Strain Fitness in Pantoea sp. MT58 around IAI47_04340

Experiment: Ying_Others16 rep A; time point 3

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Ying_Others16 rep A; time point 3
911,027	+				+0.8
911,027	+				-0.6
911,037	+				-0.1
911,037	+				+0.9
911,037	+				+0.7
911,059	+				+0.4
911,059	+				+0.8
911,059	+				-0.8
911,059	+				+0.1
911,059	+				-0.8
911,059	+				-1.4
911,063	+				+0.8
911,063	+				-0.2
911,063	+				-0.1
911,078	+				-0.6
911,087	+				+0.4
911,087	+				+0.7
911,093	+				-1.6
911,093	+				-1.0
911,093	+				+0.7
911,093	+				-0.4
911,093	+				-0.5
911,093	+				-0.6
911,180	+				-0.8
911,180	+				-0.1
911,181	-				-1.1
911,181	-				-0.6
911,204	+				-0.9
911,204	+				-1.1
911,222	-				+0.7
911,233	+				+0.5
911,233	+				-1.8
911,233	+				+0.4
911,234	-				+0.9
911,234	-				-0.1
911,252	-		IAI47_04335	0.10	-0.9
911,252	-		IAI47_04335	0.10	+0.4
911,252	-		IAI47_04335	0.10	-1.0
911,265	-		IAI47_04335	0.27	+1.0
911,265	-		IAI47_04335	0.27	+0.4
911,270	-		IAI47_04335	0.34	-1.4
911,270	-		IAI47_04335	0.34	-1.2
911,270	-		IAI47_04335	0.34	-0.2
911,334	+				-0.6
911,359	-				+0.9
911,359	-				-0.1
911,359	-				-0.0
911,368	+				+0.4
911,369	-				-0.9
911,369	-				+1.4
911,369	-				-0.3
911,387	+				-0.4
911,387	+				-0.3
911,387	+				-0.4
911,388	-				-0.5
911,388	-				-0.4
911,388	-				+0.6
911,388	-				-1.4
911,395	+				+0.7
911,395	+				+0.1
911,395	+				+1.3
911,396	-				+0.9
911,396	-				+0.3
911,396	-				+1.4
911,397	+				+0.9
911,398	-				+0.9
911,405	-				+0.6
911,405	-				+0.4
911,449	-				-0.1
911,449	-				-0.4
911,461	+				+1.8
911,461	+				+0.8
911,513	+				+1.9
911,513	+				+0.1
911,514	-				+0.2
911,514	-				+0.0
911,524	+				-0.6
911,524	+				+0.5
911,525	-				+0.2
911,558	+				+0.5
911,597	+				+0.1
911,597	+				+0.6
911,597	+				-1.1
911,597	+				+0.9
911,597	+				-2.2
911,631	-				-0.1
911,656	+				+0.6
911,731	-				+0.6
911,731	-				-0.1
911,731	-				+0.5
911,735	+				-0.1
911,735	+				-0.6
911,735	+				+1.7
911,736	-				-0.6
911,740	+				-0.2
911,740	+				-0.1
911,740	+				+0.4
911,741	-				+0.9
911,741	-				+0.3
911,776	+				+0.8
911,776	+				-0.5
911,776	+				+0.6
911,777	-				+0.7
911,777	-				-0.3
911,777	-				-0.7
911,785	+				-1.1
911,785	+				-0.6
911,785	+				-0.3
911,785	+				+0.6
911,785	+				+0.1
911,786	-				+0.4
911,786	-				-1.3
911,805	+				+1.8
911,806	-				+1.0
911,826	+				+1.2
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+0.3
911,898	+		IAI47_04340	0.22	-1.0
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+3.8
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+2.0
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+0.7
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+0.8
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+0.4
911,898	+		IAI47_04340	0.22	+1.0
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.0
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-0.7
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.8
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.2
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+1.5
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-0.2
911,899	-		IAI47_04340	0.22	-0.3
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.4
911,899	-		IAI47_04340	0.22	+0.7
911,910	+		IAI47_04340	0.24	+1.1
912,047	+		IAI47_04340	0.48	-0.0
912,048	-		IAI47_04340	0.49	+0.4
912,067	+		IAI47_04340	0.52	-1.0
912,067	+		IAI47_04340	0.52	+0.6
912,084	+		IAI47_04340	0.55	+0.7
912,084	+		IAI47_04340	0.55	-0.6
912,085	-		IAI47_04340	0.55	+1.7
912,085	-		IAI47_04340	0.55	+1.5
912,085	-		IAI47_04340	0.55	-0.2
912,085	-		IAI47_04340	0.55	-0.2
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.8
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.7
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.0
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.9
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+0.0
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-1.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-1.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-1.2
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+1.5
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.2
912,111	+		IAI47_04340	0.60	+1.7
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.1
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.2
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.7
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-1.4
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-0.9
912,111	+		IAI47_04340	0.60	-1.4
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.5
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.1
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.6
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+1.4
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.3
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.2
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.2
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.4
