.1
6,565	+		IAI47_00025	0.66	-0.4
6,565	+		IAI47_00025	0.66	-1.2
6,565	+		IAI47_00025	0.66	-1.3
6,565	+		IAI47_00025	0.66	+1.9
6,565	+		IAI47_00025	0.66	-0.7
6,565	+		IAI47_00025	0.66	-0.6
6,565	+		IAI47_00025	0.66	-0.8
6,565	+		IAI47_00025	0.66	+0.1
6,566	-		IAI47_00025	0.66	-0.3
6,566	-		IAI47_00025	0.66	-0.7
6,566	-		IAI47_00025	0.66	+0.4
6,566	-		IAI47_00025	0.66	-2.5
6,566	-		IAI47_00025	0.66	+2.0
6,566	-		IAI47_00025	0.66	-0.4
6,566	-		IAI47_00025	0.66	-1.8
6,566	-		IAI47_00025	0.66	+0.2
6,566	-		IAI47_00025	0.66	+0.3
6,566	-		IAI47_00025	0.66	+1.2
6,566	-		IAI47_00025	0.66	-1.8
6,566	-		IAI47_00025	0.66	-0.2
6,566	-		IAI47_00025	0.66	-0.6
6,566	-		IAI47_00025	0.66	-3.3
6,566	-		IAI47_00025	0.66	+0.6
6,566	-		IAI47_00025	0.66	+1.0
6,566	-		IAI47_00025	0.66	-0.6
6,587	+		IAI47_00025	0.69	+0.7
6,587	+		IAI47_00025	0.69	+0.3
6,587	+		IAI47_00025	0.69	+1.8
6,588	-		IAI47_00025	0.69	-0.2
6,588	-		IAI47_00025	0.69	+0.1
6,588	-		IAI47_00025	0.69	-1.6
6,590	+		IAI47_00025	0.69	-1.7
6,590	+		IAI47_00025	0.69	-0.0
6,590	+		IAI47_00025	0.69	+3.7
6,590	+		IAI47_00025	0.69	-1.0
6,590	+		IAI47_00025	0.69	-0.4
6,590	+		IAI47_00025	0.69	-0.6
6,590	+		IAI47_00025	0.69	-0.8
6,591	-		IAI47_00025	0.69	+0.1
6,591	-		IAI47_00025	0.69	+1.3
6,591	-		IAI47_00025	0.69	-2.3
6,661	+		IAI47_00025	0.78	-0.4
6,661	+		IAI47_00025	0.78	-2.3
6,661	+		IAI47_00025	0.78	+0.8
6,662	-		IAI47_00025	0.78	+0.7
6,662	-		IAI47_00025	0.78	+3.0
6,662	-		IAI47_00025	0.78	+0.3
6,763	+				+1.8
6,831	+				+1.9
6,831	+				-0.4
6,831	+				+0.7
6,832	-				+0.3
6,832	-				-0.5
6,832	-				+0.3
6,832	-				-0.8
6,832	-				-1.4
6,832	-				+0.1
6,832	-				-1.5
6,839	+				-0.4
6,839	+				-0.9
6,839	+				+0.3
6,839	+				+0.6
6,839	+				-0.6
6,840	-				-1.5
6,840	-				-1.6
6,888	+				+0.4
6,981	-				+0.9
7,015	+				+0.9
7,015	+				+0.8
7,016	-				-1.6
7,023	+				-1.0
7,023	+				-0.3
7,023	+				+2.0
7,023	+				+2.6
7,024	-				-1.4
7,024	-				-2.6
7,024	-				-0.6
7,024	-				+0.5
7,024	-				+1.7
7,085	+				-1.0
7,086	+				+0.2
7,086	+				+1.4
7,086	+				-0.9
7,086	+				-0.2
7,086	+				-0.4
7,087	-				-0.8
7,087	-				-0.8
7,087	-				-0.6
7,087	-				-1.6
7,179	+		IAI47_00030	0.18	-0.3
7,179	+		IAI47_00030	0.18	+0.6
7,179	+		IAI47_00030	0.18	-1.9
7,180	-		IAI47_00030	0.18	-1.1
7,180	-		IAI47_00030	0.18	+1.5
7,180	-		IAI47_00030	0.18	+0.1
7,180	-		IAI47_00030	0.18	-1.6
7,180	-		IAI47_00030	0.18	-0.5
7,180	-		IAI47_00030	0.18	+2.8
7,191	+		IAI47_00030	0.20	+0.5
7,191	+		IAI47_00030	0.20	+0.5
7,191	+		IAI47_00030	0.20	+1.1
7,192	-		IAI47_00030	0.20	+2.7
7,192	-		IAI47_00030	0.20	-0.9
7,192	-		IAI47_00030	0.20	+1.3
7,217	+		IAI47_00030	0.23	+1.0
7,288	+		IAI47_00030	0.33	-0.2
7,288	+		IAI47_00030	0.33	-0.9
7,289	-		IAI47_00030	0.34	+0.8
7,289	-		IAI47_00030	0.34	-2.2
7,447	+		IAI47_00030	0.56	+1.7
7,447	+		IAI47_00030	0.56	+0.3
7,447	+		IAI47_00030	0.56	+0.0
7,447	+		IAI47_00030	0.56	+0.5
7,447	+		IAI47_00030	0.56	+1.7
7,447	+		IAI47_00030	0.56	+0.8
7,447	+		IAI47_00030	0.56	+0.6
7,447	+		IAI47_00030	0.56	+0.6
7,447	+		IAI47_00030	0.56	+1.4
7,447	+		IAI47_00030	0.56	+0.6
7,448	-		IAI47_00030	0.56	+0.7
7,448	-		IAI47_00030	0.56	-1.4
7,448	-		IAI47_00030	0.56	-1.1
7,448	-		IAI47_00030	0.56	-0.3
7,448	-		IAI47_00030	0.56	-2.5
7,448	-		IAI47_00030	0.56	+0.4
7,448	-		IAI47_00030	0.56	+1.0
7,448	-		IAI47_00030	0.56	+0.2
7,449	+		IAI47_00030	0.57	-0.7
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7,449	+		IAI47_00030	0.57	-1.1
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