Pairwise Alignments
Query, 923 a.a., PE-PGRS family protein PE_PGRS16 from Mycobacterium tuberculosis H37Rv
Subject, 714 a.a., PE-PGRS family protein PE_PGRS55 from Mycobacterium tuberculosis H37Rv
Score = 594 bits (1532), Expect = e-174
Identities = 360/719 (50%), Positives = 398/719 (55%), Gaps = 97/719 (13%)
Query: 1 MSFVVTAPPVLASAASDLGGIASMISEANAMAAVRTTALAPAAADEVSAAIAALFSSYAR 60
+SFV+ +P V+++AA DL + S IS AN AA TT + A ADEVSA IAALF Y
Sbjct: 1 VSFVLISPEVVSAAAGDLANVGSTISAANKAAAAATTQVLAAGADEVSARIAALFGMYGL 60
Query: 61 DYQTLSVQVTAFHVQFAQTLTNAGQLYAVVDVGNGVLLKTEQQVLGVINAPTQTLVGRPL 120
+YQ +S QV A+H QF QTL Y + + N EQ +L +INAPTQTL+GRPL
Sbjct: 61 EYQAISAQVAAYHQQFVQTLRTGAASYMLAEATN-----VEQNLLNLINAPTQTLLGRPL 115
Query: 121 IGDGTHGAPGTGQNGGAGGILWGNGGNGGSGAPGQPGGRGGDAGLFGHGGHGGVGGPGIA 180
IGDG + A G GG GG+L+G+GGNG GAPGQ GG GG AGL G+GG GG GG G
Sbjct: 116 IGDGAN-ATTPGGAGGDGGLLFGSGGNGAPGAPGQAGGAGGSAGLLGNGGSGGAGGTGAP 174
Query: 181 GA-AGTAGLPGGNGANGGSGGIGG--------------------AGGAGGNGGLLFGNGG 219
G G AG G G GG+GGIGG GG GGNGG L GNGG
Sbjct: 175 GGNGGNAGWLYGRGGVGGAGGIGGGTGGAGGHAWLFGHGGTGGIGGGPGGNGGWLLGNGG 234
Query: 220 AGGQGGSGGLGGSGGTGGAGMAAGPAGGTGGIGGIGGI-GGAGGVGGHGSALFGHGGING 278
GG GG G GGSGG GG G G G GGIGG GG GGAGG GG+ + L G GG G
Sbjct: 235 HGGAGGIG--GGSGGAGGNG---GWLLGNGGIGGAGGTGGGAGGTGGNAAWLLGGGGTGG 289
Query: 279 DGGTGGMGGQGGAGGNGWAAEGITVGIGEQGGQGGDGGAGGAGGIGGSAGGIG---GSQG 335
GG G GG GG GGNG G +G G GG GGDG G GG GG+ G G G+ G
Sbjct: 290 AGGIG--GGNGGHGGNG----GWLLGNGGNGGLGGDGDGGTGGGHGGNGGNPGWLLGTAG 343
Query: 336 AGGHGG-------DGGQGGAGGSGGVGGG-----GAGAGGDGGAGGIGGTGGNGSIGGAA 383
GG+GG GG GG GG GG GG GAGAGG GG GG GG G NG GGA
Sbjct: 344 GGGNGGAGSTGTAGGGSGGTGGDGGTGGRGGLLMGAGAGGHGGTGGAGGAGVNG--GGAG 401
Query: 384 GNGGNGGRGGAGGMAT----------AGSDGGNGGGGGNG----GVGVGSAGGAGGTGGD 429
G GG GG GGAGG A AG GG+GGGGG+G G+G GG+GGTGGD
Sbjct: 402 GAGGAGGNGGAGGQAALLFGRGGTGGAGGYGGDGGGGGDGFDGTMAGLGGTGGSGGTGGD 461
Query: 430 GGAAGAGGAPGHGYFQQPAPQGLPIGTGGTGGEGGAGGAGGDGGQGDIGFD--GGRGGDG 487
GGA G GGA G G + G G G+GGAGG GG+GG G G D G G G
