Experiment set2IT092 for Rahnella sp. WP5
NLDM_metabolites carbon source
Group: carbon sourceMedia: RCH2_defined_noCarbon + 0.5X NLDM_metabolites
Culturing: RahnellaWP5_ML7, 24-well transparent microplate; Multitron, Aerobic, at 30 (C), shaken=700 rpm
By: Robert Tournay on December 7, 2021
Media components: 0.25 g/L Ammonium chloride, 0.1 g/L Potassium Chloride, 0.6 g/L Sodium phosphate monobasic monohydrate, 30 mM PIPES sesquisodium salt, Wolfe's mineral mix (0.03 g/L Magnesium Sulfate Heptahydrate, 0.015 g/L Nitrilotriacetic acid, 0.01 g/L Sodium Chloride, 0.005 g/L Manganese (II) sulfate monohydrate, 0.001 g/L Cobalt chloride hexahydrate, 0.001 g/L Zinc sulfate heptahydrate, 0.001 g/L Calcium chloride dihydrate, 0.001 g/L Iron (II) sulfate heptahydrate, 0.00025 g/L Nickel (II) chloride hexahydrate, 0.0002 g/L Aluminum potassium sulfate dodecahydrate, 0.0001 g/L Copper (II) sulfate pentahydrate, 0.0001 g/L Boric Acid, 0.0001 g/L Sodium Molybdate Dihydrate, 0.003 mg/L Sodium selenite pentahydrate), Wolfe's vitamin mix (0.1 mg/L Pyridoxine HCl, 0.05 mg/L 4-Aminobenzoic acid, 0.05 mg/L Lipoic acid, 0.05 mg/L Nicotinic Acid, 0.05 mg/L Riboflavin, 0.05 mg/L Thiamine HCl, 0.05 mg/L calcium pantothenate, 0.02 mg/L biotin, 0.02 mg/L Folic Acid, 0.001 mg/L Cyanocobalamin)
NLDM_metabolites 0.5x includes: 437.5 uM Sucrose, 437.5 uM D-Glucose, 437.5 uM D-Trehalose dihydrate, 437.5 uM m-Inositol, 437.5 uM D-Xylose, 437.5 uM D-Mannitol, 437.5 uM N-Acetyl-D-Glucosamine, 262.5 uM Sodium L-Lactate, 262.5 uM D,L-Malic Acid, 262.5 uM Citric Acid, 262.5 uM Sodium succinate dibasic hexahydrate, 262.5 uM Sodium pyruvate, 262.5 uM a-Ketoglutaric acid disodium salt hydrate, 262.5 uM L-Citrulline, 87.5 uM L-Alanine, 87.5 uM L-Arginine, 87.5 uM L-Asparagine, 87.5 uM L-Aspartic Acid, 87.5 uM L-Cysteine, 87.5 uM L-Glutamic acid, 87.5 uM L-Glutamine, 87.5 uM Glycine, 87.5 uM L-Histidine, 87.5 uM L-Isoleucine, 87.5 uM L-Leucine, 87.5 uM L-Lysine, 87.5 uM L-Methionine, 87.5 uM L-Phenylalanine, 87.5 uM L-Proline, 87.5 uM L-Serine, 87.5 uM L-Threonine, 87.5 uM L-Tryptophan, 87.5 uM L-tyrosine, 87.5 uM L-Valine, 8.75 uM 5-methyluridine, 8.75 uM Adenine hydrochloride hydrate, 8.75 uM Adenosine, 8.75 uM Cytidine, 8.75 uM Cytosine, 8.75 uM Guanine, 8.75 uM Guanosine, 8.75 uM Hypoxanthine, 8.75 uM Inosine, 8.75 uM Thymine, 8.75 uM Uracil, 8.75 uM Uridine, 8.75 uM Xanthine, 8.75 uM Xanthosine, 8.75 uM Gamma-Aminobutyric Acid Hydrochloride, 8.75 uM Ectoine, 8.75 uM Betaine, 8.75 uM N-Acetyl-glutamic acid, 8.75 uM Nicotinamide, 8.75 uM L-Ornithine, 8.75 uM Shikimic Acid, 8.75 uM spermidine, 8.75 uM Taurine, 8.75 uM Trigonelline HCl, 8.75 uM Carnitine Hydrochloride, 8.75 uM Choline chloride, 8.75 uM n-Acetyl-glutamine, 8.75 uM n-Acetyl-lysine, 8.75 uM n-Acetyl-muramic acid, 8.75 uM sn-glycero-3-phosphocholine (final concentrations)
Specific Phenotypes
None in this experiment