Strain Fitness in Shewanella amazonensis SB2B around Sama_2798

Experiment: A22 0.021875 mg/ml

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	A22 0.021875 mg/ml
3,337,446	+				-0.9
3,337,483	-				-0.5
3,337,511	+				-0.6
3,337,536	+				+0.4
3,337,536	+				-0.8
3,337,536	+				+0.4
3,337,536	+				+0.2
3,337,536	+				-1.7
3,337,536	+				+0.6
3,337,537	-				-0.5
3,337,537	-				+0.0
3,337,537	-				+0.4
3,337,537	-				+2.4
3,337,537	-				+0.3
3,337,540	+				-0.1
3,337,540	+				-0.3
3,337,541	-				+0.2
3,337,653	+		Sama_2797	0.23	+0.1
3,337,653	+		Sama_2797	0.23	+0.7
3,337,654	-		Sama_2797	0.23	-1.0
3,337,745	+		Sama_2797	0.34	+0.9
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	+0.8
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	+0.9
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	-0.2
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	-0.1
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	-0.1
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	-0.2
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	+0.3
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	-0.4
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	-0.5
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	-1.3
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	+0.1
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	+0.7
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	-0.1
3,337,819	+		Sama_2797	0.43	+0.3
3,337,819	+		Sama_2797	0.43	+0.2
3,337,819	+		Sama_2797	0.43	+0.4
3,337,819	+		Sama_2797	0.43	-0.7
3,337,820	-		Sama_2797	0.43	+0.2
3,337,820	-		Sama_2797	0.43	+0.5
3,337,820	-		Sama_2797	0.43	+0.4
3,337,876	+		Sama_2797	0.50	-0.2
3,337,877	-		Sama_2797	0.50	+0.2
3,337,913	+		Sama_2797	0.54	-0.9
3,337,913	+		Sama_2797	0.54	-1.2
3,337,913	+		Sama_2797	0.54	-1.0
3,337,914	-		Sama_2797	0.54	-1.0
3,337,914	-		Sama_2797	0.54	+0.5
3,337,914	-		Sama_2797	0.54	+0.2
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	+0.2
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	-1.1
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	-0.1
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	+2.1
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	+1.3
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	-2.1
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+0.5
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+0.0
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+1.2
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+0.6
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+0.3
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	-0.8
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	-0.4
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+1.4
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+0.1
3,338,059	+		Sama_2797	0.71	-0.5
3,338,059	+		Sama_2797	0.71	-0.1
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-0.4
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-0.6
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	+1.6
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-0.5
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-0.3
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	+0.2
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-1.1
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-1.0
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-0.3
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	+0.7
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	-0.5
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	+1.1
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	-0.6
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	-0.9
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	+0.2
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	-0.4
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	+1.8
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	-0.4
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	-0.6
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	+0.2
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	-0.5
3,338,097	+		Sama_2797	0.76	-1.8
3,338,097	+		Sama_2797	0.76	+0.2
3,338,126	-		Sama_2797	0.79	+0.0
3,338,126	-		Sama_2797	0.79	+0.3
3,338,176	+		Sama_2797	0.85	-1.7
3,338,176	+		Sama_2797	0.85	+0.4
3,338,176	+		Sama_2797	0.85	-1.7
3,338,176	+		Sama_2797	0.85	-0.2
3,338,176	+		Sama_2797	0.85	+0.2
3,338,176	+		Sama_2797	0.85	-0.0
3,338,176	+		Sama_2797	0.85	+0.2
3,338,177	-		Sama_2797	0.86	+0.0
3,338,177	-		Sama_2797	0.86	+1.4
3,338,177	-		Sama_2797	0.86	-0.2
3,338,177	-		Sama_2797	0.86	-0.2
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	-0.0
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	+0.4
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	+1.5
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	+0.4
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	-1.2
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	-1.0
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	-1.3
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	+0.5
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	+0.8
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	+0.4
3,338,201	-		Sama_2797	0.88	-0.5
3,338,201	-		Sama_2797	0.88	+0.8
3,338,201	-		Sama_2797	0.88	-1.0
3,338,201	-		Sama_2797	0.88	+0.3
3,338,201	-		Sama_2797	0.88	+1.2
3,338,208	-		Sama_2797	0.89	+0.2
3,338,208	-		Sama_2797	0.89	-0.2
3,338,208	-		Sama_2797	0.89	-1.0
3,338,213	+		Sama_2797	0.90	+0.7
3,338,213	+		Sama_2797	0.90	+0.1
3,338,213	+		Sama_2797	0.90	+0.2
3,338,214	-				+0.5
