Strain Fitness in Castellaniella sp019104865 MT123 around ABCV34_RS10000

Experiment: Anaerobic; FW104 COMM 1 X

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Anaerobic; FW104 COMM 1 X
2,136,934	+		ABCV34_RS09995	0.59	-1.8
2,136,934	+		ABCV34_RS09995	0.59	-1.6
2,136,934	+		ABCV34_RS09995	0.59	-0.9
2,136,934	+		ABCV34_RS09995	0.59	-2.2
2,136,934	+		ABCV34_RS09995	0.59	-2.2
2,136,934	+		ABCV34_RS09995	0.59	-2.2
2,136,934	+		ABCV34_RS09995	0.59	-2.3
2,136,935	-		ABCV34_RS09995	0.59	-2.4
2,136,935	-		ABCV34_RS09995	0.59	-0.9
2,136,935	-		ABCV34_RS09995	0.59	-0.5
2,136,935	-		ABCV34_RS09995	0.59	-1.2
2,136,935	-		ABCV34_RS09995	0.59	-2.1
2,136,935	-		ABCV34_RS09995	0.59	-2.1
2,136,949	+		ABCV34_RS09995	0.60	-1.6
2,136,949	+		ABCV34_RS09995	0.60	-1.3
2,136,949	+		ABCV34_RS09995	0.60	-1.6
2,136,949	+		ABCV34_RS09995	0.60	-2.0
2,136,949	+		ABCV34_RS09995	0.60	-1.3
2,136,949	+		ABCV34_RS09995	0.60	-1.3
2,136,949	+		ABCV34_RS09995	0.60	-0.9
2,136,949	+		ABCV34_RS09995	0.60	-0.7
2,136,949	+		ABCV34_RS09995	0.60	-1.3
2,136,950	-		ABCV34_RS09995	0.60	-1.8
2,136,950	-		ABCV34_RS09995	0.60	-1.8
2,136,950	-		ABCV34_RS09995	0.60	-1.5
2,136,950	-		ABCV34_RS09995	0.60	-1.0
2,136,950	-		ABCV34_RS09995	0.60	-1.3
2,137,170	+		ABCV34_RS09995	0.71	-1.5
2,137,243	+		ABCV34_RS09995	0.75	-0.1
2,137,268	+		ABCV34_RS09995	0.76	-1.6
2,137,269	-		ABCV34_RS09995	0.76	-2.8
2,137,269	-		ABCV34_RS09995	0.76	-1.6
2,137,269	-		ABCV34_RS09995	0.76	-1.6
2,137,269	-		ABCV34_RS09995	0.76	-0.5
2,137,272	+		ABCV34_RS09995	0.76	-0.5
2,137,272	+		ABCV34_RS09995	0.76	-1.6
2,137,272	+		ABCV34_RS09995	0.76	-1.3
2,137,272	+		ABCV34_RS09995	0.76	-1.8
2,137,272	+		ABCV34_RS09995	0.76	-1.7
2,137,272	+		ABCV34_RS09995	0.76	-1.9
2,137,273	-		ABCV34_RS09995	0.76	-1.7
2,137,273	-		ABCV34_RS09995	0.76	-1.8
2,137,273	-		ABCV34_RS09995	0.76	-1.2
2,137,273	-		ABCV34_RS09995	0.76	-1.6
2,137,273	-		ABCV34_RS09995	0.76	-2.4
2,137,273	-		ABCV34_RS09995	0.76	-1.9
2,137,273	-		ABCV34_RS09995	0.76	-0.1
2,137,273	-		ABCV34_RS09995	0.76	-1.2
2,137,273	-		ABCV34_RS09995	0.76	-0.3
2,137,273	-		ABCV34_RS09995	0.76	-1.0
2,137,273	-		ABCV34_RS09995	0.76	-2.0
2,137,273	-		ABCV34_RS09995	0.76	+0.6
