Strain Fitness in Shewanella amazonensis SB2B around Sama_1872

Experiment: Cobalt chloride 0.078125 mM

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Cobalt chloride 0.078125 mM
2,282,670	+		Sama_1871	0.70	-0.6
2,282,671	-		Sama_1871	0.70	+0.1
2,282,671	-		Sama_1871	0.70	+0.1
2,282,671	-		Sama_1871	0.70	-0.9
2,282,671	-		Sama_1871	0.70	+0.1
2,282,764	-		Sama_1871	0.74	-0.6
2,282,764	-		Sama_1871	0.74	+0.5
2,282,771	+		Sama_1871	0.75	-1.9
2,282,811	-		Sama_1871	0.77	-0.0
2,282,856	-		Sama_1871	0.79	-1.9
2,282,856	-		Sama_1871	0.79	+0.7
2,282,856	-		Sama_1871	0.79	-1.2
2,282,856	-		Sama_1871	0.79	+0.1
2,282,856	-		Sama_1871	0.79	-0.7
2,282,856	-		Sama_1871	0.79	+1.4
2,282,864	+		Sama_1871	0.79	-2.1
2,282,864	+		Sama_1871	0.79	+1.1
2,282,864	+		Sama_1871	0.79	-1.5
2,282,864	+		Sama_1871	0.79	+0.8
2,282,864	+		Sama_1871	0.79	+1.1
2,282,877	-		Sama_1871	0.80	-1.5
2,282,989	+		Sama_1871	0.86	+0.9
2,282,989	+		Sama_1871	0.86	-0.5
2,282,990	-		Sama_1871	0.86	-0.7
2,282,993	+		Sama_1871	0.86	+0.5
2,282,993	+		Sama_1871	0.86	-0.2
2,283,012	-		Sama_1871	0.87	+0.5
2,283,024	+		Sama_1871	0.87	-0.1
2,283,025	-		Sama_1871	0.87	-0.4
2,283,025	-		Sama_1871	0.87	+0.8
2,283,068	+		Sama_1871	0.90	+1.1
2,283,069	-		Sama_1871	0.90	-0.7
2,283,069	-		Sama_1871	0.90	+0.8
2,283,069	-		Sama_1871	0.90	-1.6
2,283,245	-				-0.5
2,283,266	-				-1.3
2,283,279	+				-0.7
2,283,279	+				+0.1
2,283,279	+				-0.4
2,283,279	+				+0.3
2,283,280	-				-1.3
2,283,280	-				-1.6
2,283,280	-				+0.1
2,283,280	-				-0.5
2,283,280	-				-0.1
2,283,280	-				+0.3
2,283,280	-				+0.3
2,283,283	-				-0.4
2,283,283	-				-1.5
2,283,310	+				+1.3
2,283,311	-				+0.9
2,283,322	-				+0.8
2,283,322	-				-1.0
2,283,322	-				+0.3
2,283,322	-				-0.2
2,283,348	+				-0.6
2,283,349	-				-1.1
2,283,352	+				-1.2
2,283,353	-				+0.9
2,283,353	-				-1.6
2,283,405	-				+0.2
2,283,417	+				+2.1
2,283,458	-				+0.1
2,283,488	+				-1.3
2,283,489	-				-0.1
2,283,493	-				-0.3
2,283,524	-				-0.9
2,283,524	-				-1.1
2,283,524	-				+0.6
2,283,524	-				-0.9
2,283,527	+				+1.8
2,283,546	+				-1.5
2,283,547	-				-0.4
2,283,584	+				+0.3
2,283,585	-				-1.1
2,283,589	-				-0.7
2,283,589	-				+1.1
2,283,599	+				+0.1
