Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS18585

Experiment: Norland

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Norland
4,003,771	+		DZA65_RS18575	0.83	-0.7
4,003,771	+		DZA65_RS18575	0.83	-0.0
4,003,843	-				-0.3
4,003,843	-				+0.1
4,003,934	+				+1.0
4,003,934	+				+0.4
4,003,935	-				-0.2
4,003,935	-				-2.3
4,004,058	+		DZA65_RS18580	0.18	-0.3
4,004,058	+		DZA65_RS18580	0.18	+0.2
4,004,058	+		DZA65_RS18580	0.18	-0.9
4,004,058	+		DZA65_RS18580	0.18	-1.4
4,004,058	+		DZA65_RS18580	0.18	+0.5
4,004,058	+		DZA65_RS18580	0.18	+0.7
4,004,058	+		DZA65_RS18580	0.18	+0.8
4,004,058	+		DZA65_RS18580	0.18	-2.8
4,004,058	+		DZA65_RS18580	0.18	-0.1
4,004,058	+		DZA65_RS18580	0.18	-1.3
4,004,059	-		DZA65_RS18580	0.18	-0.6
4,004,059	-		DZA65_RS18580	0.18	-0.0
4,004,059	-		DZA65_RS18580	0.18	+1.2
4,004,059	-		DZA65_RS18580	0.18	+0.3
4,004,059	-		DZA65_RS18580	0.18	+0.2
4,004,059	-		DZA65_RS18580	0.18	+0.1
4,004,059	-		DZA65_RS18580	0.18	-0.5
4,004,132	+		DZA65_RS18580	0.27	-1.2
4,004,184	+		DZA65_RS18580	0.34	-0.3
4,004,197	+		DZA65_RS18580	0.35	-0.4
4,004,197	+		DZA65_RS18580	0.35	-0.6
4,004,197	+		DZA65_RS18580	0.35	-1.3
4,004,197	+		DZA65_RS18580	0.35	+1.3
4,004,198	-		DZA65_RS18580	0.35	+0.8
4,004,198	-		DZA65_RS18580	0.35	-0.2
4,004,198	-		DZA65_RS18580	0.35	+1.1
4,004,198	-		DZA65_RS18580	0.35	-0.7
4,004,198	-		DZA65_RS18580	0.35	+0.8
4,004,215	-		DZA65_RS18580	0.37	-1.2
4,004,355	+		DZA65_RS18580	0.54	+0.7
4,004,355	+		DZA65_RS18580	0.54	-0.5
4,004,355	+		DZA65_RS18580	0.54	-0.1
4,004,355	+		DZA65_RS18580	0.54	-0.3
4,004,355	+		DZA65_RS18580	0.54	-0.9
4,004,356	-		DZA65_RS18580	0.54	+1.8
4,004,396	-		DZA65_RS18580	0.59	+0.5
4,004,396	-		DZA65_RS18580	0.59	+1.3
4,004,433	+		DZA65_RS18580	0.64	-0.9
4,004,433	+		DZA65_RS18580	0.64	-0.5
4,004,433	+		DZA65_RS18580	0.64	+0.7
4,004,434	-		DZA65_RS18580	0.64	-0.2
4,004,434	-		DZA65_RS18580	0.64	-0.6
4,004,434	-		DZA65_RS18580	0.64	-0.2
4,004,434	-		DZA65_RS18580	0.64	+0.7
4,004,434	-		DZA65_RS18580	0.64	-0.4
4,004,434	-		DZA65_RS18580	0.64	+1.1
4,004,434	-		DZA65_RS18580	0.64	-1.3
4,004,454	+		DZA65_RS18580	0.66	-0.3
4,004,455	-		DZA65_RS18580	0.66	-1.3
4,004,493	+		DZA65_RS18580	0.71	+1.2
4,004,543	-		DZA65_RS18580	0.77	+1.0
4,004,545	+		DZA65_RS18580	0.77	+4.0
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	-1.7
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	-0.5
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	+0.0
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	+0.1
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	-0.1
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	+0.7
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	-0.9
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	-0.5
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	-2.2
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	+0.3
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	-0.0
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	+1.8
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	-0.6
