Strain Fitness in Shewanella amazonensis SB2B around Sama_2811

Experiment: Glycine (N)

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Glycine (N)
3,348,625	+		Sama_2809	0.72	-0.1
3,348,662	-		Sama_2809	0.79	+0.7
3,348,662	-		Sama_2809	0.79	+0.8
3,348,703	+		Sama_2809	0.87	-1.0
3,348,747	-				-0.1
3,348,790	-				+0.1
3,348,810	-				-0.1
3,348,845	+				-0.1
3,348,896	+		Sama_2810	0.15	+1.4
3,348,896	+		Sama_2810	0.15	-0.7
3,348,896	+		Sama_2810	0.15	+0.2
3,348,896	+		Sama_2810	0.15	-0.1
3,348,896	+		Sama_2810	0.15	-0.8
3,348,896	+		Sama_2810	0.15	+0.5
3,348,897	-		Sama_2810	0.15	-2.8
3,348,897	-		Sama_2810	0.15	-1.0
3,348,897	-		Sama_2810	0.15	-0.5
3,348,897	-		Sama_2810	0.15	-1.7
3,348,897	-		Sama_2810	0.15	+0.3
3,348,897	-		Sama_2810	0.15	-1.3
3,348,966	+		Sama_2810	0.23	-0.0
3,348,967	-		Sama_2810	0.23	-2.0
3,348,984	+		Sama_2810	0.25	+0.3
3,349,010	-		Sama_2810	0.29	+0.6
3,349,040	-		Sama_2810	0.32	-2.2
3,349,040	-		Sama_2810	0.32	+0.1
3,349,040	-		Sama_2810	0.32	-0.2
3,349,063	+		Sama_2810	0.35	-1.4
3,349,063	+		Sama_2810	0.35	+1.7
3,349,064	-		Sama_2810	0.35	+0.7
3,349,207	+		Sama_2810	0.53	-0.7
3,349,208	-		Sama_2810	0.53	-1.3
3,349,228	+		Sama_2810	0.55	+0.1
3,349,228	+		Sama_2810	0.55	+0.8
3,349,228	+		Sama_2810	0.55	-0.2
3,349,228	+		Sama_2810	0.55	-0.5
3,349,228	+		Sama_2810	0.55	-0.7
3,349,228	+		Sama_2810	0.55	-1.4
3,349,228	+		Sama_2810	0.55	-0.0
3,349,229	-		Sama_2810	0.55	-0.8
3,349,229	-		Sama_2810	0.55	+0.9
3,349,229	-		Sama_2810	0.55	-0.4
3,349,229	-		Sama_2810	0.55	+0.0
3,349,229	-		Sama_2810	0.55	-0.8
3,349,242	+		Sama_2810	0.57	-0.1
3,349,242	+		Sama_2810	0.57	-2.0
3,349,242	+		Sama_2810	0.57	+1.0
3,349,242	+		Sama_2810	0.57	+0.4
3,349,242	+		Sama_2810	0.57	-1.2
3,349,528	-				+0.3
3,349,565	+				+0.2
3,349,565	+				+0.4
3,349,588	+				+0.8
3,349,589	-				+0.3
3,349,589	-				-0.3
3,349,606	+				-2.4
3,349,677	+				-0.2
3,349,678	-				-0.6
3,349,719	+		Sama_2811	0.11	-0.1
3,349,719	+		Sama_2811	0.11	-0.7
3,349,719	+		Sama_2811	0.11	-1.0
3,349,737	+		Sama_2811	0.12	-0.1
3,349,761	+		Sama_2811	0.15	-0.8
3,349,762	-		Sama_2811	0.15	-0.1
3,349,762	-		Sama_2811	0.15	-0.1
3,349,875	+		Sama_2811	0.27	-1.0
3,349,875	+		Sama_2811	0.27	-1.9
3,349,876	-		Sama_2811	0.27	-0.1
3,349,876	-		Sama_2811	0.27	+0.3
3,349,876	-		Sama_2811	0.27	-0.5
3,349,876	-		Sama_2811	0.27	-0.1
3,349,876	-		Sama_2811	0.27	-1.4
3,349,876	-		Sama_2811	0.27	-0.0
3,349,876	-		Sama_2811	0.27	-1.0
3,349,879	+		Sama_2811	0.27	-1.0
3,349,879	+		Sama_2811	0.27	-1.3
3,349,879	+		Sama_2811	0.27	-2.4
3,349,879	+		Sama_2811	0.27	-0.4
3,349,879	+		Sama_2811	0.27	-0.8
3,349,879	+		Sama_2811	0.27	-1.8
3,349,880	-		Sama_2811	0.27	-0.5
3,349,880	-		Sama_2811	0.27	-0.7
3,349,880	-		Sama_2811	0.27	-0.8
3,349,880	-		Sama_2811	0.27	-0.2