2,283,599	+				-0.5
2,283,600	-				+0.1
2,283,600	-				-0.0
2,283,600	-				+1.9
2,283,662	-				+0.1
2,283,763	-				-0.7
2,283,775	-				-0.7
2,283,775	-				-1.1
2,283,817	+				-0.4
2,283,817	+				-1.7
2,283,818	-				+0.8
2,283,818	-				+0.6
2,283,818	-				+0.8
2,283,818	-				-0.9
2,283,818	-				+0.6
2,283,850	-				-1.2
2,283,879	-				+1.8
2,283,879	-				+1.5
2,283,879	-				-0.8
2,283,889	+				-0.1
2,283,890	-				-2.0
2,283,977	-		Sama_1872	0.11	+0.7
2,283,996	+		Sama_1872	0.12	-1.7
2,283,996	+		Sama_1872	0.12	+0.5
2,283,999	+		Sama_1872	0.12	+0.6
2,284,024	+		Sama_1872	0.12	+1.9
2,284,088	+		Sama_1872	0.14	-0.8
2,284,122	+		Sama_1872	0.16	-0.3
2,284,123	-		Sama_1872	0.16	-1.4
2,284,123	-		Sama_1872	0.16	+0.3
2,284,123	-		Sama_1872	0.16	+0.1
2,284,159	+		Sama_1872	0.17	+0.1
2,284,160	-		Sama_1872	0.17	-0.8
2,284,166	-		Sama_1872	0.17	-0.8
2,284,262	+		Sama_1872	0.20	+0.2
2,284,262	+		Sama_1872	0.20	+0.8
2,284,262	+		Sama_1872	0.20	+0.2
2,284,262	+		Sama_1872	0.20	+0.3
2,284,289	+		Sama_1872	0.21	-0.9
2,284,371	-		Sama_1872	0.23	-1.1
2,284,371	-		Sama_1872	0.23	-0.6
2,284,383	+		Sama_1872	0.24	+0.5
2,284,384	-		Sama_1872	0.24	+0.5
2,284,422	+		Sama_1872	0.25	+0.8
2,284,423	-		Sama_1872	0.25	+0.9
2,284,423	-		Sama_1872	0.25	-0.7
2,284,423	-		Sama_1872	0.25	+0.8
2,284,431	-		Sama_1872	0.25	-0.3
2,284,458	-		Sama_1872	0.26	-0.1
2,284,458	-		Sama_1872	0.26	-0.9
2,284,458	-		Sama_1872	0.26	-1.4
2,284,462	-		Sama_1872	0.26	-1.1
2,284,487	-		Sama_1872	0.27	+0.3
2,284,497	+		Sama_1872	0.27	+0.6
2,284,498	-		Sama_1872	0.28	-0.8
2,284,519	-		Sama_1872	0.28	-1.2
2,284,562	+		Sama_1872	0.30	-0.1
2,284,563	-		Sama_1872	0.30	-0.9
2,284,563	-		Sama_1872	0.30	-0.5
2,284,563	-		Sama_1872	0.30	-1.6
2,284,612	+		Sama_1872	0.31	-0.6
2,284,638	+		Sama_1872	0.32	-0.4
2,284,700	-		Sama_1872	0.34	-1.0
2,284,700	-		Sama_1872	0.34	-0.4
2,284,700	-		Sama_1872	0.34	-0.6
2,284,786	-		Sama_1872	0.37	+0.7
2,284,801	-		Sama_1872	0.37	-1.0
2,284,801	-		Sama_1872	0.37	+2.1
2,284,818	+		Sama_1872	0.38	+1.1
2,284,819	-		Sama_1872	0.38	-0.8
2,284,883	+		Sama_1872	0.40	+0.5
2,284,883	+		Sama_1872	0.40	-1.9
2,284,968	+		Sama_1872	0.42	+1.1
2,285,029	+		Sama_1872	0.44	+0.3
2,285,036	-		Sama_1872	0.45	-0.0
