Strain Fitness in Pantoea sp. MT58 around IAI47_04765

Experiment: Survival; Treatment=UGA synthetic gw pH7.4 with 1 mM Glucose and 0 mM NaH2PO4; TreatmentDuration=24hrs; Outgrowth=LBkan50

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Survival; Treatment=UGA synthetic gw pH7.4 with 1 mM Glucose and 0 mM NaH2PO4; TreatmentDuration=24hrs; Outgrowth=LBkan50
1,000,899	-				+0.7
1,000,899	-				-0.6
1,000,926	+				+1.1
1,000,926	+				+2.2
1,000,927	-				+0.7
1,000,927	-				-0.9
1,000,942	-				-0.6
1,000,965	-				+0.7
1,000,974	-				+0.5
1,000,974	-				+0.6
1,000,977	+				-0.3
1,001,001	+				-0.5
1,001,015	+				-2.4
1,001,015	+				+0.7
1,001,015	+				+0.1
1,001,016	-				+0.7
1,001,016	-				+1.3
1,001,016	-				-1.9
1,001,016	-				+0.1
1,001,016	-				+0.7
1,001,016	-				-1.1
1,001,016	-				+0.2
1,001,017	+				+0.0
1,001,017	+				-1.7
1,001,017	+				+1.5
1,001,017	+				+2.9
1,001,018	-				+0.4
1,001,018	-				-0.7
1,001,018	-				+1.2
1,001,018	-				+1.2
1,001,026	+				+0.9
1,001,027	-				-1.3
1,001,115	-				+0.6
1,001,115	-				+1.7
1,001,139	+				+0.1
1,001,139	+				+1.5
1,001,140	-				+0.4
1,001,143	+				-0.9
1,001,223	-				+0.2
1,001,223	-				-0.5
1,001,241	+		IAI47_04760	0.11	-0.3
1,001,241	+		IAI47_04760	0.11	-1.6
1,001,241	+		IAI47_04760	0.11	-0.6
1,001,241	+		IAI47_04760	0.11	+0.1
1,001,242	-		IAI47_04760	0.11	+1.2
1,001,242	-		IAI47_04760	0.11	+1.5
1,001,242	-		IAI47_04760	0.11	-0.0
1,001,243	+		IAI47_04760	0.12	+0.9
1,001,261	+		IAI47_04760	0.14	-0.8
1,001,262	-		IAI47_04760	0.14	-1.3
1,001,263	+		IAI47_04760	0.14	+0.7
1,001,263	+		IAI47_04760	0.14	-0.7
1,001,263	+		IAI47_04760	0.14	+0.8
1,001,263	+		IAI47_04760	0.14	+0.5
1,001,263	+		IAI47_04760	0.14	-0.1
1,001,264	-		IAI47_04760	0.15	+0.1
1,001,264	-		IAI47_04760	0.15	-0.3
1,001,264	-		IAI47_04760	0.15	+0.2
1,001,264	-		IAI47_04760	0.15	-1.1
1,001,360	+		IAI47_04760	0.28	+4.9
1,001,360	+		IAI47_04760	0.28	+1.6
1,001,361	-		IAI47_04760	0.28	-1.0
1,001,361	-		IAI47_04760	0.28	+1.6
1,001,435	+		IAI47_04760	0.38	+0.9
1,001,435	+		IAI47_04760	0.38	+1.6
1,001,435	+		IAI47_04760	0.38	+0.5
1,001,435	+		IAI47_04760	0.38	+0.0
1,001,453	+		IAI47_04760	0.41	-0.5
1,001,489	+		IAI47_04760	0.46	-1.2
1,001,489	+		IAI47_04760	0.46	-0.7
1,001,490	-		IAI47_04760	0.46	+0.0
1,001,496	+		IAI47_04760	0.47	-0.5
1,001,496	+		IAI47_04760	0.47	-0.8
1,001,496	+		IAI47_04760	0.47	+0.0
1,001,496	+		IAI47_04760	0.47	+1.3
1,001,496	+		IAI47_04760	0.47	+0.3
1,001,496	+		IAI47_04760	0.47	+0.3
1,001,497	-		IAI47_04760	0.47	+0.5
1,001,497	-		IAI47_04760	0.47	-1.1
1,001,497	-		IAI47_04760	0.47	+0.8
1,001,497	-		IAI47_04760	0.47	+0.7
1,001,522	+		IAI47_04760	0.50	-1.1
1,001,523	-		IAI47_04760	0.51	-0.2
1,001,523	-		IAI47_04760	0.51	+0.2
1,001,561	+		IAI47_04760	0.56	+1.9
1,001,562	-		IAI47_04760	0.56	+1.1
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	+0.6
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	-2.3
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	-1.4
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	+0.7
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	+0.3
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	-1.1
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	-1.4
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	-0.3
1,001,567	-		IAI47_04760	0.57	-0.5
1,001,567	-		IAI47_04760	0.57	-1.3
