Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS22470

Experiment: LB

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	LB
4,858,247	+		DZA65_RS22465	0.32	-0.5
4,858,247	+		DZA65_RS22465	0.32	-0.1
4,858,248	-		DZA65_RS22465	0.32	-0.1
4,858,248	-		DZA65_RS22465	0.32	+0.2
4,858,279	+		DZA65_RS22465	0.34	-1.7
4,858,279	+		DZA65_RS22465	0.34	+0.2
4,858,279	+		DZA65_RS22465	0.34	-0.7
4,858,279	+		DZA65_RS22465	0.34	+0.8
4,858,279	+		DZA65_RS22465	0.34	+0.4
4,858,279	+		DZA65_RS22465	0.34	-2.3
4,858,279	+		DZA65_RS22465	0.34	+0.2
4,858,280	-		DZA65_RS22465	0.34	-0.0
4,858,280	-		DZA65_RS22465	0.34	+0.1
4,858,280	-		DZA65_RS22465	0.34	-0.9
4,858,280	-		DZA65_RS22465	0.34	-2.0
4,858,280	-		DZA65_RS22465	0.34	-0.0
4,858,280	-		DZA65_RS22465	0.34	+0.1
4,858,280	-		DZA65_RS22465	0.34	-1.6
4,858,280	-		DZA65_RS22465	0.34	-0.7
4,858,280	-		DZA65_RS22465	0.34	-0.8
4,858,280	-		DZA65_RS22465	0.34	+0.4
4,858,280	-		DZA65_RS22465	0.34	-0.7
4,858,283	+		DZA65_RS22465	0.34	-0.6
4,858,283	+		DZA65_RS22465	0.34	+1.1
4,858,283	+		DZA65_RS22465	0.34	-1.4
4,858,283	+		DZA65_RS22465	0.34	-0.7
4,858,283	+		DZA65_RS22465	0.34	-0.1
4,858,283	+		DZA65_RS22465	0.34	+0.1
4,858,283	+		DZA65_RS22465	0.34	+0.4
4,858,283	+		DZA65_RS22465	0.34	+0.5
4,858,283	+		DZA65_RS22465	0.34	+0.4
4,858,283	+		DZA65_RS22465	0.34	-0.1
4,858,283	+		DZA65_RS22465	0.34	+1.4
4,858,283	+		DZA65_RS22465	0.34	-0.3
4,858,284	-		DZA65_RS22465	0.34	+0.7
4,858,284	-		DZA65_RS22465	0.34	-1.4
4,858,284	-		DZA65_RS22465	0.34	-1.0
4,858,284	-		DZA65_RS22465	0.34	-0.1
4,858,284	-		DZA65_RS22465	0.34	+0.6
4,858,284	-		DZA65_RS22465	0.34	-0.1
4,858,284	-		DZA65_RS22465	0.34	-1.9
4,858,298	+		DZA65_RS22465	0.35	+1.1
4,858,298	+		DZA65_RS22465	0.35	-0.8
4,858,298	+		DZA65_RS22465	0.35	+0.9
4,858,298	+		DZA65_RS22465	0.35	+0.4
4,858,298	+		DZA65_RS22465	0.35	+0.4
4,858,298	+		DZA65_RS22465	0.35	-0.3
4,858,298	+		DZA65_RS22465	0.35	-0.0
4,858,298	+		DZA65_RS22465	0.35	+0.0
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-0.5
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-0.6
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-0.3
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-1.1
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-0.3
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	+0.6
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-0.5
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-1.1
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-0.5
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-1.1
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-0.1
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-1.3
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-1.2
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	+1.4
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-0.7
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-0.7
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	+0.5
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-2.4
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	-1.4
4,858,299	-		DZA65_RS22465	0.35	+0.3
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-1.0
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.0
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.9
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.1
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	+1.0
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-2.0
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	+1.5
4,858,385	+				+1.4
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	+0.4
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	+0.2
