Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS21665

Experiment: Norland

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Norland
4,682,013	+				+0.3
4,682,013	+				-1.9
4,682,013	+				+0.5
4,682,013	+				-0.1
4,682,014	-				+0.3
4,682,014	-				-0.1
4,682,014	-				-0.1
4,682,014	-				-0.6
4,682,014	-				+0.5
4,682,014	-				-1.2
4,682,014	-				-0.1
4,682,014	-				-0.9
4,682,014	-				-0.9
4,682,023	+				+0.1
4,682,023	+				-0.5
4,682,023	+				-0.1
4,682,024	-				+0.9
4,682,024	-				-0.8
4,682,133	+		DZA65_RS21660	0.14	-0.1
4,682,142	+		DZA65_RS21660	0.15	-1.5
4,682,142	+		DZA65_RS21660	0.15	-0.1
4,682,142	+		DZA65_RS21660	0.15	-0.6
4,682,142	+		DZA65_RS21660	0.15	+0.7
4,682,142	+		DZA65_RS21660	0.15	-0.6
4,682,143	-		DZA65_RS21660	0.15	+0.1
4,682,143	-		DZA65_RS21660	0.15	+1.1
4,682,143	-		DZA65_RS21660	0.15	+1.8
4,682,143	-		DZA65_RS21660	0.15	-1.1
4,682,147	+		DZA65_RS21660	0.16	+0.9
4,682,147	+		DZA65_RS21660	0.16	+0.1
4,682,147	+		DZA65_RS21660	0.16	-0.6
4,682,195	+		DZA65_RS21660	0.21	+1.1
4,682,220	+		DZA65_RS21660	0.24	+0.5
4,682,220	+		DZA65_RS21660	0.24	+1.1
4,682,220	+		DZA65_RS21660	0.24	-1.3
4,682,220	+		DZA65_RS21660	0.24	+0.7
4,682,221	-		DZA65_RS21660	0.24	+0.2
4,682,379	+		DZA65_RS21660	0.42	+0.1
4,682,379	+		DZA65_RS21660	0.42	-1.2
4,682,379	+		DZA65_RS21660	0.42	-0.2
4,682,380	-		DZA65_RS21660	0.42	+2.1
4,682,384	+		DZA65_RS21660	0.43	-1.7
4,682,384	+		DZA65_RS21660	0.43	-0.6
4,682,385	-		DZA65_RS21660	0.43	-0.7
4,682,458	-		DZA65_RS21660	0.51	+0.5
4,682,458	-		DZA65_RS21660	0.51	+1.6
4,682,482	+		DZA65_RS21660	0.54	-0.9
4,682,482	+		DZA65_RS21660	0.54	-1.1
4,682,483	-		DZA65_RS21660	0.54	+0.3
4,682,483	-		DZA65_RS21660	0.54	+1.6
4,682,483	-		DZA65_RS21660	0.54	-0.1
4,682,483	-		DZA65_RS21660	0.54	-0.4
4,682,574	+		DZA65_RS21660	0.64	-0.5
4,682,598	+		DZA65_RS21660	0.67	-1.2
4,682,598	+		DZA65_RS21660	0.67	+0.3
4,682,598	+		DZA65_RS21660	0.67	+2.2
4,682,598	+		DZA65_RS21660	0.67	+0.5
4,682,599	-		DZA65_RS21660	0.67	-0.7
4,682,599	-		DZA65_RS21660	0.67	+1.1
4,682,599	-		DZA65_RS21660	0.67	+2.3
4,682,599	-		DZA65_RS21660	0.67	-0.8
4,682,599	-		DZA65_RS21660	0.67	-1.2
4,682,599	-		DZA65_RS21660	0.67	-0.9
4,682,630	+		DZA65_RS21660	0.70	-0.5
4,682,630	+		DZA65_RS21660	0.70	+1.7
4,682,631	-		DZA65_RS21660	0.70	+0.8
4,682,631	-		DZA65_RS21660	0.70	+0.6
4,682,631	-		DZA65_RS21660	0.70	-0.9
4,682,631	-		DZA65_RS21660	0.70	+0.6
