Strain Fitness in Shewanella amazonensis SB2B around Sama_2026

Experiment: Uridine

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Uridine
2,461,534	-		Sama_2025	0.57	-0.2
2,461,541	+		Sama_2025	0.57	+2.1
2,461,542	-		Sama_2025	0.57	+0.1
2,461,542	-		Sama_2025	0.57	+0.1
2,461,620	+		Sama_2025	0.61	-1.2
2,461,697	+		Sama_2025	0.66	+1.0
2,461,744	+		Sama_2025	0.68	+0.7
2,461,745	-		Sama_2025	0.68	+1.4
2,461,745	-		Sama_2025	0.68	+0.6
2,461,768	-		Sama_2025	0.69	-0.9
2,461,768	-		Sama_2025	0.69	+0.6
2,461,769	+		Sama_2025	0.69	-0.2
2,461,770	-		Sama_2025	0.69	-0.8
2,461,770	-		Sama_2025	0.69	+0.1
2,461,770	-		Sama_2025	0.69	-0.1
2,461,770	-		Sama_2025	0.69	-2.6
2,461,770	-		Sama_2025	0.69	-0.3
2,461,770	-		Sama_2025	0.69	-1.4
2,461,770	-		Sama_2025	0.69	+1.2
2,461,822	-		Sama_2025	0.72	+0.0
2,461,826	-		Sama_2025	0.72	+0.7
2,461,831	-		Sama_2025	0.73	+1.0
2,461,853	+		Sama_2025	0.74	+0.4
2,461,853	+		Sama_2025	0.74	+0.4
2,461,853	+		Sama_2025	0.74	+0.9
2,461,853	+		Sama_2025	0.74	-0.4
2,461,853	+		Sama_2025	0.74	+0.1
2,461,854	-		Sama_2025	0.74	+0.2
2,461,897	-		Sama_2025	0.76	-0.6
2,461,897	-		Sama_2025	0.76	-0.0
2,461,984	-		Sama_2025	0.81	+0.1
2,462,000	-		Sama_2025	0.81	+2.0
2,462,007	-		Sama_2025	0.82	+1.0
2,462,007	-		Sama_2025	0.82	+0.1
2,462,007	-		Sama_2025	0.82	-1.6
2,462,044	+		Sama_2025	0.84	-0.8
2,462,065	-		Sama_2025	0.85	-0.4
2,462,091	+		Sama_2025	0.86	+0.1
2,462,091	+		Sama_2025	0.86	+1.1
2,462,091	+		Sama_2025	0.86	-0.2
2,462,092	-		Sama_2025	0.86	-1.6
2,462,156	+		Sama_2025	0.90	+0.2
2,462,156	+		Sama_2025	0.90	+0.1
2,462,157	-		Sama_2025	0.90	+0.0
2,462,157	-		Sama_2025	0.90	+0.0
2,462,157	-		Sama_2025	0.90	+0.3
2,462,157	-		Sama_2025	0.90	-0.9
2,462,157	-		Sama_2025	0.90	+1.1
2,462,157	-		Sama_2025	0.90	-0.6
2,462,191	+				+0.4
2,462,192	-				-0.1
2,462,230	-				+0.2
2,462,322	+				+0.6
2,462,339	-				-1.1
2,462,367	+				+0.1
2,462,368	-				+0.1
2,462,422	+				-0.2
2,462,428	+				-0.1
2,462,429	-				+0.4
2,462,429	-				+1.0
2,462,466	+				+0.6
2,462,466	+				-1.5
2,462,479	-				+0.2
2,462,505	-				+0.4
2,462,505	-				+0.6
2,462,505	-				-0.0
2,462,510	-				+0.1
2,462,510	-				+0.9
2,462,587	+				-1.0
2,462,587	+				+0.0
