Pairwise Alignments
Query, 547 a.a., hypothetical protein from Pseudomonas simiae WCS417
Subject, 471 a.a., membrane protein from Burkholderia phytofirmans PsJN
Score = 155 bits (392), Expect = 3e-42
Identities = 142/462 (30%), Positives = 212/462 (45%), Gaps = 68/462 (14%)
Query: 91 GGGTGGG--TGGGTGGGTGGG-TGGGTGSTTTPLVTGQIVGTLGGTVGNVGAAVGDLGDT 147
GG T T TG G+G G T G+G+TT TG + T ++G A+ T
Sbjct: 36 GGSTVSAPPTASNTGSGSGSGSTNTGSGTTTKTGTTG-VATAAAQTTNDLGTAIAS--QT 92
Query: 148 LNNV-PIVGTTAGGLVTATGDAVTSIGTGVTAGLGSLGTNSNSLGITVAGVGNGVADLGD 206
+ + P V G V++T + S+ V+ G+G GT +N +G TVAG+G+ V
Sbjct: 93 IPGLSPQVTQGLGNAVSSTSSTLNSLADAVSNGVGQTGTTANPVGTTVAGLGSVVG---- 148
Query: 207 GLSTTGKSLSTTLGGIPVVGGLTGGVGGAAGGLVDKVGQTVTMLGDTLSTASTTGPLGSL 266
ST+G VV GL+ VGG G + + T L TLSTA+ G
Sbjct: 149 --STSG-----------VVQGLSTAVGGLGSGRLAPLAPLTTPLASTLSTAAGALNAGGA 195
Query: 267 T--NTVGG-----------KVLVPVVSLVENTTGNLGKATGLGNPVNGLLDKVGSTVTGL 313
T N +G + P+V+ T +G +GLG P+ G+L KVG ++
Sbjct: 196 TLGNALGSVPVQQITQPVSTAITPIVTTAGLVTQTVGTQSGLGAPLGGVLAKVGGALSSA 255
Query: 314 GGQVASAGGTGNPVTNIVGGALTGVGGVLDKSGGYVAPAGGGAKSGLPELVGGLIANVGN 373
G +V +A T NPV +G + +G + +GG V P G +P GLI ++
Sbjct: 256 GSKVGNA--THNPVGADLGTLVGSLGNTVTNAGGLVNPNGPNGAMPIP----GLITSLVG 309
Query: 374 GLNVGNTNGTVSAAGVTGGALGGTVASLGTVIGGN---GISNTAATSPVAGLATQVGAA- 429
+VG NG +++ G L ++ASLG +G N +S +P+AGL + +G
Sbjct: 310 ATSVGVANGPPASSNPFG-PLQSSLASLG--LGSNPVGSLSTLLGGTPLAGLTSALGGTP 366
Query: 430 LNPVTSG------VASLTQNIGTTTGIGAPVNGLVTQVGGAVSGI-------GANLTAAN 476
L +TS ++SLT +G + P++ L + G SG+ GA +
Sbjct: 367 LGSLTSSGLSGSPLSSLTSALGGSGSASNPLSTLTGALSGVTSGVTSGSLGGGAGGSGQA 426
Query: 477 ANPITNALGGTVSAVGSTVGSVGGLVTGGTGTSG--GLLGGL 516
P+T +G A+GS GS G GT T+G LLGGL
Sbjct: 427 LAPVTALVGQLTGALGSAAGSTSG---SGTATNGLTTLLGGL 465
Score = 150 bits (378), Expect = 1e-40
Identities = 149/491 (30%), Positives = 217/491 (44%), Gaps = 93/491 (18%)
Query: 78 TGGGTGGGTGGGTGGGTGGGTGGGTGGGTGGGTGGGTGSTTTPLVTGQIVGTLGGTVGNV 137
T TG G+G G+ TG GT TG+T Q LG + +
Sbjct: 45 TASNTGSGSGSGS-------------TNTGSGTTTKTGTTGVATAAAQTTNDLGTAIAS- 90
