Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS21255

Experiment: Norland

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Norland
4,590,421	+		DZA65_RS21250	0.11	+0.1
4,590,421	+		DZA65_RS21250	0.11	-0.5
4,590,429	+		DZA65_RS21250	0.12	+0.3
4,590,429	+		DZA65_RS21250	0.12	+1.7
4,590,430	-		DZA65_RS21250	0.12	+0.1
4,590,435	+		DZA65_RS21250	0.13	+1.0
4,590,435	+		DZA65_RS21250	0.13	+1.1
4,590,435	+		DZA65_RS21250	0.13	-0.4
4,590,436	-		DZA65_RS21250	0.13	+0.6
4,590,436	-		DZA65_RS21250	0.13	+0.3
4,590,436	-		DZA65_RS21250	0.13	+1.2
4,590,436	-		DZA65_RS21250	0.13	-2.7
4,590,504	+		DZA65_RS21250	0.19	-0.3
4,590,505	-		DZA65_RS21250	0.19	-0.4
4,590,505	-		DZA65_RS21250	0.19	-1.1
4,590,505	-		DZA65_RS21250	0.19	-1.3
4,590,575	+		DZA65_RS21250	0.26	-0.7
4,590,626	+		DZA65_RS21250	0.31	-0.7
4,590,626	+		DZA65_RS21250	0.31	-1.0
4,590,626	+		DZA65_RS21250	0.31	-1.3
4,590,627	-		DZA65_RS21250	0.31	-0.9
4,590,627	-		DZA65_RS21250	0.31	-1.8
4,590,627	-		DZA65_RS21250	0.31	-0.2
4,590,627	-		DZA65_RS21250	0.31	-2.3
4,590,627	-		DZA65_RS21250	0.31	-0.6
4,590,650	-		DZA65_RS21250	0.33	-0.9
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	+0.3
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	-0.3
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	-0.4
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	+0.4
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	-1.0
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	+1.2
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	-0.5
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	+0.7
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	-0.5
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-1.7
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+0.5
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+0.6
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-1.3
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+1.9
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-0.9
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+0.5
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-0.2
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+0.9
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-0.9
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-0.7
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+2.4
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-0.9
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+0.2
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+3.9
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+1.9
4,590,868	+		DZA65_RS21250	0.54	+0.7
4,590,869	-		DZA65_RS21250	0.54	+0.1
4,590,901	+		DZA65_RS21250	0.58	+1.1
4,590,901	+		DZA65_RS21250	0.58	+1.6
4,590,902	-		DZA65_RS21250	0.58	+1.9
4,590,910	+		DZA65_RS21250	0.58	+1.1
4,590,975	+		DZA65_RS21250	0.65	+0.8
4,590,976	-		DZA65_RS21250	0.65	+1.2
4,590,978	+		DZA65_RS21250	0.65	-1.7
4,590,978	+		DZA65_RS21250	0.65	-0.2
4,590,978	+		DZA65_RS21250	0.65	+0.5
4,590,979	-		DZA65_RS21250	0.65	-0.3
4,591,015	-		DZA65_RS21250	0.69	+1.1
4,591,044	+		DZA65_RS21250	0.71	+0.1
4,591,044	+		DZA65_RS21250	0.71	+0.5
4,591,044	+		DZA65_RS21250	0.71	+0.4
4,591,044	+		DZA65_RS21250	0.71	-0.5