2,462,594	-				+0.4
2,462,594	-				+0.6
2,462,594	-				-0.2
2,462,606	+				+0.0
2,462,606	+				+1.9
2,462,607	-				-0.8
2,462,607	-				+1.0
2,462,607	-				-0.4
2,462,607	-				+1.1
2,462,621	+				-1.2
2,462,621	+				+0.0
2,462,621	+				+1.4
2,462,622	-				+0.8
2,462,648	+				-0.1
2,462,649	-				-1.6
2,462,649	-				+1.4
2,462,649	-				+1.0
2,462,719	+				+1.8
2,462,762	+				-0.5
2,462,763	-				+0.7
2,462,763	-				+1.8
2,462,763	-				+0.4
2,462,763	-				-0.4
2,462,770	+				-0.1
2,462,820	-		Sama_2026	0.11	+0.3
2,462,820	-		Sama_2026	0.11	+0.5
2,462,897	-		Sama_2026	0.14	+1.8
2,462,897	-		Sama_2026	0.14	+0.2
2,462,897	-		Sama_2026	0.14	+2.2
2,462,897	-		Sama_2026	0.14	+0.6
2,462,903	+		Sama_2026	0.14	-1.6
2,462,904	-		Sama_2026	0.14	+0.8
2,462,934	+		Sama_2026	0.15	+0.4
2,462,984	+		Sama_2026	0.16	-0.3
2,462,985	-		Sama_2026	0.16	-0.1
2,462,997	-		Sama_2026	0.17	-0.3
2,462,997	-		Sama_2026	0.17	+0.8
2,462,997	-		Sama_2026	0.17	+1.4
2,463,116	+		Sama_2026	0.21	+0.4
2,463,116	+		Sama_2026	0.21	-1.3
2,463,129	+		Sama_2026	0.21	-0.0
2,463,129	+		Sama_2026	0.21	+1.6
2,463,129	+		Sama_2026	0.21	+1.1
2,463,130	-		Sama_2026	0.21	+0.5
2,463,134	+		Sama_2026	0.21	+0.7
2,463,135	-		Sama_2026	0.21	+0.8
2,463,156	+		Sama_2026	0.22	+1.2
2,463,156	+		Sama_2026	0.22	+0.2
2,463,157	-		Sama_2026	0.22	+1.6
2,463,167	-		Sama_2026	0.22	-0.6
2,463,187	-		Sama_2026	0.23	+0.5
2,463,187	-		Sama_2026	0.23	+1.1
2,463,242	+		Sama_2026	0.24	-0.0
2,463,242	+		Sama_2026	0.24	+1.4
2,463,309	-		Sama_2026	0.27	+0.2
2,463,320	+		Sama_2026	0.27	-0.2
2,463,425	+		Sama_2026	0.30	+1.4
2,463,432	+		Sama_2026	0.30	+0.7
2,463,432	+		Sama_2026	0.30	+0.0
2,463,433	-		Sama_2026	0.30	+0.1
2,463,433	-		Sama_2026	0.30	-0.3
2,463,433	-		Sama_2026	0.30	-0.2
2,463,441	+		Sama_2026	0.31	+1.0
2,463,442	-		Sama_2026	0.31	-0.1
2,463,442	-		Sama_2026	0.31	+0.5
2,463,463	-		Sama_2026	0.31	-0.4
2,463,516	+		Sama_2026	0.33	+0.8
2,463,539	-		Sama_2026	0.34	+0.4
2,463,555	-		Sama_2026	0.34	+0.7
2,463,555	-		Sama_2026	0.34	+1.4
2,463,555	-		Sama_2026	0.34	+0.8
2,463,593	-		Sama_2026	0.35	-0.6
2,463,605	-		Sama_2026	0.36	+0.1
2,463,620	+		Sama_2026	0.36	+1.3
2,463,620	+		Sama_2026	0.36	-1.2
2,463,620	+		Sama_2026	0.36	-0.2