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-0.5
912,112	-		IAI47_04340	0.60	-1.1
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.4
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.7
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+1.5
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.9
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.4
912,112	-		IAI47_04340	0.60	+0.8
912,128	+		IAI47_04340	0.63	-2.4
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+1.0
912,185	+		IAI47_04340	0.73	-0.4
912,185	+		IAI47_04340	0.73	-0.3
912,185	+		IAI47_04340	0.73	+1.0
912,185	+		IAI47_04340	0.73	-1.6
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+0.4
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+0.4
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+0.4
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+1.8
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-0.6
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+0.4
912,186	-		IAI47_04340	0.73	-0.6
912,186	-		IAI47_04340	0.73	+0.4
912,195	+		IAI47_04340	0.74	-1.8
912,196	-		IAI47_04340	0.75	+0.4
912,196	-		IAI47_04340	0.75	-1.0
912,196	-		IAI47_04340	0.75	+2.7
912,286	-				+0.2
912,286	-				+0.7
912,297	+				-0.4
912,298	-				-0.6
912,332	+				+0.4
912,333	-				-0.6
912,346	+				+0.6
912,346	+				-0.5
912,346	+				-0.1
912,346	+				-0.2
912,346	+				+1.2
912,346	+				-1.4
912,346	+				+0.2
912,347	-				+0.4
912,347	-				+0.4
912,347	-				+0.4
912,347	-				+0.0
912,347	-				+0.6
912,347	-				-0.5
912,347	-				+0.9
912,350	+				+0.0
912,350	+				-0.8
912,350	+				-0.2
912,350	+				-0.1
912,350	+				-0.5
912,350	+				-0.2
912,350	+				+0.6
912,350	+				-0.2
912,350	+				+0.4
912,350	+				-0.6
912,350	+				-0.4
912,350	+				-1.7
912,350	+				-0.6
912,350	+				-0.4
912,350	+				+0.6
912,350	+				+0.1
912,350	+				-0.1
912,351	-				+1.4
912,351	-				+0.2
912,351	-				+0.4
912,351	-				+1.2
912,351	-				+0.8
912,351	-				+0.7
912,351	-				+1.9
912,351	-				+0.8
912,351	-				+0.8
912,351	-				-0.3
912,351	-				+0.4
912,354	+				-2.0
912,354	+				-1.6
912,355	-				+0.3
912,355	-				+1.8
912,355	-				+0.2
912,355	-				+0.4
912,418	+		IAI47_04345	0.19	+0.4
912,419	-		IAI47_04345	0.19	+1.4
912,419	-		IAI47_04345	0.19	+1.4
912,424	+		IAI47_04345	0.21	+1.4
912,424	+		IAI47_04345	0.21	+0.1
912,425	-		IAI47_04345	0.21	-0.1
912,430	+		IAI47_04345	0.22	-2.4
912,430	+		IAI47_04345	0.22	+0.0
912,430	+		IAI47_04345	0.22	-1.2
912,430	+		IAI47_04345	0.22	-0.3
912,430	+		IAI47_04345	0.22	+1.4
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-0.4
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+0.9
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+1.7
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+0.5
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-2.0
912,431	-		IAI47_04345	0.22	+2.4
912,431	-		IAI47_04345	0.22	-0.5
912,456	+		IAI47_04345	0.28	-2.1
912,457	-		IAI47_04345	0.28	+1.4
912,470	-		IAI47_04345	0.31	+0.5
912,470	-		IAI47_04345	0.31	+1.4
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-0.5
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+0.0
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+0.9
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-1.0
912,515	+		IAI47_04345	0.42	-1.0
912,515	+		IAI47_04345	0.42	+1.8
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+1.4
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-0.6
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-0.2
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-0.9
912,516	-		IAI47_04345	0.42	-0.0
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+0.1
912,516	-		IAI47_04345	0.42	+1.7
912,535	+		IAI47_04345	0.46	+0.3
912,535	+		IAI47_04345	0.46	-1.1
912,604	+		IAI47_04345	0.62	-0.4
912,605	-		IAI47_04345	0.63	-0.9
912,605	-		IAI47_04345	0.63	+0.2
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-0.6
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-1.2
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-0.1
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-0.2
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+0.9
912,625	+		IAI47_04345	0.67	+0.1
912,625	+		IAI47_04345	0.67	-1.0
912,626	-		IAI47_04345	0.68	+0.4
912,626	-		IAI47_04345	0.68	+0.4
912,626	-		IAI47_04345	0.68	-0.2
912,626	-		IAI47_04345	0.68	-0.7
912,658	+		IAI47_04345	0.75	-1.5
912,658	+		IAI47_04345	0.75	-1.0
912,659	-		IAI47_04345	0.75	+1.4
912,659	-		IAI47_04345	0.75	+0.8
912,682	+		IAI47_04345	0.81	-1.0
912,682	+		IAI47_04345	0.81	-0.4
912,682	+		IAI47_04345	0.81	+0.4
912,683	-		IAI47_04345	0.81	-0.4
912,714	+		IAI47_04345	0.88	-0.6
912,714	+		IAI47_04345	0.88	+0.6
912,714	+		IAI47_04345	0.88	-0.4
912,714	+		IAI47_04345	0.88	+0.9
912,715	-		IAI47_04345	0.88	+0.1
912,715	-		IAI47_04345	0.88	+0.8
912,715	-		IAI47_04345	0.88	-0.3
912,715	-		IAI47_04345	0.88	-0.5
912,715	-		IAI47_04345	0.88	+1.5
912,716	+		IAI47_04345	0.89	-0.7
912,716	+		IAI47_04345	0.89	-0.0
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