Strain Fitness in Shewanella amazonensis SB2B around Sama_3114

Experiment: L-Lactate

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	L-Lactate
3,691,334	+		Sama_3113	0.86	+0.8
3,691,334	+		Sama_3113	0.86	-2.0
3,691,335	-		Sama_3113	0.86	+0.3
3,691,335	-		Sama_3113	0.86	+0.3
3,691,335	-		Sama_3113	0.86	+0.3
3,691,359	+		Sama_3113	0.87	-0.3
3,691,359	+		Sama_3113	0.87	-2.6
3,691,359	+		Sama_3113	0.87	+1.7
3,691,360	-		Sama_3113	0.87	+1.3
3,691,360	-		Sama_3113	0.87	-0.9
3,691,360	-		Sama_3113	0.87	-0.5
3,691,443	+				-0.8
3,691,444	-				-0.5
3,691,470	+				+1.0
3,691,470	+				+1.7
3,691,471	-				+1.4
3,691,480	+				-1.1
3,691,480	+				-0.4
3,691,480	+				-0.4
3,691,480	+				+1.4
3,691,481	-				-0.3
3,691,481	-				+0.1
3,691,481	-				-0.4
3,691,481	-				-0.1
3,691,481	-				-1.3
3,691,481	-				-0.6
3,691,581	-				-1.3
3,691,581	-				-0.9
3,691,595	-				-2.5
3,691,661	+				+0.7
3,691,661	+				+0.6
3,691,661	+				+1.5
3,691,661	+				+2.4
3,691,661	+				+0.1
3,691,661	+				+0.5
3,691,662	-				+0.4
3,691,662	-				-1.6
3,691,662	-				+1.1
3,691,662	-				-0.1
3,691,662	-				+1.6
3,691,662	-				+0.7
3,691,665	-				-0.2
3,691,665	-				+1.7
3,691,684	+				-0.6
3,691,783	-				+0.7
3,691,810	-				+1.0
3,691,815	+				+1.3
3,691,816	-				+1.9
3,691,837	-				-0.6
3,691,837	-				+0.5
3,691,882	+				-0.2
3,691,883	-				-0.0
3,691,933	+				+0.2
3,691,933	+				-0.6
3,691,934	-				+0.5
3,691,944	-				+0.2
3,691,972	-				+1.6
3,691,972	-				-1.3
3,691,972	-				-0.0
3,692,030	+				+0.7
3,692,030	+				+0.1
3,692,030	+				+1.7
3,692,031	-				-0.6
3,692,031	-				+0.1
3,692,035	-				-0.3
3,692,035	-				-0.6
3,692,039	+				+0.7
3,692,040	-				+0.1
3,692,040	-				+0.8
3,692,095	-				+0.0
3,692,095	-				-0.4
3,692,095	-				-1.3
3,692,117	+				-1.3
3,692,135	+				+0.4
3,692,136	-				-0.6
3,692,149	+				+0.6
3,692,150	-				+0.6
3,692,150	-				-0.4
3,692,150	-				-0.1
3,692,150	-				-0.3
3,692,188	+				-0.3
3,692,188	+				+0.3
3,692,188	+				+1.0
3,692,188	+				-0.6
3,692,188	+				+0.7
3,692,189	-				+1.0
3,692,189	-				+0.2
3,692,189	-				+1.1
3,692,189	-				+0.1
3,692,189	-				+0.3
3,692,189	-				-1.3
3,692,192	+				-1.3
3,692,192	+				-0.7
3,692,192	+				-0.2
3,692,192	+				+0.1
3,692,192	+				+1.1
3,692,192	+				+1.5
3,692,192	+				-1.9
3,692,192	+				+0.1
3,692,192	+				+0.7
3,692,193	-				-1.1
3,692,193	-				+0.3
3,692,193	-				+0.7
3,692,193	-				+1.2
3,692,193	-				-0.1
3,692,193	-				-0.3
3,692,193	-				+0.1
3,692,193	-				+0.4
3,692,196	-				+1.1
3,692,196	-				-1.1
3,692,196	-				+0.5
3,692,196	-				-0.6
3,692,196	-				-0.8
3,692,231	+				+0.7
3,692,232	-				+1.2
3,692,235	+				+0.1
3,692,235	+				-2.1
3,692,235	+				+1.5
3,692,235	+				-1.6
3,692,236	-				-0.9
3,692,271	+				+0.2
3,692,271	+				+0.2
3,692,271	+				+1.2
3,692,271	+				+0.8
3,692,272	-				+0.8
3,692,272	-				+2.2
3,692,272	-				+1.7
3,692,273	+				+1.7
3,692,273	+				-1.1
3,692,273	+				-2.1
