Strain Fitness in Pantoea sp. MT58 around IAI47_04355

Experiment: copper (II) chloride 2 uM, anaerobic

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	copper (II) chloride 2 uM, anaerobic
913,567	-		IAI47_04350	0.48	+2.8
913,567	-		IAI47_04350	0.48	+1.8
913,596	+		IAI47_04350	0.50	+0.7
913,612	+		IAI47_04350	0.51	+0.6
913,612	+		IAI47_04350	0.51	+0.6
913,612	+		IAI47_04350	0.51	+1.9
913,612	+		IAI47_04350	0.51	+0.9
913,612	+		IAI47_04350	0.51	+0.1
913,612	+		IAI47_04350	0.51	+1.1
913,613	-		IAI47_04350	0.51	+1.0
913,613	-		IAI47_04350	0.51	+0.5
913,613	-		IAI47_04350	0.51	-1.0
913,613	-		IAI47_04350	0.51	-0.4
913,613	-		IAI47_04350	0.51	-1.3
913,613	-		IAI47_04350	0.51	+0.4
913,657	+		IAI47_04350	0.54	+1.0
913,657	+		IAI47_04350	0.54	+1.0
913,657	+		IAI47_04350	0.54	+0.2
913,658	-		IAI47_04350	0.54	+2.7
913,658	-		IAI47_04350	0.54	+1.0
913,658	-		IAI47_04350	0.54	+1.0
913,658	-		IAI47_04350	0.54	-0.3
913,658	-		IAI47_04350	0.54	-1.0
913,658	-		IAI47_04350	0.54	+0.9
913,658	-		IAI47_04350	0.54	+1.5
913,658	-		IAI47_04350	0.54	+1.5
913,658	-		IAI47_04350	0.54	+1.8
913,689	+		IAI47_04350	0.56	+1.4
913,689	+		IAI47_04350	0.56	-0.8
913,690	-		IAI47_04350	0.56	+1.6
913,710	+		IAI47_04350	0.57	+1.1
913,710	+		IAI47_04350	0.57	+0.9
913,710	+		IAI47_04350	0.57	+2.0
913,710	+		IAI47_04350	0.57	-1.1
913,710	+		IAI47_04350	0.57	+1.2
913,711	-		IAI47_04350	0.57	+1.9
913,711	-		IAI47_04350	0.57	+1.9
913,711	-		IAI47_04350	0.57	+2.2
913,738	+		IAI47_04350	0.59	-0.6
913,738	+		IAI47_04350	0.59	+0.5
913,738	+		IAI47_04350	0.59	+1.0
913,738	+		IAI47_04350	0.59	+0.8
913,738	+		IAI47_04350	0.59	+1.0
913,739	-		IAI47_04350	0.59	+0.4
913,755	+		IAI47_04350	0.60	+1.1
913,764	+		IAI47_04350	0.60	+1.2
913,764	+		IAI47_04350	0.60	+2.3
913,764	+		IAI47_04350	0.60	+2.5
913,765	-		IAI47_04350	0.60	+0.9
913,765	-		IAI47_04350	0.60	+2.0
913,816	+		IAI47_04350	0.63	+0.9
913,816	+		IAI47_04350	0.63	+0.8
913,816	+		IAI47_04350	0.63	-0.2
913,817	-		IAI47_04350	0.63	-1.0
913,826	+		IAI47_04350	0.64	+0.6
913,827	-		IAI47_04350	0.64	+1.3
913,827	-		IAI47_04350	0.64	-0.6
913,827	-		IAI47_04350	0.64	+2.2
913,827	-		IAI47_04350	0.64	+0.8
913,839	+		IAI47_04350	0.65	+2.0
913,911	+		IAI47_04350	0.69	+0.4
913,911	+		IAI47_04350	0.69	+0.9
913,911	+		IAI47_04350	0.69	-1.7
913,911	+		IAI47_04350	0.69	-0.1
913,911	+		IAI47_04350	0.69	+2.0
913,911	+		IAI47_04350	0.69	-0.9
913,911	+		IAI47_04350	0.69	+0.2
913,911	+		IAI47_04350	0.69	-0.8
913,912	-		IAI47_04350	0.69	+0.3
913,996	-		IAI47_04350	0.75	+2.0
914,099	+		IAI47_04350	0.81	+2.2
914,100	-		IAI47_04350	0.81	+0.9
914,100	-		IAI47_04350	0.81	+2.3
914,153	+		IAI47_04350	0.84	+1.8
914,154	-		IAI47_04350	0.84	+0.2
914,154	-		IAI47_04350	0.84	+2.6
914,177	+		IAI47_04350	0.86	-0.1
914,177	+		IAI47_04350	0.86	+1.2
914,177	+		IAI47_04350	0.86	-0.5
