Strain Fitness in Shewanella amazonensis SB2B around Sama_2797

Experiment: L-Arginine (N)

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	L-Arginine (N)
3,336,528	-		Sama_2796	0.36	-0.3
3,336,631	-		Sama_2796	0.45	+0.7
3,336,903	+		Sama_2796	0.68	-0.1
3,336,903	+		Sama_2796	0.68	-1.0
3,336,903	+		Sama_2796	0.68	-0.2
3,336,912	-		Sama_2796	0.69	+1.3
3,336,912	-		Sama_2796	0.69	-2.5
3,336,912	-		Sama_2796	0.69	+0.7
3,336,915	+		Sama_2796	0.69	+0.3
3,336,915	+		Sama_2796	0.69	+0.2
3,336,915	+		Sama_2796	0.69	-0.4
3,336,938	+		Sama_2796	0.71	+0.3
3,336,938	+		Sama_2796	0.71	-0.8
3,336,938	+		Sama_2796	0.71	-0.2
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	+0.1
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	-0.7
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	+0.5
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	+1.6
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	-1.3
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	-1.2
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	+1.0
3,336,939	-		Sama_2796	0.71	+0.2
3,336,944	+		Sama_2796	0.72	+0.6
3,336,944	+		Sama_2796	0.72	-0.7
3,336,944	+		Sama_2796	0.72	+1.4
3,336,944	+		Sama_2796	0.72	+1.7
3,336,944	+		Sama_2796	0.72	+1.8
3,336,944	+		Sama_2796	0.72	-1.3
3,336,944	+		Sama_2796	0.72	+2.0
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	+1.1
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	+1.0
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	-0.1
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	+0.0
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	+1.5
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	+0.9
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	-0.6
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	+1.4
3,336,945	-		Sama_2796	0.72	-0.0
3,336,958	+		Sama_2796	0.73	+0.8
3,336,959	-		Sama_2796	0.73	-0.3
3,337,034	+		Sama_2796	0.79	-0.6
3,337,034	+		Sama_2796	0.79	+1.8
3,337,034	+		Sama_2796	0.79	+1.1
3,337,034	+		Sama_2796	0.79	+1.8
3,337,034	+		Sama_2796	0.79	+0.9
3,337,034	+		Sama_2796	0.79	-1.4
3,337,034	+		Sama_2796	0.79	+0.9
3,337,035	-		Sama_2796	0.79	+0.7
3,337,035	-		Sama_2796	0.79	-0.5
3,337,035	-		Sama_2796	0.79	+1.3
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	-0.6
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	-0.7
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	+1.7
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	+0.6
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	-1.0
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	-0.9
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	+0.4
3,337,039	+		Sama_2796	0.80	+1.0
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-1.1
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-0.4
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-0.6
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-0.6
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	+1.4
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-0.8
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-1.6
3,337,040	-		Sama_2796	0.80	-0.2
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	+0.9
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	+0.7
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	+1.5
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-0.6
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-0.3
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-1.7
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	+0.7
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-0.8
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-1.1
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	+0.6
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-0.5
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	+0.4
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	-0.9
3,337,043	+		Sama_2796	0.80	+0.9
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-0.9
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-0.2
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-0.5
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	+0.0
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	+1.7
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-1.3
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-0.0
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	+0.5
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-0.7
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	+0.9
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	-0.3
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	+1.7
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	+0.2
3,337,044	-		Sama_2796	0.80	+0.2
3,337,065	-		Sama_2796	0.82	+0.3
3,337,065	-		Sama_2796	0.82	+0.7
3,337,065	-		Sama_2796	0.82	-2.4
3,337,080	+		Sama_2796	0.83	-0.8
3,337,080	+		Sama_2796	0.83	-0.9
3,337,081	-		Sama_2796	0.83	-1.3
3,337,117	-		Sama_2796	0.86	-1.4
3,337,117	-		Sama_2796	0.86	-0.5
3,337,173	+				+0.4
3,337,174	-				+0.5
3,337,174	-				+0.5
3,337,184	+				-0.1
3,337,184	+				+1.4
3,337,185	-				-0.9
3,337,185	-				-0.6
3,337,197	+				+0.9
3,337,283	+				+1.0
3,337,283	+				+1.0
3,337,283	+				+0.4
3,337,284	-				-1.0
3,337,284	-				+1.7
3,337,284	-				+0.5
3,337,302	+				+1.8
3,337,302	+				-0.1
3,337,332	+				+1.1
3,337,332	+				+0.0
3,337,333	-				+0.3
3,337,375	+				+1.3
3,337,375	+				+0.2
3,337,376	-				-1.3
3,337,376	-				+0.8
3,337,376	-				+1.0
3,337,376	-				-0.5
3,337,380	+				-1.1
3,337,380	+				+0.3
3,337,381	-				+0.2
3,337,381	-				-0.5
3,337,381	-				-3.3
3,337,381	-				+0.0
3,337,387	-				-1.0
3,337,446	+				+0.9
3,337,483	-				-3.0
3,337,511	+				+0.9
3,337,536	+				-0.4
3,337,536	+				+0.8
3,337,536	+				+0.2
3,337,536	+				+0.8
3,337,536	+				+0.9
