Strain Fitness in Pantoea sp. MT58 around IAI47_04360

Experiment: Survival; Treatment=FW300 (pH7.4); TreatmentDuration=24hrs; Outgrowth=LBkan50

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Survival; Treatment=FW300 (pH7.4); TreatmentDuration=24hrs; Outgrowth=LBkan50
914,153	+		IAI47_04350	0.84	+1.3
914,154	-		IAI47_04350	0.84	+0.9
914,154	-		IAI47_04350	0.84	-0.6
914,177	+		IAI47_04350	0.86	+0.8
914,177	+		IAI47_04350	0.86	+1.1
914,177	+		IAI47_04350	0.86	-0.3
914,178	-		IAI47_04350	0.86	-1.9
914,178	-		IAI47_04350	0.86	+1.2
914,182	+		IAI47_04350	0.86	-0.8
914,182	+		IAI47_04350	0.86	-0.2
914,214	+		IAI47_04350	0.88	+3.8
914,214	+		IAI47_04350	0.88	-0.8
914,215	-		IAI47_04350	0.88	-0.8
914,222	+		IAI47_04350	0.89	-2.1
914,254	+				-1.0
914,262	+				+0.3
914,262	+				-0.7
914,262	+				-1.8
914,262	+				-2.9
914,262	+				-2.8
914,262	+				+0.3
914,262	+				-2.3
914,262	+				-2.1
914,262	+				-1.2
914,263	-				-1.2
914,263	-				-1.8
914,263	-				-0.3
914,263	-				+2.1
914,361	+				-2.2
914,362	-				-3.0
914,362	-				-0.0
914,362	-				-0.7
914,362	-				-0.8
914,362	-				-1.7
914,362	-				+3.1
914,380	+				-0.8
914,380	+				-1.0
914,380	+				+1.8
914,381	-				+1.2
914,401	+				-0.2
914,402	-				+1.4
914,436	+				-0.2
914,437	-				-0.8
914,437	-				+0.7
914,437	-				-1.9
914,437	-				+0.4
914,467	-				-1.3
914,486	+				-0.6
914,486	+				+0.8
914,486	+				+2.4
914,487	-				-2.6
914,488	+				+2.2
914,488	+				-0.6
914,488	+				+1.8
914,488	+				-1.7
914,488	+				+0.5
914,488	+				+1.6
914,489	-				-1.6
914,489	-				+0.6
914,489	-				+2.4
914,556	+				-0.1
914,556	+				+1.3
914,556	+				-1.7
914,556	+				+0.5
914,556	+				+0.6
914,556	+				-0.2
914,557	-				+1.8
914,557	-				+1.0
914,557	-				-0.0
914,557	-				+0.3
914,557	-				-0.2
914,557	-				+1.4
914,557	-				-0.6
914,557	-				+1.8
914,564	+				-0.7
914,564	+				+0.8
914,565	-				-2.8
914,565	-				-0.4
914,577	+				-1.0
914,578	-				-0.2
914,649	+		IAI47_04355	0.18	+2.8
914,649	+		IAI47_04355	0.18	+2.0
914,694	+		IAI47_04355	0.27	+1.3
914,694	+		IAI47_04355	0.27	-1.2
914,694	+		IAI47_04355	0.27	-0.8
914,694	+		IAI47_04355	0.27	+1.1
914,694	+		IAI47_04355	0.27	+0.1
914,694	+		IAI47_04355	0.27	+0.2
914,695	-		IAI47_04355	0.27	+0.2
914,695	-		IAI47_04355	0.27	-0.0
914,718	+		IAI47_04355	0.31	-2.0
914,718	+		IAI47_04355	0.31	+0.1
914,718	+		IAI47_04355	0.31	+0.7
914,718	+		IAI47_04355	0.31	-0.9
914,719	-		IAI47_04355	0.31	+3.3
914,719	-		IAI47_04355	0.31	-0.5
914,719	-		IAI47_04355	0.31	-2.8
914,787	+		IAI47_04355	0.45	+1.3
914,787	+		IAI47_04355	0.45	-2.7
914,788	-		IAI47_04355	0.45	+1.1
914,788	-		IAI47_04355	0.45	+0.7
914,788	-		IAI47_04355	0.45	-1.0
914,818	+		IAI47_04355	0.51	+3.9
914,818	+		IAI47_04355	0.51	-0.7
914,818	+		IAI47_04355	0.51	+2.6
914,818	+		IAI47_04355	0.51	+3.2
914,819	-		IAI47_04355	0.51	+0.4