Query: 138 GAAVGDLGDTLNNV-PIVGTTAGGLVTATGDAVTSIGTGVTAGLGSLGTNSNSLGITVAG 196
T+ + P V G V++T + S+ V+ G+G GT +N +G TVAG
Sbjct: 91 --------QTIPGLSPQVTQGLGNAVSSTSSTLNSLADAVSNGVGQTGTTANPVGTTVAG 142
Query: 197 VGNGVADLGDGLSTTGKSLSTTLGGIPVVGGLTGGVGGAAGGLVDKVGQTVTMLGDTLST 256
+G+ V ST+G VV GL+ VGG G + + T L TLST
Sbjct: 143 LGSVVG------STSG-----------VVQGLSTAVGGLGSGRLAPLAPLTTPLASTLST 185
Query: 257 ASTTGPLGSLT--NTVG-----------GKVLVPVVSLVENTTGNLGKATGLGNPVNGLL 303
A+ G T N +G + P+V+ T +G +GLG P+ G+L
Sbjct: 186 AAGALNAGGATLGNALGSVPVQQITQPVSTAITPIVTTAGLVTQTVGTQSGLGAPLGGVL 245
Query: 304 DKVGSTVTGLGGQVASAGGTGNPVTNIVGGALTGVGGVLDKSGGYVAPAGGGAKSGLPEL 363
KVG ++ G +V +A T NPV +G + +G + +GG V P G +P
Sbjct: 246 AKVGGALSSAGSKVGNA--THNPVGADLGTLVGSLGNTVTNAGGLVNPNGPNGAMPIP-- 301
Query: 364 VGGLIANVGNGLNVGNTNGTVSAAGVTGGALGGTVASLGTVIGGNGISNTAATSPVAGLA 423
GLI ++ +VG NG A+ G L ++ASLG +G N PV L+
Sbjct: 302 --GLITSLVGATSVGVANGP-PASSNPFGPLQSSLASLG--LGSN---------PVGSLS 347
Query: 424 TQVGAA-LNPVTSGVASLTQNIGTTTGI-GAPVNGLVTQVGGAVSGIGANLTAANANPIT 481
T +G L +TS + T++G+ G+P++ L + +GG SG +N + +T
Sbjct: 348 TLLGGTPLAGLTSALGGTPLGSLTSSGLSGSPLSSLTSALGG--SGSASN----PLSTLT 401
Query: 482 NALGGTVSAVGSTVGSVGGLVTGGTGTS--------GGLLGGLNVGANASAGGSANTNTG 533
AL G S G T GS+GG GG+G + G L G L A +++G TN
Sbjct: 402 GALSGVTS--GVTSGSLGG-GAGGSGQALAPVTALVGQLTGALGSAAGSTSGSGTATN-- 456
Query: 534 SGLGGLLNGLT 544
GL LL GLT
Sbjct: 457 -GLTTLLGGLT 466
Score = 108 bits (271), Expect = 3e-28
Identities = 92/329 (27%), Positives = 133/329 (40%), Gaps = 48/329 (14%)
Query: 223 PVVGGLTGGVGGAAGGLVDKVGQTVTMLGDTLSTASTTGPLGSLTNTVGGKVLVPVVSLV 282
P++ G+ A GG T + G + ST G+ T T V +
Sbjct: 22 PLIAVAVAGLLAACGGSTVSAPPTASNTGSGSGSGSTNTGSGTTTKTG----TTGVATAA 77
Query: 283 ENTTGNLGKAT--------------GLGNPVNGLLDKVGSTVTGLGGQVASAGGTGNPVT 328
TT +LG A GLGN V+ + S + V G T NPV
Sbjct: 78 AQTTNDLGTAIASQTIPGLSPQVTQGLGNAVSSTSSTLNSLADAVSNGVGQTGTTANPV- 136
Query: 329 NIVGGALTGVGGVLDKSGGYVAPAGGGAKSGLPELVGGLIANVGNGLNVGNTNGTVSAAG 388
G + G+G V+ + G V GL VGGL G+G T A
Sbjct: 137 ---GTTVAGLGSVVGSTSGVV--------QGLSTAVGGL----GSGRLAPLAPLTTPLAS 181
