Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS20715

Experiment: PDB

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	PDB
4,469,871	+		DZA65_RS20710	0.32	-1.1
4,469,888	+		DZA65_RS20710	0.34	-1.2
4,469,909	+		DZA65_RS20710	0.36	+0.4
4,469,909	+		DZA65_RS20710	0.36	+0.6
4,469,909	+		DZA65_RS20710	0.36	-0.2
4,469,909	+		DZA65_RS20710	0.36	+1.2
4,469,909	+		DZA65_RS20710	0.36	-0.2
4,469,909	+		DZA65_RS20710	0.36	-0.4
4,469,910	-		DZA65_RS20710	0.36	-1.0
4,469,912	+		DZA65_RS20710	0.36	-0.5
4,469,912	+		DZA65_RS20710	0.36	+0.9
4,469,912	+		DZA65_RS20710	0.36	-0.6
4,469,913	-		DZA65_RS20710	0.36	+0.5
4,469,913	-		DZA65_RS20710	0.36	+1.0
4,469,913	-		DZA65_RS20710	0.36	+0.3
4,469,913	-		DZA65_RS20710	0.36	+0.6
4,469,925	+		DZA65_RS20710	0.37	+0.3
4,469,932	+		DZA65_RS20710	0.38	+0.2
4,469,961	+		DZA65_RS20710	0.40	+0.5
4,469,961	+		DZA65_RS20710	0.40	+0.4
4,469,961	+		DZA65_RS20710	0.40	-1.0
4,469,961	+		DZA65_RS20710	0.40	-1.1
4,469,961	+		DZA65_RS20710	0.40	+0.0
4,469,961	+		DZA65_RS20710	0.40	+0.8
4,469,962	-		DZA65_RS20710	0.40	+0.4
4,469,962	-		DZA65_RS20710	0.40	-0.2
4,469,962	-		DZA65_RS20710	0.40	-1.1
4,469,962	-		DZA65_RS20710	0.40	+0.2
4,470,057	+		DZA65_RS20710	0.49	-0.0
4,470,058	-		DZA65_RS20710	0.49	+1.0
4,470,058	-		DZA65_RS20710	0.49	+0.2
4,470,058	-		DZA65_RS20710	0.49	+0.6
4,470,058	-		DZA65_RS20710	0.49	+1.6
4,470,097	+		DZA65_RS20710	0.52	-0.5
4,470,097	+		DZA65_RS20710	0.52	+1.1
4,470,097	+		DZA65_RS20710	0.52	+2.0
4,470,097	+		DZA65_RS20710	0.52	+0.5
4,470,097	+		DZA65_RS20710	0.52	+0.1
4,470,097	+				-0.1
4,470,097	+		DZA65_RS20710	0.52	+1.1
4,470,097	+		DZA65_RS20710	0.52	+0.1
4,470,097	+		DZA65_RS20710	0.52	+0.2
4,470,097	+		DZA65_RS20710	0.52	-1.1
4,470,097	+		DZA65_RS20710	0.52	-0.3
4,470,097	+		DZA65_RS20710	0.52	+0.3
4,470,097	+		DZA65_RS20710	0.52	+0.4
4,470,098	-		DZA65_RS20710	0.52	-0.4
4,470,098	-		DZA65_RS20710	0.52	-0.5
4,470,098	-		DZA65_RS20710	0.52	+0.4
4,470,098	-		DZA65_RS20710	0.52	-1.9
4,470,098	-		DZA65_RS20710	0.52	+0.1
4,470,098	-		DZA65_RS20710	0.52	-0.1
4,470,098	-		DZA65_RS20710	0.52	-0.8
4,470,098	-		DZA65_RS20710	0.52	+1.3
4,470,098	-		DZA65_RS20710	0.52	-0.4
4,470,098	-		DZA65_RS20710	0.52	-0.4
4,470,098	-		DZA65_RS20710	0.52	-0.1
4,470,098	-		DZA65_RS20710	0.52	+0.2
4,470,098	-		DZA65_RS20710	0.52	-0.4
4,470,113	-		DZA65_RS20710	0.54	-1.1
4,470,113	-		DZA65_RS20710	0.54	+1.4
4,470,190	+		DZA65_RS20710	0.61	-1.1
4,470,190	+		DZA65_RS20710	0.61	+0.8
4,470,190	+		DZA65_RS20710	0.61	+1.6
4,470,191	-		DZA65_RS20710	0.61	-0.3
4,470,191	-		DZA65_RS20710	0.61	-0.9
4,470,191	-		DZA65_RS20710	0.61	-0.8
4,470,191	-		DZA65_RS20710	0.61	-0.4
4,470,191	-		DZA65_RS20710	0.61	-1.6
4,470,191	-		DZA65_RS20710	0.61	+0.4
4,470,191	-		DZA65_RS20710	0.61	+0.6
4,470,191	-		DZA65_RS20710	0.61	+0.9
4,470,191	-		DZA65_RS20710	0.61	+0.2
