Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS07485

Experiment: LB

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	LB
1,555,123	+		DZA65_RS07480	0.26	+0.8
1,555,123	+		DZA65_RS07480	0.26	-0.6
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-1.3
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-0.1
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-0.2
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-2.0
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	+0.5
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-0.2
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-0.0
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-1.3
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-1.3
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-0.7
1,555,126	+		DZA65_RS07480	0.26	+0.0
1,555,126	+		DZA65_RS07480	0.26	+0.5
1,555,126	+		DZA65_RS07480	0.26	-0.6
1,555,127	-		DZA65_RS07480	0.26	-0.0
1,555,127	-		DZA65_RS07480	0.26	+0.7
1,555,127	-		DZA65_RS07480	0.26	-1.0
1,555,166	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.0
1,555,166	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.7
1,555,166	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.2
1,555,166	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.3
1,555,166	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.6
1,555,166	+		DZA65_RS07480	0.30	+1.3
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	-2.5
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.4
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.5
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.0
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	-1.0
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.3
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.6
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	+1.1
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.2
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	-1.3
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.8
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-1.3
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.6
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.2
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.8
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+1.6
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.6
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.7
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.2
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.1
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.3
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.7
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.0
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+1.0
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.6
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.4
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.1
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.6
1,555,169	-				-0.0
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.4
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.4
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.7
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.1
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.9
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+1.1
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.0
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+1.2
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.1
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.0
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.7
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.0
1,555,169	-				+3.0
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.6
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.1
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-1.0
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.9
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.3
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.2
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.4
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.1
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.1
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.8
1,555,175	+		DZA65_RS07480	0.30	+1.0
1,555,175	+		DZA65_RS07480	0.30	-1.2
1,555,175	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.6
1,555,176	-		DZA65_RS07480	0.31	-1.0
1,555,176	-		DZA65_RS07480	0.31	+0.1
1,555,230	+		DZA65_RS07480	0.35	+1.4
1,555,230	+		DZA65_RS07480	0.35	-0.5
1,555,244	+		DZA65_RS07480	0.36	-1.0
1,555,245	-		DZA65_RS07480	0.36	-1.2
1,555,284	+		DZA65_RS07480	0.40	+0.3
1,555,284	+		DZA65_RS07480	0.40	+0.5
1,555,284	+		DZA65_RS07480	0.40	-0.5
1,555,284	+		DZA65_RS07480	0.40	+0.1
1,555,285	-		DZA65_RS07480	0.40	+2.0
1,555,334	+		DZA65_RS07480	0.44	-0.6
1,555,334	+		DZA65_RS07480	0.44	-1.0
1,555,334	+		DZA65_RS07480	0.44	-0.6