2,137,296	+		ABCV34_RS09995	0.77	-0.6
2,137,296	+		ABCV34_RS09995	0.77	-0.6
2,137,297	-		ABCV34_RS09995	0.77	-1.7
2,137,297	-		ABCV34_RS09995	0.77	-1.3
2,137,297	-		ABCV34_RS09995	0.77	-2.3
2,137,297	-		ABCV34_RS09995	0.77	-0.9
2,137,297	-		ABCV34_RS09995	0.77	-1.6
2,137,297	-		ABCV34_RS09995	0.77	-2.0
2,137,302	+		ABCV34_RS09995	0.78	-1.6
2,137,302	+		ABCV34_RS09995	0.78	+1.5
2,137,314	+		ABCV34_RS09995	0.78	+0.2
2,137,314	+		ABCV34_RS09995	0.78	-1.3
2,137,315	-		ABCV34_RS09995	0.78	-0.7
2,137,371	+		ABCV34_RS09995	0.81	-3.3
2,137,434	-		ABCV34_RS09995	0.84	-1.8
2,137,500	+		ABCV34_RS09995	0.87	-1.4
2,137,500	+		ABCV34_RS09995	0.87	-2.6
2,137,501	-		ABCV34_RS09995	0.87	-0.9
2,137,511	+		ABCV34_RS09995	0.88	-2.3
2,137,511	+		ABCV34_RS09995	0.88	-1.1
2,137,511	+		ABCV34_RS09995	0.88	-1.3
2,137,511	+		ABCV34_RS09995	0.88	-1.9
2,137,511	+		ABCV34_RS09995	0.88	-1.9
2,137,511	+		ABCV34_RS09995	0.88	-0.7
2,137,512	-		ABCV34_RS09995	0.88	-2.5
2,137,512	-		ABCV34_RS09995	0.88	-2.4
2,137,512	-		ABCV34_RS09995	0.88	-3.3
2,137,512	-		ABCV34_RS09995	0.88	-1.8
2,137,512	-		ABCV34_RS09995	0.88	-1.4
2,137,515	+		ABCV34_RS09995	0.88	-2.6
2,137,516	-		ABCV34_RS09995	0.88	-1.4
2,137,516	-		ABCV34_RS09995	0.88	-1.8
2,137,516	-		ABCV34_RS09995	0.88	-3.1
2,137,516	-		ABCV34_RS09995	0.88	-1.2
2,137,516	-		ABCV34_RS09995	0.88	-1.5
2,137,516	-		ABCV34_RS09995	0.88	-2.3
2,137,516	-		ABCV34_RS09995	0.88	-1.8
2,137,535	-		ABCV34_RS09995	0.89	-1.8
2,137,581	-				-2.2
2,137,779	+				-1.0
2,137,870	+				-2.1
2,137,870	+				-1.0
2,137,870	+				-2.4
2,137,871	-				-1.7
2,137,871	-				-1.8
2,137,871	-				-1.8
2,137,910	+				-0.9
2,137,911	-				-2.4
2,137,911	-				-1.9
2,137,911	-				-1.1
2,137,916	+				-2.0
2,137,916	+				-1.6
2,137,979	+		ABCV34_RS10000	0.15	-1.1
2,137,979	+		ABCV34_RS10000	0.15	-1.8
2,137,979	+		ABCV34_RS10000	0.15	-1.9
2,137,979	+		ABCV34_RS10000	0.15	-0.8
2,137,979	+		ABCV34_RS10000	0.15	-2.1
2,137,979	+		ABCV34_RS10000	0.15	-1.7
2,137,980	-		ABCV34_RS10000	0.15	-1.8
2,137,980	-		ABCV34_RS10000	0.15	-2.4
2,137,980	-		ABCV34_RS10000	0.15	-0.9
2,137,980	-		ABCV34_RS10000	0.15	-2.2
2,137,980	-		ABCV34_RS10000	0.15	-0.1
2,137,980	-		ABCV34_RS10000	0.15	-2.4
2,137,980	-		ABCV34_RS10000	0.15	-0.8
