Strain Fitness in Shewanella amazonensis SB2B around Sama_2025

Experiment: L-Arginine (N)

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	L-Arginine (N)
2,459,463	-		Sama_2024	0.11	+0.1
2,459,550	+		Sama_2024	0.20	+0.3
2,459,551	-		Sama_2024	0.20	-1.5
2,459,556	+		Sama_2024	0.20	+0.1
2,459,615	+		Sama_2024	0.26	+0.4
2,459,616	-		Sama_2024	0.26	-0.8
2,459,627	+		Sama_2024	0.27	+1.6
2,459,628	-		Sama_2024	0.27	-1.8
2,459,628	-		Sama_2024	0.27	+0.3
2,459,628	-		Sama_2024	0.27	+0.8
2,459,628	-		Sama_2024	0.27	+0.4
2,459,628	-		Sama_2024	0.27	+2.0
2,459,631	+		Sama_2024	0.28	-0.8
2,459,631	+		Sama_2024	0.28	-0.5
2,459,632	-		Sama_2024	0.28	-0.8
2,459,632	-		Sama_2024	0.28	-0.4
2,459,769	+		Sama_2024	0.42	-0.4
2,459,770	-		Sama_2024	0.42	-0.3
2,459,770	-		Sama_2024	0.42	+2.0
2,459,813	+		Sama_2024	0.46	-0.1
2,459,813	+		Sama_2024	0.46	+2.1
2,459,813	+		Sama_2024	0.46	-0.3
2,459,814	-		Sama_2024	0.46	+2.6
2,459,953	+		Sama_2024	0.60	+0.6
2,459,958	+		Sama_2024	0.60	+0.1
2,459,958	+		Sama_2024	0.60	-0.1
2,459,959	-		Sama_2024	0.60	+1.0
2,459,959	-		Sama_2024	0.60	+0.2
2,459,959	-		Sama_2024	0.60	+0.7
2,459,959	-		Sama_2024	0.60	-1.0
2,459,960	+		Sama_2024	0.61	-0.1
2,459,961	-		Sama_2024	0.61	+0.6
2,459,961	-		Sama_2024	0.61	-0.6
2,460,089	+		Sama_2024	0.73	+0.3
2,460,089	+		Sama_2024	0.73	+2.4
2,460,089	+		Sama_2024	0.73	-1.7
2,460,089	+		Sama_2024	0.73	+1.3
2,460,090	-		Sama_2024	0.74	-0.3
2,460,090	-		Sama_2024	0.74	+0.9
2,460,090	-		Sama_2024	0.74	+0.5
2,460,090	-		Sama_2024	0.74	-0.6
2,460,090	-		Sama_2024	0.74	-1.3
2,460,090	-		Sama_2024	0.74	-1.0
2,460,090	-		Sama_2024	0.74	+0.7
2,460,090	-		Sama_2024	0.74	+1.5
2,460,090	-		Sama_2024	0.74	-1.9
2,460,090	-		Sama_2024	0.74	+0.4
2,460,126	-		Sama_2024	0.77	-0.0
2,460,150	+		Sama_2024	0.80	+0.9
2,460,151	-		Sama_2024	0.80	-0.5
2,460,151	-		Sama_2024	0.80	-1.9
2,460,289	+				-0.1
2,460,308	+				-0.2
2,460,315	+				-1.0
2,460,315	+				+1.1
2,460,316	-				-0.9
2,460,316	-				+0.7
2,460,338	-				-0.2
2,460,382	+				-0.3
2,460,382	+				-1.1
2,460,382	+				-0.6
2,460,383	-				+0.2
2,460,383	-				-0.3
2,460,383	-				+1.4
2,460,388	+				+1.8
2,460,388	+				-1.9
2,460,388	+				+0.1
2,460,389	-				-0.1
2,460,389	-				-0.4
2,460,389	-				-0.5
2,460,389	-				+0.7
2,460,439	-				+0.8
2,460,462	+				+1.8
2,460,463	-				-1.3
2,460,469	+				-2.9
2,460,481	-				+0.1
2,460,492	-				+0.8
2,460,505	-				+0.6
2,460,513	-				-0.2
2,460,513	-				-0.7
2,460,558	-				-0.8
2,460,558	-				+0.2
2,460,558	-				+2.4
2,460,558	-				-1.2
2,460,558	-				+0.5
2,460,558	-				-3.6
2,460,558	-				+0.6
2,460,561	+				+0.3
2,460,561	+				-2.0
2,460,562	-				-0.6
2,460,562	-				+1.0
2,460,653	-		Sama_2025	0.11	+1.4
2,460,724	+		Sama_2025	0.15	+0.2
2,460,763	+		Sama_2025	0.17	+0.9
2,460,792	+		Sama_2025	0.18	+0.1
2,460,793	-		Sama_2025	0.18	-1.2
2,460,800	+		Sama_2025	0.19	-0.7
