Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS18665

Experiment: PDB

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	PDB
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	-0.5
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	-1.1
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	+1.5
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	+1.0
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	-0.0
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	+0.4
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	-0.3
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	-1.0
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	+0.9
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	+0.0
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	+1.2
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	-0.4
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	+0.4
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	+0.6
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	-2.4
4,019,270	+		DZA65_RS18660	0.11	+0.0
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	-0.3
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	+0.3
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	-0.8
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	+0.4
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	-1.2
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	+0.9
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	+1.9
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	+0.2
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	+0.4
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	+0.3
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	-1.7
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	-1.7
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	-0.0
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	-0.8
4,019,271	-		DZA65_RS18660	0.11	+2.4
4,019,272	+		DZA65_RS18660	0.11	-0.1
4,019,272	+		DZA65_RS18660	0.11	-0.7
4,019,272	+		DZA65_RS18660	0.11	+2.6
4,019,272	+		DZA65_RS18660	0.11	+1.2
4,019,272	+		DZA65_RS18660	0.11	-1.0
4,019,272	+		DZA65_RS18660	0.11	-0.0
4,019,272	+				+1.2
4,019,273	-		DZA65_RS18660	0.11	-2.0
4,019,273	-		DZA65_RS18660	0.11	-0.0
4,019,273	-		DZA65_RS18660	0.11	-0.1
4,019,273	-		DZA65_RS18660	0.11	-0.8
4,019,273	-		DZA65_RS18660	0.11	+0.2
4,019,273	-		DZA65_RS18660	0.11	-2.2
4,019,273	-		DZA65_RS18660	0.11	+0.2
4,019,273	-		DZA65_RS18660	0.11	+0.2
4,019,273	-		DZA65_RS18660	0.11	-0.9
4,019,273	-		DZA65_RS18660	0.11	-0.1
4,019,273	-		DZA65_RS18660	0.11	-0.3
4,019,273	-		DZA65_RS18660	0.11	+0.7
4,019,273	-		DZA65_RS18660	0.11	+0.3
4,019,306	+		DZA65_RS18660	0.15	+0.2
4,019,306	+		DZA65_RS18660	0.15	-0.7
4,019,306	+		DZA65_RS18660	0.15	-2.3
4,019,306	+		DZA65_RS18660	0.15	+0.4
4,019,306	+		DZA65_RS18660	0.15	-0.7
4,019,306	+		DZA65_RS18660	0.15	+1.2
4,019,307	-		DZA65_RS18660	0.15	+0.6
4,019,307	-		DZA65_RS18660	0.15	+0.0
4,019,307	-		DZA65_RS18660	0.15	+0.2
4,019,307	-		DZA65_RS18660	0.15	+0.4
4,019,307	-		DZA65_RS18660	0.15	+0.2
4,019,307	-		DZA65_RS18660	0.15	-0.7
4,019,322	-		DZA65_RS18660	0.17	+1.6
4,019,378	+		DZA65_RS18660	0.25	+0.8
4,019,378	+		DZA65_RS18660	0.25	-0.0
4,019,378	+		DZA65_RS18660	0.25	-0.8
4,019,378	+		DZA65_RS18660	0.25	-1.4
4,019,379	-		DZA65_RS18660	0.25	-1.5
4,019,379	-		DZA65_RS18660	0.25	-1.4
4,019,401	-		DZA65_RS18660	0.28	-0.8
4,019,442	+		DZA65_RS18660	0.33	-0.5
4,019,442	+		DZA65_RS18660	0.33	-0.7