2,285,066	-		Sama_1872	0.46	-0.8
2,285,067	+		Sama_1872	0.46	-0.3
2,285,068	-		Sama_1872	0.46	-0.6
2,285,126	+		Sama_1872	0.48	-0.9
2,285,127	-		Sama_1872	0.48	+0.9
2,285,127	-		Sama_1872	0.48	+0.6
2,285,137	+		Sama_1872	0.48	+0.1
2,285,138	-		Sama_1872	0.48	+0.3
2,285,217	+		Sama_1872	0.50	+1.5
2,285,217	+		Sama_1872	0.50	-1.1
2,285,217	+		Sama_1872	0.50	-0.2
2,285,218	-		Sama_1872	0.50	-2.5
2,285,218	-		Sama_1872	0.50	-0.4
2,285,218	-		Sama_1872	0.50	-1.4
2,285,218	-		Sama_1872	0.50	+0.8
2,285,218	-		Sama_1872	0.50	+0.4
2,285,218	-		Sama_1872	0.50	-0.1
2,285,239	+		Sama_1872	0.51	-1.9
2,285,240	-		Sama_1872	0.51	+0.1
2,285,275	-		Sama_1872	0.52	+0.6
2,285,287	-		Sama_1872	0.53	+0.3
2,285,303	+		Sama_1872	0.53	+0.2
2,285,303	+		Sama_1872	0.53	-0.9
2,285,303	+		Sama_1872	0.53	-0.1
2,285,350	-		Sama_1872	0.55	-0.2
2,285,449	+		Sama_1872	0.58	+1.8
2,285,449	+		Sama_1872	0.58	-0.8
2,285,450	-		Sama_1872	0.58	+1.1
2,285,450	-		Sama_1872	0.58	+1.3
2,285,565	+		Sama_1872	0.61	-0.9
2,285,575	+		Sama_1872	0.62	+1.4
2,285,642	+		Sama_1872	0.64	-0.3
2,285,642	+		Sama_1872	0.64	-0.2
2,285,669	+		Sama_1872	0.65	-2.3
2,285,766	+		Sama_1872	0.68	-0.5
2,285,766	+		Sama_1872	0.68	-0.4
2,285,766	+		Sama_1872	0.68	-0.7
2,285,766	+		Sama_1872	0.68	-0.8
2,285,766	+		Sama_1872	0.68	+0.1
2,285,766	+		Sama_1872	0.68	-0.7
2,285,766	+		Sama_1872	0.68	-0.6
2,285,767	-		Sama_1872	0.68	-1.4
2,285,767	-		Sama_1872	0.68	-1.0
2,285,767	-		Sama_1872	0.68	-0.1
2,285,767	-		Sama_1872	0.68	-0.0
2,285,767	-		Sama_1872	0.68	+0.3
2,285,767	-		Sama_1872	0.68	-0.2
2,285,767	-		Sama_1872	0.68	-0.9
2,285,767	-		Sama_1872	0.68	+0.6
2,285,767	-		Sama_1872	0.68	+0.5
2,285,770	+		Sama_1872	0.68	+1.1
2,285,770	+		Sama_1872	0.68	+0.0
2,285,771	-		Sama_1872	0.68	-1.0
2,285,771	-		Sama_1872	0.68	+1.2
2,285,771	-		Sama_1872	0.68	+0.4
2,285,771	-		Sama_1872	0.68	-1.8
2,285,771	-		Sama_1872	0.68	+1.3
2,285,771	-		Sama_1872	0.68	-1.4
2,285,837	-		Sama_1872	0.70	-0.6
2,285,839	-		Sama_1872	0.70	-0.1
2,285,855	+		Sama_1872	0.71	-0.5
2,285,855	+		Sama_1872	0.71	-0.7
2,285,855	+		Sama_1872	0.71	+0.0
2,285,885	+		Sama_1872	0.72	+0.5
2,285,950	-		Sama_1872	0.74	-1.9
2,285,956	+		Sama_1872	0.74	-1.5
