Strain Fitness in Pantoea sp. MT58 around IAI47_04350

Experiment: Survival; Treatment=FW300 (pH7.4) with 1 mM Glucose and 0 mM NaH2PO4 and 2 mg/mL CCCP; TreatmentDuration=24hrs; Outgrowth=LBkan50

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Survival; Treatment=FW300 (pH7.4) with 1 mM Glucose and 0 mM NaH2PO4 and 2 mg/mL CCCP; TreatmentDuration=24hrs; Outgrowth=LBkan50
911,805	+				+1.5
911,806	-				-1.4
911,826	+				+0.3
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-0.9
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+0.1
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-0.2
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-1.2
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-1.7
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+0.3
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-1.8
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-1.4
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.5
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-2.1
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-1.9
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-1.2
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-1.1
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-1.5
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-2.3
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-1.5
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+1.0
911,910	+		IAI47_04340	0.24	-1.6
912,047	+		IAI47_04340	0.48	-1.0
912,048	-		IAI47_04340	0.49	-0.7
912,067	+		IAI47_04340	0.52	+1.2
912,067	+		IAI47_04340	0.52	-1.5
912,084	+		IAI47_04340	0.55	-0.6
912,084	+		IAI47_04340	0.55	-0.0
912,085	-		IAI47_04340	0.55	+1.6
912,085	-		IAI47_04340	0.55	-0.7
912,085	-		IAI47_04340	0.55	+1.0
912,085	-		IAI47_04340	0.55	+0.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.2
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-3.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-2.6
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.2
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.6
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-2.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-1.3
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.7
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.5
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.6
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.6
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-3.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.3
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.2
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-2.0
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.6
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.1
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.3
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.3
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.1
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+1.4
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+1.2
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.6
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.4
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+2.4
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.9
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.4
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.8
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.4
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.9
912,128	+		IAI47_04340	0.63	-1.1
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+1.1
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+3.9
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+0.7
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+0.0
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+0.7
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+2.4
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+2.4
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+1.0
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+0.6
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-1.1
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-1.6
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-0.6
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+0.0
912,195	+		IAI47_04340	0.74	+0.8
912,196	-		IAI47_04340	0.75	-0.9
912,196	-		IAI47_04340	0.75	-1.4
912,196	-		IAI47_04340	0.75	+0.9
912,286	-				+1.1
912,286	-				-1.3
912,297	+				-0.5
912,298	-				+1.8
912,332	+				+1.4
912,333	-				-0.0
912,346	+				+0.2
912,346	+				+0.1
912,346	+				-0.8
912,346	+				-0.5
912,346	+				+0.3
912,346	+				+0.7
912,346	+				-0.3
912,347	-				-0.7
912,347	-				-1.3
912,347	-				-1.0
912,347	-				+1.0
912,347	-				-2.6
912,347	-				+0.1
912,347	-				+1.2
912,350	+				-0.1
912,350	+				-0.0
912,350	+				-1.7
912,350	+				-0.3
912,350	+				-0.9
912,350	+				+0.8
912,350	+				-1.7
912,350	+				-0.9
912,350	+				+0.1
912,350	+				-0.9
912,350	+				+0.9
912,350	+				+0.7
912,350	+				-0.9
912,350	+				-0.7
912,350	+				+0.8
912,350	+				+0.2
912,350	+				+0.1
912,351	-				+0.1
912,351	-				+0.2
912,351	-				+1.2
912,351	-				-1.2
912,351	-				-1.4
912,351	-				-2.3
912,351	-				-0.8
912,351	-				+0.5
912,351	-				-2.4
912,351	-				+0.5
912,351	-				+1.6
912,354	+				+2.7
912,354	+				-0.8
912,355	-				+1.7
912,355	-				-1.9
912,355	-				+0.3
912,355	-				-1.2
912,418	+		IAI47_04345	0.19	-0.1
912,419	-		IAI47_04345	0.19	+0.2
