Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS00380

Experiment: Atlantic

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Atlantic
88,666	+		DZA65_RS00370	0.85	-0.3
88,667	-		DZA65_RS00370	0.85	-0.2
88,719	+				-2.0
88,719	+				-2.2
88,719	+				-0.6
88,719	+				-1.2
88,719	+				-1.2
88,719	+				+0.2
88,719	+				+0.6
88,719	+				+0.8
88,719	+				+1.0
88,720	-				+0.1
88,720	-				+0.2
88,720	-				-0.0
88,720	-				+1.7
88,720	-				-2.3
88,737	+				+1.0
88,738	-				+1.7
88,738	-				-2.5
88,780	+				-1.5
88,780	+				+1.0
88,781	-				-0.2
88,781	-				-0.7
88,781	-				-0.2
88,781	-				-1.5
88,784	+				+1.0
88,784	+				+1.0
88,784	+				-1.0
88,784	+				-2.5
88,784	+				+1.0
88,785	-				-1.2
88,785	-				-2.3
88,785	-				-0.9
88,785	-				-2.2
88,785	-				+0.6
88,804	+				+0.4
88,804	+				-0.7
88,804	+				+0.6
88,804	+				-0.3
88,805	-				-3.5
88,805	-				-0.2
88,805	-				-3.2
88,805	-				-0.2
88,810	+				-1.6
88,810	+				-1.0
88,810	+				-0.8
88,810	+				+0.2
88,810	+				-0.3
88,810	+				-1.1
88,810	+				-0.4
88,810	+				+0.2
88,810	+				+0.1
88,810	+				-0.3
88,810	+				+1.8
88,810	+				-0.3
88,810	+				-2.5
88,810	+				+0.1
88,810	+				-0.5
88,811	-				-2.0
88,811	-				-1.2
88,811	-				-1.3
88,811	-				+1.2
88,811	-				+0.6
88,811	-				-1.6
88,811	-				-0.4
88,811	-				-1.0
88,811	-				-0.3
88,811	-				+0.7
88,811	-				+2.0
88,811	-				-0.6
88,811	-				-0.8
88,811	-				-1.8
88,811	-				-0.2
88,811	-				+0.4
88,811	-				+1.6
88,881	-				+0.2
88,946	+		DZA65_RS00375	0.18	-0.8
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	-1.0
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	-1.7
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	-1.0
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	-1.3
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	-1.0
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	-1.0
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	+0.6
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	-0.6
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	-0.0
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	-0.5
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	-0.2
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	-1.8
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	+0.3
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	+2.4
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	-0.9
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	-0.0
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	+0.5
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	+0.4
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	+1.1
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	+2.0
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	-2.3
88,951	+		DZA65_RS00375	0.19	+1.1
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-1.3
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-1.2
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-0.3
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-0.3
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-0.2
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-0.0
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-1.2
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	+1.2
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-1.2
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	+0.4
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	+0.6
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-0.8
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-1.2
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-0.3
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-1.3
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-0.6
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-0.1