4,682,631	-		DZA65_RS21660	0.70	-0.1
4,682,676	+		DZA65_RS21660	0.75	-0.6
4,682,676	+		DZA65_RS21660	0.75	-0.1
4,682,676	+		DZA65_RS21660	0.75	+0.1
4,682,677	-		DZA65_RS21660	0.76	+0.1
4,682,677	-		DZA65_RS21660	0.76	+0.3
4,682,677	-		DZA65_RS21660	0.76	+1.1
4,682,692	-		DZA65_RS21660	0.77	-0.8
4,682,692	-		DZA65_RS21660	0.77	+1.7
4,682,692	-		DZA65_RS21660	0.77	+0.5
4,682,694	+		DZA65_RS21660	0.77	+1.1
4,682,694	+		DZA65_RS21660	0.77	-1.7
4,682,694	+		DZA65_RS21660	0.77	+1.1
4,682,694	+		DZA65_RS21660	0.77	-0.1
4,682,694	+		DZA65_RS21660	0.77	-0.5
4,682,694	+		DZA65_RS21660	0.77	-1.3
4,682,694	+		DZA65_RS21660	0.77	+0.5
4,682,694	+		DZA65_RS21660	0.77	+0.5
4,682,694	+		DZA65_RS21660	0.77	+0.1
4,682,694	+		DZA65_RS21660	0.77	-0.1
4,682,694	+		DZA65_RS21660	0.77	-0.9
4,682,694	+		DZA65_RS21660	0.77	-1.2
4,682,694	+		DZA65_RS21660	0.77	-1.9
4,682,694	+		DZA65_RS21660	0.77	-1.1
4,682,695	-		DZA65_RS21660	0.78	+1.1
4,682,695	-		DZA65_RS21660	0.78	-0.1
4,682,695	-		DZA65_RS21660	0.78	+0.2
4,682,695	-		DZA65_RS21660	0.78	-0.1
4,682,695	-		DZA65_RS21660	0.78	-2.1
4,682,695	-		DZA65_RS21660	0.78	+0.7
4,682,695	-		DZA65_RS21660	0.78	-0.4
4,682,695	-		DZA65_RS21660	0.78	+0.9
4,682,695	-		DZA65_RS21660	0.78	+0.1
4,682,695	-		DZA65_RS21660	0.78	-1.4
4,682,695	-		DZA65_RS21660	0.78	-0.7
4,682,762	+		DZA65_RS21660	0.85	-0.1
4,682,763	-		DZA65_RS21660	0.85	-0.9
4,682,850	+				-2.6
4,682,851	-				-1.7
4,682,851	-				+0.7
4,682,851	-				+1.2
4,682,851	-				+0.5
4,682,858	+				+0.8
4,682,859	-				+0.4
4,682,859	-				-1.3
4,682,978	+				+0.5
4,682,978	+				-0.9
4,682,979	-				-0.3
4,683,203	+		DZA65_RS21665	0.17	-2.4
4,683,204	-		DZA65_RS21665	0.17	+0.1
4,683,231	-		DZA65_RS21665	0.19	+0.4
4,683,255	-		DZA65_RS21665	0.21	+0.7
4,683,294	+		DZA65_RS21665	0.24	-0.1
4,683,295	-		DZA65_RS21665	0.24	-0.7
4,683,327	+		DZA65_RS21665	0.27	-0.1
4,683,329	+		DZA65_RS21665	0.27	-0.3
4,683,329	+		DZA65_RS21665	0.27	-1.2
4,683,329	+		DZA65_RS21665	0.27	+0.4
4,683,329	+		DZA65_RS21665	0.27	-0.2
4,683,329	+		DZA65_RS21665	0.27	+0.1
4,683,329	+		DZA65_RS21665	0.27	+0.3
4,683,329	+		DZA65_RS21665	0.27	-1.9
4,683,329	+		DZA65_RS21665	0.27	+1.1
4,683,329	+		DZA65_RS21665	0.27	+0.1
4,683,329	+		DZA65_RS21665	0.27	-1.1
4,683,329	+		DZA65_RS21665	0.27	-0.3
4,683,329	+		DZA65_RS21665	0.27	-0.6
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	-1.2
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	-0.3