3,349,880	-		Sama_2811	0.27	-0.9
3,349,880	-		Sama_2811	0.27	-0.2
3,350,031	+		Sama_2811	0.43	+0.9
3,350,031	+		Sama_2811	0.43	+1.0
3,350,032	-		Sama_2811	0.43	-0.9
3,350,032	-		Sama_2811	0.43	+0.5
3,350,032	-		Sama_2811	0.43	-1.5
3,350,032	-		Sama_2811	0.43	+0.1
3,350,044	+		Sama_2811	0.45	-1.9
3,350,045	-		Sama_2811	0.45	-0.1
3,350,045	-		Sama_2811	0.45	-0.7
3,350,059	-		Sama_2811	0.46	+0.9
3,350,077	-		Sama_2811	0.48	+0.6
3,350,229	+		Sama_2811	0.64	-0.3
3,350,229	+		Sama_2811	0.64	+0.4
3,350,229	+		Sama_2811	0.64	-1.5
3,350,229	+		Sama_2811	0.64	+0.3
3,350,229	+		Sama_2811	0.64	+1.6
3,350,229	+		Sama_2811	0.64	-0.7
3,350,229	+		Sama_2811	0.64	-0.7
3,350,229	+		Sama_2811	0.64	-0.1
3,350,230	-		Sama_2811	0.64	-1.2
3,350,230	-		Sama_2811	0.64	-0.5
3,350,230	-		Sama_2811	0.64	-1.2
3,350,230	-		Sama_2811	0.64	+0.7
3,350,230	-		Sama_2811	0.64	+0.2
3,350,230	-		Sama_2811	0.64	+0.2
3,350,230	-		Sama_2811	0.64	-1.1
3,350,230	-		Sama_2811	0.64	-0.2
3,350,230	-		Sama_2811	0.64	-0.7
3,350,230	-		Sama_2811	0.64	-0.2
3,350,230	-		Sama_2811	0.64	-0.3
3,350,230	-		Sama_2811	0.64	-1.0
3,350,230	-		Sama_2811	0.64	-1.6
3,350,230	-		Sama_2811	0.64	-0.5
3,350,362	+		Sama_2811	0.78	-0.2
3,350,362	+		Sama_2811	0.78	-0.7
3,350,363	-		Sama_2811	0.78	+1.1
3,350,366	+		Sama_2811	0.78	+1.2
3,350,366	+		Sama_2811	0.78	+0.3
3,350,366	+		Sama_2811	0.78	-0.8
3,350,366	+		Sama_2811	0.78	+0.5
3,350,366	+		Sama_2811	0.78	+1.8
3,350,366	+		Sama_2811	0.78	-1.3
3,350,366	+		Sama_2811	0.78	+0.6
3,350,367	-		Sama_2811	0.79	+0.9
3,350,367	-		Sama_2811	0.79	+0.5
3,350,382	+		Sama_2811	0.80	-0.4
3,350,382	+		Sama_2811	0.80	+0.8
3,350,383	-		Sama_2811	0.80	+0.1
3,350,383	-		Sama_2811	0.80	-1.0
3,350,416	-		Sama_2811	0.84	+0.2
3,350,425	+		Sama_2811	0.85	+1.3
3,350,457	+		Sama_2811	0.88	+0.4
3,350,458	-		Sama_2811	0.88	-0.6
3,350,554	+				+0.3
3,350,555	-				-1.2
3,350,575	+				+0.7
3,350,575	+				-0.6
3,350,575	+				-1.5
3,350,575	+				-2.1
3,350,575	+				-0.5
3,350,576	-				+0.9
3,350,576	-				-0.1
3,350,576	-				-0.7
3,350,576	-				+0.3
3,350,648	+		Sama_2812	0.12	+1.2
3,350,649	-		Sama_2812	0.12	-0.2
3,350,684	+		Sama_2812	0.18	-0.5
3,350,685	-		Sama_2812	0.18	+0.0
3,350,788	+		Sama_2812	0.35	+0.6
3,350,788	+		Sama_2812	0.35	-0.7
3,350,788	+		Sama_2812	0.35	-1.0
3,350,789	-		Sama_2812	0.35	-2.4
3,350,789	-		Sama_2812	0.35	-1.6
3,350,789	-		Sama_2812	0.35	+0.2
3,350,789	-		Sama_2812	0.35	+0.4
3,350,836	+		Sama_2812	0.42	-0.0
3,350,836	+		Sama_2812	0.42	-0.9
3,350,836	+		Sama_2812	0.42	-1.6
3,350,837	-		Sama_2812	0.43	-1.0
3,350,837	-		Sama_2812	0.43	+1.8
3,350,837	-		Sama_2812	0.43	+0.0
3,350,837	-		Sama_2812	0.43	-0.5
3,350,837	-		Sama_2812	0.43	+0.8
3,350,863	+		Sama_2812	0.47	+0.1
3,350,863	+		Sama_2812	0.47	-2.3