1,555,334	+		DZA65_RS07480	0.44	-0.0
1,555,334	+		DZA65_RS07480	0.44	-1.6
1,555,334	+		DZA65_RS07480	0.44	-1.5
1,555,401	+		DZA65_RS07480	0.50	-0.3
1,555,401	+		DZA65_RS07480	0.50	+0.1
1,555,401	+		DZA65_RS07480	0.50	+0.4
1,555,401	+		DZA65_RS07480	0.50	+1.2
1,555,402	-		DZA65_RS07480	0.50	+1.0
1,555,402	-		DZA65_RS07480	0.50	+0.6
1,555,402	-		DZA65_RS07480	0.50	+0.7
1,555,402	-		DZA65_RS07480	0.50	+0.3
1,555,402	-		DZA65_RS07480	0.50	-0.5
1,555,402	-		DZA65_RS07480	0.50	-0.9
1,555,402	-		DZA65_RS07480	0.50	+1.5
1,555,415	+		DZA65_RS07480	0.51	-0.8
1,555,416	-		DZA65_RS07480	0.51	-0.2
1,555,430	+		DZA65_RS07480	0.52	-0.4
1,555,430	+		DZA65_RS07480	0.52	-0.1
1,555,430	+		DZA65_RS07480	0.52	-2.3
1,555,430	+		DZA65_RS07480	0.52	-0.7
1,555,433	-		DZA65_RS07480	0.52	+1.0
1,555,455	+		DZA65_RS07480	0.54	-0.8
1,555,528	-		DZA65_RS07480	0.60	+0.3
1,555,553	-		DZA65_RS07480	0.62	+0.6
1,555,567	+		DZA65_RS07480	0.64	-0.5
1,555,589	+		DZA65_RS07480	0.65	-0.1
1,555,590	-		DZA65_RS07480	0.66	-0.2
1,555,617	-		DZA65_RS07480	0.68	-0.1
1,555,617	-		DZA65_RS07480	0.68	-0.6
1,555,617	-		DZA65_RS07480	0.68	+0.6
1,555,617	-		DZA65_RS07480	0.68	-0.0
1,555,626	+		DZA65_RS07480	0.69	-0.1
1,555,626	+		DZA65_RS07480	0.69	-0.7
1,555,626	+		DZA65_RS07480	0.69	-0.5
1,555,626	+		DZA65_RS07480	0.69	+0.7
1,555,712	-		DZA65_RS07480	0.76	+0.2
1,555,719	+		DZA65_RS07480	0.76	-0.5
1,555,720	-		DZA65_RS07480	0.77	+0.0
1,555,797	+		DZA65_RS07480	0.83	+0.6
1,555,797	+		DZA65_RS07480	0.83	+0.0
1,555,797	+		DZA65_RS07480	0.83	-0.4
1,555,798	-		DZA65_RS07480	0.83	-0.4
1,555,798	-		DZA65_RS07480	0.83	-0.8
1,555,798	-		DZA65_RS07480	0.83	+0.5
1,555,798	-		DZA65_RS07480	0.83	-0.5
1,555,798	-		DZA65_RS07480	0.83	+0.2
1,555,799	+		DZA65_RS07480	0.83	-0.0
1,555,799	+		DZA65_RS07480	0.83	-1.3
1,555,799	+		DZA65_RS07480	0.83	-2.0
1,555,799	+		DZA65_RS07480	0.83	-1.3
1,555,799	+		DZA65_RS07480	0.83	+0.4
1,555,800	-		DZA65_RS07480	0.83	-0.4
1,555,800	-		DZA65_RS07480	0.83	-0.3
1,555,800	-		DZA65_RS07480	0.83	-0.6
1,555,862	+		DZA65_RS07480	0.89	-0.5
1,555,862	+		DZA65_RS07480	0.89	-1.2
1,555,862	+		DZA65_RS07480	0.89	-0.0
1,555,862	+		DZA65_RS07480	0.89	-0.2
1,555,863	-		DZA65_RS07480	0.89	-0.5
1,555,863	-		DZA65_RS07480	0.89	-0.4
1,555,863	-		DZA65_RS07480	0.89	+1.2
1,555,863	-		DZA65_RS07480	0.89	-0.6
1,555,863	-		DZA65_RS07480	0.89	+0.6
1,555,866	+		DZA65_RS07480	0.89	-0.6
1,555,866	+		DZA65_RS07480	0.89	+0.2
1,555,866	+		DZA65_RS07480	0.89	+1.0
1,555,866	+		DZA65_RS07480	0.89	-0.4
1,555,866	+		DZA65_RS07480	0.89	+0.2
1,555,867	-		DZA65_RS07480	0.89	+0.8
1,555,908	-				-2.0
1,555,936	+				+0.0
1,555,937	-				+0.1
1,556,020	-				+1.0
1,556,089	+				+0.2
1,556,089	+				+1.3
1,556,148	+		DZA65_RS07485	0.16	+0.9
1,556,149	-		DZA65_RS07485	0.16	-1.2
1,556,149	-		DZA65_RS07485	0.16	+0.4
1,556,233	+		DZA65_RS07485	0.27	-1.1
1,556,234	-		DZA65_RS07485	0.27	+2.0
1,556,234	-		DZA65_RS07485	0.27	-0.3
1,556,395	+		DZA65_RS07485	0.46	+0.7
1,556,395	+		DZA65_RS07485	0.46	-0.1
1,556,395	+		DZA65_RS07485	0.46	-0.0
1,556,396	-		DZA65_RS07485	0.46	-0.2
1,556,424	+		DZA65_RS07485	0.49	+2.4
1,556,425	-		DZA65_RS07485	0.49	+0.2
1,556,436	+		DZA65_RS07485	0.51	-0.3
1,556,436	+		DZA65_RS07485	0.51	+1.2
1,556,436	+		DZA65_RS07485	0.51	-1.2
1,556,436	+		DZA65_RS07485	0.51	+0.2
1,556,436	+		DZA65_RS07485	0.51	+0.7
1,556,436	+		DZA65_RS07485	0.51	+1.4
1,556,436	+		DZA65_RS07485	0.51	+1.0
1,556,436	+		DZA65_RS07485	0.51	+0.2
1,556,437	-		DZA65_RS07485	0.51	+0.6
1,556,437	-		DZA65_RS07485	0.51	+0.3
1,556,437	-		DZA65_RS07485	0.51	-1.4
1,556,437	-		DZA65_RS07485	0.51	-0.3
1,556,437	-		DZA65_RS07485	0.51	-0.1
1,556,437	-		DZA65_RS07485	0.51	-0.8
1,556,437	-		DZA65_RS07485	0.51	+0.1
1,556,450	+		DZA65_RS07485	0.52	+0.3
1,556,476	-		DZA65_RS07485	0.56	-0.4
1,556,476	-		DZA65_RS07485	0.56	+0.2
1,556,488	+		DZA65_RS07485	0.57	-0.2
1,556,489	-				+1.2
1,556,489	-		DZA65_RS07485	0.57	-0.8
1,556,489	-		DZA65_RS07485	0.57	-0.4
1,556,489	-		DZA65_RS07485	0.57	-0.5
1,556,489	-		DZA65_RS07485	0.57	+0.4
1,556,527	-		DZA65_RS07485	0.62	-0.0
1,556,542	+				+1.0
1,556,557	+		DZA65_RS07485	0.65	-2.0
1,556,655	-		DZA65_RS07485	0.77	+0.5
1,556,655	-		DZA65_RS07485	0.77	-0.8
1,556,655	-		DZA65_RS07485	0.77	-0.6
1,556,719	+		DZA65_RS07485	0.85	+1.0
1,556,719	+		DZA65_RS07485	0.85	+0.6
1,556,720	-		DZA65_RS07485	0.85	+0.3
1,556,755	+		DZA65_RS07485	0.89	+1.7
1,556,755	+		DZA65_RS07485	0.89	-2.2
1,556,756	-		DZA65_RS07485	0.89	-1.7
1,556,756	-		DZA65_RS07485	0.89	+0.1
1,556,764	+				+1.0
1,556,767	+				-0.2
1,556,768	-				+0.3
1,556,808	+				-0.4
1,556,809	-				-0.6
1,556,809	-				-0.7
1,556,809	-				+0.2
1,556,809	-				+1.0
1,556,809	-				-0.6
1,556,823	+				+0.6
1,556,823	+				+0.3
1,556,824	-				-0.5
1,556,824	-				+0.7
1,556,824	-				-0.6
1,556,845	+				-0.2
1,556,846	-				+0.4
1,556,846	-				-0.9
1,556,846	-				-0.8
1,556,859	+				-0.7
1,556,860	-				-0.3
1,556,877	+				+0.8
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