2,137,980	-		ABCV34_RS10000	0.15	-2.0
2,137,980	-		ABCV34_RS10000	0.15	-1.8
2,138,012	+		ABCV34_RS10000	0.18	-2.1
2,138,012	+		ABCV34_RS10000	0.18	-2.4
2,138,012	+		ABCV34_RS10000	0.18	-2.3
2,138,012	+		ABCV34_RS10000	0.18	-1.3
2,138,012	+		ABCV34_RS10000	0.18	-1.7
2,138,012	+		ABCV34_RS10000	0.18	-3.4
2,138,013	-		ABCV34_RS10000	0.18	-1.0
2,138,013	-		ABCV34_RS10000	0.18	-2.1
2,138,013	-		ABCV34_RS10000	0.18	-1.5
2,138,013	-		ABCV34_RS10000	0.18	-2.1
2,138,013	-		ABCV34_RS10000	0.18	-1.2
2,138,024	+		ABCV34_RS10000	0.19	-1.6
2,138,024	+		ABCV34_RS10000	0.19	-1.0
2,138,024	+		ABCV34_RS10000	0.19	-1.7
2,138,024	+		ABCV34_RS10000	0.19	-1.4
2,138,024	+		ABCV34_RS10000	0.19	-1.1
2,138,024	+		ABCV34_RS10000	0.19	-2.0
2,138,024	+		ABCV34_RS10000	0.19	-1.1
2,138,025	-		ABCV34_RS10000	0.19	-1.4
2,138,025	-		ABCV34_RS10000	0.19	-0.1
2,138,025	-		ABCV34_RS10000	0.19	-3.4
2,138,025	-		ABCV34_RS10000	0.19	-1.0
2,138,025	-		ABCV34_RS10000	0.19	-1.3
2,138,025	-		ABCV34_RS10000	0.19	-2.8
2,138,025	-		ABCV34_RS10000	0.19	-1.6
2,138,025	-		ABCV34_RS10000	0.19	-2.9
2,138,025	-		ABCV34_RS10000	0.19	-1.7
2,138,025	-		ABCV34_RS10000	0.19	-1.4
2,138,025	-		ABCV34_RS10000	0.19	-1.9
2,138,025	-		ABCV34_RS10000	0.19	-1.7
2,138,025	-		ABCV34_RS10000	0.19	-1.8
2,138,030	+		ABCV34_RS10000	0.19	-2.8
2,138,051	+		ABCV34_RS10000	0.21	-0.2
2,138,109	+		ABCV34_RS10000	0.26	-2.1
2,138,109	+		ABCV34_RS10000	0.26	-1.3
2,138,109	+		ABCV34_RS10000	0.26	-0.5
2,138,109	+		ABCV34_RS10000	0.26	-2.4
2,138,109	+		ABCV34_RS10000	0.26	-2.7
2,138,109	+		ABCV34_RS10000	0.26	-1.5
2,138,109	+		ABCV34_RS10000	0.26	-2.1
2,138,109	+		ABCV34_RS10000	0.26	-2.6
2,138,109	+		ABCV34_RS10000	0.26	-1.9
2,138,109	+		ABCV34_RS10000	0.26	-1.5
2,138,109	+		ABCV34_RS10000	0.26	-0.8
2,138,110	-		ABCV34_RS10000	0.26	-1.4
2,138,110	-		ABCV34_RS10000	0.26	-0.1
2,138,110	-		ABCV34_RS10000	0.26	-1.4
2,138,110	-		ABCV34_RS10000	0.26	-2.4
2,138,111	+		ABCV34_RS10000	0.26	-1.1
2,138,111	+		ABCV34_RS10000	0.26	-1.4
2,138,111	+		ABCV34_RS10000	0.26	-0.1
2,138,111	+		ABCV34_RS10000	0.26	-2.1
2,138,111	+		ABCV34_RS10000	0.26	-1.2
2,138,112	-		ABCV34_RS10000	0.26	-0.8
2,138,112	-		ABCV34_RS10000	0.26	-2.4