914,178	-		IAI47_04350	0.86	+0.2
914,178	-		IAI47_04350	0.86	+1.0
914,182	+		IAI47_04350	0.86	+2.6
914,182	+		IAI47_04350	0.86	+0.6
914,214	+		IAI47_04350	0.88	+1.0
914,214	+		IAI47_04350	0.88	-0.9
914,215	-		IAI47_04350	0.88	+2.0
914,222	+		IAI47_04350	0.89	+0.8
914,254	+				-0.0
914,262	+				+1.4
914,262	+				+2.2
914,262	+				-0.1
914,262	+				+1.2
914,262	+				+1.7
914,262	+				+2.1
914,262	+				+2.6
914,262	+				+0.7
914,262	+				+1.5
914,263	-				+2.0
914,263	-				+0.2
914,263	-				+0.4
914,263	-				+0.1
914,361	+				+0.2
914,362	-				+0.7
914,362	-				+0.3
914,362	-				-1.1
914,362	-				-2.2
914,362	-				-0.8
914,362	-				-0.0
914,380	+				+2.1
914,380	+				-0.2
914,380	+				+0.8
914,381	-				-0.7
914,401	+				+0.8
914,402	-				+0.5
914,436	+				+0.0
914,437	-				+1.4
914,437	-				+0.7
914,437	-				-1.1
914,437	-				-1.1
914,467	-				-0.7
914,486	+				+3.5
914,486	+				+0.6
914,486	+				+0.8
914,487	-				+0.1
914,488	+				+0.5
914,488	+				-0.9
914,488	+				-0.7
914,488	+				+0.8
914,488	+				+0.7
914,488	+				+3.0
914,489	-				-0.7
914,489	-				-0.2
914,489	-				-1.3
914,556	+				+1.3
914,556	+				-1.8
914,556	+				-1.6
914,556	+				-0.5
914,556	+				+0.8
914,556	+				+1.0
914,557	-				+2.1
914,557	-				-2.4
914,557	-				-0.0
914,557	-				-1.3
914,557	-				-0.1
914,557	-				-1.5
914,557	-				+1.5
914,557	-				+1.6
914,564	+				+1.4
914,564	+				-1.4
914,565	-				+0.9
914,565	-				-0.6
914,577	+				-0.5
914,578	-				-0.3
914,649	+		IAI47_04355	0.18	+0.4
914,649	+		IAI47_04355	0.18	-0.6
914,694	+		IAI47_04355	0.27	-0.8
914,694	+		IAI47_04355	0.27	+2.8
914,694	+		IAI47_04355	0.27	+1.2
914,694	+		IAI47_04355	0.27	-1.3
914,694	+		IAI47_04355	0.27	+0.4
914,694	+		IAI47_04355	0.27	+0.2
914,695	-		IAI47_04355	0.27	+0.7
914,695	-		IAI47_04355	0.27	-1.1
914,718	+		IAI47_04355	0.31	-0.4
914,718	+		IAI47_04355	0.31	-2.5
914,718	+		IAI47_04355	0.31	-1.0
914,718	+		IAI47_04355	0.31	+0.3
914,719	-		IAI47_04355	0.31	+1.6
914,719	-		IAI47_04355	0.31	-0.3
914,719	-		IAI47_04355	0.31	-0.1
914,787	+		IAI47_04355	0.45	-0.3
914,787	+		IAI47_04355	0.45	+1.0
914,788	-		IAI47_04355	0.45	-1.4
914,788	-		IAI47_04355	0.45	-0.2
914,788	-		IAI47_04355	0.45	-0.1
914,818	+		IAI47_04355	0.51	-1.8
914,818	+		IAI47_04355	0.51	-0.6
914,818	+		IAI47_04355	0.51	+6.4
914,818	+		IAI47_04355	0.51	-0.6
914,819	-		IAI47_04355	0.51	-0.7
914,819	-		IAI47_04355	0.51	-0.1
914,819	-		IAI47_04355	0.51	+3.2
914,819	-		IAI47_04355	0.51	-0.8
914,819	-		IAI47_04355	0.51	-1.6
914,835	+		IAI47_04355	0.54	-1.7
914,836	-		IAI47_04355	0.54	-1.9
914,836	-		IAI47_04355	0.54	+1.7
914,932	+		IAI47_04355	0.73	-0.3
914,932	+		IAI47_04355	0.73	+1.2
914,932	+		IAI47_04355	0.73	-0.0
914,933	-		IAI47_04355	0.73	+0.1
914,933	-		IAI47_04355	0.73	-0.7
914,933	-		IAI47_04355	0.73	-0.6
914,933	-		IAI47_04355	0.73	-2.6