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	+0.2
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-1.2
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-0.7
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	+0.8
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	+0.7
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-2.0
88,952	-		DZA65_RS00375	0.19	-2.2
88,955	+		DZA65_RS00375	0.20	+1.2
88,955	+		DZA65_RS00375	0.20	-0.2
88,955	+		DZA65_RS00375	0.20	+0.0
88,955	+		DZA65_RS00375	0.20	+0.3
88,955	+		DZA65_RS00375	0.20	+0.4
88,955	+		DZA65_RS00375	0.20	-0.1
88,955	+		DZA65_RS00375	0.20	+1.6
88,955	+		DZA65_RS00375	0.20	+0.2
88,955	+		DZA65_RS00375	0.20	+0.7
88,955	+		DZA65_RS00375	0.20	-1.0
88,955	+		DZA65_RS00375	0.20	+1.2
88,955	+		DZA65_RS00375	0.20	+0.2
88,956	-		DZA65_RS00375	0.20	-0.2
88,956	-		DZA65_RS00375	0.20	+0.8
88,956	-		DZA65_RS00375	0.20	+0.3
88,956	-		DZA65_RS00375	0.20	-0.0
88,956	-		DZA65_RS00375	0.20	-0.2
88,956	-		DZA65_RS00375	0.20	-0.2
88,956	-		DZA65_RS00375	0.20	-2.2
89,034	+		DZA65_RS00375	0.31	-0.0
89,034	+		DZA65_RS00375	0.31	-0.0
89,035	-		DZA65_RS00375	0.31	-1.2
89,131	-		DZA65_RS00375	0.45	+0.4
89,158	+		DZA65_RS00375	0.49	-0.6
89,158	+		DZA65_RS00375	0.49	+1.0
89,158	+		DZA65_RS00375	0.49	-1.0
89,158	+		DZA65_RS00375	0.49	+1.2
89,158	+		DZA65_RS00375	0.49	-0.5
89,159	-		DZA65_RS00375	0.49	-0.6
89,159	-		DZA65_RS00375	0.49	+0.8
89,159	-		DZA65_RS00375	0.49	+0.3
89,159	-		DZA65_RS00375	0.49	+0.4
89,159	-		DZA65_RS00375	0.49	+2.4
89,159	-		DZA65_RS00375	0.49	-1.6
89,159	-		DZA65_RS00375	0.49	-0.2
89,197	+		DZA65_RS00375	0.55	-0.0
89,198	-		DZA65_RS00375	0.55	+0.2
89,205	+		DZA65_RS00375	0.56	+0.2
89,205	+		DZA65_RS00375	0.56	+1.6
89,205	+		DZA65_RS00375	0.56	-0.5
89,205	+		DZA65_RS00375	0.56	+1.3
89,205	+		DZA65_RS00375	0.56	+1.0
89,205	+		DZA65_RS00375	0.56	+0.6
89,205	+		DZA65_RS00375	0.56	-0.2
89,205	+		DZA65_RS00375	0.56	-0.0
89,206	-		DZA65_RS00375	0.56	-0.7
89,206	-		DZA65_RS00375	0.56	-0.4
89,206	-		DZA65_RS00375	0.56	-1.2
89,206	-		DZA65_RS00375	0.56	-0.0
89,206	-		DZA65_RS00375	0.56	-1.1
89,378	+		DZA65_RS00375	0.81	-0.2
89,408	+		DZA65_RS00375	0.85	-1.0
89,438	+		DZA65_RS00375	0.89	-0.3
89,438	+		DZA65_RS00375	0.89	-0.3
89,439	-		DZA65_RS00375	0.90	-1.2
89,439	-		DZA65_RS00375	0.90	+0.1
89,439	-		DZA65_RS00375	0.90	+0.5
89,452	+				-0.3
89,474	-				-1.5
89,476	+				+0.1
89,476	+				+1.4
89,477	-				-0.8
89,502	+				-1.5
89,503	-				-0.3
89,592	+				+1.0
89,593	-				+0.2
89,593	-				-0.3
89,593	-				-1.8
89,595	-				+1.4
89,614	+				+0.5
89,647	+				+0.6
89,648	-				-0.0
89,648	-				-1.3
89,683	-				+1.1
89,683	-				-0.4
89,683	-				-1.0
89,710	+				-0.4
89,722	-				-1.6
89,754	-				-1.3
89,788	+				-1.6
89,789	-				-1.8
89,878	+				+1.0
89,905	+				-1.6
89,905	+				-1.8
89,906	-				-0.3
89,906	-				+1.3
89,911	+				-0.6
89,911	+				+2.0
89,938	+				-1.3
89,938	+				-1.3
89,938	+				+2.0
89,939	-				-0.3
89,939	-				-0.8
89,939	-				-0.3
89,939	-				-1.2
89,939	-				+0.7
89,939	-				-0.6
89,981	-				+1.0
89,981	-				+0.2
89,981	-				-0.1
89,981	-				+1.3
89,997	+				-0.0
90,019	+				+0.1
90,019	+				-0.0
90,019	+				+1.0
90,019	+				-0.7
90,020	-				+2.0
90,020	-				+1.0
90,020	-				-1.3
90,020	-				-0.6
90,031	+				-1.1
90,032	-				+0.3
90,032	-				-0.1
90,142	+		DZA65_RS00380	0.11	+2.0
90,143	-		DZA65_RS00380	0.11	-0.6
90,202	-		DZA65_RS00380	0.12	-0.2
90,279	+		DZA65_RS00380	0.14	-1.4
90,279	+		DZA65_RS00380	0.14	-0.0
90,279	+		DZA65_RS00380	0.14	+1.6
90,279	+		DZA65_RS00380	0.14	+0.3
90,279	+		DZA65_RS00380	0.14	-0.7
90,279	+		DZA65_RS00380	0.14	-0.8
90,280	-		DZA65_RS00380	0.14	-0.6
90,286	+		DZA65_RS00380	0.14	+0.4
90,286	+		DZA65_RS00380	0.14	+0.7
90,286	+		DZA65_RS00380	0.14	+0.3
90,286	+		DZA65_RS00380	0.14	-0.3
90,286	+		DZA65_RS00380	0.14	+0.0