2,463,621	-		Sama_2026	0.36	+1.0
2,463,621	-		Sama_2026	0.36	+0.3
2,463,621	-		Sama_2026	0.36	-0.2
2,463,699	+		Sama_2026	0.39	+0.5
2,463,699	+		Sama_2026	0.39	+2.2
2,463,700	-		Sama_2026	0.39	+0.8
2,463,700	-		Sama_2026	0.39	+0.1
2,463,829	-		Sama_2026	0.43	-0.1
2,463,865	+		Sama_2026	0.44	+0.2
2,463,865	+		Sama_2026	0.44	+0.8
2,463,866	-		Sama_2026	0.44	+0.6
2,463,866	-		Sama_2026	0.44	+0.2
2,463,866	-		Sama_2026	0.44	-1.2
2,463,940	-		Sama_2026	0.46	+0.7
2,463,951	+		Sama_2026	0.47	+0.1
2,463,951	+		Sama_2026	0.47	-0.5
2,463,968	+		Sama_2026	0.47	+0.1
2,463,969	-		Sama_2026	0.47	-0.2
2,463,969	-		Sama_2026	0.47	-0.4
2,463,994	-		Sama_2026	0.48	+1.3
2,464,033	-		Sama_2026	0.49	+0.8
2,464,100	+		Sama_2026	0.51	+0.2
2,464,150	-		Sama_2026	0.53	+0.8
2,464,155	+		Sama_2026	0.53	+0.0
2,464,155	+		Sama_2026	0.53	+0.5
2,464,185	-		Sama_2026	0.54	+1.2
2,464,188	-		Sama_2026	0.54	+0.4
2,464,235	-		Sama_2026	0.55	+0.4
2,464,254	-		Sama_2026	0.56	-0.1
2,464,268	-		Sama_2026	0.56	-0.5
2,464,303	-		Sama_2026	0.58	+0.6
2,464,303	-		Sama_2026	0.58	+0.4
2,464,306	-		Sama_2026	0.58	+1.1
2,464,357	+		Sama_2026	0.59	+0.5
2,464,358	-		Sama_2026	0.59	+0.4
2,464,389	-		Sama_2026	0.60	-1.5
2,464,390	-		Sama_2026	0.60	+0.9
2,464,390	-		Sama_2026	0.60	-0.9
2,464,455	-		Sama_2026	0.62	+2.3
2,464,455	-		Sama_2026	0.62	+0.7
2,464,488	+		Sama_2026	0.63	-0.6
2,464,489	-		Sama_2026	0.63	+1.2
2,464,525	+		Sama_2026	0.64	+0.7
2,464,526	-		Sama_2026	0.64	+1.7
2,464,545	+		Sama_2026	0.65	+1.1
2,464,545	+		Sama_2026	0.65	+0.9
2,464,545	+		Sama_2026	0.65	+0.9
2,464,545	+		Sama_2026	0.65	+0.2
2,464,545	+		Sama_2026	0.65	+2.4
2,464,545	+		Sama_2026	0.65	+1.0
2,464,546	-		Sama_2026	0.65	+0.3
2,464,546	-		Sama_2026	0.65	+0.4
2,464,546	-		Sama_2026	0.65	+0.1
2,464,546	-		Sama_2026	0.65	-0.1
2,464,548	-		Sama_2026	0.65	+0.4
2,464,562	+		Sama_2026	0.66	-1.2
2,464,562	+		Sama_2026	0.66	-1.9
2,464,563	-		Sama_2026	0.66	-0.1
2,464,563	-		Sama_2026	0.66	-1.4
2,464,566	-		Sama_2026	0.66	-2.4
2,464,566	-		Sama_2026	0.66	-2.2
2,464,581	-		Sama_2026	0.66	-0.6
2,464,586	+		Sama_2026	0.66	+0.4
2,464,586	+		Sama_2026	0.66	+0.5
2,464,586	+		Sama_2026	0.66	+0.4
2,464,586	+		Sama_2026	0.66	+0.7