2,138,112	-		ABCV34_RS10000	0.26	-1.2
2,138,112	-		ABCV34_RS10000	0.26	-1.8
2,138,112	-		ABCV34_RS10000	0.26	-1.4
2,138,112	-		ABCV34_RS10000	0.26	-1.0
2,138,112	-		ABCV34_RS10000	0.26	-2.1
2,138,112	-		ABCV34_RS10000	0.26	-2.1
2,138,120	+		ABCV34_RS10000	0.27	-0.4
2,138,120	+		ABCV34_RS10000	0.27	-2.7
2,138,121	-		ABCV34_RS10000	0.27	-1.8
2,138,190	+		ABCV34_RS10000	0.33	-2.4
2,138,191	-		ABCV34_RS10000	0.33	-1.4
2,138,191	-		ABCV34_RS10000	0.33	-2.0
2,138,243	+		ABCV34_RS10000	0.37	-3.1
2,138,243	+		ABCV34_RS10000	0.37	-2.1
2,138,243	+		ABCV34_RS10000	0.37	-2.0
2,138,244	-		ABCV34_RS10000	0.37	-2.1
2,138,244	-		ABCV34_RS10000	0.37	-1.8
2,138,244	-		ABCV34_RS10000	0.37	-0.5
2,138,330	+		ABCV34_RS10000	0.44	-1.6
2,138,330	+		ABCV34_RS10000	0.44	-1.1
2,138,330	+		ABCV34_RS10000	0.44	-2.5
2,138,330	+		ABCV34_RS10000	0.44	-2.6
2,138,330	+		ABCV34_RS10000	0.44	-0.9
2,138,330	+		ABCV34_RS10000	0.44	-2.1
2,138,330	+		ABCV34_RS10000	0.44	-0.3
2,138,330	+		ABCV34_RS10000	0.44	-1.6
2,138,330	+		ABCV34_RS10000	0.44	+1.5
2,138,330	+		ABCV34_RS10000	0.44	-0.6
2,138,330	+		ABCV34_RS10000	0.44	-1.2
2,138,331	-		ABCV34_RS10000	0.44	-1.9
2,138,331	-		ABCV34_RS10000	0.44	-1.7
2,138,372	+		ABCV34_RS10000	0.47	-2.4
2,138,373	-		ABCV34_RS10000	0.48	-1.9
2,138,373	-		ABCV34_RS10000	0.48	-2.6
2,138,373	-		ABCV34_RS10000	0.48	-2.0
2,138,373	-		ABCV34_RS10000	0.48	-0.9
2,138,373	-		ABCV34_RS10000	0.48	-1.2
2,138,373	-		ABCV34_RS10000	0.48	-1.7
2,138,587	+		ABCV34_RS10000	0.65	-1.4
2,138,587	+		ABCV34_RS10000	0.65	-1.1
2,138,624	+		ABCV34_RS10000	0.68	-1.9
2,138,624	+		ABCV34_RS10000	0.68	-1.4
2,138,674	+		ABCV34_RS10000	0.72	-1.8
2,138,675	-		ABCV34_RS10000	0.72	-1.5
2,138,675	-		ABCV34_RS10000	0.72	-1.8
2,138,675	-		ABCV34_RS10000	0.72	-1.3
2,138,675	-		ABCV34_RS10000	0.72	-0.7
2,138,675	-		ABCV34_RS10000	0.72	-1.8
2,138,862	-		ABCV34_RS10000	0.88	-2.1
2,138,951	+				-0.1
2,138,951	+				-0.5
2,138,951	+				-2.2
2,138,951	+				-1.5
2,138,951	+				-3.0
2,138,952	-				-1.5
2,138,952	-				-0.6
2,138,952	-				-1.7
2,138,953	+				-1.8
2,138,953	+				-1.9
2,138,953	+				-2.1
2,138,953	+				-1.8
2,138,953	+				-3.7
2,138,953	+				-1.4
2,138,953	+				-1.1
2,138,953	+				-2.2
