Strain Fitness in Pantoea sp. MT58 around IAI47_04350

Experiment: Survival; Treatment=FW106 (pH3.9) with 1 mM Glucose; TreatmentDuration=24hrs; Outgrowth=LBkan50

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Survival; Treatment=FW106 (pH3.9) with 1 mM Glucose; TreatmentDuration=24hrs; Outgrowth=LBkan50
911,805	+				-0.8
911,806	-				-0.6
911,826	+				-0.3
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+1.0
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-0.4
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+1.0
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+0.1
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-1.5
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+0.6
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-0.8
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-3.3
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.2
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-1.2
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-0.4
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.8
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+1.6
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-1.1
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-1.0
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-0.9
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.3
911,910	+		IAI47_04340	0.24	-1.9
912,047	+		IAI47_04340	0.48	+0.1
912,048	-		IAI47_04340	0.49	-0.0
912,067	+		IAI47_04340	0.52	-0.7
912,067	+		IAI47_04340	0.52	-3.4
912,084	+		IAI47_04340	0.55	+1.5
912,084	+		IAI47_04340	0.55	+0.4
912,085	-		IAI47_04340	0.55	-1.1
912,085	-		IAI47_04340	0.55	+0.1
912,085	-		IAI47_04340	0.55	+0.4
912,085	-		IAI47_04340	0.55	-1.7
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+2.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-1.8
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+1.7
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+1.6
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+1.2
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.6
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.3
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.2
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.8
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-2.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.8
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+2.6
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+2.0
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-2.0
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+1.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+2.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.2
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.6
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.5
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.8
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.2
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.2
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.8
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.9
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.6
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.0
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.7
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.9
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-2.3
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.9
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.9
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.8
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.7
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.0
912,128	+		IAI47_04340	0.63	-0.1
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+0.3
912,185	+		IAI47_04340	0.73	-0.2
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+1.0
912,185	+		IAI47_04340	0.73	-1.7
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+1.0
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-0.4
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-2.4
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+1.2
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-0.6
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-1.4
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+0.6
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-1.6
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-0.6
912,195	+		IAI47_04340	0.74	-1.0
912,196	-		IAI47_04340	0.75	-0.2
912,196	-		IAI47_04340	0.75	-1.5
912,196	-		IAI47_04340	0.75	-0.2
912,286	-				-1.6
912,286	-				+0.7
912,297	+				+0.2
912,298	-				+0.2
912,332	+				-0.0
912,333	-				-0.8
912,346	+				+0.2
912,346	+				-0.9
912,346	+				+0.5
912,346	+				-0.6
912,346	+				-0.9
912,346	+				+0.4
912,346	+				+0.9
912,347	-				-1.6
912,347	-				+2.3
912,347	-				+0.7
912,347	-				-0.6
912,347	-				-0.8
912,347	-				+1.4
912,347	-				-2.8
912,350	+				+1.2
912,350	+				+0.1
912,350	+				-1.1
912,350	+				+0.3
912,350	+				-0.0
912,350	+				+0.8
912,350	+				+1.2
912,350	+				-0.0
912,350	+				+1.2
912,350	+				-0.2
912,350	+				+0.4
912,350	+				+0.5
912,350	+				+0.1
912,350	+				+0.6
912,350	+				+0.5
912,350	+				-0.1
912,350	+				-1.7
912,351	-				-0.2
912,351	-				+0.1
912,351	-				+1.9
912,351	-				-1.2
912,351	-				-0.8
912,351	-				+0.3
912,351	-				-1.1
912,351	-				-2.0
912,351	-				-0.4
912,351	-				-1.1
912,351	-				-0.0
912,354	+				+1.8
912,354	+				-0.2
912,355	-				-0.7
912,355	-				+1.6
912,355	-				+1.8
912,355	-				-0.6
