Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS11495

Experiment: LB

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	LB
2,452,488	-				+0.7
2,452,565	+				-0.5
2,452,570	+				-0.3
2,452,608	-				+0.7
2,452,671	+				-1.1
2,452,672	-				+1.0
2,452,679	+				-0.1
2,452,679	+				-0.2
2,452,679	+				+0.7
2,452,745	+				-0.2
2,452,746	-				-1.5
2,452,830	-		DZA65_RS11490	0.16	-0.0
2,452,869	+		DZA65_RS11490	0.25	+0.1
2,452,869	+		DZA65_RS11490	0.25	-0.0
2,452,907	+		DZA65_RS11490	0.33	-1.0
2,452,907	+		DZA65_RS11490	0.33	+0.7
2,452,908	-		DZA65_RS11490	0.34	-0.1
2,452,976	+		DZA65_RS11490	0.49	-0.0
2,452,976	+		DZA65_RS11490	0.49	+0.1
2,452,976	+		DZA65_RS11490	0.49	-0.2
2,452,977	-		DZA65_RS11490	0.49	-0.0
2,453,139	+		DZA65_RS11490	0.87	-0.0
2,453,139	+		DZA65_RS11490	0.87	+1.3
2,453,139	+		DZA65_RS11490	0.87	-0.8
2,453,405	+				-1.3
2,453,415	+				+0.4
2,453,416	-				+0.4
2,453,416	-				+0.2
2,453,416	-				-0.2
2,453,416	-				-0.7
2,453,416	-				-0.2
2,453,455	-				-0.9
2,453,532	+				-1.6
2,453,532	+				-0.3
2,453,532	+				+0.4
2,453,532	+				-0.4
2,453,532	+				-0.8
2,453,533	-				-2.0
2,453,533	-				+0.4
2,453,730	+				+0.1
2,453,730	+				-1.3
2,453,730	+				-0.9
2,453,731	-				-1.2
2,453,791	-		DZA65_RS11495	0.10	-0.0
2,453,823	-		DZA65_RS11495	0.11	-0.8
2,453,834	+		DZA65_RS11495	0.11	-0.1
2,453,835	-		DZA65_RS11495	0.11	-0.3
2,453,835	-		DZA65_RS11495	0.11	-0.8
2,453,918	+		DZA65_RS11495	0.13	-0.3
2,454,111	+		DZA65_RS11495	0.17	+0.7
2,454,111	+		DZA65_RS11495	0.17	+0.4
2,454,111	+		DZA65_RS11495	0.17	-0.5
2,454,112	-		DZA65_RS11495	0.17	+0.2
2,454,112	-		DZA65_RS11495	0.17	-0.8
2,454,112	-		DZA65_RS11495	0.17	+1.6
2,454,204	+		DZA65_RS11495	0.19	+1.0
2,454,204	+		DZA65_RS11495	0.19	+2.0
2,454,204	+		DZA65_RS11495	0.19	-1.3
2,454,204	+		DZA65_RS11495	0.19	-0.7
2,454,204	+		DZA65_RS11495	0.19	-1.0
2,454,204	+		DZA65_RS11495	0.19	+0.3
2,454,205	-		DZA65_RS11495	0.19	+0.7
2,454,205	-		DZA65_RS11495	0.19	+0.2
2,454,205	-		DZA65_RS11495	0.19	-0.7
2,454,207	+		DZA65_RS11495	0.19	-0.0
2,454,207	+		DZA65_RS11495	0.19	-0.3
2,454,207	+		DZA65_RS11495	0.19	+0.4
2,454,207	+				+1.0
2,454,207	+		DZA65_RS11495	0.19	-0.6
2,454,207	+		DZA65_RS11495	0.19	+0.8
2,454,208	-		DZA65_RS11495	0.19	+0.8
2,454,208	-		DZA65_RS11495	0.19	-0.8
2,454,210	+		DZA65_RS11495	0.19	-0.8
2,454,210	+		DZA65_RS11495	0.19	-0.1
2,454,211	-		DZA65_RS11495	0.19	-1.3
2,454,211	-		DZA65_RS11495	0.19	-1.6
2,454,271	-		DZA65_RS11495	0.20	+1.3
2,454,478	-		DZA65_RS11495	0.24	-0.6
2,454,616	+		DZA65_RS11495	0.27	-0.1
2,454,617	-		DZA65_RS11495	0.27	+0.3
2,454,709	-		DZA65_RS11495	0.29	-0.2
2,454,815	+		DZA65_RS11495	0.31	+1.3
2,454,815	+		DZA65_RS11495	0.31	-0.4
2,454,815	+		DZA65_RS11495	0.31	-0.3
2,454,815	+		DZA65_RS11495	0.31	-0.5
2,454,816	-		DZA65_RS11495	0.31	+0.7
2,454,816	-		DZA65_RS11495	0.31	+0.0
2,454,816	-		DZA65_RS11495	0.31	+0.1
2,454,816	-		DZA65_RS11495	0.31	-1.2
2,454,816	-		DZA65_RS11495	0.31	+0.7