4,591,044	+		DZA65_RS21250	0.71	+0.6
4,591,044	+		DZA65_RS21250	0.71	+0.5
4,591,045	-		DZA65_RS21250	0.71	-0.2
4,591,045	-		DZA65_RS21250	0.71	+0.7
4,591,045	-		DZA65_RS21250	0.71	-0.1
4,591,045	-		DZA65_RS21250	0.71	+0.1
4,591,045	-		DZA65_RS21250	0.71	+0.4
4,591,045	-		DZA65_RS21250	0.71	-2.3
4,591,137	-		DZA65_RS21250	0.80	+0.7
4,591,137	-		DZA65_RS21250	0.80	-1.5
4,591,181	+		DZA65_RS21250	0.85	+0.1
4,591,204	-		DZA65_RS21250	0.87	+0.8
4,591,204	-		DZA65_RS21250	0.87	+1.1
4,591,209	-		DZA65_RS21250	0.87	-2.1
4,591,359	+				+1.1
4,591,359	+				+0.2
4,591,359	+				+1.3
4,591,395	+				+1.8
4,591,395	+				+0.1
4,591,396	-				+1.9
4,591,425	+				-1.5
4,591,426	-				+0.6
4,591,453	+				-0.4
4,591,453	+				-0.5
4,591,542	+		DZA65_RS21255	0.12	+1.1
4,591,542	+		DZA65_RS21255	0.12	+3.4
4,591,542	+		DZA65_RS21255	0.12	-0.9
4,591,542	+		DZA65_RS21255	0.12	-0.5
4,591,543	-		DZA65_RS21255	0.12	+0.1
4,591,543	-		DZA65_RS21255	0.12	+1.4
4,591,543	-		DZA65_RS21255	0.12	-0.5
4,591,606	+		DZA65_RS21255	0.18	+0.4
4,591,606	+		DZA65_RS21255	0.18	-0.3
4,591,606	+		DZA65_RS21255	0.18	+0.5
4,591,606	+		DZA65_RS21255	0.18	+0.1
4,591,606	+		DZA65_RS21255	0.18	-0.2
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	+0.2
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	+1.1
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	+0.1
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	+0.4
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	+0.9
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	+0.3
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	+0.5
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	-0.1
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	+0.2
4,591,663	+		DZA65_RS21255	0.23	+0.1
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	+1.3
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	-1.5
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	-0.4
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	+1.6
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	+0.6
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	-0.7
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	+0.7
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	-0.5
4,591,699	+		DZA65_RS21255	0.26	-1.2
4,591,699	+		DZA65_RS21255	0.26	-1.7
4,591,700	-		DZA65_RS21255	0.26	+0.8
4,591,700	-		DZA65_RS21255	0.26	-1.1
4,591,700	-		DZA65_RS21255	0.26	-0.3
4,591,700	-		DZA65_RS21255	0.26	+0.1
4,591,714	-		DZA65_RS21255	0.28	-0.3
4,591,730	-		DZA65_RS21255	0.29	-0.7
4,591,730	-		DZA65_RS21255	0.29	+2.3
4,591,825	+		DZA65_RS21255	0.38	-0.5
4,591,826	-		DZA65_RS21255	0.38	+0.4
4,591,867	+		DZA65_RS21255	0.42	+1.4
4,591,867	+		DZA65_RS21255	0.42	+1.8
4,591,867	+		DZA65_RS21255	0.42	+0.1
4,591,867	+		DZA65_RS21255	0.42	-0.5
4,591,867	+		DZA65_RS21255	0.42	-0.6
4,591,868	-		DZA65_RS21255	0.42	+0.4
4,591,868	-				+3.6
4,591,868	-		DZA65_RS21255	0.42	+0.8
4,591,868	-		DZA65_RS21255	0.42	-1.1
4,591,868	-		DZA65_RS21255	0.42	-1.3
4,591,868	-		DZA65_RS21255	0.42	+0.7
4,591,868	-		DZA65_RS21255	0.42	-0.3
4,591,868	-		DZA65_RS21255	0.42	-0.7
4,591,869	+		DZA65_RS21255	0.42	-1.8
4,591,869	+		DZA65_RS21255	0.42	+0.1
4,591,869	+		DZA65_RS21255	0.42	+0.6
4,591,869	+		DZA65_RS21255	0.42	+0.1