2,138,953	+				-1.6
2,138,953	+				-1.4
2,138,953	+				-1.4
2,138,953	+				-1.8
2,138,953	+				-1.5
2,138,953	+				-1.1
2,138,953	+				-1.7
2,138,954	-				-2.0
2,138,954	-				-2.4
2,138,954	-				-1.9
2,138,954	-				-1.1
2,138,954	-				-2.7
2,138,954	-				-1.4
2,138,954	-				-1.8
2,138,954	-				-0.5
2,138,954	-				+1.5
2,138,954	-				-1.1
2,138,954	-				-2.1
2,139,009	+				-2.2
2,139,009	+				-2.0
2,139,009	+				-1.2
2,139,009	+				-2.5
2,139,009	+				-1.4
2,139,009	+				-2.2
2,139,009	+				-2.1
2,139,009	+				-2.6
2,139,009	+				-1.7
2,139,009	+				-1.8
2,139,009	+				-0.7
2,139,010	-				-1.3
2,139,010	-				-2.3
2,139,010	-				-2.2
2,139,010	-				-1.2
2,139,010	-				-3.4
2,139,010	-				-1.3
2,139,010	-				-1.9
2,139,010	-				-1.4
2,139,010	-				-1.8
2,139,010	-				-1.3
2,139,010	-				-2.1
2,139,010	-				+0.2
2,139,010	-				-0.5
2,139,010	-				-2.8
2,139,024	-				-1.1
2,139,129	-				-1.1
2,139,129	-				-1.4
2,139,129	-				-1.7
2,139,153	-				-1.3
2,139,203	+				-1.6
2,139,204	-				-2.7
2,139,236	+		ABCV34_RS10005	0.11	-0.1
2,139,236	+		ABCV34_RS10005	0.11	-1.7
2,139,236	+		ABCV34_RS10005	0.11	-1.7
2,139,236	+		ABCV34_RS10005	0.11	-0.8
2,139,236	+		ABCV34_RS10005	0.11	-1.8
2,139,237	-		ABCV34_RS10005	0.11	-2.2
2,139,237	-		ABCV34_RS10005	0.11	-2.2
2,139,237	-		ABCV34_RS10005	0.11	-2.0
2,139,237	-		ABCV34_RS10005	0.11	-1.8
2,139,237	-		ABCV34_RS10005	0.11	-0.5
2,139,237	-		ABCV34_RS10005	0.11	-1.2
2,139,237	-		ABCV34_RS10005	0.11	-1.0
2,139,290	+		ABCV34_RS10005	0.14	-1.5
2,139,290	+		ABCV34_RS10005	0.14	-1.9
2,139,290	+		ABCV34_RS10005	0.14	-2.8
2,139,290	+		ABCV34_RS10005	0.14	-2.1
2,139,290	+		ABCV34_RS10005	0.14	-2.1
2,139,291	-		ABCV34_RS10005	0.14	-2.0
2,139,291	-		ABCV34_RS10005	0.14	-2.6
2,139,291	-		ABCV34_RS10005	0.14	-1.1
2,139,368	+		ABCV34_RS10005	0.18	-2.2
2,139,368	+		ABCV34_RS10005	0.18	-1.7
2,139,368	+		ABCV34_RS10005	0.18	-0.4
2,139,368	+		ABCV34_RS10005	0.18	-1.5
2,139,368	+		ABCV34_RS10005	0.18	-1.3
2,139,368	+		ABCV34_RS10005	0.18	-2.2
2,139,368	+		ABCV34_RS10005	0.18	-1.5
2,139,368	+		ABCV34_RS10005	0.18	-2.1
2,139,368	+		ABCV34_RS10005	0.18	-1.4
2,139,369	-		ABCV34_RS10005	0.18	-1.8
2,139,369	-		ABCV34_RS10005	0.18	-1.4