912,418	+		IAI47_04345	0.19	+0.8
912,419	-		IAI47_04345	0.19	+0.5
912,419	-		IAI47_04345	0.19	-1.0
912,424	+		IAI47_04345	0.21	+3.5
912,424	+		IAI47_04345	0.21	+0.0
912,425	-		IAI47_04345	0.21	-0.7
912,430	+		IAI47_04345	0.22	+0.5
912,430	+		IAI47_04345	0.22	+1.2
912,430	+		IAI47_04345	0.22	-0.9
912,430	+		IAI47_04345	0.22	-0.6
912,430	+		IAI47_04345	0.22	+0.1
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+0.1
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-2.5
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-0.9
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-0.0
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+1.0
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+0.1
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-1.2
912,456	+		IAI47_04345	0.28	-1.0
912,457	-		IAI47_04345	0.28	-0.2
912,470	-		IAI47_04345	0.31	+0.2
912,470	-		IAI47_04345	0.31	-1.6
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+1.5
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-0.1
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-0.9
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+1.0
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-0.6
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-0.6
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-0.5
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-0.9
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+1.4
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-0.2
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-0.9
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+0.8
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+1.0
912,535	+		IAI47_04345	0.46	+0.7
912,535	+		IAI47_04345	0.46	+0.7
912,604	+		IAI47_04345	0.62	+0.6
912,605	-		IAI47_04345	0.63	-0.8
912,605	-		IAI47_04345	0.63	-0.4
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+1.6
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-1.4
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-0.6
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+1.3
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-0.2
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+0.9
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+2.0
912,626	-		IAI47_04345	0.68	-1.0
912,626	-		IAI47_04345	0.68	-1.0
912,626	-		IAI47_04345	0.68	+1.6
912,626	-		IAI47_04345	0.68	-0.4
912,658	+		IAI47_04345	0.75	-1.8
912,658	+		IAI47_04345	0.75	+2.8
912,659	-		IAI47_04345	0.75	-0.8
912,659	-		IAI47_04345	0.75	-2.5
912,682	+		IAI47_04345	0.81	+0.6
912,682	+		IAI47_04345	0.81	-0.9
912,682	+		IAI47_04345	0.81	+2.2
912,683	-		IAI47_04345	0.81	+0.6
912,714	+		IAI47_04345	0.88	+1.8
912,714	+		IAI47_04345	0.88	-1.0
912,714	+		IAI47_04345	0.88	-0.6
912,714	+		IAI47_04345	0.88	+0.9
912,715	-		IAI47_04345	0.88	-1.3
912,715	-		IAI47_04345	0.88	-1.7
912,715	-		IAI47_04345	0.88	-0.0
912,715	-		IAI47_04345	0.88	+0.2
912,715	-		IAI47_04345	0.88	-0.0
912,716	+		IAI47_04345	0.89	-0.7
912,716	+		IAI47_04345	0.89	+0.2
912,716	+		IAI47_04345	0.89	-0.4
912,716	+		IAI47_04345	0.89	+0.6
912,716	+		IAI47_04345	0.89	+0.7
912,716	+		IAI47_04345	0.89	-1.1
912,717	-		IAI47_04345	0.89	+0.9
912,717	-		IAI47_04345	0.89	+0.8
912,717	-		IAI47_04345	0.89	+1.6
912,717	-		IAI47_04345	0.89	+2.1
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-3.1
912,717	-		IAI47_04345	0.89	+0.2
912,717	-		IAI47_04345	0.89	+3.2
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-1.1
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-0.0
912,717	-		IAI47_04345	0.89	+0.1
912,739	+				+0.8
912,739	+				+0.2
912,739	+				-0.3
912,739	+				+1.3
912,739	+				-0.1
912,740	-				-0.2
912,740	-				+0.0
912,740	-				-1.1
912,746	+				-0.3
912,747	-				-2.0
912,747	-				+0.0
912,747	-				-0.4
912,795	+				-0.5
912,795	+				+0.4
912,795	+				+1.9
912,795	+				-0.0
912,795	+				+0.8
912,795	+				+1.0
912,796	-				+0.2
912,796	-				+0.9
912,796	-				-1.6
912,796	-				-0.6
912,810	+				-1.3
912,818	+				-1.3
912,818	+				+1.6
912,851	+				+2.0
912,851	+				+1.2
912,852	-				-1.3
912,855	+				+1.1
912,855	+				+0.3
912,856	-				-0.0
912,856	-				-1.6
912,856	-				+1.9
912,863	+				-3.2
913,071	+		IAI47_04350	0.17	+1.0
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-0.0
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-0.9
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-0.0
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-1.8
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-2.0
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-1.1
913,071	+		IAI47_04350	0.17	+1.6
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-0.9
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-0.9
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-1.6
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-1.9
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-1.5
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-0.5
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-1.8
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-1.3
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-2.7
913,146	+		IAI47_04350	0.22	-1.2
913,146	+		IAI47_04350	0.22	-2.0
913,147	-		IAI47_04350	0.22	+0.4
913,147	-		IAI47_04350	0.22	-1.1
913,176	+		IAI47_04350	0.24	+0.1
913,176	+		IAI47_04350	0.24	+0.4
913,177	-		IAI47_04350	0.24	-1.2
913,193	-		IAI47_04350	0.25	-0.0
913,213	-		IAI47_04350	0.26	-2.4
913,288	+		IAI47_04350	0.31	-0.1
913,289	-		IAI47_04350	0.31	-0.7
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