4,591,869	+		DZA65_RS21255	0.42	+1.3
4,591,869	+		DZA65_RS21255	0.42	+0.3
4,591,870	-		DZA65_RS21255	0.42	-0.0
4,591,870	-		DZA65_RS21255	0.42	-1.7
4,591,870	-		DZA65_RS21255	0.42	-0.0
4,591,870	-		DZA65_RS21255	0.42	-1.3
4,591,870	-		DZA65_RS21255	0.42	+1.1
4,591,882	+		DZA65_RS21255	0.43	+0.0
4,591,905	+		DZA65_RS21255	0.45	+0.7
4,591,906	-		DZA65_RS21255	0.46	-0.7
4,591,906	-		DZA65_RS21255	0.46	-0.0
4,591,906	-		DZA65_RS21255	0.46	+0.3
4,591,906	-		DZA65_RS21255	0.46	+0.4
4,591,957	+		DZA65_RS21255	0.50	-1.5
4,591,957	+		DZA65_RS21255	0.50	-0.4
4,591,957	+		DZA65_RS21255	0.50	+0.6
4,591,958	-		DZA65_RS21255	0.50	-0.4
4,591,968	+		DZA65_RS21255	0.51	-1.7
4,592,044	+		DZA65_RS21255	0.58	+1.6
4,592,045	-		DZA65_RS21255	0.58	-0.7
4,592,089	-		DZA65_RS21255	0.63	+0.2
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	+0.5
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	+1.6
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	+1.5
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	-0.3
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	+0.1
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	-0.3
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	-2.7
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	-1.1
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	+0.8
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	+0.6
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	+0.2
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	-0.7
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	+1.1
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	+0.2
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	-0.8
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	+1.1
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	+0.1
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	+0.4
4,592,133	+		DZA65_RS21255	0.67	+1.1
4,592,134	-		DZA65_RS21255	0.67	+1.0
4,592,134	-		DZA65_RS21255	0.67	+0.8
4,592,195	+		DZA65_RS21255	0.72	+1.1
4,592,195	+		DZA65_RS21255	0.72	+0.3
4,592,196	-		DZA65_RS21255	0.73	+1.7
4,592,277	+		DZA65_RS21255	0.80	-0.5
4,592,277	+		DZA65_RS21255	0.80	-1.3
4,592,277	+		DZA65_RS21255	0.80	-1.7
4,592,278	-		DZA65_RS21255	0.80	-1.0
4,592,278	-		DZA65_RS21255	0.80	-0.7
4,592,278	-		DZA65_RS21255	0.80	+1.5
4,592,278	-		DZA65_RS21255	0.80	-0.7
4,592,278	-		DZA65_RS21255	0.80	+0.3
4,592,315	+		DZA65_RS21255	0.84	-0.5
4,592,315	+		DZA65_RS21255	0.84	+0.1
4,592,316	-		DZA65_RS21255	0.84	+0.5
4,592,316	-		DZA65_RS21255	0.84	+0.5
4,592,316	-		DZA65_RS21255	0.84	-1.3
4,592,337	+		DZA65_RS21255	0.86	-0.3
4,592,337	+		DZA65_RS21255	0.86	+1.8
4,592,337	+		DZA65_RS21255	0.86	-0.6
4,592,338	-		DZA65_RS21255	0.86	+0.8
4,592,338	-		DZA65_RS21255	0.86	+0.7
4,592,347	+		DZA65_RS21255	0.87	-0.3
4,592,474	+				+0.1
4,592,474	+				+0.5
4,592,475	-				-0.9
4,592,506	+				-1.9
4,592,506	+				-1.3
4,592,507	-				-0.3
4,592,507	-				-0.5
4,592,522	+				-0.4
4,592,522	+				-1.3
4,592,523	-				+0.3
4,592,525	+				+1.5
4,592,550	+				-0.2
4,592,551	-				-0.8
4,592,555	+				-0.3
4,592,645	+				+0.1
4,592,646	-				-0.4
4,592,646	-				-0.3
4,592,646	-				-0.9
4,592,646	-				+0.7
4,592,713	+				+0.5
4,592,714	-				-0.1