Strain Fitness in Pantoea sp. MT58 around IAI47_04770

Experiment: Survival; Treatment=FW300 (pH7.4) with 1.0 mM Glucose; TreatmentDuration=2hrs; Outgrowth=LBkan50

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Survival; Treatment=FW300 (pH7.4) with 1.0 mM Glucose; TreatmentDuration=2hrs; Outgrowth=LBkan50
1,001,435	+		IAI47_04760	0.38	-0.0
1,001,435	+		IAI47_04760	0.38	+0.2
1,001,435	+		IAI47_04760	0.38	-0.8
1,001,435	+		IAI47_04760	0.38	-1.5
1,001,453	+		IAI47_04760	0.41	-0.0
1,001,489	+		IAI47_04760	0.46	-2.7
1,001,489	+		IAI47_04760	0.46	-1.4
1,001,490	-		IAI47_04760	0.46	-0.3
1,001,496	+		IAI47_04760	0.47	+0.2
1,001,496	+		IAI47_04760	0.47	-0.4
1,001,496	+		IAI47_04760	0.47	+0.3
1,001,496	+		IAI47_04760	0.47	+0.4
1,001,496	+		IAI47_04760	0.47	-1.4
1,001,496	+		IAI47_04760	0.47	-0.7
1,001,497	-		IAI47_04760	0.47	-0.1
1,001,497	-		IAI47_04760	0.47	-0.1
1,001,497	-		IAI47_04760	0.47	+1.1
1,001,497	-		IAI47_04760	0.47	+1.0
1,001,522	+		IAI47_04760	0.50	+0.8
1,001,523	-		IAI47_04760	0.51	-1.0
1,001,523	-		IAI47_04760	0.51	-1.1
1,001,561	+		IAI47_04760	0.56	-0.1
1,001,562	-		IAI47_04760	0.56	+0.7
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	-0.7
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	-0.2
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	-1.7
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	-0.3
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	-0.5
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	-1.7
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	+0.5
1,001,566	+		IAI47_04760	0.57	-0.0
1,001,567	-		IAI47_04760	0.57	-1.5
1,001,567	-		IAI47_04760	0.57	+0.4
1,001,567	-		IAI47_04760	0.57	-1.4
1,001,567	-		IAI47_04760	0.57	-0.1
1,001,567	-		IAI47_04760	0.57	-0.0
1,001,591	+		IAI47_04760	0.60	+0.7
1,001,592	-		IAI47_04760	0.60	+0.5
1,001,649	-		IAI47_04760	0.68	+0.2
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	-0.9
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	+0.6
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	+0.6
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	-0.1
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	-2.3
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	-0.1
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	-1.2
1,001,651	+		IAI47_04760	0.68	+0.8
1,001,652	-		IAI47_04760	0.69	+0.5
1,001,652	-		IAI47_04760	0.69	-0.1
1,001,652	-		IAI47_04760	0.69	-1.2
1,001,652	-		IAI47_04760	0.69	-1.7
1,001,652	-		IAI47_04760	0.69	+1.5
1,001,654	+		IAI47_04760	0.69	-0.6
1,001,654	+		IAI47_04760	0.69	+1.2
1,001,654	+		IAI47_04760	0.69	-0.2
1,001,654	+		IAI47_04760	0.69	-0.0
1,001,654	+		IAI47_04760	0.69	+0.4
1,001,654	+		IAI47_04760	0.69	-0.2
1,001,654	+		IAI47_04760	0.69	-0.7
1,001,655	-		IAI47_04760	0.69	+0.2
1,001,655	-		IAI47_04760	0.69	-3.5
1,001,655	-		IAI47_04760	0.69	-2.3
1,001,655	-		IAI47_04760	0.69	-0.6
1,001,655	-		IAI47_04760	0.69	+1.2
1,001,655	-		IAI47_04760	0.69	+1.0
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	+0.1
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	-1.1
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	+0.8
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	-1.3
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	+0.8
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	+0.9