4,019,442	+		DZA65_RS18660	0.33	-1.0
4,019,443	-		DZA65_RS18660	0.33	+0.1
4,019,475	+		DZA65_RS18660	0.37	-0.1
4,019,475	+		DZA65_RS18660	0.37	-1.7
4,019,475	+		DZA65_RS18660	0.37	-0.5
4,019,475	+		DZA65_RS18660	0.37	+0.2
4,019,475	+		DZA65_RS18660	0.37	-1.1
4,019,475	+		DZA65_RS18660	0.37	+0.4
4,019,479	+		DZA65_RS18660	0.38	-1.8
4,019,480	-		DZA65_RS18660	0.38	-1.0
4,019,480	-		DZA65_RS18660	0.38	+0.1
4,019,480	-				+0.2
4,019,480	-		DZA65_RS18660	0.38	+0.2
4,019,480	-		DZA65_RS18660	0.38	-1.7
4,019,480	-		DZA65_RS18660	0.38	-0.6
4,019,480	-		DZA65_RS18660	0.38	-0.0
4,019,548	-		DZA65_RS18660	0.47	-1.2
4,019,548	-		DZA65_RS18660	0.47	-0.7
4,019,567	+		DZA65_RS18660	0.49	+0.2
4,019,735	-		DZA65_RS18660	0.71	+0.9
4,019,828	+		DZA65_RS18660	0.83	-1.8
4,019,828	+		DZA65_RS18660	0.83	-1.4
4,019,837	+		DZA65_RS18660	0.85	-0.4
4,019,838	-		DZA65_RS18660	0.85	-0.4
4,019,838	-		DZA65_RS18660	0.85	-0.5
4,019,854	+		DZA65_RS18660	0.87	-0.8
4,019,854	+		DZA65_RS18660	0.87	-0.7
4,019,854	+		DZA65_RS18660	0.87	-0.2
4,019,854	+		DZA65_RS18660	0.87	-0.6
4,019,854	+		DZA65_RS18660	0.87	-0.8
4,019,855	-		DZA65_RS18660	0.87	-0.7
4,019,855	-		DZA65_RS18660	0.87	+1.2
4,019,855	-		DZA65_RS18660	0.87	-0.4
4,019,855	-		DZA65_RS18660	0.87	+0.2
4,019,860	+		DZA65_RS18660	0.88	-0.1
4,019,860	+		DZA65_RS18660	0.88	-0.2
4,019,926	+				+0.4
4,020,060	+				-0.2
4,020,063	-				+0.5
4,020,063	-				+0.2
4,020,176	+				-0.3
4,020,200	+				+0.9
4,020,213	-				-0.8
4,020,250	-				-0.3
4,020,250	-				-0.4
4,020,256	+				-1.7
4,020,580	+		DZA65_RS18665	0.24	-0.2
4,020,580	+		DZA65_RS18665	0.24	+1.2
4,020,580	+		DZA65_RS18665	0.24	-1.5
4,020,581	-				+1.9
4,020,721	+		DZA65_RS18665	0.34	+0.3
4,020,721	+		DZA65_RS18665	0.34	-0.7
4,020,722	-		DZA65_RS18665	0.34	-1.2
4,020,722	-		DZA65_RS18665	0.34	-0.3
4,020,722	-		DZA65_RS18665	0.34	+1.3
4,020,795	-		DZA65_RS18665	0.39	-0.4
4,020,856	+		DZA65_RS18665	0.44	-0.7
4,020,857	-		DZA65_RS18665	0.44	-0.6
4,020,889	+		DZA65_RS18665	0.46	+0.0
4,020,889	+		DZA65_RS18665	0.46	-0.4
4,020,889	+		DZA65_RS18665	0.46	-0.6
4,020,889	+		DZA65_RS18665	0.46	-0.8
4,020,889	+		DZA65_RS18665	0.46	+0.2
4,020,890	-		DZA65_RS18665	0.46	+1.0
4,020,890	-		DZA65_RS18665	0.46	-0.0
4,020,890	-		DZA65_RS18665	0.46	-1.3
4,020,890	-		DZA65_RS18665	0.46	-0.7
4,020,890	-		DZA65_RS18665	0.46	+0.5
4,020,890	-		DZA65_RS18665	0.46	-1.7
4,020,890	-		DZA65_RS18665	0.46	-0.2
4,020,890	-		DZA65_RS18665	0.46	-0.2
4,020,907	+		DZA65_RS18665	0.47	-0.8
4,020,907	+		DZA65_RS18665	0.47	-0.2
4,020,935	+		DZA65_RS18665	0.49	-0.4
4,021,117	+		DZA65_RS18665	0.63	-0.8
4,021,118	-		DZA65_RS18665	0.63	-0.3
4,021,189	+		DZA65_RS18665	0.68	-0.1
4,021,190	-		DZA65_RS18665	0.68	-0.8
4,021,190	-		DZA65_RS18665	0.68	-0.8
4,021,190	-		DZA65_RS18665	0.68	-2.7
4,021,196	+		DZA65_RS18665	0.68	-1.5
4,021,197	-		DZA65_RS18665	0.69	-0.6
4,021,197	-		DZA65_RS18665	0.69	-0.7
4,021,221	-		DZA65_RS18665	0.70	-1.2
4,021,285	+		DZA65_RS18665	0.75	-0.5
4,021,285	+		DZA65_RS18665	0.75	+0.2
4,021,285	+		DZA65_RS18665	0.75	-0.3
4,021,285	+		DZA65_RS18665	0.75	-0.2
4,021,285	+		DZA65_RS18665	0.75	+2.2
4,021,285	+		DZA65_RS18665	0.75	-0.4
4,021,285	+		DZA65_RS18665	0.75	-0.1
4,021,285	+		DZA65_RS18665	0.75	-2.5
4,021,285	+		DZA65_RS18665	0.75	-2.5
4,021,285	+		DZA65_RS18665	0.75	-1.4
4,021,285	+		DZA65_RS18665	0.75	-1.0
4,021,285	+		DZA65_RS18665	0.75	-1.0
4,021,285	+		DZA65_RS18665	0.75	+0.3
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	-0.8
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	-1.4