3,692,274	-				+1.8
3,692,274	-				-1.5
3,692,274	-				-0.3
3,692,274	-				+0.6
3,692,274	-				+1.5
3,692,284	+				+2.7
3,692,295	+				+0.1
3,692,295	+				-2.0
3,692,295	+				-0.0
3,692,295	+				-0.2
3,692,295	+				+2.3
3,692,295	+				-1.0
3,692,295	+				+0.4
3,692,295	+				-1.9
3,692,296	-				+0.1
3,692,296	-				-0.1
3,692,296	-				-1.0
3,692,296	-				-0.5
3,692,296	-				+0.7
3,692,296	-				+0.8
3,692,296	-				-1.7
3,692,303	+				+2.1
3,692,303	+				-1.4
3,692,303	+				+1.2
3,692,304	-				+0.8
3,692,304	-				+0.3
3,692,304	-				-0.2
3,692,304	-				-1.0
3,692,327	+				-0.6
3,692,340	+				+1.2
3,692,340	+				-2.5
3,692,340	+				+0.7
3,692,341	-				+0.5
3,692,364	+				-0.3
3,692,387	-				-0.2
3,692,387	-				+0.3
3,692,417	-		Sama_3114	0.13	-1.0
3,692,464	-		Sama_3114	0.20	+0.2
3,692,513	+		Sama_3114	0.27	+1.6
3,692,514	-		Sama_3114	0.28	-1.5
3,692,618	+		Sama_3114	0.43	+0.8
3,692,618	+		Sama_3114	0.43	+1.0
3,692,618	+		Sama_3114	0.43	+0.7
3,692,618	+		Sama_3114	0.43	+0.1
3,692,619	-		Sama_3114	0.44	+0.1
3,692,619	-		Sama_3114	0.44	+0.2
3,692,619	-		Sama_3114	0.44	+0.7
3,692,619	-		Sama_3114	0.44	+0.0
3,692,619	-		Sama_3114	0.44	+0.1
3,692,619	-		Sama_3114	0.44	+1.7
3,692,619	-		Sama_3114	0.44	-2.2
3,692,619	-		Sama_3114	0.44	+1.0
3,692,619	-		Sama_3114	0.44	+1.2
3,692,657	+		Sama_3114	0.49	+3.7
3,692,657	+		Sama_3114	0.49	-1.1
3,692,657	+		Sama_3114	0.49	+0.1
3,692,657	+		Sama_3114	0.49	-0.5
3,692,657	+		Sama_3114	0.49	-0.6
3,692,657	+		Sama_3114	0.49	-0.7
3,692,657	+		Sama_3114	0.49	-1.6
3,692,658	-		Sama_3114	0.49	-0.3
3,692,658	-		Sama_3114	0.49	+0.3
3,692,658	-		Sama_3114	0.49	-0.4
3,692,658	-		Sama_3114	0.49	-0.3
3,692,658	-		Sama_3114	0.49	+1.3
3,692,692	+		Sama_3114	0.55	-0.6
3,692,692	+		Sama_3114	0.55	+0.3
3,692,732	+		Sama_3114	0.61	+0.6
3,692,732	+		Sama_3114	0.61	+1.1
3,692,732	+		Sama_3114	0.61	+1.6
3,692,732	+		Sama_3114	0.61	-0.6
3,692,732	+		Sama_3114	0.61	-0.2
3,692,732	+		Sama_3114	0.61	+0.3
3,692,732	+		Sama_3114	0.61	-0.1
3,692,733	-		Sama_3114	0.61	+0.8
3,692,733	-		Sama_3114	0.61	+3.7
3,692,733	-		Sama_3114	0.61	-0.0
3,692,733	-		Sama_3114	0.61	+0.8
3,692,733	-		Sama_3114	0.61	-1.3
3,692,733	-		Sama_3114	0.61	+1.4
3,692,734	+		Sama_3114	0.61	+0.1
3,692,734	+		Sama_3114	0.61	-1.1
3,692,734	+		Sama_3114	0.61	+1.6
3,692,734	+		Sama_3114	0.61	+3.7
3,692,734	+		Sama_3114	0.61	-1.3
3,692,734	+		Sama_3114	0.61	-1.6
3,692,734	+		Sama_3114	0.61	+3.2
3,692,734	+		Sama_3114	0.61	-0.6
3,692,735	-		Sama_3114	0.61	-0.8
3,692,735	-		Sama_3114	0.61	-0.9
3,692,735	-		Sama_3114	0.61	-0.6
3,692,735	-		Sama_3114	0.61	-0.6
3,692,735	-		Sama_3114	0.61	-0.3
3,692,735	-		Sama_3114	0.61	-0.1
3,692,735	-		Sama_3114	0.61	-1.6
3,692,735	-		Sama_3114	0.61	-2.3
3,692,735	-		Sama_3114	0.61	-0.1
3,692,735	-		Sama_3114	0.61	+1.1
3,692,735	-		Sama_3114	0.61	+0.7
3,692,735	-		Sama_3114	0.61	+0.3
3,692,735	-		Sama_3114	0.61	-2.5
3,692,735	-		Sama_3114	0.61	-0.8