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	+0.4
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	-0.5
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	-0.2
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	+0.5
1,001,662	+		IAI47_04760	0.70	-0.6
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	+0.1
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	+4.7
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	-0.0
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	-0.1
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	+0.7
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	-0.3
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	-0.3
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	+1.0
1,001,663	-		IAI47_04760	0.70	+1.0
1,001,667	+		IAI47_04760	0.71	-0.1
1,001,667	+		IAI47_04760	0.71	-0.1
1,001,667	+		IAI47_04760	0.71	-1.1
1,001,667	+		IAI47_04760	0.71	-0.5
1,001,668	-		IAI47_04760	0.71	+0.4
1,001,668	-		IAI47_04760	0.71	+0.2
1,001,668	-		IAI47_04760	0.71	+0.4
1,001,668	-		IAI47_04760	0.71	-0.4
1,001,719	+		IAI47_04760	0.78	-1.3
1,001,719	+		IAI47_04760	0.78	+0.1
1,001,719	+		IAI47_04760	0.78	-0.0
1,001,719	+		IAI47_04760	0.78	-0.4
1,001,719	+		IAI47_04760	0.78	+2.2
1,001,719	+		IAI47_04760	0.78	-0.4
1,001,719	+		IAI47_04760	0.78	-1.1
1,001,720	-		IAI47_04760	0.78	-0.3
1,001,720	-		IAI47_04760	0.78	+0.5
1,001,720	-		IAI47_04760	0.78	+1.1
1,001,720	-		IAI47_04760	0.78	+0.5
1,001,720	-		IAI47_04760	0.78	-1.4
1,001,720	-		IAI47_04760	0.78	-1.7
1,001,720	-		IAI47_04760	0.78	+0.8
1,001,722	+		IAI47_04760	0.78	+0.9
1,001,722	+		IAI47_04760	0.78	+0.1
1,001,722	+		IAI47_04760	0.78	-0.1
1,001,722	+		IAI47_04760	0.78	+0.4
1,001,722	+		IAI47_04760	0.78	+1.4
1,001,722	+		IAI47_04760	0.78	+0.8
1,001,723	-		IAI47_04760	0.79	+0.6
1,001,723	-		IAI47_04760	0.79	-0.1
1,001,723	-		IAI47_04760	0.79	+0.0
1,001,748	-		IAI47_04760	0.82	+0.9
1,001,748	-		IAI47_04760	0.82	-0.0
1,001,778	-		IAI47_04760	0.86	+1.3
1,001,783	+		IAI47_04760	0.87	-1.8
1,001,784	-		IAI47_04760	0.87	-0.9
1,001,804	+		IAI47_04760	0.90	-1.6
1,001,804	+		IAI47_04760	0.90	+1.4
1,001,804	+		IAI47_04760	0.90	-0.4
1,001,804	+		IAI47_04760	0.90	-0.2
1,001,804	+		IAI47_04760	0.90	-0.4
1,001,804	+		IAI47_04760	0.90	+1.3
1,001,805	-				+0.3
1,001,805	-				+0.3
1,001,908	+		IAI47_04765	0.14	-1.4
1,001,908	+		IAI47_04765	0.14	+1.2
1,001,908	+		IAI47_04765	0.14	-1.5
1,001,909	-		IAI47_04765	0.14	+0.2
1,001,909	-		IAI47_04765	0.14	+0.9
1,001,909	-		IAI47_04765	0.14	+0.7
1,001,924	+		IAI47_04765	0.20	-1.5
1,001,924	+		IAI47_04765	0.20	-1.7
1,001,924	+		IAI47_04765	0.20	-1.8
1,001,924	+		IAI47_04765	0.20	-0.8
1,001,924	+		IAI47_04765	0.20	-1.0
1,001,924	+		IAI47_04765	0.20	-1.9
1,001,925	-		IAI47_04765	0.21	-0.2
1,001,925	-		IAI47_04765	0.21	+1.5
1,001,925	-		IAI47_04765	0.21	-0.8
1,001,925	-		IAI47_04765	0.21	+0.7
1,001,925	-		IAI47_04765	0.21	+0.4
1,001,926	+		IAI47_04765	0.21	+0.6
1,001,926	+		IAI47_04765	0.21	+1.0
1,001,926	+		IAI47_04765	0.21	-0.1
1,001,926	+		IAI47_04765	0.21	+0.8
1,001,926	+		IAI47_04765	0.21	+0.3
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	-0.5
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	-0.3
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	+0.7
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	-2.1