912,419	-		IAI47_04345	0.19	+1.3
912,424	+		IAI47_04345	0.21	+4.8
912,424	+		IAI47_04345	0.21	+1.4
912,425	-		IAI47_04345	0.21	-1.1
912,430	+		IAI47_04345	0.22	+2.8
912,430	+		IAI47_04345	0.22	+1.3
912,430	+		IAI47_04345	0.22	+0.3
912,430	+		IAI47_04345	0.22	-2.3
912,430	+		IAI47_04345	0.22	+0.4
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-3.3
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+1.5
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-0.3
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+0.5
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+0.2
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-1.5
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+1.9
912,456	+		IAI47_04345	0.28	-1.4
912,457	-		IAI47_04345	0.28	-1.8
912,470	-		IAI47_04345	0.31	-0.1
912,470	-		IAI47_04345	0.31	-0.7
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+0.9
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+0.1
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+2.9
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-2.6
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-1.6
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+0.2
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-1.9
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-1.9
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+1.2
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+2.0
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-0.3
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-0.2
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+0.9
912,535	+		IAI47_04345	0.46	-1.6
912,535	+		IAI47_04345	0.46	+0.5
912,604	+		IAI47_04345	0.62	+0.6
912,605	-		IAI47_04345	0.63	-0.9
912,605	-		IAI47_04345	0.63	+0.4
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+0.1
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-1.2
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+0.2
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+0.7
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+1.9
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-0.4
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-0.2
912,626	-		IAI47_04345	0.68	-2.1
912,626	-		IAI47_04345	0.68	+0.7
912,626	-		IAI47_04345	0.68	-0.0
912,626	-		IAI47_04345	0.68	-0.2
912,658	+		IAI47_04345	0.75	-0.7
912,658	+		IAI47_04345	0.75	+0.5
912,659	-		IAI47_04345	0.75	+0.1
912,659	-		IAI47_04345	0.75	+0.4
912,682	+		IAI47_04345	0.81	-0.3
912,682	+		IAI47_04345	0.81	-2.6
912,682	+		IAI47_04345	0.81	-0.9
912,683	-		IAI47_04345	0.81	-2.9
912,714	+		IAI47_04345	0.88	+1.4
912,714	+		IAI47_04345	0.88	-2.1
912,714	+		IAI47_04345	0.88	+1.3
912,714	+		IAI47_04345	0.88	-2.4
912,715	-		IAI47_04345	0.88	+2.8
912,715	-		IAI47_04345	0.88	-2.4
912,715	-		IAI47_04345	0.88	-0.6
912,715	-		IAI47_04345	0.88	+0.2
912,715	-		IAI47_04345	0.88	-0.4
912,716	+		IAI47_04345	0.89	-1.0
912,716	+		IAI47_04345	0.89	+0.2
912,716	+		IAI47_04345	0.89	+0.3
912,716	+		IAI47_04345	0.89	-1.5
912,716	+		IAI47_04345	0.89	+0.1
912,716	+		IAI47_04345	0.89	+2.1
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-1.8
912,717	-		IAI47_04345	0.89	+0.1
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-0.3
912,717	-		IAI47_04345	0.89	+0.7
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-0.9
912,717	-		IAI47_04345	0.89	+1.6
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-1.4
912,717	-		IAI47_04345	0.89	+1.6
912,717	-		IAI47_04345	0.89	+3.0
912,717	-		IAI47_04345	0.89	-1.2
912,739	+				-1.9
912,739	+				-1.2
912,739	+				-0.1
912,739	+				-0.2
912,739	+				+0.5
912,740	-				-3.3
912,740	-				+0.7
912,740	-				-0.6
912,746	+				+1.2
912,747	-				-2.6
912,747	-				-2.4
912,747	-				-0.8
912,795	+				+0.9
912,795	+				+1.1
912,795	+				+1.2
912,795	+				+0.1
912,795	+				-2.0
912,795	+				+0.4
912,796	-				-0.9
912,796	-				-0.6
912,796	-				+1.2
912,796	-				+0.0
912,810	+				+3.2
912,818	+				+0.9
912,818	+				-1.6
912,851	+				-1.3
912,851	+				+0.4
912,852	-				-1.9
912,855	+				-1.9
912,855	+				-1.4
912,856	-				+1.2
912,856	-				-0.3
912,856	-				-1.2
912,863	+				-1.2
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-1.4
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-1.4
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-1.5
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-1.4
913,071	+		IAI47_04350	0.17	+1.6
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-0.2
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-1.9
913,071	+		IAI47_04350	0.17	-0.9
913,072	-		IAI47_04350	0.17	+0.6
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-2.5
913,072	-		IAI47_04350	0.17	+0.5
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-1.3
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-1.9
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-3.4
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-0.9
913,072	-		IAI47_04350	0.17	-1.9
913,072	-		IAI47_04350	0.17	+0.7
913,146	+		IAI47_04350	0.22	-2.1
913,146	+		IAI47_04350	0.22	-0.5
913,147	-		IAI47_04350	0.22	+1.1
913,147	-		IAI47_04350	0.22	+0.1
913,176	+		IAI47_04350	0.24	-2.7
913,176	+		IAI47_04350	0.24	+3.0
913,177	-		IAI47_04350	0.24	-1.3
913,193	-		IAI47_04350	0.25	+2.6
913,213	-		IAI47_04350	0.26	-0.5
913,288	+		IAI47_04350	0.31	-2.9
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914,932	+		IAI47_04355	0.73	-1.1
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