Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS21670

Experiment: Norland

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Norland
4,683,767	+		DZA65_RS21665	0.60	+0.6
4,683,767	+		DZA65_RS21665	0.60	-0.2
4,683,767	+		DZA65_RS21665	0.60	+1.3
4,683,767	+		DZA65_RS21665	0.60	+0.9
4,683,767	+		DZA65_RS21665	0.60	-1.4
4,683,768	-		DZA65_RS21665	0.60	-1.5
4,683,842	+		DZA65_RS21665	0.66	+0.2
4,683,842	+		DZA65_RS21665	0.66	-0.4
4,683,842	+		DZA65_RS21665	0.66	+0.9
4,683,842	+		DZA65_RS21665	0.66	-0.6
4,683,842	+		DZA65_RS21665	0.66	+0.9
4,683,842	+		DZA65_RS21665	0.66	-0.2
4,683,843	-		DZA65_RS21665	0.66	-0.2
4,683,843	-		DZA65_RS21665	0.66	-0.7
4,683,843	-		DZA65_RS21665	0.66	-0.2
4,683,843	-		DZA65_RS21665	0.66	-0.3
4,683,843	-		DZA65_RS21665	0.66	-0.3
4,683,845	+		DZA65_RS21665	0.66	+0.4
4,683,845	+		DZA65_RS21665	0.66	+0.7
4,683,845	+		DZA65_RS21665	0.66	-1.4
4,683,845	+		DZA65_RS21665	0.66	-0.1
4,683,845	+		DZA65_RS21665	0.66	+0.9
4,683,846	-				+1.5
4,683,846	-		DZA65_RS21665	0.66	-0.1
4,683,846	-		DZA65_RS21665	0.66	-0.8
4,683,846	-		DZA65_RS21665	0.66	-2.4
4,683,846	-		DZA65_RS21665	0.66	-1.6
4,683,846	-		DZA65_RS21665	0.66	+0.9
4,683,846	-		DZA65_RS21665	0.66	-1.1
4,683,846	-		DZA65_RS21665	0.66	+0.5
4,683,908	+		DZA65_RS21665	0.71	-0.9
4,683,909	-		DZA65_RS21665	0.71	-0.7
4,683,911	+		DZA65_RS21665	0.71	+0.2
4,683,911	+		DZA65_RS21665	0.71	+0.1
4,683,911	+		DZA65_RS21665	0.71	-0.4
4,683,947	+		DZA65_RS21665	0.73	-0.1
4,683,978	-		DZA65_RS21665	0.76	+0.7
4,683,978	-		DZA65_RS21665	0.76	-0.1
4,683,991	-		DZA65_RS21665	0.77	-0.4
4,684,028	+		DZA65_RS21665	0.80	+0.6
4,684,028	+		DZA65_RS21665	0.80	+1.5
4,684,029	-		DZA65_RS21665	0.80	+0.6
4,684,097	+		DZA65_RS21665	0.85	+1.1
4,684,097	+		DZA65_RS21665	0.85	-2.4
4,684,097	+		DZA65_RS21665	0.85	+0.5
4,684,097	+		DZA65_RS21665	0.85	-0.0
4,684,097	+		DZA65_RS21665	0.85	-1.5
4,684,097	+		DZA65_RS21665	0.85	-0.1
4,684,097	+		DZA65_RS21665	0.85	+0.3
4,684,098	-		DZA65_RS21665	0.85	-0.1
4,684,098	-		DZA65_RS21665	0.85	-0.9
4,684,109	+		DZA65_RS21665	0.86	-0.6
4,684,109	+		DZA65_RS21665	0.86	+0.2
4,684,110	-		DZA65_RS21665	0.86	-2.2
4,684,110	-		DZA65_RS21665	0.86	+0.1
4,684,110	-		DZA65_RS21665	0.86	-0.2
4,684,110	-		DZA65_RS21665	0.86	-0.7
4,684,110	-		DZA65_RS21665	0.86	-0.4
4,684,254	+				+0.7
4,684,254	+				-0.9
4,684,254	+				+0.7
4,684,275	+				-2.4
4,684,275	+				-0.5
4,684,276	-				-2.1
4,684,377	+				-0.3
4,684,377	+				-0.3
4,684,378	-				+0.2
4,684,378	-				+0.9
4,684,378	-				-1.4
4,684,390	+				-1.6
4,684,419	+				-0.3
4,684,419	+				-0.0
4,684,452	+				-0.1
4,684,452	+				-0.8
4,684,452	+				-0.1
4,684,453	-				+0.9
4,684,453	-				+0.1
4,684,453	-				-0.2
4,684,453	-				-1.1
4,684,453	-				+0.2
4,684,517	+				-1.4
4,684,548	+				+0.5
4,684,548	+				-0.9
4,684,549	-				+0.9
4,684,549	-				-0.9
4,684,549	-				-1.5
