Pairwise Alignments

Query, 391 a.a., RND efflux system for fusidic acid, chlorpromazine, and thioridazine, membrane fusion component (from data) from Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482

Subject, 391 a.a., efflux transporter, RND family, MFP subunit from Bacteroides ovatus ATCC 8483

 Score =  700 bits (1806), Expect = 0.0
 Identities = 356/391 (91%), Positives = 376/391 (96%)

Query: 1   MKSRIVFFAFCLALLSSCGNKGNDTGKVPEYAVQELQKTTANLMKAYPATIKGRQDVEIR 60
           MKSRIV FAFC+ALLSSCGNKGNDTGKVPEYAVQELQKTTANL  AYPATIKG+QDVEIR
Sbjct: 1   MKSRIVLFAFCVALLSSCGNKGNDTGKVPEYAVQELQKTTANLTTAYPATIKGKQDVEIR 60

Query: 61  PQVSGFITKLCVDEGATVRKGQLLFIIDPTQYEAAVRTAKASVATAEAAVNTQQMTVDNK 120
           PQVSGFITKLCVDEGA VRKGQ+LFI+DPTQYEAAVRTAKA+VATAEAAV+TQQMT DNK
Sbjct: 61  PQVSGFITKLCVDEGAAVRKGQVLFIVDPTQYEAAVRTAKAAVATAEAAVSTQQMTYDNK 120

Query: 121 IELNKKQIISDYDLSMAKNSLAQAQAQLAQAKAQLTTAQQNYSFTQVKSPSDGVINDIPY 180
            ELNKKQIISDYDL+MA+NSLAQ +AQLAQAKAQLTTAQQN SFTQVKSPSDGVIN+IPY
Sbjct: 121 KELNKKQIISDYDLAMAENSLAQTKAQLAQAKAQLTTAQQNLSFTQVKSPSDGVINNIPY 180

Query: 181 RLGALVSPSMATPMTTVSEIDEVYVYFSTTEKELLAMTKTGGTIKEEISKIPAIKLQLID 240
           R+GALVSPS+ATPMTTVSEIDEVYVYFS TEKELLAMTK+G TIKEEISKIP IKLQLID
Sbjct: 181 RVGALVSPSIATPMTTVSEIDEVYVYFSMTEKELLAMTKSGSTIKEEISKIPTIKLQLID 240

Query: 241 GTTYDAEGKVDAITGVIDQSTGSVSMRAIFPNKEHMLRSGGTANVLIPYNMENVISIPQS 300
           G+TYD EGKVDAITGVIDQSTGSVS+RAIFPNKEH+LRSGGTANVLIPY MENVI+IPQS
Sbjct: 241 GSTYDIEGKVDAITGVIDQSTGSVSIRAIFPNKEHVLRSGGTANVLIPYAMENVITIPQS 300

Query: 301 ATVEIQDKKFVYVLQPDNTVKYTEIGIFNLDNGKEYLVTSGLNPGDKIVIEGVQSLKDGQ 360
           ATVEIQDKKFVYVLQPDNTVKYTEI IFNLDNGK+YLVTSGLN GDKIVIEGVQ+LKDGQ
Sbjct: 301 ATVEIQDKKFVYVLQPDNTVKYTEIKIFNLDNGKDYLVTSGLNSGDKIVIEGVQNLKDGQ 360

Query: 361 KIQPITPAQKEANYQQHLKDQHDGNLATAFN 391
           K+QPITPAQKEANYQQHLKDQHDGNLATAFN
Sbjct: 361 KVQPITPAQKEANYQQHLKDQHDGNLATAFN 391