Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS21330

Experiment: Atlantic

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Atlantic
4,613,488	-				-0.1
4,613,520	+				+1.6
4,613,520	+				-0.3
4,613,521	-				+1.5
4,613,614	+		DZA65_RS21325	0.12	+0.6
4,613,614	+		DZA65_RS21325	0.12	-0.2
4,613,615	-		DZA65_RS21325	0.12	+1.5
4,613,615	-		DZA65_RS21325	0.12	+0.6
4,613,615	-		DZA65_RS21325	0.12	+0.9
4,613,620	+		DZA65_RS21325	0.13	+0.6
4,613,620	+		DZA65_RS21325	0.13	+0.6
4,613,621	-		DZA65_RS21325	0.13	+0.3
4,613,621	-		DZA65_RS21325	0.13	-0.9
4,613,621	-		DZA65_RS21325	0.13	+1.3
4,613,621	-		DZA65_RS21325	0.13	+0.9
4,613,621	-		DZA65_RS21325	0.13	+0.3
4,613,621	-		DZA65_RS21325	0.13	+0.4
4,613,621	-		DZA65_RS21325	0.13	-1.0
4,613,676	-		DZA65_RS21325	0.20	+0.4
4,613,723	+		DZA65_RS21325	0.27	+0.4
4,613,723	+		DZA65_RS21325	0.27	-0.1
4,613,723	+		DZA65_RS21325	0.27	-1.6
4,613,724	-		DZA65_RS21325	0.27	-1.7
4,613,731	+		DZA65_RS21325	0.28	+0.3
4,613,731	+		DZA65_RS21325	0.28	+0.1
4,613,732	-		DZA65_RS21325	0.28	-0.0
4,613,732	-		DZA65_RS21325	0.28	-1.0
4,613,779	+		DZA65_RS21325	0.34	-0.4
4,613,779	+		DZA65_RS21325	0.34	+0.0
4,613,779	+		DZA65_RS21325	0.34	-1.4
4,613,779	+		DZA65_RS21325	0.34	-3.0
4,613,779	+		DZA65_RS21325	0.34	-0.7
4,613,779	+		DZA65_RS21325	0.34	+0.1
4,613,779	+		DZA65_RS21325	0.34	+1.9
4,613,779	+		DZA65_RS21325	0.34	-0.1
4,613,780	-		DZA65_RS21325	0.34	-1.1
4,613,780	-		DZA65_RS21325	0.34	-0.7
4,613,780	-		DZA65_RS21325	0.34	+0.3
4,613,896	+		DZA65_RS21325	0.50	-0.7
4,613,896	+		DZA65_RS21325	0.50	-0.7
4,613,896	+		DZA65_RS21325	0.50	+1.5
4,613,896	+		DZA65_RS21325	0.50	-1.4
4,613,896	+		DZA65_RS21325	0.50	+0.8
4,613,896	+		DZA65_RS21325	0.50	+0.9
4,613,896	+		DZA65_RS21325	0.50	-1.1
4,613,897	-		DZA65_RS21325	0.50	-0.7
4,613,897	-		DZA65_RS21325	0.50	-0.7
4,613,897	-		DZA65_RS21325	0.50	-0.7
4,613,897	-		DZA65_RS21325	0.50	+1.3
4,613,897	-		DZA65_RS21325	0.50	-1.2
4,613,897	-		DZA65_RS21325	0.50	+0.2
4,613,897	-				-1.1
4,613,897	-		DZA65_RS21325	0.50	-0.7
4,613,899	+		DZA65_RS21325	0.50	-1.3
4,613,900	-		DZA65_RS21325	0.50	-0.7
4,613,900	-		DZA65_RS21325	0.50	+0.3
4,613,905	-		DZA65_RS21325	0.51	-0.3
4,613,905	-		DZA65_RS21325	0.51	+0.5
4,613,911	+		DZA65_RS21325	0.52	-1.3
4,613,912	-		DZA65_RS21325	0.52	-0.0
4,613,975	+		DZA65_RS21325	0.61	-0.5
4,613,975	+		DZA65_RS21325	0.61	+0.6
4,614,054	+		DZA65_RS21325	0.71	+0.0
4,614,054	+		DZA65_RS21325	0.71	+0.3
4,614,054	+		DZA65_RS21325	0.71	+0.9
4,614,054	+		DZA65_RS21325	0.71	+0.6
4,614,054	+		DZA65_RS21325	0.71	+0.1
4,614,055	-		DZA65_RS21325	0.71	+0.9
4,614,163	+		DZA65_RS21325	0.86	+0.4
4,614,163	+		DZA65_RS21325	0.86	+1.6
4,614,163	+		DZA65_RS21325	0.86	+0.3
4,614,164	-		DZA65_RS21325	0.86	+0.5
4,614,210	+				-0.5
4,614,210	+				-1.5
4,614,306	-				+0.0
4,614,306	-				-0.3
4,614,320	+				+0.2
4,614,320	+				-0.1
4,614,320	+				+0.3
4,614,321	-				-1.1
4,614,321	-				-1.2
4,614,325	+				-0.2
4,614,326	-				+0.1
4,614,399	+				-0.6
4,614,400	-				+0.8
4,614,565	+		DZA65_RS21330	0.11	-1.6
4,614,565	+		DZA65_RS21330	0.11	-1.7
4,614,566	-		DZA65_RS21330	0.11	-1.1
4,614,566	-		DZA65_RS21330	0.11	-0.4
4,614,566	-		DZA65_RS21330	0.11	-1.0
4,614,573	+		DZA65_RS21330	0.11	+0.1
4,614,573	+		DZA65_RS21330	0.11	-1.4
4,614,573	+		DZA65_RS21330	0.11	+0.6
4,614,574	-		DZA65_RS21330	0.11	+0.3
4,614,574	-		DZA65_RS21330	0.11	-1.9
4,614,574	-		DZA65_RS21330	0.11	-1.7
4,614,586	+		DZA65_RS21330	0.12	-1.1
4,614,586	+		DZA65_RS21330	0.12	-1.2
4,614,586	+		DZA65_RS21330	0.12	-0.9
4,614,586	+		DZA65_RS21330	0.12	-1.7
4,614,587	-		DZA65_RS21330	0.12	+0.0
4,614,636	+		DZA65_RS21330	0.15	-0.2
4,614,636	+		DZA65_RS21330	0.15	-1.6
4,614,636	+		DZA65_RS21330	0.15	-0.4
4,614,637	-		DZA65_RS21330	0.15	-3.0
4,614,637	-		DZA65_RS21330	0.15	+0.4
4,614,637	-		DZA65_RS21330	0.15	-0.3
4,614,681	+		DZA65_RS21330	0.18	-0.4
4,614,681	+		DZA65_RS21330	0.18	-1.3
4,614,681	+		DZA65_RS21330	0.18	-0.8
4,614,681	+		DZA65_RS21330	0.18	-1.4
4,614,681	+		DZA65_RS21330	0.18	+1.4
4,614,682	-		DZA65_RS21330	0.18	-0.6