4,684,549	-				-3.1
4,684,552	-				+1.1
4,684,552	-				-1.5
4,684,552	-				+0.8
4,684,564	+				+1.4
4,684,565	-				-0.8
4,684,573	+				-0.3
4,684,574	-				+1.3
4,684,577	+				+0.6
4,684,577	+				+0.1
4,684,577	+				-0.9
4,684,577	+				+0.3
4,684,577	+				-1.4
4,684,577	+				+1.7
4,684,577	+				+3.1
4,684,578	-				-0.1
4,684,578	-				+0.5
4,684,597	+				+0.9
4,684,683	-				-0.3
4,684,698	+				+0.4
4,684,698	+				+0.7
4,684,698	+				+0.5
4,684,698	+				+0.6
4,684,698	+				+1.7
4,684,699	-				-0.6
4,684,699	-				-0.5
4,684,699	-				+2.7
4,684,699	-				-1.5
4,684,699	-				-0.9
4,684,699	-				+1.2
4,684,699	-				-0.2
4,684,699	-				+0.2
4,684,699	-				-0.4
4,684,699	-				+0.9
4,684,699	-				-0.1
4,684,699	-				-0.9
4,684,702	+				-0.8
4,684,702	+				-0.4
4,684,702	+				+0.7
4,684,702	+				-2.1
4,684,703	-				-1.1
4,684,703	-				-0.6
4,684,703	-				-0.2
4,684,703	-				-0.2
4,684,703	-				-0.7
4,684,703	-				-0.1
4,684,787	-		DZA65_RS21670	0.11	+1.2
4,684,788	+		DZA65_RS21670	0.11	+0.1
4,684,788	+		DZA65_RS21670	0.11	-0.3
4,684,789	-		DZA65_RS21670	0.11	+0.4
4,684,789	-		DZA65_RS21670	0.11	+3.7
4,684,789	-		DZA65_RS21670	0.11	+0.4
4,684,789	-		DZA65_RS21670	0.11	+0.4
4,684,789	-		DZA65_RS21670	0.11	-0.2
4,684,789	-		DZA65_RS21670	0.11	+0.6
4,684,789	-		DZA65_RS21670	0.11	-1.1
4,684,800	+		DZA65_RS21670	0.12	+1.3
4,684,800	+		DZA65_RS21670	0.12	-0.1
4,684,801	-		DZA65_RS21670	0.12	+1.0
4,684,872	+		DZA65_RS21670	0.18	-2.6
4,684,884	-		DZA65_RS21670	0.19	+0.3
4,684,905	-		DZA65_RS21670	0.21	+2.7
4,684,944	+		DZA65_RS21670	0.25	+0.2
4,684,944	+		DZA65_RS21670	0.25	-0.6
4,684,944	+		DZA65_RS21670	0.25	+1.1
4,684,945	-		DZA65_RS21670	0.25	-3.0
4,684,952	+		DZA65_RS21670	0.25	+2.3
4,684,953	-		DZA65_RS21670	0.25	-0.8
4,684,953	-		DZA65_RS21670	0.25	-0.6
4,684,953	-		DZA65_RS21670	0.25	-0.9
4,684,953	-		DZA65_RS21670	0.25	+0.9
4,684,971	+		DZA65_RS21670	0.27	+0.9
4,684,971	+		DZA65_RS21670	0.27	+0.2
4,684,971	+		DZA65_RS21670	0.27	-0.2
4,684,971	+		DZA65_RS21670	0.27	-0.1
4,684,971	+		DZA65_RS21670	0.27	-1.0
4,684,971	+		DZA65_RS21670	0.27	+0.6
4,684,971	+		DZA65_RS21670	0.27	-0.1
4,684,971	+		DZA65_RS21670	0.27	+0.7
4,684,971	+		DZA65_RS21670	0.27	+0.0
4,684,971	+		DZA65_RS21670	0.27	+0.3
4,684,971	+		DZA65_RS21670	0.27	-0.4
4,684,971	+		DZA65_RS21670	0.27	-1.5
4,684,972	-		DZA65_RS21670	0.27	-2.1
4,684,972	-				+1.9
4,684,972	-		DZA65_RS21670	0.27	+0.0
4,684,972	-		DZA65_RS21670	0.27	-1.2
4,684,972	-		DZA65_RS21670	0.27	+1.0
4,684,972	-		DZA65_RS21670	0.27	-0.2
4,684,972	-		DZA65_RS21670	0.27	+0.9
4,684,972	-		DZA65_RS21670	0.27	-0.6
4,684,972	-		DZA65_RS21670	0.27	-1.1
4,684,972	-		DZA65_RS21670	0.27	+2.7
4,684,972	-		DZA65_RS21670	0.27	+0.8
4,684,973	+		DZA65_RS21670	0.27	+0.9
4,684,973	+		DZA65_RS21670	0.27	-0.5
4,684,974	-		DZA65_RS21670	0.27	-1.1
4,684,974	-		DZA65_RS21670	0.27	+0.1