1,001,567	-		IAI47_04760	0.57	-1.0
1,001,567	-		IAI47_04760	0.57	-0.6
1,001,567	-		IAI47_04760	0.57	-0.5
1,001,591	+		IAI47_04760	0.60	+0.9
1,001,592	-		IAI47_04760	0.60	+2.3
1,001,649	-		IAI47_04760	0.68	-1.1
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	+0.8
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	+0.8
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	-1.3
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	+0.3
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	+0.6
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	-1.3
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	-1.3
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	-0.6
1,001,652	-		IAI47_04760	0.69	+1.0
1,001,652	-		IAI47_04760	0.69	+1.1
1,001,652	-		IAI47_04760	0.69	+0.2
1,001,652	-		IAI47_04760	0.69	+0.0
1,001,652	-		IAI47_04760	0.69	+2.1
1,001,654	+		IAI47_04760	0.69	-0.0
1,001,654	+		IAI47_04760	0.69	+0.0
1,001,654	+		IAI47_04760	0.69	-0.0
1,001,654	+		IAI47_04760	0.69	+1.4
1,001,654	+		IAI47_04760	0.69	-1.2
1,001,654	+		IAI47_04760	0.69	+0.5
1,001,654	+		IAI47_04760	0.69	+1.2
1,001,655	-		IAI47_04760	0.69	-1.4
1,001,655	-		IAI47_04760	0.69	+3.2
1,001,655	-		IAI47_04760	0.69	-1.3
1,001,655	-		IAI47_04760	0.69	+2.3
1,001,655	-		IAI47_04760	0.69	+0.2
1,001,655	-		IAI47_04760	0.69	+0.1
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	-1.3
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	-0.2
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	+2.1
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	+1.1
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	+1.1
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	-1.7
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	-0.1
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	+0.5
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	-1.6
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	+0.2
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	-2.3
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	+1.8
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	+1.3
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	+1.1
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	+0.2
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	-1.3
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	-1.3
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	+1.1
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	-2.6
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	-0.3
1,001,667	+		IAI47_04760	0.71	+0.2
1,001,667	+		IAI47_04760	0.71	+0.5
1,001,667	+		IAI47_04760	0.71	+1.2
1,001,667	+		IAI47_04760	0.71	+1.6
1,001,668	-		IAI47_04760	0.71	-1.5
1,001,668	-		IAI47_04760	0.71	-1.7
1,001,668	-		IAI47_04760	0.71	+1.0
1,001,668	-		IAI47_04760	0.71	-0.2
1,001,719	+		IAI47_04760	0.78	+0.8
1,001,719	+		IAI47_04760	0.78	+0.7
1,001,719	+		IAI47_04760	0.78	+0.0
1,001,719	+		IAI47_04760	0.78	+0.2
1,001,719	+		IAI47_04760	0.78	-0.4
1,001,719	+		IAI47_04760	0.78	-0.5
1,001,719	+		IAI47_04760	0.78	-0.1
1,001,720	-		IAI47_04760	0.78	-1.5
1,001,720	-		IAI47_04760	0.78	-2.9
1,001,720	-		IAI47_04760	0.78	+0.0
1,001,720	-		IAI47_04760	0.78	+0.3
1,001,720	-		IAI47_04760	0.78	-0.8
1,001,720	-		IAI47_04760	0.78	-1.0
1,001,720	-		IAI47_04760	0.78	+0.4
1,001,722	+		IAI47_04760	0.78	+1.4