3,338,214	-				-2.7
3,338,214	-				+0.8
3,338,296	-				-0.4
3,338,296	-				+0.2
3,338,322	+				-1.0
3,338,334	+				-0.9
3,338,334	+				+0.6
3,338,334	+				-1.0
3,338,334	+				+0.1
3,338,335	-				-0.9
3,338,335	-				+0.8
3,338,340	+				+0.3
3,338,340	+				+0.1
3,338,341	-				-0.1
3,338,341	-				+1.1
3,338,341	-				-0.7
3,338,341	-				+1.5
3,338,386	+				+0.6
3,338,386	+				+1.0
3,338,386	+				+0.3
3,338,386	+				-0.0
3,338,386	+				+0.6
3,338,386	+				+0.1
3,338,387	-				+0.4
3,338,387	-				-0.6
3,338,387	-				-0.5
3,338,387	-				+1.4
3,338,387	-				-2.4
3,338,393	+				-0.2
3,338,393	+				-0.2
3,338,393	+				+1.8
3,338,393	+				-0.8
3,338,393	+				-0.1
3,338,394	-				+0.5
3,338,394	-				-0.2
3,338,394	-				-1.1
3,338,464	+				-0.8
3,338,598	+		Sama_2798	0.21	+1.4
3,338,599	-		Sama_2798	0.21	-0.2
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	-0.4
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	+0.2
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	+1.0
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	+0.3
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	+0.1
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	-0.1
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	-0.7
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	+0.5
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	-0.7
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	+0.6
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	-0.6
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	-1.5
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	-0.5
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	-0.1
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	+0.6
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	-0.9
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	-0.0
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	-0.0
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	-0.2
3,338,616	+		Sama_2798	0.23	+0.2
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	-1.2
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	+0.5
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	+0.3
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	+1.8
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	-0.1
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	-1.3
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	+0.3
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	+0.0
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	+1.3
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	+0.8
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	+1.1
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	-0.8
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	+0.1
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	+1.6
3,338,617	-		Sama_2798	0.23	+0.4
3,338,637	+		Sama_2798	0.25	-1.2
3,338,637	+		Sama_2798	0.25	-0.1
3,338,638	-		Sama_2798	0.25	+0.5
3,338,638	-		Sama_2798	0.25	+3.1
3,338,638	-		Sama_2798	0.25	-0.0
3,338,638	-		Sama_2798	0.25	+0.4
3,338,640	+		Sama_2798	0.25	+0.4
3,338,674	+		Sama_2798	0.29	-0.6
3,338,675	-		Sama_2798	0.29	+0.3
3,338,680	-		Sama_2798	0.30	+0.6
3,338,680	-		Sama_2798	0.30	+0.7
3,338,706	-		Sama_2798	0.33	-0.1
3,338,706	-		Sama_2798	0.33	+0.8
3,338,752	-		Sama_2798	0.38	+0.1
3,338,771	+		Sama_2798	0.40	+0.1
3,338,771	+		Sama_2798	0.40	+0.8
3,338,771	+		Sama_2798	0.40	-0.8
3,338,847	-		Sama_2798	0.49	+1.3
3,338,851	+		Sama_2798	0.49	-0.1
3,338,852	-		Sama_2798	0.49	+1.2
3,338,870	+		Sama_2798	0.51	-2.3
3,338,870	+		Sama_2798	0.51	-1.2
3,338,870	+		Sama_2798	0.51	-0.2
3,338,871	-		Sama_2798	0.52	+0.7
3,338,876	+		Sama_2798	0.52	+0.2
3,338,876	+		Sama_2798	0.52	-0.7
3,338,876	+		Sama_2798	0.52	-1.3
3,338,876	+		Sama_2798	0.52	-1.1
3,338,877	-		Sama_2798	0.52	-0.3
3,338,877	-		Sama_2798	0.52	+0.8
3,338,877	-		Sama_2798	0.52	+0.4
3,338,877	-		Sama_2798	0.52	+1.2
3,338,877	-		Sama_2798	0.52	+0.4
3,338,880	+		Sama_2798	0.53	-0.5
3,338,880	+		Sama_2798	0.53	-1.1
3,338,881	-		Sama_2798	0.53	+0.6
3,338,881	-		Sama_2798	0.53	-0.5
3,338,881	-		Sama_2798	0.53	+1.5
3,338,881	-		Sama_2798	0.53	+0.1
3,338,901	+		Sama_2798	0.55	-2.1
3,338,901	+		Sama_2798	0.55	-0.4
3,338,902	-		Sama_2798	0.55	+0.3
3,338,902	-		Sama_2798	0.55	-0.1
3,338,902	-		Sama_2798	0.55	+1.4
3,338,902	-		Sama_2798	0.55	+0.9
3,338,907	+		Sama_2798	0.56	-1.7
3,338,907	+		Sama_2798	0.56	-0.1
3,338,907	+		Sama_2798	0.56	-0.9
3,338,907	+		Sama_2798	0.56	-0.8
3,338,908	-		Sama_2798	0.56	-0.2
3,338,908	-		Sama_2798	0.56	+0.7
3,338,908	-		Sama_2798	0.56	-0.5
3,338,908	-		Sama_2798	0.56	+0.4
3,338,908	-		Sama_2798	0.56	+0.3
3,338,908	-		Sama_2798	0.56	+0.2
3,338,908	-		Sama_2798	0.56	-1.0
3,338,926	+		Sama_2798	0.58	-0.7
3,338,994	+		Sama_2798	0.65	+0.0
3,338,994	+		Sama_2798	0.65	-1.0
3,338,994	+		Sama_2798	0.65	-0.4
3,338,994	+		Sama_2798	0.65	+1.2
3,338,994	+		Sama_2798	0.65	-1.6
3,338,995	-		Sama_2798	0.66	-0.1
3,338,995	-		Sama_2798	0.66	-0.3
3,338,995	-		Sama_2798	0.66	+0.2
3,339,008	+		Sama_2798	0.67	-0.8
3,339,016	+		Sama_2798	0.68	+0.1
3,339,016	+		Sama_2798	0.68	-0.0
3,339,017	-		Sama_2798	0.68	+1.7
3,339,069	+		Sama_2798	0.74	-0.7
3,339,069	+		Sama_2798	0.74	-1.2
3,339,069	+		Sama_2798	0.74	+0.1
3,339,069	+		Sama_2798	0.74	+0.9
3,339,069	+		Sama_2798	0.74	-0.9
3,339,069	+		Sama_2798	0.74	-0.0
3,339,069	+		Sama_2798	0.74	+1.2
3,339,069	+		Sama_2798	0.74	-0.4
3,339,069	+		Sama_2798	0.74	-1.4
3,339,069	+		Sama_2798	0.74	-0.8
3,339,069	+		Sama_2798	0.74	-1.5
3,339,069	+		Sama_2798	0.74	-0.3
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