90,286	+		DZA65_RS00380	0.14	+0.7
90,286	+		DZA65_RS00380	0.14	-0.1
90,286	+		DZA65_RS00380	0.14	+0.2
90,286	+		DZA65_RS00380	0.14	+0.8
90,286	+		DZA65_RS00380	0.14	-1.0
90,287	-		DZA65_RS00380	0.14	+1.0
90,287	-		DZA65_RS00380	0.14	-0.8
90,287	-		DZA65_RS00380	0.14	+2.0
90,287	-		DZA65_RS00380	0.14	+0.6
90,287	-		DZA65_RS00380	0.14	+0.2
90,287	-		DZA65_RS00380	0.14	-1.3
90,287	-		DZA65_RS00380	0.14	-0.5
90,419	+		DZA65_RS00380	0.17	+0.3
90,419	+		DZA65_RS00380	0.17	-0.3
90,419	+		DZA65_RS00380	0.17	-0.2
90,419	+		DZA65_RS00380	0.17	+2.0
90,420	-		DZA65_RS00380	0.17	-0.9
90,420	-		DZA65_RS00380	0.17	+2.6
90,420	-		DZA65_RS00380	0.17	-0.4
90,447	-		DZA65_RS00380	0.18	+0.2
90,447	-		DZA65_RS00380	0.18	+0.6
90,447	-		DZA65_RS00380	0.18	+0.2
90,447	-		DZA65_RS00380	0.18	-0.4
90,447	-		DZA65_RS00380	0.18	-0.0
90,447	-		DZA65_RS00380	0.18	+0.3
90,514	-		DZA65_RS00380	0.19	-0.5
90,555	-		DZA65_RS00380	0.20	+0.1
90,555	-		DZA65_RS00380	0.20	+1.0
90,555	-		DZA65_RS00380	0.20	+0.3
90,575	+		DZA65_RS00380	0.20	-0.6
90,586	+		DZA65_RS00380	0.21	-0.8
90,587	-		DZA65_RS00380	0.21	+0.5
90,587	-		DZA65_RS00380	0.21	-0.0
90,587	-		DZA65_RS00380	0.21	+1.3
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	-1.2
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	+1.0
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	-0.7
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	-1.3
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	-0.3
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	-1.5
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	+0.6
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	-0.8
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	-1.5
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	+1.2
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	-2.0
90,596	+				-0.6
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	+0.8
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	+2.0
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	+0.2
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	+0.2
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	-0.2
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	-1.1
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	-0.0
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	-0.5
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	-0.5
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	+0.1
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	+0.6
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	+2.0
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	-0.5
90,596	+		DZA65_RS00380	0.21	+1.7
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91,833	-		DZA65_RS00380	0.49	-1.0
91,833	-		DZA65_RS00380	0.49	+0.3
91,834	+				-1.0
91,835	-		DZA65_RS00380	0.49	+0.6
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91,911	-		DZA65_RS00380	0.50	-1.3
91,939	+		DZA65_RS00380	0.51	-1.3
91,939	+		DZA65_RS00380	0.51	+0.2
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91,940	-		DZA65_RS00380	0.51	+0.6
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91,999	-		DZA65_RS00380	0.52	-0.1
92,031	-		DZA65_RS00380	0.53	+0.7
92,031	-		DZA65_RS00380	0.53	-0.2
92,031	-		DZA65_RS00380	0.53	-1.3
92,031	-		DZA65_RS00380	0.53	-1.3
92,072	+		DZA65_RS00380	0.54	-0.4
92,072	+		DZA65_RS00380	0.54	+1.7
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92,072	+		DZA65_RS00380	0.54	+0.7
92,072	+		DZA65_RS00380	0.54	+1.3
92,072	+		DZA65_RS00380	0.54	+0.3
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93,542	+		DZA65_RS00380	0.87	-0.5
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93,544	+		DZA65_RS00380	0.87	-0.3
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93,544	+		DZA65_RS00380	0.87	-1.0
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