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	+1.2
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	-0.4
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	+0.5
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	-0.4
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	-0.6
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	-1.1
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	-0.4
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	-0.7
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	-0.2
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	-1.2
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	-0.3
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	-0.2
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	-0.3
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	+0.4
4,021,286	-		DZA65_RS18665	0.75	+0.8
4,021,327	+		DZA65_RS18665	0.78	-1.5
4,021,327	+		DZA65_RS18665	0.78	-2.0
4,021,327	+		DZA65_RS18665	0.78	-1.3
4,021,327	+		DZA65_RS18665	0.78	-0.8
4,021,327	+		DZA65_RS18665	0.78	-1.7
4,021,327	+		DZA65_RS18665	0.78	-0.4
4,021,327	+		DZA65_RS18665	0.78	+1.0
4,021,327	+		DZA65_RS18665	0.78	+0.4
4,021,327	+		DZA65_RS18665	0.78	-1.0
4,021,327	+		DZA65_RS18665	0.78	+1.2
4,021,327	+		DZA65_RS18665	0.78	+0.4
4,021,327	+		DZA65_RS18665	0.78	-0.1
4,021,327	+		DZA65_RS18665	0.78	+0.3
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	-1.2
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	-0.2
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	+0.4
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	-0.8
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	+0.2
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	-0.1
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	-0.8
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	-0.3
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	+0.7
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	-0.3
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	+0.1
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	-1.2
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	-1.4
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	+0.1
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	-1.2
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	-0.9
4,021,328	-		DZA65_RS18665	0.78	+0.2
4,021,328	-				-0.8
4,021,339	+		DZA65_RS18665	0.79	-2.0
4,021,339	+		DZA65_RS18665	0.79	+0.6
4,021,340	-		DZA65_RS18665	0.79	-2.0
4,021,355	+		DZA65_RS18665	0.80	-0.8
4,021,355	+		DZA65_RS18665	0.80	-0.6
4,021,355	+		DZA65_RS18665	0.80	-0.1
4,021,355	+		DZA65_RS18665	0.80	+0.3
4,021,356	-		DZA65_RS18665	0.80	+0.0
4,021,356	-		DZA65_RS18665	0.80	-0.2
4,021,378	+		DZA65_RS18665	0.82	+0.1
4,021,448	+				-1.2
4,021,568	+				-0.6
4,021,568	+				+0.4
4,021,568	+				+0.6
4,021,569	-				+0.6
4,021,569	-				-0.7
4,021,652	+				-0.6
4,021,652	+				+0.5
4,021,652	+				+0.4
4,021,653	-				-1.2
4,021,653	-				+0.7
4,021,653	-				+0.5
4,021,666	+				+0.8
4,021,666	+				-0.4
4,021,666	+				-1.5
4,021,667	-				-0.7
4,021,667	-				-0.4
4,021,676	+				+0.3
4,021,676	+				+0.3
4,021,676	+				-1.7
4,021,676	+				+0.4
4,021,676	+				-0.9
4,021,677	-				-0.5
4,021,677	-				-0.8
4,021,686	-				-1.7
4,021,707	-				-0.7
4,021,707	-				+0.5
4,021,754	-				+0.2
4,021,800	-				+0.5
4,021,835	-				+0.3
4,021,883	+				-0.2
4,021,883	+				+2.7
4,021,884	-				-0.7
4,021,884	-				-2.2
4,021,884	-				-1.2
4,021,884	-				-0.5
4,021,884	-				-0.2