2,460,801	-		Sama_2025	0.19	+0.7
2,460,801	-		Sama_2025	0.19	-0.4
2,460,801	-		Sama_2025	0.19	-1.4
2,460,801	-		Sama_2025	0.19	-0.7
2,460,808	-		Sama_2025	0.19	-2.5
2,460,840	-		Sama_2025	0.21	+1.6
2,460,905	+		Sama_2025	0.24	+0.4
2,460,906	-		Sama_2025	0.24	-1.5
2,460,906	-		Sama_2025	0.24	-0.2
2,460,906	-		Sama_2025	0.24	+1.2
2,460,906	-		Sama_2025	0.24	+0.8
2,460,906	-		Sama_2025	0.24	+1.1
2,460,979	-		Sama_2025	0.28	-1.3
2,461,001	+		Sama_2025	0.29	-0.3
2,461,001	+		Sama_2025	0.29	-1.1
2,461,015	-		Sama_2025	0.30	+0.3
2,461,022	+		Sama_2025	0.30	-2.6
2,461,023	-		Sama_2025	0.30	+1.1
2,461,023	-		Sama_2025	0.30	+1.1
2,461,040	-		Sama_2025	0.31	+0.2
2,461,040	-		Sama_2025	0.31	+0.6
2,461,060	+		Sama_2025	0.32	+0.9
2,461,060	+		Sama_2025	0.32	+2.6
2,461,061	-		Sama_2025	0.32	-2.5
2,461,099	+		Sama_2025	0.34	+0.4
2,461,100	-		Sama_2025	0.34	+1.5
2,461,142	+		Sama_2025	0.36	+1.5
2,461,142	+		Sama_2025	0.36	-0.4
2,461,143	-		Sama_2025	0.37	+0.6
2,461,143	-		Sama_2025	0.37	+1.6
2,461,175	+		Sama_2025	0.38	+2.3
2,461,176	-		Sama_2025	0.38	+0.3
2,461,176	-		Sama_2025	0.38	+1.3
2,461,184	+		Sama_2025	0.39	-1.6
2,461,185	-		Sama_2025	0.39	+0.4
2,461,185	-		Sama_2025	0.39	-0.1
2,461,228	-		Sama_2025	0.41	+0.7
2,461,228	-		Sama_2025	0.41	-0.4
2,461,268	+		Sama_2025	0.43	-0.8
2,461,268	+		Sama_2025	0.43	+0.0
2,461,268	+		Sama_2025	0.43	+0.7
2,461,268	+		Sama_2025	0.43	-1.1
2,461,268	+		Sama_2025	0.43	-0.5
2,461,269	-		Sama_2025	0.43	+0.6
2,461,269	-		Sama_2025	0.43	-0.1
2,461,269	-		Sama_2025	0.43	-0.8
2,461,271	+		Sama_2025	0.43	+1.2
2,461,271	+		Sama_2025	0.43	+0.6
2,461,271	+		Sama_2025	0.43	+1.4
2,461,272	-		Sama_2025	0.43	+0.6
2,461,272	-		Sama_2025	0.43	-1.0
2,461,272	-		Sama_2025	0.43	+0.5
2,461,272	-		Sama_2025	0.43	+0.4
2,461,326	+		Sama_2025	0.46	+2.1
2,461,327	-		Sama_2025	0.46	+0.8
2,461,327	-		Sama_2025	0.46	-0.6
2,461,327	-		Sama_2025	0.46	+0.8
2,461,327	-		Sama_2025	0.46	-2.3
2,461,339	-		Sama_2025	0.47	-0.2
2,461,369	-		Sama_2025	0.48	-0.8
2,461,382	+		Sama_2025	0.49	+0.5
2,461,408	-		Sama_2025	0.50	+0.7
2,461,456	-		Sama_2025	0.53	-0.2
2,461,534	-		Sama_2025	0.57	+0.8
2,461,541	+		Sama_2025	0.57	-1.4
2,461,542	-		Sama_2025	0.57	-0.2
2,461,542	-		Sama_2025	0.57	-0.5
2,461,620	+		Sama_2025	0.61	+0.2
2,461,697	+		Sama_2025	0.66	-0.2
2,461,744	+		Sama_2025	0.68	+1.7
2,461,745	-		Sama_2025	0.68	+1.0
2,461,745	-		Sama_2025	0.68	+1.4
2,461,768	-		Sama_2025	0.69	-2.9
2,461,768	-		Sama_2025	0.69	+1.4
2,461,769	+		Sama_2025	0.69	+2.2
2,461,770	-		Sama_2025	0.69	+1.6
2,461,770	-		Sama_2025	0.69	-1.9
2,461,770	-		Sama_2025	0.69	-0.0
2,461,770	-		Sama_2025	0.69	-1.7
2,461,770	-		Sama_2025	0.69	+1.6
2,461,770	-		Sama_2025	0.69	+0.2
2,461,770	-		Sama_2025	0.69	+1.1
2,461,822	-		Sama_2025	0.72	-1.1
2,461,826	-		Sama_2025	0.72	+1.9
2,461,831	-		Sama_2025	0.73	+0.7
