Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS21335

Experiment: M9+glycerol

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	M9+glycerol
4,614,966	+		DZA65_RS21330	0.37	-1.1
4,614,966	+		DZA65_RS21330	0.37	-2.1
4,614,966	+		DZA65_RS21330	0.37	-1.5
4,614,966	+		DZA65_RS21330	0.37	-0.6
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-0.4
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-2.0
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-1.6
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-1.2
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-1.2
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-0.4
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-1.6
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-2.4
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-1.6
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-2.1
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-1.2
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-2.5
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-2.6
4,615,006	+		DZA65_RS21330	0.39	-0.2
4,615,007	-		DZA65_RS21330	0.39	-1.1
4,615,047	+		DZA65_RS21330	0.42	-0.4
4,615,047	+		DZA65_RS21330	0.42	-1.5
4,615,047	+		DZA65_RS21330	0.42	-0.6
4,615,047	+		DZA65_RS21330	0.42	-1.0
4,615,135	+		DZA65_RS21330	0.48	-1.1
4,615,135	+		DZA65_RS21330	0.48	+1.4
4,615,135	+		DZA65_RS21330	0.48	-0.8
4,615,135	+		DZA65_RS21330	0.48	-0.8
4,615,136	-		DZA65_RS21330	0.48	+0.5
4,615,136	-		DZA65_RS21330	0.48	-2.3
4,615,154	-		DZA65_RS21330	0.49	-3.0
4,615,170	+		DZA65_RS21330	0.50	-1.4
4,615,170	+		DZA65_RS21330	0.50	+0.0
4,615,171	-		DZA65_RS21330	0.50	+0.4
4,615,171	-		DZA65_RS21330	0.50	-1.2
4,615,394	+		DZA65_RS21330	0.64	-0.2
4,615,395	-		DZA65_RS21330	0.65	-1.1
4,615,395	-		DZA65_RS21330	0.65	-1.4
4,615,395	-		DZA65_RS21330	0.65	-1.0
4,615,395	-		DZA65_RS21330	0.65	-1.5
4,615,395	-		DZA65_RS21330	0.65	-0.1
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.2
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.6
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-2.1
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.8
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.6
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	+1.0
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.3
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.5
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.4
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.1
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.5
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-2.0
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-0.4
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-1.2
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-2.2
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-1.2
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-0.4
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-1.1
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-2.4
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-0.2
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-2.0
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	+0.2
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-2.5
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-1.2
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-2.9
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-1.0
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-1.6
4,615,556	+		DZA65_RS21330	0.75	-1.6
4,615,556	+		DZA65_RS21330	0.75	-1.6
4,615,556	+		DZA65_RS21330	0.75	-0.6
4,615,556	+		DZA65_RS21330	0.75	-1.3
4,615,556	+		DZA65_RS21330	0.75	-1.1
4,615,556	+		DZA65_RS21330	0.75	-1.4
4,615,557	-		DZA65_RS21330	0.75	+0.0
4,615,743	+		DZA65_RS21330	0.87	-0.5
4,615,743	+		DZA65_RS21330	0.87	+1.4
4,615,743	+		DZA65_RS21330	0.87	-2.2
4,615,744	-		DZA65_RS21330	0.87	-1.0
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-0.8
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-1.2
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-2.9
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-2.0
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	+0.4
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-1.4
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-1.4
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-1.8
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-0.7
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	+1.1
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-2.4
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-2.1
4,615,766	-		DZA65_RS21330	0.89	+0.8
4,615,766	-		DZA65_RS21330	0.89	-1.8
4,615,766	-		DZA65_RS21330	0.89	-2.2
4,615,766	-		DZA65_RS21330	0.89	-2.0
4,615,866	+				-0.2
4,615,866	+				-0.7
4,615,866	+				-1.3
4,615,867	-				-0.6
4,615,897	-				-1.8
4,616,012	+				-2.2
4,616,013	-				-3.1
4,616,154	+		DZA65_RS21335	0.11	+1.4
4,616,414	-		DZA65_RS21335	0.25	-2.6
4,616,414	-		DZA65_RS21335	0.25	-1.0
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-1.0
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-1.4