4,470,205	+		DZA65_RS20710	0.62	-0.2
4,470,205	+		DZA65_RS20710	0.62	-0.3
4,470,205	+		DZA65_RS20710	0.62	-0.1
4,470,205	+		DZA65_RS20710	0.62	-0.8
4,470,205	+		DZA65_RS20710	0.62	-0.0
4,470,205	+		DZA65_RS20710	0.62	-0.2
4,470,205	+		DZA65_RS20710	0.62	+0.1
4,470,206	-		DZA65_RS20710	0.62	-1.8
4,470,206	-		DZA65_RS20710	0.62	-1.2
4,470,206	-		DZA65_RS20710	0.62	+0.8
4,470,206	-		DZA65_RS20710	0.62	+0.7
4,470,206	-		DZA65_RS20710	0.62	-0.0
4,470,206	-		DZA65_RS20710	0.62	-0.4
4,470,259	+		DZA65_RS20710	0.67	-0.2
4,470,259	+		DZA65_RS20710	0.67	+0.8
4,470,259	+		DZA65_RS20710	0.67	-1.2
4,470,259	+		DZA65_RS20710	0.67	+0.6
4,470,259	+		DZA65_RS20710	0.67	-0.2
4,470,260	-		DZA65_RS20710	0.67	+1.2
4,470,260	-		DZA65_RS20710	0.67	+0.2
4,470,260	-		DZA65_RS20710	0.67	+0.6
4,470,260	-		DZA65_RS20710	0.67	+0.1
4,470,260	-		DZA65_RS20710	0.67	+0.2
4,470,260	-		DZA65_RS20710	0.67	+0.6
4,470,260	-		DZA65_RS20710	0.67	-0.7
4,470,260	-		DZA65_RS20710	0.67	+0.6
4,470,260	-		DZA65_RS20710	0.67	-0.8
4,470,260	-		DZA65_RS20710	0.67	-0.5
4,470,260	-		DZA65_RS20710	0.67	+0.2
4,470,260	-		DZA65_RS20710	0.67	-0.8
4,470,261	+		DZA65_RS20710	0.67	+0.1
4,470,261	+		DZA65_RS20710	0.67	-0.6
4,470,261	+		DZA65_RS20710	0.67	-0.4
4,470,261	+		DZA65_RS20710	0.67	+0.1
4,470,261	+		DZA65_RS20710	0.67	-0.3
4,470,261	+		DZA65_RS20710	0.67	-0.1
4,470,271	+		DZA65_RS20710	0.68	-0.5
4,470,271	+		DZA65_RS20710	0.68	+0.2
4,470,373	+		DZA65_RS20710	0.77	+0.1
4,470,385	-		DZA65_RS20710	0.78	-0.1
4,470,445	+		DZA65_RS20710	0.83	-0.4
4,470,445	+		DZA65_RS20710	0.83	-0.3
4,470,445	+		DZA65_RS20710	0.83	+0.0
4,470,445	+		DZA65_RS20710	0.83	-0.6
4,470,445	+		DZA65_RS20710	0.83	+0.1
4,470,445	+		DZA65_RS20710	0.83	-1.5
4,470,445	+		DZA65_RS20710	0.83	+0.6
4,470,445	+		DZA65_RS20710	0.83	+1.1
4,470,445	+		DZA65_RS20710	0.83	+0.3
4,470,445	+		DZA65_RS20710	0.83	+0.2
4,470,445	+		DZA65_RS20710	0.83	-0.3
4,470,445	+		DZA65_RS20710	0.83	-1.1
4,470,446	-				-1.4
4,470,446	-		DZA65_RS20710	0.83	-1.8
4,470,446	-		DZA65_RS20710	0.83	-0.4
4,470,446	-		DZA65_RS20710	0.83	+0.1
4,470,446	-		DZA65_RS20710	0.83	-0.8
4,470,446	-		DZA65_RS20710	0.83	-0.1
4,470,446	-		DZA65_RS20710	0.83	-0.1
4,470,446	-		DZA65_RS20710	0.83	+0.7
4,470,446	-		DZA65_RS20710	0.83	-1.6
4,470,446	-		DZA65_RS20710	0.83	-0.1
4,470,446	-		DZA65_RS20710	0.83	-1.8
4,470,446	-		DZA65_RS20710	0.83	-0.4
4,470,446	-		DZA65_RS20710	0.83	-0.1
4,470,446	-		DZA65_RS20710	0.83	+0.3
4,470,478	+		DZA65_RS20710	0.86	+0.5
4,470,478	+		DZA65_RS20710	0.86	+0.7
4,470,478	+		DZA65_RS20710	0.86	+1.0
4,470,478	+		DZA65_RS20710	0.86	+0.0
4,470,478	+		DZA65_RS20710	0.86	-0.5
4,470,478	+		DZA65_RS20710	0.86	-0.8
4,470,478	+		DZA65_RS20710	0.86	-0.6
4,470,478	+		DZA65_RS20710	0.86	+0.2
4,470,478	+		DZA65_RS20710	0.86	-0.4
4,470,479	-		DZA65_RS20710	0.86	-0.2