4,614,682	-		DZA65_RS21330	0.18	-1.7
4,614,682	-		DZA65_RS21330	0.18	-0.3
4,614,682	-		DZA65_RS21330	0.18	-1.9
4,614,732	+		DZA65_RS21330	0.22	-1.4
4,614,808	+		DZA65_RS21330	0.27	-0.4
4,614,808	+		DZA65_RS21330	0.27	-0.4
4,614,808	+		DZA65_RS21330	0.27	-0.7
4,614,809	-		DZA65_RS21330	0.27	-0.9
4,614,809	-		DZA65_RS21330	0.27	-2.7
4,614,809	-		DZA65_RS21330	0.27	-1.4
4,614,837	+				-0.9
4,614,837	+		DZA65_RS21330	0.28	-2.4
4,614,838	-		DZA65_RS21330	0.28	-0.1
4,614,914	+		DZA65_RS21330	0.33	-1.9
4,614,966	+		DZA65_RS21330	0.37	+0.2
4,614,966	+		DZA65_RS21330	0.37	-1.7
4,614,966	+		DZA65_RS21330	0.37	-2.4
4,614,966	+		DZA65_RS21330	0.37	-1.7
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-1.1
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-3.0
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-1.4
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-1.7
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-2.6
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-2.1
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-1.1
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-1.6
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-1.2
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-1.8
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-2.4
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-0.7
4,614,967	-		DZA65_RS21330	0.37	-2.6
4,615,006	+		DZA65_RS21330	0.39	-1.4
4,615,007	-		DZA65_RS21330	0.39	-1.7
4,615,047	+		DZA65_RS21330	0.42	-3.0
4,615,047	+		DZA65_RS21330	0.42	-0.6
4,615,047	+		DZA65_RS21330	0.42	-0.1
4,615,047	+		DZA65_RS21330	0.42	-2.6
4,615,135	+		DZA65_RS21330	0.48	-2.1
4,615,135	+		DZA65_RS21330	0.48	-0.7
4,615,135	+		DZA65_RS21330	0.48	-2.6
4,615,135	+		DZA65_RS21330	0.48	-1.1
4,615,136	-		DZA65_RS21330	0.48	-0.3
4,615,136	-		DZA65_RS21330	0.48	-2.6
4,615,154	-		DZA65_RS21330	0.49	-0.6
4,615,170	+		DZA65_RS21330	0.50	+0.0
4,615,170	+		DZA65_RS21330	0.50	-1.0
4,615,171	-		DZA65_RS21330	0.50	-1.9
4,615,171	-		DZA65_RS21330	0.50	-2.8
4,615,394	+		DZA65_RS21330	0.64	+0.3
4,615,395	-		DZA65_RS21330	0.65	-1.4
4,615,395	-		DZA65_RS21330	0.65	-1.1
4,615,395	-		DZA65_RS21330	0.65	-1.1
4,615,395	-		DZA65_RS21330	0.65	-2.3
4,615,395	-		DZA65_RS21330	0.65	-3.1
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.8
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	+0.3
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-0.8
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	+0.2
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-0.8
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-0.9
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.8
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.1
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.6
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-2.3
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.6
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.0
4,615,492	+		DZA65_RS21330	0.71	-1.0
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-1.1
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-2.2
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-1.7
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	+0.4
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-1.1
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-0.4
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	+0.3
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-1.9
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-1.4
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-1.6
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-1.8
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-3.0
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-1.4
4,615,493	-		DZA65_RS21330	0.71	-0.7
4,615,556	+		DZA65_RS21330	0.75	-3.0
4,615,556	+		DZA65_RS21330	0.75	-1.1
4,615,556	+		DZA65_RS21330	0.75	-1.1
4,615,556	+		DZA65_RS21330	0.75	-1.2
4,615,556	+		DZA65_RS21330	0.75	+1.3
4,615,556	+		DZA65_RS21330	0.75	+0.3