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	-1.5
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	-1.4
4,683,330	-				-1.5
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	+0.5
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	+1.1
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	-1.3
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	-0.6
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	-0.1
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	-0.4
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	+0.5
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	-0.1
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	-0.8
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	+0.8
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	+1.4
4,683,330	-		DZA65_RS21665	0.27	-0.2
4,683,334	-		DZA65_RS21665	0.27	-1.4
4,683,334	-		DZA65_RS21665	0.27	-1.2
4,683,416	+		DZA65_RS21665	0.33	+1.6
4,683,416	+		DZA65_RS21665	0.33	-1.0
4,683,417	-		DZA65_RS21665	0.33	+1.1
4,683,437	+		DZA65_RS21665	0.35	-0.8
4,683,437	+		DZA65_RS21665	0.35	+0.6
4,683,438	-		DZA65_RS21665	0.35	-0.1
4,683,438	-		DZA65_RS21665	0.35	-0.3
4,683,438	-		DZA65_RS21665	0.35	-0.7
4,683,462	+		DZA65_RS21665	0.37	+0.5
4,683,463	-		DZA65_RS21665	0.37	-0.2
4,683,463	-				+1.1
4,683,463	-		DZA65_RS21665	0.37	-1.0
4,683,463	-		DZA65_RS21665	0.37	-0.9
4,683,512	+		DZA65_RS21665	0.41	+0.1
4,683,512	+		DZA65_RS21665	0.41	-0.6
4,683,512	+		DZA65_RS21665	0.41	-0.3
4,683,512	+		DZA65_RS21665	0.41	-0.4
4,683,512	+		DZA65_RS21665	0.41	-1.9
4,683,512	+		DZA65_RS21665	0.41	+0.1
4,683,512	+		DZA65_RS21665	0.41	-1.2
4,683,513	-		DZA65_RS21665	0.41	+1.5
4,683,513	-		DZA65_RS21665	0.41	+0.9
4,683,513	-		DZA65_RS21665	0.41	-1.0
4,683,513	-		DZA65_RS21665	0.41	+0.1
4,683,513	-		DZA65_RS21665	0.41	+1.5
4,683,513	-		DZA65_RS21665	0.41	-0.5
4,683,545	+		DZA65_RS21665	0.43	+0.0
4,683,545	+		DZA65_RS21665	0.43	-0.1
4,683,546	-		DZA65_RS21665	0.43	-0.5
4,683,548	+		DZA65_RS21665	0.43	-0.2
4,683,548	+		DZA65_RS21665	0.43	-0.4
4,683,548	+		DZA65_RS21665	0.43	+0.9
4,683,548	+		DZA65_RS21665	0.43	-0.5
4,683,548	+		DZA65_RS21665	0.43	+0.7
4,683,548	+		DZA65_RS21665	0.43	+1.5
4,683,549	-		DZA65_RS21665	0.43	+0.5
4,683,549	-		DZA65_RS21665	0.43	-0.3
4,683,549	-		DZA65_RS21665	0.43	-0.9
4,683,549	-		DZA65_RS21665	0.43	-0.3
4,683,549	-		DZA65_RS21665	0.43	+1.1
