Pairwise Alignments

Query, 339 a.a., transcription initiation factor IIB from Methanococcus maripaludis S2

Subject, 339 a.a., transcription initiation factor IIB from Methanococcus maripaludis S2

 Score =  665 bits (1715), Expect = 0.0
 Identities = 339/339 (100%), Positives = 339/339 (100%)

Query: 1   MKVESVTKEDTKKSERKIKIAIAKPEDYSNKNVILEKEEELICPVCGSKSIIKDYERAEI 60
           MKVESVTKEDTKKSERKIKIAIAKPEDYSNKNVILEKEEELICPVCGSKSIIKDYERAEI
Sbjct: 1   MKVESVTKEDTKKSERKIKIAIAKPEDYSNKNVILEKEEELICPVCGSKSIIKDYERAEI 60

Query: 61  VCEMCGCVLQQNLFDVGPEWRAFDHEQRVKRSRVGAPMTYTIHDKGLSTVIDWRNKDSYG 120
           VCEMCGCVLQQNLFDVGPEWRAFDHEQRVKRSRVGAPMTYTIHDKGLSTVIDWRNKDSYG
Sbjct: 61  VCEMCGCVLQQNLFDVGPEWRAFDHEQRVKRSRVGAPMTYTIHDKGLSTVIDWRNKDSYG 120

Query: 121 KDISADKRAQLYRLRKWQRRIRVSDASERNLAFALSELDRIASKLGLPRNVRENAAVLYR 180
           KDISADKRAQLYRLRKWQRRIRVSDASERNLAFALSELDRIASKLGLPRNVRENAAVLYR
Sbjct: 121 KDISADKRAQLYRLRKWQRRIRVSDASERNLAFALSELDRIASKLGLPRNVRENAAVLYR 180

Query: 181 GAVEKGLIRGRSIEGVAAAALYAACRRCKVPRTLDEIAEVSRVDRKEIGRTYRFISRELN 240
           GAVEKGLIRGRSIEGVAAAALYAACRRCKVPRTLDEIAEVSRVDRKEIGRTYRFISRELN
Sbjct: 181 GAVEKGLIRGRSIEGVAAAALYAACRRCKVPRTLDEIAEVSRVDRKEIGRTYRFISRELN 240

Query: 241 IRLAPTNPVDYVPRFASELKLPGEVESKAISILQKAGERGLTSGRGPTGVAAAAIYIASV 300
           IRLAPTNPVDYVPRFASELKLPGEVESKAISILQKAGERGLTSGRGPTGVAAAAIYIASV
Sbjct: 241 IRLAPTNPVDYVPRFASELKLPGEVESKAISILQKAGERGLTSGRGPTGVAAAAIYIASV 300

Query: 301 LQGTRRTQREVADVAGVTEVTIRNRYKELTEHLDIDVTL 339
           LQGTRRTQREVADVAGVTEVTIRNRYKELTEHLDIDVTL
Sbjct: 301 LQGTRRTQREVADVAGVTEVTIRNRYKELTEHLDIDVTL 339