1,001,722	+		IAI47_04760	0.78	+2.5
1,001,722	+		IAI47_04760	0.78	-0.9
1,001,722	+		IAI47_04760	0.78	+1.2
1,001,722	+		IAI47_04760	0.78	-1.3
1,001,722	+		IAI47_04760	0.78	+0.1
1,001,723	-		IAI47_04760	0.79	-1.1
1,001,723	-		IAI47_04760	0.79	-1.0
1,001,723	-		IAI47_04760	0.79	+0.1
1,001,748	-		IAI47_04760	0.82	-1.9
1,001,748	-		IAI47_04760	0.82	-0.8
1,001,778	-		IAI47_04760	0.86	+0.2
1,001,783	+		IAI47_04760	0.87	-1.3
1,001,784	-		IAI47_04760	0.87	+0.8
1,001,804	+		IAI47_04760	0.90	-1.0
1,001,804	+		IAI47_04760	0.90	-0.5
1,001,804	+		IAI47_04760	0.90	+1.1
1,001,804	+		IAI47_04760	0.90	-2.1
1,001,804	+		IAI47_04760	0.90	+1.7
1,001,804	+		IAI47_04760	0.90	+0.6
1,001,805	-				+1.4
1,001,805	-				+1.4
1,001,908	+		IAI47_04765	0.14	-1.6
1,001,908	+		IAI47_04765	0.14	+4.8
1,001,908	+		IAI47_04765	0.14	+0.5
1,001,909	-		IAI47_04765	0.14	+1.5
1,001,909	-		IAI47_04765	0.14	+1.7
1,001,909	-		IAI47_04765	0.14	+0.5
1,001,924	+		IAI47_04765	0.20	-0.4
1,001,924	+		IAI47_04765	0.20	-0.6
1,001,924	+		IAI47_04765	0.20	+1.0
1,001,924	+		IAI47_04765	0.20	+0.0
1,001,924	+		IAI47_04765	0.20	+0.0
1,001,924	+		IAI47_04765	0.20	+0.7
1,001,925	-		IAI47_04765	0.21	-1.0
1,001,925	-		IAI47_04765	0.21	-2.0
1,001,925	-		IAI47_04765	0.21	+1.1
1,001,925	-		IAI47_04765	0.21	+1.8
1,001,925	-		IAI47_04765	0.21	+0.9
1,001,926	+		IAI47_04765	0.21	+1.4
1,001,926	+		IAI47_04765	0.21	+0.8
1,001,926	+		IAI47_04765	0.21	+0.6
1,001,926	+		IAI47_04765	0.21	+1.7
1,001,926	+		IAI47_04765	0.21	-1.8
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	+0.2
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	-0.6
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	-1.9
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	+1.8
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	+1.5
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	+0.4
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	+3.2
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	+1.0
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	+2.1
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	-1.3
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	-0.5
1,001,965	+		IAI47_04765	0.37	+0.3
1,001,966	-		IAI47_04765	0.37	+1.0
1,001,966	-		IAI47_04765	0.37	-0.9
1,001,983	+		IAI47_04765	0.44	-0.4
1,001,983	+		IAI47_04765	0.44	+0.5
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	-1.3
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	+0.3
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	-0.4
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	-1.1
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	+2.2
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	-1.2
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	-0.6
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	-1.5
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	-0.9
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	-0.8
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	+0.4
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	+2.7
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	+1.5
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	+2.5
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	-1.7
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	-1.0
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