3,350,864	-		Sama_2812	0.47	-1.2
3,350,864	-		Sama_2812	0.47	+0.1
3,350,888	-		Sama_2812	0.51	+0.3
3,350,888	-		Sama_2812	0.51	+0.7
3,350,888	-		Sama_2812	0.51	-0.7
3,350,949	-		Sama_2812	0.61	+2.0
3,350,962	+		Sama_2812	0.63	-1.0
3,350,962	+		Sama_2812	0.63	-0.4
3,350,963	-		Sama_2812	0.63	+0.7
3,350,971	+		Sama_2812	0.64	+1.6
3,350,971	+		Sama_2812	0.64	+0.4
3,350,971	+		Sama_2812	0.64	-0.1
3,350,971	+		Sama_2812	0.64	+0.2
3,350,971	+		Sama_2812	0.64	+0.6
3,350,971	+		Sama_2812	0.64	-1.2
3,350,971	+		Sama_2812	0.64	-1.9
3,350,972	-		Sama_2812	0.64	+0.5
3,350,972	-		Sama_2812	0.64	-0.9
3,350,972	-		Sama_2812	0.64	+2.2
3,350,972	-		Sama_2812	0.64	+0.2
3,350,972	-		Sama_2812	0.64	+2.9
3,350,972	-		Sama_2812	0.64	-1.0
3,350,972	-		Sama_2812	0.64	-0.9
3,350,972	-		Sama_2812	0.64	-2.8
3,350,972	-		Sama_2812	0.64	-0.2
3,350,972	-		Sama_2812	0.64	+0.2
3,350,972	-		Sama_2812	0.64	+0.0
3,350,972	-		Sama_2812	0.64	+0.7
3,350,972	-		Sama_2812	0.64	-0.9
3,350,972	-		Sama_2812	0.64	+0.4
3,350,975	+		Sama_2812	0.65	-2.4
3,350,975	+		Sama_2812	0.65	-0.7
3,350,975	+		Sama_2812	0.65	-1.3
3,350,975	+		Sama_2812	0.65	-0.6
3,350,975	+		Sama_2812	0.65	-0.1
3,350,975	+		Sama_2812	0.65	-1.0
3,350,976	-		Sama_2812	0.65	-0.6
3,350,976	-		Sama_2812	0.65	-2.4
3,350,976	-		Sama_2812	0.65	-0.8
3,350,976	-		Sama_2812	0.65	-0.6
3,351,006	+		Sama_2812	0.70	-1.6
3,351,006	+		Sama_2812	0.70	-1.6
3,351,006	+		Sama_2812	0.70	-0.6
3,351,006	+		Sama_2812	0.70	-0.9
3,351,007	-		Sama_2812	0.70	+1.3
3,351,007	-		Sama_2812	0.70	-0.8
3,351,007	-		Sama_2812	0.70	-0.6
3,351,007	-		Sama_2812	0.70	-0.6
3,351,016	+		Sama_2812	0.72	+0.3
3,351,121	+		Sama_2812	0.89	+0.6
3,351,121	+		Sama_2812	0.89	+0.6
3,351,121	+		Sama_2812	0.89	-0.2
3,351,121	+		Sama_2812	0.89	+0.2
3,351,121	+		Sama_2812	0.89	-0.2
3,351,121	+		Sama_2812	0.89	-1.4
3,351,121	+		Sama_2812	0.89	+0.9
3,351,121	+		Sama_2812	0.89	-0.3
3,351,121	+		Sama_2812	0.89	+0.3
3,351,121	+		Sama_2812	0.89	-0.5
3,351,121	+		Sama_2812	0.89	+1.3
3,351,121	+		Sama_2812	0.89	-1.0
3,351,121	+		Sama_2812	0.89	+0.3
3,351,122	-		Sama_2812	0.89	-0.6
3,351,122	-		Sama_2812	0.89	-0.2
3,351,122	-		Sama_2812	0.89	-1.5
3,351,122	-		Sama_2812	0.89	+0.4
3,351,122	-		Sama_2812	0.89	+0.3
3,351,122	-		Sama_2812	0.89	+0.0
3,351,122	-		Sama_2812	0.89	+1.1
3,351,122	-		Sama_2812	0.89	+1.9
3,351,122	-		Sama_2812	0.89	+0.6
3,351,122	-		Sama_2812	0.89	+0.3
3,351,122	-		Sama_2812	0.89	-0.3
3,351,242	+				+1.3
3,351,299	-	djlA	Sama_2813	0.12	-0.3
3,351,376	-	djlA	Sama_2813	0.22	-0.3
3,351,389	-	djlA	Sama_2813	0.23	+0.1
3,351,389	-	djlA	Sama_2813	0.23	+0.7
3,351,395	-	djlA	Sama_2813	0.24	-0.2
3,351,395	-	djlA	Sama_2813	0.24	+0.6
3,351,404	+	djlA	Sama_2813	0.25	-0.2
3,351,405	-	djlA	Sama_2813	0.26	+0.9
3,351,523	+	djlA	Sama_2813	0.41	-0.9