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	+0.2
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.3
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.3
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	+1.7
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	+0.1
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	+0.1
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-1.7
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.5
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	+0.8
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.3
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.9
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-1.0
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-1.7
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	+0.8
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-2.4
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	+0.9
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-1.4
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.2
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.0
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.6
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.6
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	+0.5
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.3
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.3
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.3
4,858,385	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.4
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-1.0
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.4
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.4
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	+0.0
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-1.1
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.3
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	+1.2
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	+0.7
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-1.1
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.9
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	+0.1
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-2.3
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-1.4
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	+0.8
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	+1.2
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.6
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.4
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.1
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	+0.3
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	+1.4
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	+0.4
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.1
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	+0.0
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.6
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.4
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	+0.4
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	+0.2
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	+1.1
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.9
4,858,386	-		DZA65_RS22465	0.42	+0.4
4,858,389	+		DZA65_RS22465	0.42	+0.1
4,858,389	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.1
4,858,389	+		DZA65_RS22465	0.42	+0.1
4,858,389	+		DZA65_RS22465	0.42	+0.0
4,858,389	+		DZA65_RS22465	0.42	-0.4
4,858,389	+		DZA65_RS22465	0.42	-1.6
4,858,389	+		DZA65_RS22465	0.42	+0.2
4,858,390	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.3
4,858,390	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.0
4,858,390	-		DZA65_RS22465	0.42	+0.0