4,615,557	-		DZA65_RS21330	0.75	-1.1
4,615,743	+		DZA65_RS21330	0.87	-0.4
4,615,743	+		DZA65_RS21330	0.87	-0.9
4,615,743	+		DZA65_RS21330	0.87	-0.2
4,615,744	-		DZA65_RS21330	0.87	-1.1
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-1.4
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-0.1
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-2.1
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	+0.5
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	+0.9
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	+1.1
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-1.7
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	+0.5
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-1.9
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	+0.1
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	+0.6
4,615,765	+		DZA65_RS21330	0.88	-1.8
4,615,766	-		DZA65_RS21330	0.89	-0.1
4,615,766	-		DZA65_RS21330	0.89	-1.5
4,615,766	-		DZA65_RS21330	0.89	-1.5
4,615,766	-		DZA65_RS21330	0.89	+0.1
4,615,866	+				-0.7
4,615,866	+				+0.2
4,615,866	+				-2.6
4,615,867	-				-1.1
4,615,897	-				-2.8
4,616,012	+				-1.1
4,616,013	-				-1.2
4,616,154	+		DZA65_RS21335	0.11	+0.0
4,616,414	-		DZA65_RS21335	0.25	-1.3
4,616,414	-		DZA65_RS21335	0.25	-1.7
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-0.4
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-0.3
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-0.4
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	+2.9
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-0.1
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-0.7
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-0.1
4,616,435	+		DZA65_RS21335	0.26	-1.1
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-1.7
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-1.7
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-0.7
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	+1.9
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-1.9
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-3.6
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-1.9
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-2.2
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-3.1
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-0.1
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-2.6
4,616,436	-		DZA65_RS21335	0.26	-1.9
4,616,496	+		DZA65_RS21335	0.30	-1.9
4,616,522	+		DZA65_RS21335	0.31	-2.4
4,616,522	+		DZA65_RS21335	0.31	-2.9
4,616,552	+		DZA65_RS21335	0.33	+1.7
4,616,552	+		DZA65_RS21335	0.33	-1.1
4,616,552	+		DZA65_RS21335	0.33	-0.5
4,616,552	+		DZA65_RS21335	0.33	-0.7
4,616,552	+		DZA65_RS21335	0.33	+1.2
4,616,552	+		DZA65_RS21335	0.33	-0.7
4,616,553	-		DZA65_RS21335	0.33	-1.6
4,616,553	-		DZA65_RS21335	0.33	-1.9
4,616,553	-		DZA65_RS21335	0.33	-0.7
4,616,553	-		DZA65_RS21335	0.33	+0.9
4,616,708	+		DZA65_RS21335	0.41	-3.8
4,616,709	-		DZA65_RS21335	0.41	-1.6
4,616,760	+		DZA65_RS21335	0.44	-1.3
4,616,761	-		DZA65_RS21335	0.44	-2.4
4,616,797	-		DZA65_RS21335	0.46	-3.4
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	+0.5
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-2.1
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-3.6
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-1.1
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-1.3
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-2.3
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-2.4
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-2.1
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-2.1
4,616,837	+		DZA65_RS21335	0.48	-2.1
4,616,838	-		DZA65_RS21335	0.48	-2.7
4,616,838	-		DZA65_RS21335	0.48	-3.5
4,616,838	-		DZA65_RS21335	0.48	-3.6
4,616,838	-		DZA65_RS21335	0.48	-2.7
4,616,838	-		DZA65_RS21335	0.48	-1.1
4,616,875	+		DZA65_RS21335	0.50	-2.8
4,616,876	-		DZA65_RS21335	0.50	-1.4
4,616,876	-		DZA65_RS21335	0.50	-1.1
4,616,876	-		DZA65_RS21335	0.50	-1.5
4,616,907	+		DZA65_RS21335	0.52	-1.1
4,616,908	-		DZA65_RS21335	0.52	-2.1