914,819	-		IAI47_04355	0.51	-3.9
914,819	-		IAI47_04355	0.51	-0.7
914,819	-		IAI47_04355	0.51	-1.1
914,819	-		IAI47_04355	0.51	-0.7
914,835	+		IAI47_04355	0.54	-0.7
914,836	-		IAI47_04355	0.54	-0.5
914,836	-		IAI47_04355	0.54	-1.4
914,932	+		IAI47_04355	0.73	-0.4
914,932	+		IAI47_04355	0.73	-0.6
914,932	+		IAI47_04355	0.73	+1.8
914,933	-		IAI47_04355	0.73	+0.8
914,933	-		IAI47_04355	0.73	-0.7
914,933	-		IAI47_04355	0.73	+0.8
914,933	-		IAI47_04355	0.73	+2.6
914,947	+		IAI47_04355	0.76	+1.8
914,948	-		IAI47_04355	0.76	+1.8
914,948	-		IAI47_04355	0.76	-0.7
914,948	-		IAI47_04355	0.76	-1.9
914,948	-		IAI47_04355	0.76	-1.6
915,015	-		IAI47_04355	0.89	+0.1
915,022	-				-3.2
915,022	-				-0.0
915,070	+				-1.2
915,070	+				-1.2
915,070	+				-2.6
915,071	-				+0.2
915,071	-				+1.5
915,071	-				-1.0
915,071	-				-2.1
915,128	-				+0.3
915,187	+				+0.8
915,187	+				-1.4
915,187	+				+1.9
915,188	-				+0.2
915,188	-				+1.5
915,193	+				-0.9
915,193	+				+0.2
915,193	+				+1.0
915,193	+				-1.2
915,193	+				-1.9
915,193	+				+2.1
915,193	+				-0.4
915,193	+				-1.4
915,193	+				-2.1
915,193	+				+0.2
915,193	+				+0.4
915,193	+				-0.0
915,193	+				-2.3
915,193	+				+0.9
915,193	+				+0.7
915,194	-				-2.2
915,194	-				+0.4
915,194	-				+0.3
915,194	-				-0.2
915,196	+				+0.7
915,197	-				+1.9
915,197	-				-0.7
915,197	-				-2.0
915,214	+				+0.2
915,215	-				-0.6
915,215	-				+0.4
915,225	+				+0.3
915,225	+				-2.9
915,225	+				+0.8
915,225	+				-0.4
915,225	+				+0.8
915,226	-				-2.3
915,226	-				-2.4
915,226	-				-4.2
915,226	-				-0.8
915,226	-				-0.3
915,226	-				-0.6
915,226	-				-0.4
915,226	-				+0.0
915,229	+				+1.4
915,229	+				+1.4
915,230	-				+1.1
915,230	-				-0.6
915,253	+				-1.1
915,253	+				+0.1
915,253	+				-2.3
915,253	+				-1.8
915,253	+				+0.3
915,254	-				-2.7
915,298	+		IAI47_04360	0.13	+2.7
915,299	-		IAI47_04360	0.13	+0.1
915,299	-		IAI47_04360	0.13	+0.2
915,328	+		IAI47_04360	0.15	+0.7
915,329	-		IAI47_04360	0.15	+0.6
915,329	-		IAI47_04360	0.15	-0.7
915,337	+		IAI47_04360	0.16	+0.7
915,337	+		IAI47_04360	0.16	+1.7
915,338	-		IAI47_04360	0.16	+0.2
915,430	+		IAI47_04360	0.23	+0.4
915,431	-		IAI47_04360	0.23	+0.8
915,431	-		IAI47_04360	0.23	+1.3
915,431	-		IAI47_04360	0.23	-0.7
915,431	-		IAI47_04360	0.23	+0.3
915,431	-		IAI47_04360	0.23	+1.3
915,468	-		IAI47_04360	0.26	-0.0
915,468	-		IAI47_04360	0.26	-0.9
915,495	+		IAI47_04360	0.28	+0.4
915,496	-		IAI47_04360	0.28	+2.3
915,496	-		IAI47_04360	0.28	+1.2
915,496	-		IAI47_04360	0.28	+0.2
915,496	-		IAI47_04360	0.28	+1.9
915,499	+		IAI47_04360	0.28	+4.1
915,579	+		IAI47_04360	0.35	+0.9
915,579	+		IAI47_04360	0.35	-0.3
915,580	-		IAI47_04360	0.35	-0.4
915,580	-		IAI47_04360	0.35	+0.8
915,580	-		IAI47_04360	0.35	-0.7
915,580	-		IAI47_04360	0.35	-0.5
915,580	-		IAI47_04360	0.35	+0.9
