Strain Fitness in Shewanella amazonensis SB2B around Sama_2796

Experiment: nitrate 200 mM

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	nitrate 200 mM
3,335,142	+		Sama_2795	0.61	+0.4
3,335,142	+		Sama_2795	0.61	-0.4
3,335,143	-		Sama_2795	0.61	-0.5
3,335,143	-		Sama_2795	0.61	+2.1
3,335,143	-		Sama_2795	0.61	-0.4
3,335,189	-		Sama_2795	0.63	-0.4
3,335,256	+		Sama_2795	0.66	-0.5
3,335,256	+		Sama_2795	0.66	-0.9
3,335,256	+		Sama_2795	0.66	-0.2
3,335,257	-		Sama_2795	0.66	-1.4
3,335,257	-		Sama_2795	0.66	-1.3
3,335,257	-		Sama_2795	0.66	-0.4
3,335,257	-		Sama_2795	0.66	-0.5
3,335,296	+		Sama_2795	0.67	+0.1
3,335,402	-		Sama_2795	0.72	+0.1
3,335,432	-		Sama_2795	0.73	-0.1
3,335,434	+		Sama_2795	0.73	-0.7
3,335,479	+		Sama_2795	0.75	+1.6
3,335,480	-		Sama_2795	0.75	-0.9
3,335,584	+		Sama_2795	0.80	-1.3
3,335,584	+		Sama_2795	0.80	+1.1
3,335,585	-		Sama_2795	0.80	+0.7
3,335,585	-		Sama_2795	0.80	+0.4
3,335,734	+		Sama_2795	0.86	+0.8
3,335,734	+		Sama_2795	0.86	-0.2
3,335,734	+		Sama_2795	0.86	+0.3
3,335,735	-		Sama_2795	0.86	+1.2
3,335,735	-		Sama_2795	0.86	-0.9
3,335,831	-				-1.4
3,335,832	+				-0.1
3,335,832	+				-1.0
3,335,832	+				-0.6
3,335,892	-				-2.2
3,335,892	-				+0.1
3,335,892	-				-0.6
3,335,962	+				+1.5
3,335,963	-				+0.2
3,335,963	-				-0.4
3,335,972	-				-0.1
3,336,008	-				-1.0
3,336,008	-				+0.2
3,336,028	+				-1.1
3,336,028	+				+0.4
3,336,028	+				+0.2
3,336,028	+				+0.1
3,336,029	-				-2.7
3,336,048	-				-0.8
3,336,173	+				-0.6
3,336,173	+				-0.1
3,336,173	+				-0.2
3,336,173	+				-1.1
3,336,173	+				+1.2
3,336,173	+				-1.4
3,336,173	+				+0.2
3,336,174	-				+0.2
3,336,174	-				-0.7
3,336,174	-				+0.7
3,336,208	+				+0.2
3,336,209	-				-1.0
3,336,209	-				+0.5
3,336,209	-				+0.2
3,336,209	-				+0.9
3,336,209	-				-2.3
3,336,209	-				-0.1
3,336,211	+				-1.9
3,336,211	+				-2.3
3,336,211	+				-2.7
3,336,211	+				+0.2
3,336,212	-				+0.1
3,336,212	-				+0.3
3,336,212	-				+0.4
3,336,212	-				-1.9
3,336,212	-				+0.3
3,336,212	-				+0.5
3,336,212	-				+0.4
3,336,212	-				+0.2
3,336,212	-				-0.8
3,336,212	-				+1.2
3,336,212	-				-1.2
3,336,212	-				-0.2
3,336,212	-				+0.4
3,336,232	-		Sama_2796	0.11	-0.1
3,336,396	+		Sama_2796	0.25	-0.6
3,336,417	-		Sama_2796	0.27	-1.1
3,336,417	-		Sama_2796	0.27	+0.2
3,336,453	+		Sama_2796	0.30	-1.5
3,336,453	+		Sama_2796	0.30	+0.3
3,336,454	-		Sama_2796	0.30	+0.3
3,336,454	-		Sama_2796	0.30	-1.1
3,336,528	-		Sama_2796	0.36	-1.0
3,336,631	-		Sama_2796	0.45	-0.7
3,336,903	+		Sama_2796	0.68	+1.4
3,336,903	+		Sama_2796	0.68	-1.8
3,336,903	+		Sama_2796	0.68	+0.5
3,336,912	-		Sama_2796	0.69	+0.4
3,336,912	-		Sama_2796	0.69	-0.4
3,336,912	-		Sama_2796	0.69	-0.1
3,336,915	+		Sama_2796	0.69	-0.5
3,336,915	+		Sama_2796	0.69	+0.6
3,336,915	+		Sama_2796	0.69	-0.0
3,336,938	+		Sama_2796	0.71	-0.7
3,336,938	+		Sama_2796	0.71	+1.2
3,336,938	+		Sama_2796	0.71	-0.2
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	-0.0
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	+1.0
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	+0.5
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	+1.6
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	+2.4
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	+0.2
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	-0.6
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	+1.1
3,336,944	+		Sama_2796	0.72	+1.4
3,336,944	+		Sama_2796	0.72	-1.3
3,336,944	+		Sama_2796	0.72	-1.4
3,336,944	+		Sama_2796	0.72	+1.5
3,336,944	+		Sama_2796	0.72	-1.4
3,336,944	+		Sama_2796	0.72	-0.4
3,336,944	+		Sama_2796	0.72	-1.2
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	-1.2
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	-0.4
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	-0.7
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	-0.9
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	-0.7
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	+1.5
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	+1.1
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	-0.6
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	+0.0
3,336,958	+		Sama_2796	0.73	-1.4
3,336,959	-		Sama_2796	0.73	+1.4
3,337,034	+		Sama_2796	0.79	+0.7
3,337,034	+		Sama_2796	0.79	-1.2
3,337,034	+		Sama_2796	0.79	-0.3
3,337,034	+		Sama_2796	0.79	-0.2
3,337,034	+		Sama_2796	0.79	+0.5
3,337,034	+		Sama_2796	0.79	+0.8
3,337,034	+		Sama_2796	0.79	-0.1
3,337,035	-		Sama_2796	0.79	-0.8
3,337,035	-		Sama_2796	0.79	-0.9
3,337,035	-		Sama_2796	0.79	-0.2
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	+0.3
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	+0.1
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	-0.5
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	-0.7
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	+1.0
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	+0.4
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	+0.2
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	-1.8
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-0.2
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-0.1
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-0.0
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-0.5
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-1.6
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-0.7
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-1.6
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-0.3
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-1.1
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-0.9
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	+0.1