2,454,819	+		DZA65_RS11495	0.31	+0.4
2,454,819	+		DZA65_RS11495	0.31	+0.5
2,454,819	+		DZA65_RS11495	0.31	+0.0
2,454,820	-		DZA65_RS11495	0.31	-0.9
2,454,820	-		DZA65_RS11495	0.31	-1.7
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	-0.1
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	-0.4
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	-0.6
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	-0.3
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	+0.2
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	+1.0
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	-0.6
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	+0.2
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	+1.6
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	+0.6
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	-0.1
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	-1.6
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	-0.5
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	-0.1
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	+0.3
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	-1.0
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	+0.4
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	-0.4
2,454,899	+		DZA65_RS11495	0.33	-0.4
2,454,900	-		DZA65_RS11495	0.33	+1.2
2,454,900	-		DZA65_RS11495	0.33	+1.1
2,454,900	-		DZA65_RS11495	0.33	-0.6
2,454,900	-		DZA65_RS11495	0.33	-0.6
2,454,900	-		DZA65_RS11495	0.33	+0.4
2,454,900	-		DZA65_RS11495	0.33	+0.6
2,454,900	-		DZA65_RS11495	0.33	-0.3
2,454,900	-		DZA65_RS11495	0.33	+1.0
2,454,900	-		DZA65_RS11495	0.33	+1.5
2,454,900	-		DZA65_RS11495	0.33	-0.6
2,454,900	-		DZA65_RS11495	0.33	+0.3
2,454,900	-		DZA65_RS11495	0.33	-0.2
2,454,923	+		DZA65_RS11495	0.33	-1.3
2,454,923	+		DZA65_RS11495	0.33	+1.2
2,454,923	+		DZA65_RS11495	0.33	-0.4
2,454,923	+		DZA65_RS11495	0.33	-1.4
2,454,923	+		DZA65_RS11495	0.33	-0.2
2,454,923	+		DZA65_RS11495	0.33	+0.1
2,454,923	+		DZA65_RS11495	0.33	-0.5
2,454,923	+		DZA65_RS11495	0.33	-0.6
2,454,923	+		DZA65_RS11495	0.33	+1.0
2,454,924	-		DZA65_RS11495	0.33	-0.5
2,454,924	-		DZA65_RS11495	0.33	+0.4
2,454,924	-		DZA65_RS11495	0.33	-1.7
2,454,924	-		DZA65_RS11495	0.33	-0.3
2,454,924	-		DZA65_RS11495	0.33	-0.8
2,454,924	-		DZA65_RS11495	0.33	+0.0
2,454,924	-		DZA65_RS11495	0.33	-1.1
2,454,928	-		DZA65_RS11495	0.34	-1.3
2,455,003	-		DZA65_RS11495	0.35	-0.3
2,455,072	-		DZA65_RS11495	0.37	-0.1
2,455,091	+		DZA65_RS11495	0.37	-0.7
2,455,091	+		DZA65_RS11495	0.37	-0.7
2,455,160	+		DZA65_RS11495	0.38	-0.1
2,455,160	+		DZA65_RS11495	0.38	-0.1
2,455,161	-		DZA65_RS11495	0.38	-2.3
2,455,368	-		DZA65_RS11495	0.43	+0.3
2,455,375	-		DZA65_RS11495	0.43	+0.0
2,455,491	+		DZA65_RS11495	0.45	+0.3
2,455,492	-		DZA65_RS11495	0.45	+0.5
2,455,492	-		DZA65_RS11495	0.45	+0.3
2,455,779	-		DZA65_RS11495	0.51	-2.0
2,455,779	-		DZA65_RS11495	0.51	+1.0
2,455,807	+		DZA65_RS11495	0.51	+0.2
2,455,807	+		DZA65_RS11495	0.51	-0.6