4,858,390	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.8
4,858,390	-		DZA65_RS22465	0.42	-0.9
4,858,407	-		DZA65_RS22465	0.43	-1.3
4,858,458	+		DZA65_RS22465	0.47	-0.3
4,858,458	+		DZA65_RS22465	0.47	-0.1
4,858,458	+		DZA65_RS22465	0.47	-0.2
4,858,458	+		DZA65_RS22465	0.47	-1.7
4,858,458	+		DZA65_RS22465	0.47	-0.7
4,858,458	+		DZA65_RS22465	0.47	-0.7
4,858,458	+				+0.1
4,858,458	+		DZA65_RS22465	0.47	+0.1
4,858,458	+		DZA65_RS22465	0.47	+0.3
4,858,458	+		DZA65_RS22465	0.47	-0.4
4,858,458	+		DZA65_RS22465	0.47	+1.1
4,858,458	+		DZA65_RS22465	0.47	+0.1
4,858,458	+		DZA65_RS22465	0.47	-0.1
4,858,458	+		DZA65_RS22465	0.47	+1.6
4,858,458	+		DZA65_RS22465	0.47	-0.9
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	-0.8
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	-0.8
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	+0.1
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	+0.7
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	+0.0
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	-0.1
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	+0.5
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	-1.0
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	-0.7
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	-1.1
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	+0.3
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	+0.6
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	+0.6
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	+0.0
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	-1.1
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	-2.0
4,858,459	-		DZA65_RS22465	0.47	+0.3
4,858,460	+		DZA65_RS22465	0.47	-0.9
4,858,461	-		DZA65_RS22465	0.47	+1.4
4,858,461	-		DZA65_RS22465	0.47	-0.7
4,858,461	-		DZA65_RS22465	0.47	-0.6
4,858,506	-		DZA65_RS22465	0.50	-1.5
4,858,506	-		DZA65_RS22465	0.50	-0.3
4,858,658	+		DZA65_RS22465	0.61	-1.1
4,858,865	+		DZA65_RS22465	0.77	-1.4
4,858,865	+		DZA65_RS22465	0.77	+0.7
4,858,865	+		DZA65_RS22465	0.77	-2.8
4,858,865	+		DZA65_RS22465	0.77	+0.5
4,858,866	-		DZA65_RS22465	0.77	-1.5
4,858,866	-		DZA65_RS22465	0.77	+0.4
4,858,866	-		DZA65_RS22465	0.77	+0.4
4,858,871	+				+0.4
4,858,872	-		DZA65_RS22465	0.77	-0.4
4,858,883	+		DZA65_RS22465	0.78	+0.6
4,858,883	+		DZA65_RS22465	0.78	-0.3
4,858,883	+		DZA65_RS22465	0.78	+1.0
4,858,883	+		DZA65_RS22465	0.78	-0.3
4,858,884	-		DZA65_RS22465	0.78	-1.0
4,858,884	-		DZA65_RS22465	0.78	-0.6
4,858,884	-		DZA65_RS22465	0.78	+0.2
4,858,889	+		DZA65_RS22465	0.78	-2.3
4,858,889	+		DZA65_RS22465	0.78	+1.4
4,858,889	+		DZA65_RS22465	0.78	-0.6
4,858,889	+		DZA65_RS22465	0.78	+0.4
4,858,889	+		DZA65_RS22465	0.78	+0.7
4,858,889	+		DZA65_RS22465	0.78	-0.5
4,858,889	+		DZA65_RS22465	0.78	-1.5
4,858,889	+		DZA65_RS22465	0.78	-1.9
4,858,889	+		DZA65_RS22465	0.78	-0.1
4,858,889	+		DZA65_RS22465	0.78	-0.9
4,858,890	-		DZA65_RS22465	0.78	-0.4
4,858,890	-		DZA65_RS22465	0.78	+0.7
4,858,890	-				-0.1
4,858,890	-		DZA65_RS22465	0.78	-1.7
4,858,890	-		DZA65_RS22465	0.78	-0.1
4,859,158	+				+0.7
4,859,158	+				+1.2
4,859,159	-				-0.1
4,859,159	-				-0.4
4,859,159	-				+0.2
4,859,159	-				-0.5
4,859,159	-				+0.1
4,859,230	+		DZA65_RS22470	0.19	+0.9
4,859,230	+		DZA65_RS22470	0.19	+0.8
4,859,230	+		DZA65_RS22470	0.19	+1.6
4,859,230	+		DZA65_RS22470	0.19	+0.4
4,859,230	+		DZA65_RS22470	0.19	-0.1
4,859,231	-		DZA65_RS22470	0.20	-0.7
4,859,231	-		DZA65_RS22470	0.20	+1.9
4,859,231	-		DZA65_RS22470	0.20	-0.9
4,859,231	-		DZA65_RS22470	0.20	+0.2
4,859,231	-		DZA65_RS22470	0.20	+0.1
4,859,231	-		DZA65_RS22470	0.20	+0.4
4,859,231	-		DZA65_RS22470	0.20	+0.7