914,947	+		IAI47_04355	0.76	-0.2
914,948	-		IAI47_04355	0.76	+1.4
914,948	-		IAI47_04355	0.76	-0.6
914,948	-		IAI47_04355	0.76	-1.3
914,948	-		IAI47_04355	0.76	+1.4
915,015	-		IAI47_04355	0.89	-0.7
915,022	-				-0.8
915,022	-				-1.6
915,070	+				+0.8
915,070	+				+2.3
915,070	+				+2.7
915,071	-				-0.2
915,071	-				+0.5
915,071	-				-0.3
915,071	-				-0.4
915,128	-				+0.2
915,187	+				+0.2
915,187	+				+0.3
915,187	+				-1.0
915,188	-				+0.4
915,188	-				+5.0
915,193	+				-0.8
915,193	+				-1.3
915,193	+				-0.1
915,193	+				-1.6
915,193	+				+0.5
915,193	+				+0.6
915,193	+				-0.2
915,193	+				+1.2
915,193	+				-0.5
915,193	+				+1.2
915,193	+				-0.7
915,193	+				+0.4
915,193	+				+1.8
915,193	+				+0.7
915,193	+				+0.5
915,194	-				-0.7
915,194	-				+0.6
915,194	-				-1.1
915,194	-				+1.0
915,196	+				+0.3
915,197	-				-1.5
915,197	-				-2.2
915,197	-				-0.9
915,214	+				+0.4
915,215	-				+0.6
915,215	-				-0.6
915,225	+				+0.5
915,225	+				-0.2
915,225	+				+1.2
915,225	+				-0.2
915,225	+				-0.6
915,226	-				-0.4
915,226	-				+0.5
915,226	-				+3.2
915,226	-				-0.4
915,226	-				+1.1
915,226	-				+0.2
915,226	-				+0.4
915,226	-				+0.8
915,229	+				+1.8
915,229	+				-1.1
915,230	-				-0.8
915,230	-				+1.6
915,253	+				+0.0
915,253	+				-1.6
915,253	+				-0.0
915,253	+				+0.3
915,253	+				+1.6
915,254	-				-0.0
915,298	+		IAI47_04360	0.13	+0.4
915,299	-		IAI47_04360	0.13	-0.3
915,299	-		IAI47_04360	0.13	+0.8
915,328	+		IAI47_04360	0.15	-0.1
915,329	-		IAI47_04360	0.15	+0.6
915,329	-		IAI47_04360	0.15	+0.6
915,337	+		IAI47_04360	0.16	-0.6
915,337	+		IAI47_04360	0.16	-1.0
915,338	-		IAI47_04360	0.16	+2.1
915,430	+		IAI47_04360	0.23	+2.8
915,431	-		IAI47_04360	0.23	-0.2
915,431	-		IAI47_04360	0.23	+0.4
915,431	-		IAI47_04360	0.23	-0.4
915,431	-		IAI47_04360	0.23	+0.8
915,431	-		IAI47_04360	0.23	-0.3
915,468	-		IAI47_04360	0.26	-1.5
915,468	-		IAI47_04360	0.26	-2.7
915,495	+		IAI47_04360	0.28	+1.4
915,496	-		IAI47_04360	0.28	-0.8
915,496	-		IAI47_04360	0.28	+0.5
915,496	-		IAI47_04360	0.28	-0.2
915,496	-		IAI47_04360	0.28	-1.4
915,499	+		IAI47_04360	0.28	+3.8
915,579	+		IAI47_04360	0.35	+3.5
915,579	+		IAI47_04360	0.35	+1.6
915,580	-		IAI47_04360	0.35	+0.1
915,580	-		IAI47_04360	0.35	-1.1
915,580	-		IAI47_04360	0.35	-1.1
915,580	-		IAI47_04360	0.35	+1.3
915,580	-		IAI47_04360	0.35	+1.2
915,582	+		IAI47_04360	0.35	-0.6
915,582	+		IAI47_04360	0.35	-0.8
915,582	+		IAI47_04360	0.35	-0.3
915,583	-		IAI47_04360	0.35	-0.3
915,583	-		IAI47_04360	0.35	+0.4
915,583	-		IAI47_04360	0.35	-0.0
915,731	+		IAI47_04360	0.46	-0.1
915,731	+		IAI47_04360	0.46	+0.5
915,731	+		IAI47_04360	0.46	-1.3
915,732	-		IAI47_04360	0.46	+2.2
915,732	-		IAI47_04360	0.46	-1.3
915,732	-		IAI47_04360	0.46	-1.4
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