2,139,369	-		ABCV34_RS10005	0.18	-1.9
2,139,369	-		ABCV34_RS10005	0.18	-1.7
2,139,369	-		ABCV34_RS10005	0.18	-1.2
2,139,369	-		ABCV34_RS10005	0.18	-1.1
2,139,449	+		ABCV34_RS10005	0.22	-0.5
2,139,449	+		ABCV34_RS10005	0.22	-1.1
2,139,450	-		ABCV34_RS10005	0.22	-2.0
2,139,530	+		ABCV34_RS10005	0.26	-1.3
2,139,530	+		ABCV34_RS10005	0.26	-1.6
2,139,530	+		ABCV34_RS10005	0.26	-1.2
2,139,530	+		ABCV34_RS10005	0.26	-1.5
2,139,531	-		ABCV34_RS10005	0.27	-0.9
2,139,531	-		ABCV34_RS10005	0.27	-0.8
2,139,531	-		ABCV34_RS10005	0.27	-1.9
2,139,531	-		ABCV34_RS10005	0.27	-1.6
2,139,531	-		ABCV34_RS10005	0.27	-1.2
2,139,531	-		ABCV34_RS10005	0.27	-1.9
2,139,531	-		ABCV34_RS10005	0.27	-1.4
2,139,693	+		ABCV34_RS10005	0.35	-3.0
2,139,693	+		ABCV34_RS10005	0.35	-1.6
2,139,693	+		ABCV34_RS10005	0.35	-1.5
2,139,694	-		ABCV34_RS10005	0.35	-1.2
2,139,694	-		ABCV34_RS10005	0.35	-1.5
2,139,694	-		ABCV34_RS10005	0.35	-2.1
2,139,694	-		ABCV34_RS10005	0.35	-1.5
2,139,694	-		ABCV34_RS10005	0.35	-2.4
2,139,694	-		ABCV34_RS10005	0.35	-0.9
2,139,741	+		ABCV34_RS10005	0.37	-1.2
2,139,741	+		ABCV34_RS10005	0.37	-1.3
2,139,741	+		ABCV34_RS10005	0.37	-1.7
2,139,741	+		ABCV34_RS10005	0.37	-1.2
2,139,741	+		ABCV34_RS10005	0.37	-2.7
2,139,742	-		ABCV34_RS10005	0.38	-2.0
2,139,742	-		ABCV34_RS10005	0.38	-1.1
2,139,742	-		ABCV34_RS10005	0.38	-1.4
2,139,869	+		ABCV34_RS10005	0.44	-0.9
2,139,869	+		ABCV34_RS10005	0.44	-1.9
2,139,869	+		ABCV34_RS10005	0.44	-1.3
2,139,870	-		ABCV34_RS10005	0.44	-1.2
2,139,870	-		ABCV34_RS10005	0.44	-1.5
2,139,946	+		ABCV34_RS10005	0.48	-1.2
2,139,946	+		ABCV34_RS10005	0.48	-3.1
2,139,946	+		ABCV34_RS10005	0.48	-1.6
2,139,946	+		ABCV34_RS10005	0.48	-1.7
2,139,947	-		ABCV34_RS10005	0.48	-1.1
2,139,947	-		ABCV34_RS10005	0.48	-0.9
2,139,947	-		ABCV34_RS10005	0.48	-1.9
2,139,947	-		ABCV34_RS10005	0.48	-1.4
2,139,947	-		ABCV34_RS10005	0.48	-1.5
2,139,947	-		ABCV34_RS10005	0.48	-1.3
2,139,947	-		ABCV34_RS10005	0.48	-1.9
2,139,947	-		ABCV34_RS10005	0.48	-1.2
2,139,947	-		ABCV34_RS10005	0.48	-1.6
2,139,947	-		ABCV34_RS10005	0.48	-3.3
2,139,947	-		ABCV34_RS10005	0.48	-1.7
2,140,001	+		ABCV34_RS10005	0.51	-1.3
2,140,001	+		ABCV34_RS10005	0.51	-0.4
2,140,002	-		ABCV34_RS10005	0.51	-1.7