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	+1.5
4,004,586	+		DZA65_RS18580	0.82	-0.3
4,004,587	-		DZA65_RS18580	0.82	-0.5
4,004,587	-		DZA65_RS18580	0.82	+0.5
4,004,587	-		DZA65_RS18580	0.82	+0.3
4,004,587	-		DZA65_RS18580	0.82	-0.0
4,004,587	-		DZA65_RS18580	0.82	-1.2
4,004,587	-		DZA65_RS18580	0.82	-0.3
4,004,587	-		DZA65_RS18580	0.82	+1.4
4,004,587	-		DZA65_RS18580	0.82	+0.1
4,004,587	-		DZA65_RS18580	0.82	-1.3
4,004,587	-		DZA65_RS18580	0.82	+0.5
4,004,587	-		DZA65_RS18580	0.82	-0.9
4,004,587	-		DZA65_RS18580	0.82	+0.0
4,004,854	+				-1.7
4,004,854	+				+1.8
4,004,854	+				-0.3
4,004,854	+				+0.1
4,004,854	+				-1.5
4,004,855	-				-0.4
4,004,855	-				+2.7
4,004,855	-				+1.5
4,004,855	-				+0.7
4,004,856	+				-0.8
4,004,857	-				-0.5
4,004,857	-				+0.0
4,004,857	-				-0.9
4,004,931	+		DZA65_RS18585	0.17	+0.7
4,004,973	+		DZA65_RS18585	0.21	+0.2
4,004,973	+		DZA65_RS18585	0.21	+0.5
4,004,973	+		DZA65_RS18585	0.21	-0.7
4,004,973	+		DZA65_RS18585	0.21	+0.1
4,004,973	+		DZA65_RS18585	0.21	+0.1
4,004,973	+		DZA65_RS18585	0.21	-0.7
4,004,973	+		DZA65_RS18585	0.21	+0.7
4,004,973	+		DZA65_RS18585	0.21	-0.1
4,004,973	+		DZA65_RS18585	0.21	-1.2
4,004,973	+		DZA65_RS18585	0.21	-2.5
4,004,973	+		DZA65_RS18585	0.21	+1.4
4,004,974	-		DZA65_RS18585	0.21	+0.1
4,004,974	-		DZA65_RS18585	0.21	+0.1
4,004,974	-		DZA65_RS18585	0.21	+0.1
4,004,974	-		DZA65_RS18585	0.21	-0.2
4,005,012	+		DZA65_RS18585	0.25	-1.7
4,005,012	+		DZA65_RS18585	0.25	-0.9
4,005,012	+		DZA65_RS18585	0.25	-0.6
4,005,013	-		DZA65_RS18585	0.25	-0.9
4,005,068	+		DZA65_RS18585	0.30	-1.3
4,005,068	+		DZA65_RS18585	0.30	-0.9
4,005,068	+		DZA65_RS18585	0.30	+0.3
4,005,103	-		DZA65_RS18585	0.33	-0.1
4,005,103	-		DZA65_RS18585	0.33	+0.5
4,005,327	+		DZA65_RS18585	0.55	-0.6
4,005,327	+		DZA65_RS18585	0.55	+0.4
4,005,327	+		DZA65_RS18585	0.55	-1.3
4,005,327	+		DZA65_RS18585	0.55	+0.2
4,005,327	+		DZA65_RS18585	0.55	-0.1
4,005,327	+		DZA65_RS18585	0.55	-0.3
4,005,328	-		DZA65_RS18585	0.55	-0.7
4,005,328	-		DZA65_RS18585	0.55	+0.2
4,005,328	-		DZA65_RS18585	0.55	+0.4
4,005,328	-		DZA65_RS18585	0.55	+1.1
4,005,328	-		DZA65_RS18585	0.55	-1.7
4,005,328	-		DZA65_RS18585	0.55	+0.7
4,005,328	-		DZA65_RS18585	0.55	-0.9
4,005,328	-		DZA65_RS18585	0.55	+0.5
4,005,328	-		DZA65_RS18585	0.55	+0.7
4,005,328	-		DZA65_RS18585	0.55	+1.4
4,005,328	-		DZA65_RS18585	0.55	+0.3
4,005,328	-		DZA65_RS18585	0.55	+0.5
4,005,328	-		DZA65_RS18585	0.55	-0.3
4,005,328	-		DZA65_RS18585	0.55	+0.7
4,005,371	+		DZA65_RS18585	0.59	-0.2
4,005,371	+		DZA65_RS18585	0.59	+0.3
4,005,371	+		DZA65_RS18585	0.59	+0.7
4,005,372	-		DZA65_RS18585	0.59	-1.1
4,005,372	-		DZA65_RS18585	0.59	-0.8
4,005,372	-		DZA65_RS18585	0.59	-0.2
4,005,372	-		DZA65_RS18585	0.59	+0.7
4,005,372	-		DZA65_RS18585	0.59	+0.6
4,005,383	-		DZA65_RS18585	0.60	-0.1
4,005,391	+		DZA65_RS18585	0.61	-0.1
4,005,411	+		DZA65_RS18585	0.62	-0.0
4,005,411	+		DZA65_RS18585	0.62	-0.8
4,005,411	+		DZA65_RS18585	0.62	-0.2
4,005,411	+		DZA65_RS18585	0.62	-1.0
4,005,412	-		DZA65_RS18585	0.63	-0.1
4,005,412	-		DZA65_RS18585	0.63	-0.2