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	-0.5
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	-2.1
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	-0.1
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	+0.7
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	+0.9
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	+0.3
1,001,927	-		IAI47_04765	0.21	+0.0
1,001,965	+		IAI47_04765	0.37	-0.8
1,001,966	-		IAI47_04765	0.37	+0.6
1,001,966	-		IAI47_04765	0.37	+0.4
1,001,983	+		IAI47_04765	0.44	-0.4
1,001,983	+		IAI47_04765	0.44	-1.0
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	-1.7
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	-2.6
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	+0.0
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	-0.8
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	+1.2
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	+0.3
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	+0.1
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	+0.3
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	-0.8
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	+1.5
1,002,007	+		IAI47_04765	0.53	-0.6
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	-0.3
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	+1.9
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	+0.5
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	-2.4
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	-1.3
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	-0.4
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	-0.7
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	-1.0
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	-0.3
1,002,008	-		IAI47_04765	0.54	-0.3
1,002,095	+		IAI47_04765	0.88	-1.2
1,002,096	-		IAI47_04765	0.88	-0.4
1,002,122	+				+0.9
1,002,122	+				+1.2
1,002,123	-				-0.9
1,002,130	+				-0.1
1,002,130	+				+1.5
1,002,209	+				+0.5
1,002,209	+				+1.1
1,002,209	+				-0.5
1,002,210	-				+1.1
1,002,210	-				-1.2
1,002,210	-				-0.6
1,002,210	-				-0.3
1,002,227	+				+0.7
1,002,227	+				+0.5
1,002,227	+				+0.8
1,002,227	+				+0.3
1,002,228	-				-1.4
1,002,228	-				+0.1
1,002,228	-				-0.7
1,002,228	-				+0.1
1,002,228	-				+0.8
1,002,228	-				-0.6
1,002,332	+				-1.4
1,002,332	+				-0.6
1,002,333	-				+0.7
1,002,357	-				-0.6
1,002,357	-				-2.2
1,002,401	+				-2.7
1,002,401	+				+0.4
1,002,401	+				+1.0
1,002,402	-				-0.2
1,002,402	-				+0.3
1,002,402	-				+0.6
1,002,402	-				-1.2
1,002,402	-				+0.6
1,002,406	+				+1.0
1,002,406	+				-0.9
1,002,406	+				-0.9
1,002,406	+				+0.0
1,002,406	+				-0.9
1,002,406	+				+0.5
1,002,406	+				+0.8
1,002,406	+				-0.7
1,002,407	-				+0.4
1,002,407	-				+0.3
1,002,433	+				-0.9
1,002,486	-				-0.8
1,002,486	-				+0.1
1,002,486	-				+0.5
1,002,515	+				-1.4
1,002,515	+				+0.9
1,002,541	+				-1.3
1,002,542	-				+0.7
1,002,542	-				-0.2
1,002,546	-				+1.4
1,002,546	-				+0.8
1,002,550	+		IAI47_04770	0.10	-1.7
1,002,550	+		IAI47_04770	0.10	-2.6
1,002,550	+		IAI47_04770	0.10	-0.8
1,002,551	-		IAI47_04770	0.10	-0.8
1,002,551	-		IAI47_04770	0.10	-0.5
1,002,589	+		IAI47_04770	0.12	+0.6
1,002,590	-		IAI47_04770	0.12	+0.6
1,002,601	-		IAI47_04770	0.13	+0.7
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