Query: 389 VTGGALGGTVASLGTVIGGNGISNTAATSPVAGLATQVGAALNPVTSGVASLTQNIGTTT 448
A G A GG + N + PV + V A+ P+ + +TQ +GT +
Sbjct: 182 TLSTAAGALNA------GGATLGNALGSVPVQQITQPVSTAITPIVTTAGLVTQTVGTQS 235
Query: 449 GIGAPVNGLVTQVGGAVSGIGANLTAANANPITNALGGTVSAVGSTVGSVGGLVTGG--- 505
G+GAP+ G++ +VGGA+S G+ + A NP+ LG V ++G+TV + GGLV
Sbjct: 236 GLGAPLGGVLAKVGGALSSAGSKVGNATHNPVGADLGTLVGSLGNTVTNAGGLVNPNGPN 295
Query: 506 -----TGTSGGLLGGLNVGANASAGGSAN 529
G L+G +VG S+N
Sbjct: 296 GAMPIPGLITSLVGATSVGVANGPPASSN 324
Score = 97.8 bits (242), Expect = 8e-25
Identities = 128/471 (27%), Positives = 187/471 (39%), Gaps = 108/471 (22%)
Query: 11 STALALAVALALGGCSSGGGGHKSSVASSSPDAGAGTGGGTGGGDGGTGGGTG---GGTG 67
S+ A +A+A+ G + GG S+V S+P + TG G+G G TG GT G TG
Sbjct: 17 SSLRAPLIAVAVAGLLAACGG--STV--SAPPTASNTGSGSGSGSTNTGSGTTTKTGTTG 72
Query: 68 GGT-------DGGT--------------------------------------GGGTGGGT 82
T D GT G G G T
Sbjct: 73 VATAAAQTTNDLGTAIASQTIPGLSPQVTQGLGNAVSSTSSTLNSLADAVSNGVGQTGTT 132
Query: 83 G---GGTGGGTGGGTGGGTGGGTGGGTG-GGTGGGTGSTTTPLVTGQIVGTLGGTVGNVG 138
G T G G G +G G T GG G G + PL T + TL G +
Sbjct: 133 ANPVGTTVAGLGSVVGSTSGVVQGLSTAVGGLGSGRLAPLAPLTT-PLASTLSTAAGALN 191
Query: 139 AAVGDLGDTLNNVPI------VGTTAGGLVTATGDAVTSIGT---------GVTAGLGSL 183
A LG+ L +VP+ V T +VT G ++GT GV A +G
Sbjct: 192 AGGATLGNALGSVPVQQITQPVSTAITPIVTTAGLVTQTVGTQSGLGAPLGGVLAKVGGA 251
Query: 184 GTNSNS-------------LGITVAGVGNGVADLGDGLSTTGKSLSTTLGGIPVVGGLTG 230
+++ S LG V +GN V + G ++ G + G +P+ G +T
Sbjct: 252 LSSAGSKVGNATHNPVGADLGTLVGSLGNTVTNAGGLVNPNGPN-----GAMPIPGLITS 306
Query: 231 GVGGAAGGLVDKVGQTVTMLGDTLSTASTTG----PLGSLTNTVGGKVLVPVVSLVENTT 286
VG + G+ + + G S+ ++ G P+GSL+ +GG L + S + T
Sbjct: 307 LVGATSVGVANGPPASSNPFGPLQSSLASLGLGSNPVGSLSTLLGGTPLAGLTSALGGTP 366
Query: 287 GNLGKATGLGNPVNGLLDKVGSTVTGLGGQVASAGGTGNPVTNIVGGALTGV-GGVLDKS 345
LG T G GS ++ L + +G NP++ + GAL+GV GV S
Sbjct: 367 --LGSLTSSG--------LSGSPLSSLTSALGGSGSASNPLSTLT-GALSGVTSGVTSGS 415
Query: 346 GGYVAPAGGGAKSGLPELVGGLIANVGNGLNVGNTNGTVSAAGVTGGALGG 396
G A G A + + LVG L +G+ G+T+G+ +A LGG
Sbjct: 416 LGGGAGGSGQALAPVTALVGQLTGALGSA--AGSTSGSGTATNGLTTLLGG 464