4,859,232	+		DZA65_RS22470	0.20	-0.7
4,859,232	+		DZA65_RS22470	0.20	-0.7
4,859,232	+		DZA65_RS22470	0.20	-0.1
4,859,232	+		DZA65_RS22470	0.20	-0.1
4,859,232	+		DZA65_RS22470	0.20	+0.1
4,859,232	+		DZA65_RS22470	0.20	-0.2
4,859,232	+		DZA65_RS22470	0.20	-0.3
4,859,232	+		DZA65_RS22470	0.20	+0.8
4,859,232	+		DZA65_RS22470	0.20	+0.6
4,859,232	+		DZA65_RS22470	0.20	+1.1
4,859,232	+		DZA65_RS22470	0.20	-0.7
4,859,233	-		DZA65_RS22470	0.20	+0.3
4,859,233	-				+0.9
4,859,458	+				+0.5
4,859,458	+				+0.1
4,859,458	+				+2.1
4,859,459	-				-0.6
4,859,466	+				+1.5
4,859,466	+				+0.7
4,859,467	-				-0.7
4,859,467	-				+1.8
4,859,467	-				+1.2
4,859,467	-				+0.7
4,859,467	-				-0.7
4,859,467	-				+0.1
4,859,467	-				+0.3
4,859,467	-				+2.0
4,859,467	-				-0.3
4,859,467	-				-0.1
4,859,467	-				+0.1
4,859,509	-				+1.0
4,859,522	+				-0.1
4,859,522	+				-1.1
4,859,522	+				+0.0
4,859,522	+				+0.3
4,859,522	+				-0.2
4,859,522	+				-1.6
4,859,522	+				-0.4
4,859,522	+				-0.2
4,859,522	+				+0.2
4,859,522	+				+0.4
4,859,522	+				-1.4
4,859,522	+				-0.4
4,859,522	+				+0.6
4,859,522	+				-1.0
4,859,522	+				+0.4
4,859,522	+				-1.5
4,859,523	-				+0.1
4,859,523	-				+1.2
4,859,523	-				-0.2
4,859,523	-				+0.3
4,859,523	-				-0.4
4,859,523	-				-0.0
4,859,523	-				+0.1
4,859,523	-				-0.6
4,859,523	-				-0.3
4,859,523	-				-0.7
4,859,523	-				-0.3
4,859,526	+				-0.8
4,859,527	-				-1.7
4,859,527	-				+1.0
4,859,527	-				-0.7
4,859,540	+				-0.4
4,859,540	+				-0.5
4,859,540	+				-0.3
4,859,540	+				+1.2
4,859,540	+				-1.0
4,859,540	+				-0.2
4,859,540	+				-0.5
4,859,540	+				-1.4
4,859,540	+				-0.2
4,859,540	+				+0.3
4,859,541	-				-0.2
4,859,541	-				-0.1
4,859,541	-				+0.4
4,859,541	-				+0.4
4,859,541	-				+0.4
4,859,541	-				+1.4
4,859,544	+				-2.0
4,859,544	+				-0.1
4,859,544	+				+0.9
4,859,544	+				-0.7
4,859,544	+				-1.5
4,859,545	-				+0.6
4,859,545	-				+0.4
4,859,545	-				-1.6
4,859,545	-				+0.4
4,859,545	-				-0.7
4,859,621	+				-0.4
4,859,621	+				-0.1
4,859,621	+				+0.4
4,859,622	-				-0.3
4,859,622	-				-0.1
4,859,667	+				+0.4
4,859,667	+				+1.4
4,859,667	+				+0.1
4,859,667	+				-0.3
4,859,667	+				-0.4
4,859,667	+				-0.1
4,859,668	-				+1.4
4,859,668	-				-0.6
4,859,734	+				+0.4
4,859,896	+		DZA65_RS22475	0.16	+0.9
4,859,933	+		DZA65_RS22475	0.18	-0.2
4,859,933	+		DZA65_RS22475	0.18	-0.4
4,859,997	+		DZA65_RS22475	0.22	-0.2
4,859,998	-		DZA65_RS22475	0.22	-1.2
4,860,027	+		DZA65_RS22475	0.24	+1.2
4,860,027	+		DZA65_RS22475	0.24	+0.6
4,860,028	-		DZA65_RS22475	0.24	-1.6
4,860,028	-		DZA65_RS22475	0.24	-0.1
4,860,028	-		DZA65_RS22475	0.24	+0.9
4,860,036	+		DZA65_RS22475	0.24	-0.4
4,860,036	+		DZA65_RS22475	0.24	+0.5
4,860,036	+		DZA65_RS22475	0.24	-0.4
4,860,036	+		DZA65_RS22475	0.24	-0.3
4,860,036	+		DZA65_RS22475	0.24	+0.7
4,860,036	+		DZA65_RS22475	0.24	+0.1
4,860,036	+		DZA65_RS22475	0.24	+1.8
4,860,036	+		DZA65_RS22475	0.24	-0.6
4,860,037	-		DZA65_RS22475	0.24	+0.7
4,860,112	-		DZA65_RS22475	0.29	-0.1
4,860,198	+		DZA65_RS22475	0.34	+0.4
4,860,198	+		DZA65_RS22475	0.34	+0.2
4,860,198	+		DZA65_RS22475	0.34	-0.5
4,860,199	-		DZA65_RS22475	0.34	-0.1
4,860,199	-		DZA65_RS22475	0.34	+0.7
4,860,199	-		DZA65_RS22475	0.34	+1.1
4,860,199	-		DZA65_RS22475	0.34	+0.6
4,860,226	+		DZA65_RS22475	0.35	-0.6
4,860,226	+		DZA65_RS22475	0.35	-1.1
4,860,226	+		DZA65_RS22475	0.35	-1.0
4,860,226	+		DZA65_RS22475	0.35	-0.5
4,860,227	-		DZA65_RS22475	0.35	+1.7
4,860,227	-		DZA65_RS22475	0.35	+0.0
4,860,231	-		DZA65_RS22475	0.36	-0.6
4,860,260	-		DZA65_RS22475	0.37	+0.4
4,860,401	+		DZA65_RS22475	0.46	-0.3
4,860,401	+		DZA65_RS22475	0.46	+0.1
4,860,458	+		DZA65_RS22475	0.49	+0.6