2,285,956	+		Sama_1872	0.74	-0.7
2,285,956	+		Sama_1872	0.74	+0.0
2,285,956	+		Sama_1872	0.74	+0.3
2,285,957	-		Sama_1872	0.74	-1.0
2,285,957	-		Sama_1872	0.74	+0.6
2,285,957	-		Sama_1872	0.74	-1.7
2,285,957	-		Sama_1872	0.74	-1.9
2,285,970	-		Sama_1872	0.74	+0.9
2,285,987	+		Sama_1872	0.75	-1.1
2,286,034	+		Sama_1872	0.76	+0.2
2,286,034	+		Sama_1872	0.76	+0.9
2,286,034	+		Sama_1872	0.76	-0.3
2,286,034	+		Sama_1872	0.76	+1.5
2,286,034	+		Sama_1872	0.76	+0.3
2,286,035	-		Sama_1872	0.76	+0.3
2,286,035	-		Sama_1872	0.76	-1.2
2,286,135	+		Sama_1872	0.80	+0.1
2,286,158	-		Sama_1872	0.80	+0.3
2,286,177	+		Sama_1872	0.81	+0.5
2,286,236	+		Sama_1872	0.83	-0.4
2,286,236	+		Sama_1872	0.83	+1.5
2,286,236	+		Sama_1872	0.83	+0.4
2,286,237	-		Sama_1872	0.83	-1.3
2,286,284	+		Sama_1872	0.84	-0.7
2,286,285	-		Sama_1872	0.84	-2.0
2,286,285	-		Sama_1872	0.84	-0.4
2,286,288	+		Sama_1872	0.84	-0.4
2,286,288	+		Sama_1872	0.84	-1.5
2,286,288	+		Sama_1872	0.84	+0.6
2,286,288	+		Sama_1872	0.84	-1.2
2,286,289	-		Sama_1872	0.85	-2.0
2,286,289	-		Sama_1872	0.85	-1.1
2,286,294	+		Sama_1872	0.85	-0.1
2,286,294	+		Sama_1872	0.85	-0.8
2,286,294	+		Sama_1872	0.85	+0.3
2,286,294	+		Sama_1872	0.85	+0.5
2,286,295	-		Sama_1872	0.85	+0.1
2,286,295	-		Sama_1872	0.85	-0.4
2,286,297	+		Sama_1872	0.85	-0.4
2,286,297	+		Sama_1872	0.85	+0.8
2,286,298	-		Sama_1872	0.85	-0.5
2,286,318	+		Sama_1872	0.85	-1.5
2,286,327	-		Sama_1872	0.86	-0.7
2,286,347	+		Sama_1872	0.86	+0.8
2,286,406	-		Sama_1872	0.88	-0.4
2,286,436	-		Sama_1872	0.89	+0.9
2,286,456	+		Sama_1872	0.90	+0.3
2,286,456	+		Sama_1872	0.90	+0.9
2,286,456	+		Sama_1872	0.90	-0.1
2,286,456	+		Sama_1872	0.90	+0.8
2,286,457	-		Sama_1872	0.90	-0.2
2,286,457	-		Sama_1872	0.90	+0.8
2,286,457	-		Sama_1872	0.90	-2.1
2,286,457	-		Sama_1872	0.90	-1.7
2,286,457	-		Sama_1872	0.90	-0.2
2,286,457	-		Sama_1872	0.90	-0.0
2,286,457	-		Sama_1872	0.90	-1.6
2,286,458	+		Sama_1872	0.90	-1.6
2,286,458	+		Sama_1872	0.90	-0.9
2,286,458	+		Sama_1872	0.90	-0.7
2,286,458	+		Sama_1872	0.90	-0.1
2,286,459	-		Sama_1872	0.90	-1.1
2,286,459	-		Sama_1872	0.90	+0.3
2,286,459	-		Sama_1872	0.90	-0.4
2,286,486	+				-1.3
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