915,582	+		IAI47_04360	0.35	+1.0
915,582	+		IAI47_04360	0.35	+1.0
915,582	+		IAI47_04360	0.35	-3.2
915,583	-		IAI47_04360	0.35	-2.3
915,583	-		IAI47_04360	0.35	-2.0
915,583	-		IAI47_04360	0.35	-3.0
915,731	+		IAI47_04360	0.46	-2.8
915,731	+		IAI47_04360	0.46	-0.2
915,731	+		IAI47_04360	0.46	-3.5
915,732	-		IAI47_04360	0.46	-1.3
915,732	-		IAI47_04360	0.46	-2.7
915,732	-		IAI47_04360	0.46	-2.2
915,773	-		IAI47_04360	0.50	+3.4
915,773	-		IAI47_04360	0.50	+1.7
915,773	-		IAI47_04360	0.50	-4.0
915,773	-		IAI47_04360	0.50	+0.6
915,773	-		IAI47_04360	0.50	-1.4
915,799	+		IAI47_04360	0.52	+1.9
915,799	+		IAI47_04360	0.52	+0.8
915,799	+		IAI47_04360	0.52	+0.6
915,799	+		IAI47_04360	0.52	+0.9
915,799	+		IAI47_04360	0.52	+0.1
915,799	+		IAI47_04360	0.52	+1.8
915,800	-		IAI47_04360	0.52	-1.4
915,800	-		IAI47_04360	0.52	-0.3
915,800	-		IAI47_04360	0.52	-0.2
915,800	-		IAI47_04360	0.52	+1.5
915,800	-		IAI47_04360	0.52	-1.4
915,800	-		IAI47_04360	0.52	-0.4
915,800	-		IAI47_04360	0.52	+1.1
915,874	+		IAI47_04360	0.57	+1.6
915,874	+		IAI47_04360	0.57	+1.3
915,875	-		IAI47_04360	0.58	-3.3
915,885	+		IAI47_04360	0.58	-1.2
915,885	+		IAI47_04360	0.58	+1.2
915,885	+		IAI47_04360	0.58	-2.4
915,885	+		IAI47_04360	0.58	+2.1
915,885	+		IAI47_04360	0.58	-1.9
915,886	-		IAI47_04360	0.58	+2.0
915,886	-		IAI47_04360	0.58	+0.5
915,886	-		IAI47_04360	0.58	-0.5
915,899	+		IAI47_04360	0.59	+1.3
915,899	+		IAI47_04360	0.59	+1.1
915,899	+		IAI47_04360	0.59	-0.3
915,900	-		IAI47_04360	0.60	-2.0
915,900	-		IAI47_04360	0.60	-1.0
915,900	-		IAI47_04360	0.60	+1.6
915,900	-		IAI47_04360	0.60	-0.5
915,900	-		IAI47_04360	0.60	+1.9
915,900	-		IAI47_04360	0.60	-0.2
915,900	-		IAI47_04360	0.60	+0.3
915,900	-		IAI47_04360	0.60	-0.1
915,900	-		IAI47_04360	0.60	-0.6
915,900	-		IAI47_04360	0.60	-0.9
915,925	+		IAI47_04360	0.61	-0.8
915,925	+		IAI47_04360	0.61	+2.4
915,946	+		IAI47_04360	0.63	+1.2
915,947	-		IAI47_04360	0.63	+2.3
915,973	+		IAI47_04360	0.65	+0.2
916,001	+		IAI47_04360	0.67	+2.7
916,001	+		IAI47_04360	0.67	+2.7
916,011	+		IAI47_04360	0.68	+4.8
916,011	+		IAI47_04360	0.68	+1.3
916,011	+		IAI47_04360	0.68	-0.8
916,011	+		IAI47_04360	0.68	+1.5
916,011	+		IAI47_04360	0.68	-0.4
916,011	+		IAI47_04360	0.68	-0.6
916,012	-		IAI47_04360	0.68	+1.3
916,012	-		IAI47_04360	0.68	+1.0
916,012	-		IAI47_04360	0.68	-0.7
916,012	-		IAI47_04360	0.68	-0.9
916,012	-		IAI47_04360	0.68	+2.6
916,025	-		IAI47_04360	0.69	+1.4
916,029	-		IAI47_04360	0.70	-0.0
916,029	-		IAI47_04360	0.70	+2.4
916,045	-		IAI47_04360	0.71	-0.2
916,155	+		IAI47_04360	0.79	-1.7
916,155	+		IAI47_04360	0.79	+0.1
916,155	+		IAI47_04360	0.79	-2.0
916,155	+		IAI47_04360	0.79	+1.9
916,155	+		IAI47_04360	0.79	-0.4
916,155	+		IAI47_04360	0.79	-1.8
916,155	+		IAI47_04360	0.79	-0.6
916,155	+		IAI47_04360	0.79	+0.3
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