3,692,746	+		Sama_3114	0.63	-0.6
3,692,746	+		Sama_3114	0.63	+0.7
3,692,747	-		Sama_3114	0.63	+0.6
3,692,747	-		Sama_3114	0.63	-1.1
3,692,747	-		Sama_3114	0.63	-1.1
3,692,750	+		Sama_3114	0.63	+3.5
3,692,750	+		Sama_3114	0.63	+0.5
3,692,750	+		Sama_3114	0.63	-1.1
3,692,750	+		Sama_3114	0.63	-0.4
3,692,751	-		Sama_3114	0.64	-1.3
3,692,751	-		Sama_3114	0.64	-0.2
3,692,889	+		Sama_3114	0.85	+0.1
3,692,889	+		Sama_3114	0.85	+1.0
3,692,889	+		Sama_3114	0.85	+0.0
3,692,890	-		Sama_3114	0.85	-1.9
3,692,890	-		Sama_3114	0.85	-0.6
3,692,942	-				+1.5
3,692,942	-				-2.3
3,692,983	+				+1.5
3,692,984	-				-1.6
3,692,987	+				-0.6
3,692,988	-				-0.1
3,692,988	-				-1.3
3,692,988	-				+0.6
3,692,988	-				+1.7
3,692,988	-				+1.0
3,692,989	-				-0.3
3,693,091	+				+0.0
3,693,091	+				-1.1
3,693,155	+				+0.0
3,693,247	+		Sama_3115	0.12	+1.7
3,693,350	+		Sama_3115	0.16	-0.0
3,693,351	-		Sama_3115	0.16	-1.1
3,693,351	-		Sama_3115	0.16	+0.1
3,693,351	-		Sama_3115	0.16	+2.3
3,693,352	+		Sama_3115	0.16	+0.5
3,693,352	+		Sama_3115	0.16	-0.5
3,693,352	+		Sama_3115	0.16	+0.6
3,693,352	+		Sama_3115	0.16	+0.2
3,693,352	+		Sama_3115	0.16	+1.7
3,693,352	+		Sama_3115	0.16	-0.5
3,693,352	+		Sama_3115	0.16	-1.1
3,693,352	+		Sama_3115	0.16	+0.1
3,693,352	+		Sama_3115	0.16	-0.8
3,693,353	-		Sama_3115	0.16	+0.2
3,693,353	-		Sama_3115	0.16	-2.5
3,693,353	-		Sama_3115	0.16	+0.3
3,693,353	-		Sama_3115	0.16	+1.6
3,693,353	-		Sama_3115	0.16	-1.8
3,693,353	-		Sama_3115	0.16	+1.4
3,693,353	-		Sama_3115	0.16	-0.8
3,693,463	+		Sama_3115	0.21	-0.0
3,693,463	+		Sama_3115	0.21	+1.6
3,693,548	+		Sama_3115	0.25	-1.3
3,693,575	-		Sama_3115	0.26	+0.3
3,693,679	+		Sama_3115	0.30	+0.5
3,693,679	+		Sama_3115	0.30	-0.6
3,693,679	+		Sama_3115	0.30	-1.0
3,693,679	+		Sama_3115	0.30	+1.7
3,693,679	+		Sama_3115	0.30	-0.5
3,693,680	-		Sama_3115	0.30	-0.6
3,693,680	-		Sama_3115	0.30	-0.6
3,693,680	-		Sama_3115	0.30	-0.9
3,693,699	+		Sama_3115	0.31	-2.6
3,693,699	+		Sama_3115	0.31	-0.5
3,693,699	+		Sama_3115	0.31	-0.1
3,693,699	+		Sama_3115	0.31	-0.3
3,693,699	+		Sama_3115	0.31	+0.4
3,693,699	+		Sama_3115	0.31	-0.7
3,693,699	+		Sama_3115	0.31	-0.7
3,693,700	-		Sama_3115	0.31	-0.3
3,693,700	-		Sama_3115	0.31	+1.2
3,693,700	-		Sama_3115	0.31	+2.4
3,693,700	-		Sama_3115	0.31	+0.5
3,693,700	-		Sama_3115	0.31	-0.7
3,693,700	-		Sama_3115	0.31	+0.4
3,693,700	-		Sama_3115	0.31	-0.6
3,693,700	-		Sama_3115	0.31	+1.6
3,693,700	-		Sama_3115	0.31	-0.3
3,693,707	+		Sama_3115	0.32	-1.6
3,693,707	+		Sama_3115	0.32	+0.1
3,693,707	+		Sama_3115	0.32	-0.3
3,693,708	-		Sama_3115	0.32	-0.2
3,693,762	+		Sama_3115	0.34	-1.2
3,693,779	+		Sama_3115	0.35	-1.1
3,693,780	-		Sama_3115	0.35	-0.3
3,693,780	-		Sama_3115	0.35	-0.2
3,693,780	-		Sama_3115	0.35	+0.6
3,693,780	-		Sama_3115	0.35	-1.9
3,693,780	-		Sama_3115	0.35	+0.6
3,693,877	+		Sama_3115	0.39	+1.7
3,693,877	+		Sama_3115	0.39	-0.3
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