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-2.1
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	+0.9
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-0.5
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	+0.6
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	+0.5
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-0.4
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-0.6
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	+0.7
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-1.5
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-1.7
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-0.0
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-1.2
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	+0.4
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	+0.6
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-0.5
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-1.4
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	+2.7
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-0.6
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-1.2
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-0.2
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-0.8
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	+0.2
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-0.4
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-0.5
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-0.4
3,337,065	-		Sama_2796	0.82	+0.0
3,337,065	-		Sama_2796	0.82	+0.5
3,337,065	-		Sama_2796	0.82	-0.2
3,337,080	+		Sama_2796	0.83	-0.0
3,337,080	+		Sama_2796	0.83	+1.6
3,337,081	-		Sama_2796	0.83	+0.1
3,337,117	-		Sama_2796	0.86	-0.5
3,337,117	-		Sama_2796	0.86	+0.1
3,337,173	+				+0.9
3,337,174	-				-0.3
3,337,174	-				-1.3
3,337,184	+				-0.0
3,337,184	+				-0.0
3,337,185	-				-0.9
3,337,185	-				-0.1
3,337,197	+				+0.5
3,337,283	+				+2.8
3,337,283	+				-0.6
3,337,283	+				-0.3
3,337,284	-				+0.3
3,337,284	-				-0.2
3,337,284	-				-0.4
3,337,302	+				+0.8
3,337,302	+				-0.8
3,337,332	+				-0.5
3,337,332	+				-0.2
3,337,333	-				+1.0
3,337,375	+				+0.4
3,337,375	+				+0.2
3,337,376	-				+0.1
3,337,376	-				+0.6
3,337,376	-				+1.4
3,337,376	-				-2.1
3,337,380	+				+1.4
3,337,380	+				+0.2
3,337,381	-				-1.6
3,337,381	-				+0.3
3,337,381	-				+0.8
3,337,381	-				+0.9
3,337,387	-				-0.1
3,337,446	+				+0.5
3,337,483	-				+0.1
3,337,511	+				-1.7
3,337,536	+				-1.6
3,337,536	+				-1.2
3,337,536	+				+1.4
3,337,536	+				+0.2
3,337,536	+				+0.4
3,337,536	+				-0.2
3,337,537	-				-0.9
3,337,537	-				-0.1
3,337,537	-				+0.0
3,337,537	-				+0.4
3,337,537	-				+0.8
3,337,540	+				-0.8
3,337,540	+				-0.3
3,337,541	-				+2.1
3,337,653	+		Sama_2797	0.23	-1.1
3,337,653	+		Sama_2797	0.23	-0.3
3,337,654	-		Sama_2797	0.23	+1.6
3,337,745	+		Sama_2797	0.34	+0.1
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	-1.2
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	+1.8
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	-0.0
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	-0.3
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	+0.5
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	+0.8
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	-0.2
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	-0.8
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	-0.9
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	+0.6
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	+1.4
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	+0.3
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	-0.8
3,337,819	+		Sama_2797	0.43	-0.4
3,337,819	+		Sama_2797	0.43	+0.8
3,337,819	+		Sama_2797	0.43	-0.1
3,337,819	+		Sama_2797	0.43	-1.3
3,337,820	-		Sama_2797	0.43	+0.8
3,337,820	-		Sama_2797	0.43	-0.6
3,337,820	-		Sama_2797	0.43	+0.4
3,337,876	+		Sama_2797	0.50	-0.5
3,337,877	-		Sama_2797	0.50	+1.1
3,337,913	+		Sama_2797	0.54	+0.7
3,337,913	+		Sama_2797	0.54	-1.6
3,337,913	+		Sama_2797	0.54	-2.4
3,337,914	-		Sama_2797	0.54	-1.0
3,337,914	-		Sama_2797	0.54	-0.9
3,337,914	-		Sama_2797	0.54	+1.6
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	-0.3
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	+0.6
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	+0.0
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	-0.6
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	-0.0
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	-1.5
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+0.1
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	-0.0
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+1.1
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+0.4
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	-0.6
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	-0.2
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+0.2
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+1.7
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+0.5
3,338,059	+		Sama_2797	0.71	-0.9
3,338,059	+		Sama_2797	0.71	+1.1
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	+0.2
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	+0.1
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-1.4
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	+0.6
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-0.2
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-0.6
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-3.5
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-0.8
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	+0.4
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