Sbjct: 462 GGAPGNGGAGGAGQLLSHS------GVAGASGKGGAGGTGGNGGAGSAGADAPAGSGAMG 515
Query: 488 GPGGGGGAGGDG--SGTFNAQANNGGDGGAGGVGGAGGTGGTGGVGAD----GGRGGDSG 541
G GGAGGDG G A NGG+GG GG GG GGTGG G D GG G
Sbjct: 516 STGFAGGAGGDGGNGGGSGASQGNGGNGGNGGTGGKGGTGGAGMNSLDPLLAAQDGGQGG 575
Query: 542 RGGDGGNAGHGGAAQFSGRGAYGGEGGSGGAGGNAGG-------AGTGGTAGSGGAGGFG 594
GG GGNAG GG G G GG GG GGN G A G T G+GGAGG G
Sbjct: 576 TGGTGGNAGAGGTGFTQGADGNAGNGGDGGVGGNGGNGADNTTTAAAGTTGGAGGAGGAG 635
Query: 595 GNGADGGNG-----GNGGNGGFGGINGTFGTNGAGGTGGLGTLLGGHNGNIGLNGATGG 648
G G G G GNGGNGG GG G GT GA G L LL +G G G TGG
Sbjct: 636 GTGGAAGTGTGGQQGNGGNGGNGGTGGKGGTGGA-GMNSLDPLLAAQDGGQGGTGGTGG 693
Score = 210 bits (534), Expect = 3e-58
Identities = 162/372 (43%), Positives = 178/372 (47%), Gaps = 105/372 (28%)
Query: 356 GGGAGAGGDGGAGGIGGTGGNGSIGGAAGNGGNGGRGGAGGMATAGSDGGNGGGGGNGGV 415
G GA A GGAGG GG + G+ GNG G G AGG GG+ G GNGG
Sbjct: 117 GDGANATTPGGAGGDGGL-----LFGSGGNGAPGAPGQAGGA------GGSAGLLGNGG- 164
Query: 416 GVGSAGGAGGTGGDGGAAG-AGGAPGHGYFQQPAPQGLPIGTGGTGG-EGGAGGAG---- 469
+GGAGGTG GG G AG G G G GG GG GG GGAG
Sbjct: 165 ----SGGAGGTGAPGGNGGNAGWLYGRG------------GVGGAGGIGGGTGGAGGHAW 208
Query: 470 --GDGGQGDIGFDGGRGGDG----GPGGGGGAGGDGSGTFNAQAN------NGGDGGAGG 517
G GG G IG GG GG+G G GG GGAGG G G+ A N NGG GGAGG
Sbjct: 209 LFGHGGTGGIG--GGPGGNGGWLLGNGGHGGAGGIGGGSGGAGGNGGWLLGNGGIGGAGG 266
Query: 518 VG--------------GAGGTGGTGGV-----------------GADGGRGGD------S 540
G G GGTGG GG+ G +GG GGD
Sbjct: 267 TGGGAGGTGGNAAWLLGGGGTGGAGGIGGGNGGHGGNGGWLLGNGGNGGLGGDGDGGTGG 326
Query: 541 GRGGDGGN----------AGHGGAAQF----SGRGAYGGEGGSGGAGGNAGGAGTGGTAG 586
G GG+GGN G+GGA G G GG+GG+GG GG GAG GG G
Sbjct: 327 GHGGNGGNPGWLLGTAGGGGNGGAGSTGTAGGGSGGTGGDGGTGGRGGLLMGAGAGGHGG 386
Query: 587 SGGAGGFGGNGAD-GGNGGNGGNGGFGG----INGTFGTNGAGGTGGLGTLLG-GHNGNI 640
+GGAGG G NG GG GG GGNGG GG + G GT GAGG GG G G G +G +
Sbjct: 387 TGGAGGAGVNGGGAGGAGGAGGNGGAGGQAALLFGRGGTGGAGGYGGDGGGGGDGFDGTM 446
Query: 641 GLNGATGGIGST 652
G TGG G T
Sbjct: 447 AGLGGTGGSGGT 458