2,461,853	+		Sama_2025	0.74	-1.6
2,461,853	+		Sama_2025	0.74	+2.0
2,461,853	+		Sama_2025	0.74	-1.3
2,461,853	+		Sama_2025	0.74	-2.4
2,461,853	+		Sama_2025	0.74	+1.7
2,461,854	-		Sama_2025	0.74	-0.4
2,461,897	-		Sama_2025	0.76	+1.3
2,461,897	-		Sama_2025	0.76	-1.8
2,461,984	-		Sama_2025	0.81	-0.2
2,462,000	-		Sama_2025	0.81	-2.2
2,462,007	-		Sama_2025	0.82	+0.3
2,462,007	-		Sama_2025	0.82	+1.0
2,462,007	-		Sama_2025	0.82	+0.2
2,462,044	+		Sama_2025	0.84	-1.7
2,462,065	-		Sama_2025	0.85	+1.2
2,462,091	+		Sama_2025	0.86	+0.7
2,462,091	+		Sama_2025	0.86	-0.4
2,462,091	+		Sama_2025	0.86	-1.4
2,462,092	-		Sama_2025	0.86	-1.2
2,462,156	+		Sama_2025	0.90	-0.0
2,462,156	+		Sama_2025	0.90	-1.8
2,462,157	-		Sama_2025	0.90	+0.7
2,462,157	-		Sama_2025	0.90	-1.3
2,462,157	-		Sama_2025	0.90	+0.2
2,462,157	-		Sama_2025	0.90	+0.3
2,462,157	-		Sama_2025	0.90	+1.1
2,462,157	-		Sama_2025	0.90	-0.7
2,462,191	+				-2.6
2,462,192	-				+1.6
2,462,230	-				+0.6
2,462,322	+				-3.6
2,462,339	-				-0.8
2,462,367	+				+0.1
2,462,368	-				+0.3
2,462,422	+				+0.7
2,462,428	+				-1.7
2,462,429	-				+0.9
2,462,429	-				+1.0
2,462,466	+				+0.8
2,462,466	+				-0.4
2,462,479	-				+0.2
2,462,505	-				-2.0
2,462,505	-				+0.5
2,462,505	-				+0.8
2,462,510	-				+0.6
2,462,510	-				+0.1
2,462,587	+				+2.2
2,462,587	+				-1.6
2,462,594	-				-0.2
2,462,594	-				+0.2
2,462,594	-				+0.2
2,462,606	+				-0.6
2,462,606	+				-1.8
2,462,607	-				-0.7
2,462,607	-				-0.3
2,462,607	-				-0.2
2,462,607	-				+0.2
2,462,621	+				-0.6
2,462,621	+				+0.3
2,462,621	+				+0.7
2,462,622	-				-1.1
2,462,648	+				-2.7
2,462,649	-				+2.6
2,462,649	-				-0.1
2,462,649	-				+1.4
2,462,719	+				-0.3
2,462,762	+				-0.3
2,462,763	-				-2.2
2,462,763	-				+1.6
2,462,763	-				+0.7
2,462,763	-				+0.6
2,462,770	+				-0.7
2,462,820	-		Sama_2026	0.11	+0.9
2,462,820	-		Sama_2026	0.11	+0.6
2,462,897	-		Sama_2026	0.14	-0.5
2,462,897	-		Sama_2026	0.14	+1.1
2,462,897	-		Sama_2026	0.14	-1.6
2,462,897	-		Sama_2026	0.14	+0.8
2,462,903	+		Sama_2026	0.14	-1.9
2,462,904	-		Sama_2026	0.14	-1.4
2,462,934	+		Sama_2026	0.15	-1.2
2,462,984	+		Sama_2026	0.16	+0.4
2,462,985	-		Sama_2026	0.16	+0.0
2,462,997	-		Sama_2026	0.17	-1.1
2,462,997	-		Sama_2026	0.17	+1.3
2,462,997	-		Sama_2026	0.17	+1.1
2,463,116	+		Sama_2026	0.21	-0.6
2,463,116	+		Sama_2026	0.21	+0.7
2,463,129	+		Sama_2026	0.21	-0.0
2,463,129	+		Sama_2026	0.21	-0.8
2,463,129	+		Sama_2026	0.21	-2.0
2,463,130	-		Sama_2026	0.21	+0.6
2,463,134	+		Sama_2026	0.21	-0.4
2,463,135	-		Sama_2026	0.21	+0.5
2,463,156	+		Sama_2026	0.22	-1.4
2,463,156	+		Sama_2026	0.22	-0.9
2,463,157	-		Sama_2026	0.22	+0.7
2,463,167	-		Sama_2026	0.22	-0.4
2,463,187	-		Sama_2026	0.23	-1.3
2,463,187	-		Sama_2026	0.23	-0.1
2,463,242	+		Sama_2026	0.24	-0.4
2,463,242	+		Sama_2026	0.24	+1.2
2,463,309	-		Sama_2026	0.27	+1.0
2,463,320	+		Sama_2026	0.27	-0.9