2,464,587	-		Sama_2026	0.66	+0.7
2,464,587	-		Sama_2026	0.66	-0.2
2,464,587	-		Sama_2026	0.66	+0.7
2,464,587	-		Sama_2026	0.66	-0.7
2,464,587	-		Sama_2026	0.66	+1.5
2,464,587	-		Sama_2026	0.66	+0.8
2,464,587	-		Sama_2026	0.66	+0.7
2,464,587	-		Sama_2026	0.66	-0.1
2,464,587	-		Sama_2026	0.66	+2.0
2,464,587	-		Sama_2026	0.66	+0.3
2,464,702	+		Sama_2026	0.70	-0.3
2,464,703	-		Sama_2026	0.70	-1.4
2,464,706	+		Sama_2026	0.70	+0.4
2,464,707	-		Sama_2026	0.70	+1.1
2,464,707	-		Sama_2026	0.70	-0.0
2,464,707	-		Sama_2026	0.70	+0.7
2,464,707	-		Sama_2026	0.70	+1.4
2,464,744	-		Sama_2026	0.71	+0.7
2,464,749	+		Sama_2026	0.71	+0.6
2,464,750	-		Sama_2026	0.71	+0.7
2,464,750	-		Sama_2026	0.71	+1.4
2,464,772	+		Sama_2026	0.72	+1.3
2,464,803	+		Sama_2026	0.73	+1.3
2,464,828	-		Sama_2026	0.74	+0.2
2,464,828	-		Sama_2026	0.74	-0.8
2,464,833	+		Sama_2026	0.74	-0.4
2,464,833	+		Sama_2026	0.74	+2.1
2,464,833	+		Sama_2026	0.74	+1.0
2,464,833	+		Sama_2026	0.74	+0.9
2,464,834	-		Sama_2026	0.74	+0.5
2,464,834	-		Sama_2026	0.74	-0.6
2,464,834	-		Sama_2026	0.74	-0.6
2,464,834	-		Sama_2026	0.74	+1.0
2,464,834	-		Sama_2026	0.74	+0.1
2,464,869	-		Sama_2026	0.75	+0.6
2,464,869	-		Sama_2026	0.75	-0.5
2,464,898	+		Sama_2026	0.76	+1.2
2,464,899	-		Sama_2026	0.76	-0.0
2,464,899	-		Sama_2026	0.76	+1.6
2,464,926	+		Sama_2026	0.77	-1.0
2,464,966	-		Sama_2026	0.78	-0.8
2,464,966	-		Sama_2026	0.78	+1.5
2,464,966	-		Sama_2026	0.78	-1.2
2,464,967	+		Sama_2026	0.78	+1.2
2,464,987	-		Sama_2026	0.79	+0.5
2,465,007	+		Sama_2026	0.79	+0.9
2,465,016	+		Sama_2026	0.80	+1.5
2,465,016	+		Sama_2026	0.80	+0.4
2,465,188	+		Sama_2026	0.85	-0.2
2,465,188	+		Sama_2026	0.85	-0.2
2,465,189	-		Sama_2026	0.85	+0.6
2,465,189	-		Sama_2026	0.85	+0.2
2,465,233	+		Sama_2026	0.87	+0.4
2,465,251	-		Sama_2026	0.87	+1.3
2,465,251	-		Sama_2026	0.87	+0.1
2,465,278	-		Sama_2026	0.88	+0.9
2,465,278	-		Sama_2026	0.88	+0.1
2,465,339	+		Sama_2026	0.90	+1.2
2,465,352	+				+1.4
2,465,353	-				+1.2
2,465,356	-				+0.5
2,465,454	+				+0.4
2,465,454	+				+0.8
2,465,454	+				+0.6
2,465,455	-				-0.4
2,465,455	-				+0.2
2,465,455	-				+0.6
2,465,455	-				+0.7
2,465,500	-				+0.4
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