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-1.0
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-1.8
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-1.6
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-1.8
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-0.8
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-1.6
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-2.0
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-2.1
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-0.2
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	+0.4
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-1.0
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-2.0
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	+0.4
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-3.0
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-5.2
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-1.0
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-3.0
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-0.2
4,616,496	+		DZA65_RS21335	0.30	-1.9
4,616,522	+		DZA65_RS21335	0.31	-2.2
4,616,522	+		DZA65_RS21335	0.31	-2.6
4,616,552	+		DZA65_RS21335	0.33	+0.6
4,616,552	+		DZA65_RS21335	0.33	+1.4
4,616,552	+		DZA65_RS21335	0.33	-0.9
4,616,552	+		DZA65_RS21335	0.33	-2.4
4,616,552	+		DZA65_RS21335	0.33	+0.6
4,616,552	+		DZA65_RS21335	0.33	-1.0
4,616,553	-		DZA65_RS21335	0.33	-1.6
4,616,553	-		DZA65_RS21335	0.33	-4.9
4,616,553	-		DZA65_RS21335	0.33	-1.2
4,616,553	-		DZA65_RS21335	0.33	-2.0
4,616,708	+		DZA65_RS21335	0.41	-2.5
4,616,709	-		DZA65_RS21335	0.41	-2.0
4,616,760	+		DZA65_RS21335	0.44	+0.4
4,616,761	-		DZA65_RS21335	0.44	-3.2
4,616,797	-		DZA65_RS21335	0.46	-4.1
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-2.7
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-3.4
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-4.0
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	+0.8
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-0.8
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-2.4
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-2.7
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-4.1
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-2.5
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-1.2
4,616,838	-		DZA65_RS21335	0.48	-1.2
4,616,838	-		DZA65_RS21335	0.48	-3.0
4,616,838	-		DZA65_RS21335	0.48	-3.9
4,616,838	-		DZA65_RS21335	0.48	-2.2
4,616,838	-		DZA65_RS21335	0.48	-1.8
4,616,875	+		DZA65_RS21335	0.50	-3.0
4,616,876	-		DZA65_RS21335	0.50	-2.4
4,616,876	-		DZA65_RS21335	0.50	-1.0
4,616,876	-		DZA65_RS21335	0.50	-3.1
4,616,907	+		DZA65_RS21335	0.52	-1.0
4,616,908	-		DZA65_RS21335	0.52	-1.6
4,617,059	+		DZA65_RS21335	0.60	-2.9
4,617,059	+		DZA65_RS21335	0.60	-3.2
4,617,059	+				-1.0
4,617,059	+		DZA65_RS21335	0.60	-1.4
4,617,059	+		DZA65_RS21335	0.60	-1.3
4,617,060	-		DZA65_RS21335	0.60	-0.3
4,617,060	-		DZA65_RS21335	0.60	-1.0
4,617,060	-		DZA65_RS21335	0.60	-1.8
4,617,060	-		DZA65_RS21335	0.60	+0.7
4,617,060	-		DZA65_RS21335	0.60	-1.6
4,617,060	-		DZA65_RS21335	0.60	-1.6
4,617,062	+		DZA65_RS21335	0.60	-1.8
4,617,063	-		DZA65_RS21335	0.60	-1.4
4,617,063	-		DZA65_RS21335	0.60	-2.9
4,617,482	+		DZA65_RS21335	0.83	-2.3
4,617,482	+		DZA65_RS21335	0.83	-2.7
4,617,482	+		DZA65_RS21335	0.83	-1.0
4,617,482	+		DZA65_RS21335	0.83	-2.4
4,617,482	+		DZA65_RS21335	0.83	-2.9
4,617,482	+		DZA65_RS21335	0.83	-0.6
4,617,482	+		DZA65_RS21335	0.83	-1.5
4,617,482	+		DZA65_RS21335	0.83	-1.0
4,617,482	+		DZA65_RS21335	0.83	-0.6
4,617,482	+		DZA65_RS21335	0.83	-1.8
4,617,482	+		DZA65_RS21335	0.83	-3.0
4,617,482	+		DZA65_RS21335	0.83	-2.0
4,617,482	+		DZA65_RS21335	0.83	+0.4
4,617,483	-		DZA65_RS21335	0.83	-3.7
4,617,483	-		DZA65_RS21335	0.83	-1.2
4,617,483	-		DZA65_RS21335	0.83	-1.5
4,617,483	-		DZA65_RS21335	0.83	-1.6
4,617,483	-		DZA65_RS21335	0.83	+1.4
4,617,483	-		DZA65_RS21335	0.83	-3.0
4,617,524	+		DZA65_RS21335	0.85	-2.8
4,617,524	+		DZA65_RS21335	0.85	-2.4
4,617,525	-		DZA65_RS21335	0.85	-2.3
4,617,525	-		DZA65_RS21335	0.85	-1.4
4,617,525	-		DZA65_RS21335	0.85	-1.5
4,617,525	-		DZA65_RS21335	0.85	-3.2
4,617,532	-		DZA65_RS21335	0.86	-2.5
4,617,532	-		DZA65_RS21335	0.86	+0.4
4,617,573	+		DZA65_RS21335	0.88	-4.3
4,617,693	+				-2.3
4,617,693	+				-3.7
4,617,693	+				-3.1
4,617,693	+				-3.8
4,617,694	-				-3.6
4,617,694	-				-1.6
4,617,694	-				-1.8
4,617,694	-				+1.4
4,617,694	-				-1.6
4,617,756	+				-2.9
4,617,756	+				-0.6
4,617,756	+				-0.6
4,617,757	-				-3.4
4,617,759	+				-3.8
4,617,759	+				-2.9
4,617,759	+				-2.4
4,617,759	+				-0.5
4,617,759	+				-3.4
4,617,759	+				-2.5
4,617,759	+				-3.2
4,617,760	-				-2.6
4,617,760	-				-2.0
4,617,760	-				-0.9
4,617,760	-				-2.0
4,617,760	-				-2.4
4,617,760	-				-2.2
4,617,788	+				-3.7
4,617,789	-				-0.9
4,617,789	-				-1.2
4,617,789	-				-4.2
4,617,789	-				-1.0
4,617,792	+				-1.6
4,617,792	+				+0.5
4,617,792	+				-2.8
4,617,792	+				+0.2
4,617,792	+				-0.8
4,617,792	+				+0.4
4,617,793	-				-0.4
4,617,793	-				-3.2
4,617,793	-				-1.8
4,617,793	-				-2.9
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