4,021,888	+				-0.4
4,021,940	+				-0.8
4,021,940	+				-1.3
4,021,940	+				-0.8
4,021,941	-				+0.2
4,021,982	+				+1.0
4,021,982	+				-2.2
4,021,999	-				+0.7
4,021,999	-				+1.2
4,022,018	+				-0.2
4,022,018	+				-0.3
4,022,019	-				+0.3
4,022,019	-				-1.0
4,022,019	-				-0.8
4,022,019	-				-1.0
4,022,019	-				-0.2
4,022,019	-				-2.7
4,022,019	-				-1.5
4,022,022	+				-1.4
4,022,022	+				+0.6
4,022,022	+				-0.6
4,022,022	+				+0.9
4,022,022	+				+0.9
4,022,022	+				-0.2
4,022,022	+				+0.5
4,022,022	+				-0.7
4,022,022	+				-0.2
4,022,022	+				-0.8
4,022,022	+				+1.5
4,022,022	+				+0.2
4,022,022	+				+0.5
4,022,023	-				+0.8
4,022,023	-				+0.4
4,022,023	-				-0.6
4,022,023	-				+0.3
4,022,023	-				+0.1
4,022,023	-				-0.0
4,022,023	-				-0.6
4,022,023	-				-0.2
4,022,023	-				-0.3
4,022,081	+		DZA65_RS18670	0.13	+0.7
4,022,081	+		DZA65_RS18670	0.13	+0.2
4,022,081	+		DZA65_RS18670	0.13	-1.4
4,022,082	-		DZA65_RS18670	0.13	-1.1
4,022,082	-		DZA65_RS18670	0.13	-0.9
4,022,082	-		DZA65_RS18670	0.13	-1.0
4,022,082	-		DZA65_RS18670	0.13	-0.2
4,022,082	-		DZA65_RS18670	0.13	-1.1
4,022,142	-		DZA65_RS18670	0.26	-0.3
4,022,243	+		DZA65_RS18670	0.47	+0.3
4,022,243	+		DZA65_RS18670	0.47	+0.1
4,022,244	-		DZA65_RS18670	0.47	-0.1
4,022,263	+		DZA65_RS18670	0.51	-0.8
4,022,263	+		DZA65_RS18670	0.51	-1.7
4,022,264	-				+1.2
4,022,264	-		DZA65_RS18670	0.51	+1.6
4,022,264	-		DZA65_RS18670	0.51	-1.2
4,022,313	+		DZA65_RS18670	0.62	+0.6
4,022,313	+		DZA65_RS18670	0.62	-0.2
4,022,314	-				+1.2
4,022,314	-		DZA65_RS18670	0.62	+1.7
4,022,314	-		DZA65_RS18670	0.62	+0.4
4,022,315	+		DZA65_RS18670	0.62	-1.8
4,022,315	+		DZA65_RS18670	0.62	-0.8
4,022,315	+		DZA65_RS18670	0.62	+0.6
4,022,315	+		DZA65_RS18670	0.62	-0.2
4,022,315	+		DZA65_RS18670	0.62	-0.3
4,022,316	-		DZA65_RS18670	0.62	-0.6
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	-0.3
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	-0.8
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	-1.2
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	+0.5
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	-0.9
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	-0.9
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	-1.0
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	-0.7
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	+0.1
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	-0.0
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	+0.5
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	+1.0
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	-0.4
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	+0.2
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	+0.7
4,022,337	+		DZA65_RS18670	0.67	+1.4
4,022,338	-		DZA65_RS18670	0.67	-0.8
4,022,338	-		DZA65_RS18670	0.67	+0.4
4,022,338	-		DZA65_RS18670	0.67	-0.2
4,022,338	-		DZA65_RS18670	0.67	+0.0
4,022,338	-		DZA65_RS18670	0.67	+0.9
4,022,338	-		DZA65_RS18670	0.67	-0.1
4,022,338	-		DZA65_RS18670	0.67	+0.5
4,022,338	-		DZA65_RS18670	0.67	-1.0
4,022,338	-		DZA65_RS18670	0.67	+0.2
4,022,338	-		DZA65_RS18670	0.67	-0.4
4,022,338	-		DZA65_RS18670	0.67	-0.2
4,022,338	-		DZA65_RS18670	0.67	-0.5
4,022,338	-		DZA65_RS18670	0.67	-0.1
4,022,467	+				-0.4
4,022,535	+				-0.1
4,022,536	-				-0.8
4,022,536	-				+0.5
4,022,549	+				+0.3
4,022,557	-				-0.5
4,022,557	-				-0.1
4,022,558	+				-1.8
4,022,559	-				-0.4
4,022,570	-				-1.7
4,022,579	-				-1.5
4,022,582	+				+0.4
4,022,615	-				+0.2