4,005,412	-		DZA65_RS18585	0.63	+0.2
4,005,412	-		DZA65_RS18585	0.63	+0.7
4,005,412	-		DZA65_RS18585	0.63	-0.3
4,005,480	+		DZA65_RS18585	0.69	+0.5
4,005,480	+		DZA65_RS18585	0.69	-0.0
4,005,480	+		DZA65_RS18585	0.69	-0.6
4,005,480	+		DZA65_RS18585	0.69	+1.0
4,005,481	-		DZA65_RS18585	0.69	+1.7
4,005,481	-		DZA65_RS18585	0.69	+0.7
4,005,481	-		DZA65_RS18585	0.69	-1.3
4,005,481	-		DZA65_RS18585	0.69	+1.7
4,005,627	+		DZA65_RS18585	0.83	-1.7
4,005,627	+		DZA65_RS18585	0.83	+0.9
4,005,627	+		DZA65_RS18585	0.83	-0.6
4,005,628	-		DZA65_RS18585	0.83	+0.8
4,005,628	-		DZA65_RS18585	0.83	+1.9
4,005,628	-		DZA65_RS18585	0.83	+0.7
4,005,628	-		DZA65_RS18585	0.83	-0.3
4,005,628	-		DZA65_RS18585	0.83	-2.3
4,005,653	-		DZA65_RS18585	0.85	+0.5
4,005,653	-		DZA65_RS18585	0.85	-0.3
4,005,653	-		DZA65_RS18585	0.85	+2.7
4,005,653	-		DZA65_RS18585	0.85	+1.0
4,005,653	-		DZA65_RS18585	0.85	-0.3
4,005,653	-		DZA65_RS18585	0.85	-0.2
4,005,653	-		DZA65_RS18585	0.85	-0.2
4,005,673	+		DZA65_RS18585	0.87	+0.1
4,005,673	+		DZA65_RS18585	0.87	+0.7
4,005,683	-				+2.0
4,005,691	+		DZA65_RS18585	0.89	-0.3
4,005,694	+		DZA65_RS18585	0.89	+1.2
4,005,694	+		DZA65_RS18585	0.89	-0.9
4,005,694	+		DZA65_RS18585	0.89	+2.6
4,005,695	-		DZA65_RS18585	0.89	-0.6
4,005,695	-		DZA65_RS18585	0.89	+1.2
4,005,695	-		DZA65_RS18585	0.89	+0.1
4,005,695	-		DZA65_RS18585	0.89	-1.3
4,005,695	-		DZA65_RS18585	0.89	-0.9
4,005,780	-				+2.7
4,005,809	+				-0.1
4,005,809	+				-0.8
4,005,809	+				+0.3
4,005,809	+				+1.5
4,005,809	+				-0.6
4,005,809	+				-1.7
4,005,809	+				-0.8
4,005,810	-				+0.4
4,005,818	+				-0.5
4,005,818	+				-1.3
4,005,819	-				-1.7
4,005,819	-				+0.7
4,005,819	-				-2.8
4,005,819	-				+1.7
4,005,819	-				+0.1
4,005,819	-				+3.1
4,005,819	-				-1.7
4,005,833	+				-1.6
4,005,833	+				-0.9
4,005,834	-				+0.2
4,005,834	-				+1.1
4,005,834	-				+1.7
4,005,834	-				+0.2
4,005,873	+				-0.8
4,005,873	+				-1.2
4,005,874	-				+1.1
4,005,878	-				-0.9
4,006,022	-				+0.2
4,006,038	+				-0.8
4,006,039	-				+1.2
4,006,039	-				-0.0
4,006,207	+		DZA65_RS18590	0.19	+0.2
4,006,297	+		DZA65_RS18590	0.31	-1.2
4,006,297	+		DZA65_RS18590	0.31	+0.5
4,006,297	+		DZA65_RS18590	0.31	+0.1
4,006,297	+		DZA65_RS18590	0.31	-0.0
4,006,298	-		DZA65_RS18590	0.31	-2.2
4,006,298	-		DZA65_RS18590	0.31	+0.3
4,006,298	-		DZA65_RS18590	0.31	+1.8
4,006,298	-		DZA65_RS18590	0.31	-0.3
4,006,298	-		DZA65_RS18590	0.31	-0.2
4,006,298	-		DZA65_RS18590	0.31	-0.6
4,006,298	-		DZA65_RS18590	0.31	+0.6
4,006,301	+		DZA65_RS18590	0.32	+0.7
4,006,301	+		DZA65_RS18590	0.32	-0.2
4,006,301	+		DZA65_RS18590	0.32	+0.1
4,006,301	+		DZA65_RS18590	0.32	+0.8
4,006,301	+		DZA65_RS18590	0.32	+0.8
4,006,301	+		DZA65_RS18590	0.32	-0.3
4,006,301	+		DZA65_RS18590	0.32	+0.7
4,006,301	+		DZA65_RS18590	0.32	+1.1
4,006,301	+		DZA65_RS18590	0.32	-0.4
4,006,301	+		DZA65_RS18590	0.32	+0.5
4,006,301	+		DZA65_RS18590	0.32	-0.7
4,006,301	+		DZA65_RS18590	0.32	+0.1
4,006,301	+		DZA65_RS18590	0.32	-0.4
4,006,301	+		DZA65_RS18590	0.32	+0.2
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	-0.9