4,470,479	-		DZA65_RS20710	0.86	-0.2
4,470,479	-		DZA65_RS20710	0.86	-0.4
4,470,479	-		DZA65_RS20710	0.86	-0.4
4,470,479	-		DZA65_RS20710	0.86	+0.1
4,470,479	-		DZA65_RS20710	0.86	-0.4
4,470,479	-		DZA65_RS20710	0.86	-0.8
4,470,479	-		DZA65_RS20710	0.86	+1.2
4,470,479	-		DZA65_RS20710	0.86	+0.8
4,470,479	-		DZA65_RS20710	0.86	-0.4
4,470,515	-		DZA65_RS20710	0.89	+0.9
4,470,524	+				-0.5
4,470,524	+				-0.4
4,470,524	+				-1.7
4,470,525	-				+0.2
4,470,525	-				-0.4
4,470,530	-				-0.8
4,470,536	-				+1.2
4,470,536	-				+0.3
4,470,536	-				-0.6
4,470,536	-				-1.4
4,470,536	-				-0.4
4,470,536	-				+0.2
4,470,580	+				+0.0
4,470,581	-				+0.5
4,470,581	-				-0.6
4,470,627	+				-0.6
4,470,628	-				+0.1
4,470,628	-				-0.8
4,470,628	-				-0.9
4,470,632	-				+0.3
4,470,632	-				-1.2
4,470,802	-				+0.1
4,470,810	+				+0.8
4,470,810	+				-0.2
4,470,810	+				-1.4
4,470,810	+				-0.8
4,470,810	+				-0.1
4,470,811	-				-1.4
4,470,811	-				+0.2
4,470,811	-				+0.2
4,470,811	-				-0.6
4,470,827	+				+0.1
4,470,827	+				-0.8
4,470,827	+				-0.4
4,471,069	+		DZA65_RS20715	0.21	+0.2
4,471,069	+		DZA65_RS20715	0.21	-0.9
4,471,069	+		DZA65_RS20715	0.21	-0.6
4,471,069	+		DZA65_RS20715	0.21	-0.4
4,471,069	+		DZA65_RS20715	0.21	+0.1
4,471,069	+		DZA65_RS20715	0.21	-0.6
4,471,069	+		DZA65_RS20715	0.21	+0.1
4,471,069	+				+2.2
4,471,070	-		DZA65_RS20715	0.21	-0.8
4,471,070	-		DZA65_RS20715	0.21	-2.0
4,471,070	-		DZA65_RS20715	0.21	+0.1
4,471,070	-		DZA65_RS20715	0.21	+0.2
4,471,070	-		DZA65_RS20715	0.21	-0.2
4,471,151	+		DZA65_RS20715	0.28	-0.1
4,471,151	+		DZA65_RS20715	0.28	-0.0
4,471,151	+		DZA65_RS20715	0.28	-1.6
4,471,151	+		DZA65_RS20715	0.28	+0.6
4,471,151	+		DZA65_RS20715	0.28	-0.8
4,471,164	+		DZA65_RS20715	0.29	+0.8
4,471,164	+		DZA65_RS20715	0.29	-0.2
4,471,164	+		DZA65_RS20715	0.29	-0.6
4,471,164	+		DZA65_RS20715	0.29	-1.1
4,471,164	+		DZA65_RS20715	0.29	-0.8
4,471,164	+		DZA65_RS20715	0.29	-1.0
4,471,165	-		DZA65_RS20715	0.29	-0.8
4,471,165	-		DZA65_RS20715	0.29	-0.0
4,471,165	-		DZA65_RS20715	0.29	-2.8
4,471,165	-		DZA65_RS20715	0.29	-2.5
4,471,246	+		DZA65_RS20715	0.35	-0.5
4,471,246	+		DZA65_RS20715	0.35	-0.6
4,471,246	+		DZA65_RS20715	0.35	+1.8
4,471,247	-		DZA65_RS20715	0.35	-0.1
4,471,247	-		DZA65_RS20715	0.35	-0.5
4,471,284	+		DZA65_RS20715	0.38	-0.8
4,471,344	+		DZA65_RS20715	0.43	+1.5
4,471,345	-		DZA65_RS20715	0.43	+0.2
4,471,345	-		DZA65_RS20715	0.43	-1.8
4,471,363	-		DZA65_RS20715	0.44	-0.7
4,471,384	+		DZA65_RS20715	0.46	-1.1
4,471,385	-		DZA65_RS20715	0.46	-0.1
4,471,385	-		DZA65_RS20715	0.46	-0.2
4,471,407	+		DZA65_RS20715	0.48	-0.1
4,471,407	+		DZA65_RS20715	0.48	-1.1
4,471,407	+		DZA65_RS20715	0.48	-1.6
4,471,408	-		DZA65_RS20715	0.48	-0.2
4,471,408	-		DZA65_RS20715	0.48	+0.4
4,471,408	-		DZA65_RS20715	0.48	-1.4
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