4,684,974	-		DZA65_RS21670	0.27	+0.2
4,684,974	-		DZA65_RS21670	0.27	+0.1
4,684,993	+		DZA65_RS21670	0.29	-0.2
4,684,993	+		DZA65_RS21670	0.29	-1.4
4,684,993	+		DZA65_RS21670	0.29	-0.6
4,684,993	+		DZA65_RS21670	0.29	-1.9
4,684,993	+		DZA65_RS21670	0.29	-0.9
4,684,993	+		DZA65_RS21670	0.29	+0.3
4,684,993	+		DZA65_RS21670	0.29	-0.1
4,684,993	+		DZA65_RS21670	0.29	-0.6
4,684,993	+		DZA65_RS21670	0.29	+0.2
4,684,993	+		DZA65_RS21670	0.29	-0.3
4,684,993	+		DZA65_RS21670	0.29	+1.1
4,684,994	-		DZA65_RS21670	0.29	-0.8
4,684,994	-		DZA65_RS21670	0.29	+0.8
4,684,994	-		DZA65_RS21670	0.29	-0.5
4,684,994	-		DZA65_RS21670	0.29	-1.1
4,684,994	-		DZA65_RS21670	0.29	-0.1
4,684,994	-		DZA65_RS21670	0.29	+0.9
4,684,994	-		DZA65_RS21670	0.29	-2.4
4,684,994	-		DZA65_RS21670	0.29	+0.2
4,684,996	+		DZA65_RS21670	0.29	+0.9
4,684,996	+		DZA65_RS21670	0.29	-2.4
4,684,996	+		DZA65_RS21670	0.29	+0.4
4,684,996	+		DZA65_RS21670	0.29	+0.6
4,684,996	+		DZA65_RS21670	0.29	-0.6
4,684,996	+		DZA65_RS21670	0.29	+0.5
4,684,997	-		DZA65_RS21670	0.29	-2.5
4,684,997	-		DZA65_RS21670	0.29	-0.3
4,685,044	+		DZA65_RS21670	0.33	-0.2
4,685,045	-		DZA65_RS21670	0.33	-0.2
4,685,045	-		DZA65_RS21670	0.33	-0.4
4,685,122	+		DZA65_RS21670	0.40	+0.1
4,685,123	-		DZA65_RS21670	0.40	+1.5
4,685,123	-		DZA65_RS21670	0.40	-2.2
4,685,123	-		DZA65_RS21670	0.40	+1.3
4,685,164	+		DZA65_RS21670	0.43	-0.5
4,685,165	-		DZA65_RS21670	0.43	-1.1
4,685,179	+		DZA65_RS21670	0.44	+0.4
4,685,180	-		DZA65_RS21670	0.45	+0.3
4,685,192	-		DZA65_RS21670	0.46	+1.1
4,685,193	+		DZA65_RS21670	0.46	+0.9
4,685,193	+		DZA65_RS21670	0.46	+0.7
4,685,194	-		DZA65_RS21670	0.46	+0.5
4,685,194	-		DZA65_RS21670	0.46	+0.9
4,685,194	-		DZA65_RS21670	0.46	+0.6
4,685,194	-		DZA65_RS21670	0.46	-1.1
4,685,223	+		DZA65_RS21670	0.48	-0.2
4,685,224	-		DZA65_RS21670	0.48	+0.4
4,685,265	+				+1.9
4,685,265	+		DZA65_RS21670	0.52	+0.3
4,685,265	+		DZA65_RS21670	0.52	+0.2
4,685,265	+		DZA65_RS21670	0.52	+1.9
4,685,266	-		DZA65_RS21670	0.52	+0.1
4,685,266	-		DZA65_RS21670	0.52	+1.1
4,685,266	-		DZA65_RS21670	0.52	+0.2
4,685,273	+		DZA65_RS21670	0.52	-0.1
4,685,273	+		DZA65_RS21670	0.52	+0.5
4,685,273	+		DZA65_RS21670	0.52	-0.1
4,685,274	-		DZA65_RS21670	0.53	+0.5
4,685,274	-		DZA65_RS21670	0.53	-1.2
4,685,323	-		DZA65_RS21670	0.57	-0.1
4,685,396	+		DZA65_RS21670	0.63	+0.4
4,685,396	+		DZA65_RS21670	0.63	-0.6
4,685,396	+		DZA65_RS21670	0.63	+1.0
4,685,397	-		DZA65_RS21670	0.63	-0.4
4,685,397	-		DZA65_RS21670	0.63	-1.4
4,685,426	+		DZA65_RS21670	0.65	+0.9
4,685,434	+		DZA65_RS21670	0.66	-0.6
4,685,434	+		DZA65_RS21670	0.66	+0.9
4,685,434	+		DZA65_RS21670	0.66	-0.6
4,685,453	-		DZA65_RS21670	0.68	+0.9
4,685,453	-		DZA65_RS21670	0.68	+0.6
4,685,461	+		DZA65_RS21670	0.68	-0.3
4,685,461	+		DZA65_RS21670	0.68	+0.8
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