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	+0.7
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	+0.4
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	+0.9
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	+1.3
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	-0.5
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	-2.0
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	+1.1
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	-1.2
4,006,302	-				-0.7
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	+0.7
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	+4.1
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	+0.7
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	-0.4
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	+2.0
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	-1.3
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	-0.3
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	-0.9
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	-2.3
4,006,302	-		DZA65_RS18590	0.32	+0.8
4,006,303	+		DZA65_RS18590	0.32	+0.7
4,006,304	-		DZA65_RS18590	0.32	-0.9
4,006,304	-		DZA65_RS18590	0.32	-0.3
4,006,355	-		DZA65_RS18590	0.40	-1.5
4,006,445	+		DZA65_RS18590	0.52	-2.5
4,006,445	+		DZA65_RS18590	0.52	-0.8
4,006,445	+		DZA65_RS18590	0.52	-0.4
4,006,446	-		DZA65_RS18590	0.52	+0.8
4,006,446	-		DZA65_RS18590	0.52	-1.2
4,006,450	+		DZA65_RS18590	0.53	-0.2
4,006,490	+		DZA65_RS18590	0.59	+0.2
4,006,490	+		DZA65_RS18590	0.59	-0.6
4,006,490	+		DZA65_RS18590	0.59	-0.7
4,006,490	+		DZA65_RS18590	0.59	-0.6
4,006,490	+		DZA65_RS18590	0.59	+0.0
4,006,490	+		DZA65_RS18590	0.59	+1.8
4,006,490	+		DZA65_RS18590	0.59	+1.2
4,006,491	-		DZA65_RS18590	0.59	-0.2
4,006,491	-		DZA65_RS18590	0.59	+0.2
4,006,491	-		DZA65_RS18590	0.59	+2.7
4,006,503	-		DZA65_RS18590	0.61	-2.2
4,006,503	-				+0.1
4,006,537	+		DZA65_RS18590	0.65	-0.3
4,006,580	+		DZA65_RS18590	0.71	-0.8
4,006,580	+		DZA65_RS18590	0.71	-0.5
4,006,580	+		DZA65_RS18590	0.71	+1.4
4,006,581	-		DZA65_RS18590	0.72	-0.6
4,006,581	-		DZA65_RS18590	0.72	+0.2
4,006,585	+		DZA65_RS18590	0.72	+0.7
4,006,586	-		DZA65_RS18590	0.72	-0.1
4,006,609	+		DZA65_RS18590	0.76	-0.1
4,006,609	+		DZA65_RS18590	0.76	+0.5
4,006,609	+		DZA65_RS18590	0.76	+1.7
4,006,609	+		DZA65_RS18590	0.76	-0.4
4,006,610	-		DZA65_RS18590	0.76	-1.7
4,006,733	+				-0.6
4,006,733	+				-0.3
4,006,740	-				+0.7
4,006,749	-				+1.2
4,006,760	+				-0.0
4,006,760	+				-1.9
4,006,760	+				+0.0
4,006,760	+				+0.9
4,006,760	+				+0.1
4,006,760	+				+0.7
4,006,760	+				-0.9
4,006,760	+				+0.1
4,006,760	+				-2.2
4,006,760	+				-0.6
4,006,760	+				-0.6
4,006,761	-				-0.1
4,006,761	-				-1.2
4,006,761	-				-2.5
4,006,761	-				+0.7
4,006,761	-				-0.6
4,006,761	-				-0.3
4,006,761	-				-0.9
4,006,761	-				+1.7
4,006,761	-				+0.2
4,006,761	-				+0.2
4,006,761	-				-0.3
4,006,761	-				-0.8
4,006,770	+				+0.3
4,006,770	+				+0.2
4,006,770	+				-0.5
4,006,770	+				+0.4
4,006,770	+				+0.7
4,006,771	-				-0.7
4,006,771	-				+0.4
4,006,771	-				-0.2