2,455,807	+		DZA65_RS11495	0.51	-2.0
2,455,807	+		DZA65_RS11495	0.51	+0.4
2,455,807	+		DZA65_RS11495	0.51	-0.4
2,455,807	+		DZA65_RS11495	0.51	-0.6
2,455,807	+		DZA65_RS11495	0.51	+0.3
2,455,807	+		DZA65_RS11495	0.51	+0.7
2,455,808	-		DZA65_RS11495	0.52	-0.5
2,455,808	-		DZA65_RS11495	0.52	+0.5
2,455,808	-		DZA65_RS11495	0.52	+0.3
2,455,808	-		DZA65_RS11495	0.52	-0.9
2,455,808	-		DZA65_RS11495	0.52	-1.3
2,455,808	-		DZA65_RS11495	0.52	-1.0
2,455,809	+		DZA65_RS11495	0.52	-0.6
2,455,809	+		DZA65_RS11495	0.52	-0.5
2,455,809	+		DZA65_RS11495	0.52	+0.3
2,455,809	+		DZA65_RS11495	0.52	-0.2
2,455,809	+		DZA65_RS11495	0.52	-0.6
2,455,809	+		DZA65_RS11495	0.52	+0.8
2,455,809	+		DZA65_RS11495	0.52	-1.0
2,455,810	-		DZA65_RS11495	0.52	-0.1
2,455,810	-		DZA65_RS11495	0.52	+0.2
2,455,810	-		DZA65_RS11495	0.52	+0.5
2,455,810	-		DZA65_RS11495	0.52	+0.3
2,455,868	+		DZA65_RS11495	0.53	+0.0
2,455,868	+		DZA65_RS11495	0.53	-0.1
2,455,868	+		DZA65_RS11495	0.53	-2.0
2,455,869	-		DZA65_RS11495	0.53	-0.4
2,455,869	-		DZA65_RS11495	0.53	+0.3
2,455,869	-		DZA65_RS11495	0.53	-0.2
2,455,869	-		DZA65_RS11495	0.53	-1.6
2,455,869	-		DZA65_RS11495	0.53	-0.1
2,455,869	-		DZA65_RS11495	0.53	+1.0
2,455,880	+		DZA65_RS11495	0.53	+0.2
2,455,880	+		DZA65_RS11495	0.53	-1.5
2,455,893	+		DZA65_RS11495	0.53	-1.7
2,455,894	-		DZA65_RS11495	0.53	-0.1
2,455,894	-		DZA65_RS11495	0.53	-0.3
2,455,894	-		DZA65_RS11495	0.53	-0.8
2,456,009	+		DZA65_RS11495	0.56	-0.2
2,456,009	+		DZA65_RS11495	0.56	+0.7
2,456,009	+		DZA65_RS11495	0.56	+0.6
2,456,009	+		DZA65_RS11495	0.56	-0.6
2,456,009	+		DZA65_RS11495	0.56	+0.5
2,456,009	+				+0.4
2,456,009	+		DZA65_RS11495	0.56	+0.7
2,456,010	-		DZA65_RS11495	0.56	-1.5
2,456,010	-		DZA65_RS11495	0.56	+0.5
2,456,010	-		DZA65_RS11495	0.56	+0.0
2,456,010	-				+1.0
2,456,010	-		DZA65_RS11495	0.56	-2.0
2,456,010	-		DZA65_RS11495	0.56	+0.2
2,456,010	-		DZA65_RS11495	0.56	+0.7
2,456,010	-		DZA65_RS11495	0.56	+0.1
2,456,249	-				+0.0
2,456,451	+		DZA65_RS11495	0.65	+0.7
2,456,535	+		DZA65_RS11495	0.66	+1.6
2,456,535	+		DZA65_RS11495	0.66	+0.0
2,456,536	-		DZA65_RS11495	0.66	-2.0
2,456,536	-		DZA65_RS11495	0.66	-0.2
2,456,606	+		DZA65_RS11495	0.68	-0.4
2,456,606	+		DZA65_RS11495	0.68	-0.2
2,456,606	+		DZA65_RS11495	0.68	-0.9
2,456,606	+		DZA65_RS11495	0.68	+1.0
2,456,606	+				+1.0
2,456,606	+		DZA65_RS11495	0.68	+0.3
2,456,606	+		DZA65_RS11495	0.68	+1.0
2,456,606	+		DZA65_RS11495	0.68	+0.7
2,456,606	+		DZA65_RS11495	0.68	+0.9
2,456,606	+		DZA65_RS11495	0.68	+0.1
2,456,607	-		DZA65_RS11495	0.68	-0.1
2,456,607	-		DZA65_RS11495	0.68	-0.6
2,456,673	+		DZA65_RS11495	0.69	+1.0
2,456,674	-		DZA65_RS11495	0.69	-1.0
2,456,688	-		DZA65_RS11495	0.69	+0.5
2,456,911	-		DZA65_RS11495	0.74	-1.2
2,456,988	-		DZA65_RS11495	0.76	-0.3
2,457,135	+		DZA65_RS11495	0.79	-1.6
2,457,318	+		DZA65_RS11495	0.82	+0.0
2,457,319	-		DZA65_RS11495	0.82	-0.6
2,457,347	+		DZA65_RS11495	0.83	-0.3
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