3,337,536	+				+0.2
3,337,537	-				-1.0
3,337,537	-				-0.3
3,337,537	-				+1.0
3,337,537	-				+1.0
3,337,537	-				+0.2
3,337,540	+				+1.3
3,337,540	+				+0.2
3,337,541	-				-0.1
3,337,653	+		Sama_2797	0.23	+1.1
3,337,653	+		Sama_2797	0.23	-0.6
3,337,654	-		Sama_2797	0.23	-0.8
3,337,745	+		Sama_2797	0.34	-0.8
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	+0.4
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	-0.3
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	-0.4
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	+0.5
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	+0.5
3,337,775	+		Sama_2797	0.38	+0.3
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	-0.8
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	+1.2
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	+1.4
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	-0.2
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	-0.4
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	-1.8
3,337,776	-		Sama_2797	0.38	+0.3
3,337,819	+		Sama_2797	0.43	+1.6
3,337,819	+		Sama_2797	0.43	-1.9
3,337,819	+		Sama_2797	0.43	+1.2
3,337,819	+		Sama_2797	0.43	+0.5
3,337,820	-		Sama_2797	0.43	+2.3
3,337,820	-		Sama_2797	0.43	+0.5
3,337,820	-		Sama_2797	0.43	-0.5
3,337,876	+		Sama_2797	0.50	-0.6
3,337,877	-		Sama_2797	0.50	-0.2
3,337,913	+		Sama_2797	0.54	+0.2
3,337,913	+		Sama_2797	0.54	-1.0
3,337,913	+		Sama_2797	0.54	+0.6
3,337,914	-		Sama_2797	0.54	+1.7
3,337,914	-		Sama_2797	0.54	-0.9
3,337,914	-		Sama_2797	0.54	-0.6
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	+0.1
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	+0.5
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	-0.7
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	+2.7
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	+1.6
3,337,917	+		Sama_2797	0.54	+1.1
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	-0.1
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+0.2
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+1.3
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	-0.5
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	-0.9
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+0.4
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+1.7
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+0.4
3,337,918	-		Sama_2797	0.55	+0.4
3,338,059	+		Sama_2797	0.71	+0.9
3,338,059	+		Sama_2797	0.71	-1.1
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	+0.9
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-1.2
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	+1.0
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-0.3
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-0.5
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-1.0
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-0.1
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	+0.6
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	-0.0
3,338,092	+		Sama_2797	0.75	+1.3
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	-0.1
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	+1.2
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	+0.1
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	-0.3
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	+4.4
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	-1.3
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	-0.1
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	+0.7
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	+1.4
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	+0.5
3,338,093	-		Sama_2797	0.76	-0.0
3,338,097	+		Sama_2797	0.76	-0.3
3,338,097	+		Sama_2797	0.76	-0.8
3,338,126	-		Sama_2797	0.79	+0.4
3,338,126	-		Sama_2797	0.79	-0.9
3,338,176	+		Sama_2797	0.85	-0.3
3,338,176	+		Sama_2797	0.85	+0.6
3,338,176	+		Sama_2797	0.85	-2.3
3,338,176	+		Sama_2797	0.85	-0.5
3,338,176	+		Sama_2797	0.85	+0.0
3,338,176	+		Sama_2797	0.85	+0.5
3,338,176	+		Sama_2797	0.85	+2.9
3,338,177	-		Sama_2797	0.86	-1.2
3,338,177	-		Sama_2797	0.86	+0.4
3,338,177	-		Sama_2797	0.86	+0.9
3,338,177	-		Sama_2797	0.86	+0.5
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	+1.0
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	-0.0
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	-0.5
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	-0.7
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	+0.2
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	+0.6
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	-2.0
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	+1.7
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	-1.1
3,338,200	+		Sama_2797	0.88	+0.9
3,338,201	-		Sama_2797	0.88	-1.3
3,338,201	-		Sama_2797	0.88	+0.3
3,338,201	-		Sama_2797	0.88	+2.2
3,338,201	-		Sama_2797	0.88	+0.8
3,338,201	-		Sama_2797	0.88	+1.9
3,338,208	-		Sama_2797	0.89	-1.3
3,338,208	-		Sama_2797	0.89	-0.5
3,338,208	-		Sama_2797	0.89	+0.0
3,338,213	+		Sama_2797	0.90	-0.8
3,338,213	+		Sama_2797	0.90	+0.4
3,338,213	+		Sama_2797	0.90	-1.2
3,338,214	-				-0.9
3,338,214	-				+0.7
3,338,214	-				-1.3
3,338,296	-				-2.9
3,338,296	-				+2.0
3,338,322	+				-0.3
3,338,334	+				+0.9
3,338,334	+				-1.3
3,338,334	+				-0.6
3,338,334	+				-2.6
3,338,335	-				-1.8
3,338,335	-				+0.1
3,338,340	+				-0.2
3,338,340	+				-0.5
3,338,341	-				-1.6
3,338,341	-				+1.7
3,338,341	-				-0.6
3,338,341	-				+2.4
3,338,386	+				-2.1
3,338,386	+				-0.7
3,338,386	+				-0.1
3,338,386	+				+0.0
3,338,386	+				-0.6
3,338,386	+				+0.2
3,338,387	-				+0.6
3,338,387	-				+0.6
3,338,387	-				+0.8
3,338,387	-				+1.6
3,338,387	-				-0.1
3,338,393	+				-2.0
3,338,393	+				+0.2
3,338,393	+				+0.6
3,338,393	+				-1.4
3,338,393	+				+1.0
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