4,683,591	+		DZA65_RS21665	0.47	+0.9
4,683,591	+		DZA65_RS21665	0.47	+0.5
4,683,591	+		DZA65_RS21665	0.47	-1.7
4,683,591	+		DZA65_RS21665	0.47	-1.0
4,683,591	+		DZA65_RS21665	0.47	+0.2
4,683,591	+		DZA65_RS21665	0.47	-1.1
4,683,591	+		DZA65_RS21665	0.47	-0.6
4,683,591	+		DZA65_RS21665	0.47	-0.9
4,683,592	-		DZA65_RS21665	0.47	-3.0
4,683,592	-		DZA65_RS21665	0.47	-0.2
4,683,592	-		DZA65_RS21665	0.47	-0.3
4,683,592	-		DZA65_RS21665	0.47	-1.4
4,683,592	-		DZA65_RS21665	0.47	-2.2
4,683,767	+		DZA65_RS21665	0.60	-0.1
4,683,767	+		DZA65_RS21665	0.60	+0.5
4,683,767	+		DZA65_RS21665	0.60	+0.6
4,683,767	+		DZA65_RS21665	0.60	+0.5
4,683,767	+		DZA65_RS21665	0.60	+0.8
4,683,768	-		DZA65_RS21665	0.60	+0.2
4,683,842	+		DZA65_RS21665	0.66	-0.5
4,683,842	+		DZA65_RS21665	0.66	-1.2
4,683,842	+		DZA65_RS21665	0.66	-0.5
4,683,842	+		DZA65_RS21665	0.66	+0.1
4,683,842	+		DZA65_RS21665	0.66	+1.3
4,683,842	+		DZA65_RS21665	0.66	+0.1
4,683,843	-		DZA65_RS21665	0.66	+0.8
4,683,843	-		DZA65_RS21665	0.66	+0.2
4,683,843	-		DZA65_RS21665	0.66	+0.4
4,683,843	-		DZA65_RS21665	0.66	-0.7
4,683,843	-		DZA65_RS21665	0.66	-0.4
4,683,845	+		DZA65_RS21665	0.66	-1.5
4,683,845	+		DZA65_RS21665	0.66	+0.3
4,683,845	+		DZA65_RS21665	0.66	-0.6
4,683,845	+		DZA65_RS21665	0.66	+0.1
4,683,845	+		DZA65_RS21665	0.66	+1.5
4,683,846	-				+1.1
4,683,846	-		DZA65_RS21665	0.66	+0.4
4,683,846	-		DZA65_RS21665	0.66	-1.8
4,683,846	-		DZA65_RS21665	0.66	-0.2
4,683,846	-		DZA65_RS21665	0.66	-0.6
4,683,846	-		DZA65_RS21665	0.66	+1.1
4,683,846	-		DZA65_RS21665	0.66	+0.3
4,683,846	-		DZA65_RS21665	0.66	-0.5
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4,685,179	+		DZA65_RS21670	0.44	-2.1
4,685,180	-		DZA65_RS21670	0.45	+1.2
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4,685,193	+		DZA65_RS21670	0.46	-0.7
4,685,193	+		DZA65_RS21670	0.46	+0.5
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4,685,223	+		DZA65_RS21670	0.48	+0.0
4,685,224	-		DZA65_RS21670	0.48	+1.9
4,685,265	+				+1.1
4,685,265	+		DZA65_RS21670	0.52	-0.6
4,685,265	+		DZA65_RS21670	0.52	+0.6
4,685,265	+		DZA65_RS21670	0.52	-0.9
4,685,266	-		DZA65_RS21670	0.52	+0.2
4,685,266	-		DZA65_RS21670	0.52	-0.6
4,685,266	-		DZA65_RS21670	0.52	-1.5
4,685,273	+		DZA65_RS21670	0.52	+0.9
4,685,273	+		DZA65_RS21670	0.52	-0.4
4,685,273	+		DZA65_RS21670	0.52	-0.1
4,685,274	-		DZA65_RS21670	0.53	-0.5
4,685,274	-		DZA65_RS21670	0.53	-0.3