Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS21275

Experiment: Atlantic

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Atlantic
4,595,141	+		DZA65_RS21270	0.23	-1.2
4,595,193	+		DZA65_RS21270	0.28	-1.9
4,595,193	+		DZA65_RS21270	0.28	-0.0
4,595,194	-		DZA65_RS21270	0.28	-1.1
4,595,194	-		DZA65_RS21270	0.28	-1.1
4,595,194	-		DZA65_RS21270	0.28	-0.8
4,595,247	-		DZA65_RS21270	0.32	-0.7
4,595,280	+		DZA65_RS21270	0.34	-0.4
4,595,280	+		DZA65_RS21270	0.34	-0.1
4,595,280	+		DZA65_RS21270	0.34	-0.3
4,595,280	+		DZA65_RS21270	0.34	-0.2
4,595,281	-		DZA65_RS21270	0.34	-0.1
4,595,281	-		DZA65_RS21270	0.34	+0.3
4,595,303	+		DZA65_RS21270	0.36	-0.6
4,595,303	+		DZA65_RS21270	0.36	-1.6
4,595,303	+		DZA65_RS21270	0.36	-1.4
4,595,303	+		DZA65_RS21270	0.36	+0.9
4,595,303	+		DZA65_RS21270	0.36	-1.5
4,595,304	-		DZA65_RS21270	0.36	-1.5
4,595,304	-		DZA65_RS21270	0.36	-0.4
4,595,349	+		DZA65_RS21270	0.40	-1.0
4,595,349	+		DZA65_RS21270	0.40	-1.2
4,595,349	+		DZA65_RS21270	0.40	-0.1
4,595,350	-		DZA65_RS21270	0.40	-1.3
4,595,350	-		DZA65_RS21270	0.40	-1.4
4,595,350	-		DZA65_RS21270	0.40	-1.3
4,595,350	-		DZA65_RS21270	0.40	-0.1
4,595,350	-		DZA65_RS21270	0.40	-1.8
4,595,440	+		DZA65_RS21270	0.47	-0.7
4,595,441	-		DZA65_RS21270	0.47	-1.4
4,595,445	+		DZA65_RS21270	0.47	-0.7
4,595,446	-		DZA65_RS21270	0.47	-2.7
4,595,490	+		DZA65_RS21270	0.51	-1.2
4,595,491	-		DZA65_RS21270	0.51	-0.8
4,595,491	-		DZA65_RS21270	0.51	+0.9
4,595,547	+		DZA65_RS21270	0.55	-0.9
4,595,547	+		DZA65_RS21270	0.55	-1.0
4,595,548	-		DZA65_RS21270	0.55	-0.2
4,595,548	-		DZA65_RS21270	0.55	-0.8
4,595,548	-		DZA65_RS21270	0.55	-1.1
4,595,651	+		DZA65_RS21270	0.63	-1.4
4,595,651	+		DZA65_RS21270	0.63	-0.9
4,595,652	-		DZA65_RS21270	0.63	-0.7
4,595,652	-		DZA65_RS21270	0.63	-3.1
4,595,652	-		DZA65_RS21270	0.63	-1.5
4,595,652	-		DZA65_RS21270	0.63	-3.5
4,595,652	-		DZA65_RS21270	0.63	-1.5
4,595,652	-		DZA65_RS21270	0.63	-2.8
4,595,762	+		DZA65_RS21270	0.72	-0.1
4,595,782	+		DZA65_RS21270	0.73	-0.7
4,595,782	+		DZA65_RS21270	0.73	+0.7
4,595,782	+		DZA65_RS21270	0.73	-0.1
4,595,783	-		DZA65_RS21270	0.73	-1.6
4,595,783	-		DZA65_RS21270	0.73	-1.4
4,595,783	-		DZA65_RS21270	0.73	-0.5
4,595,801	+		DZA65_RS21270	0.75	-0.7
4,595,802	-		DZA65_RS21270	0.75	-0.1
4,595,821	+		DZA65_RS21270	0.76	-2.7
4,595,821	+		DZA65_RS21270	0.76	-1.1
4,595,821	+		DZA65_RS21270	0.76	-1.5
4,595,821	+		DZA65_RS21270	0.76	-0.6
4,595,822	-		DZA65_RS21270	0.76	-1.1
4,595,822	-		DZA65_RS21270	0.76	+0.9
4,595,822	-		DZA65_RS21270	0.76	-0.3
4,595,822	-		DZA65_RS21270	0.76	-0.7
4,595,822	-		DZA65_RS21270	0.76	-1.1
4,595,822	-		DZA65_RS21270	0.76	-1.8
4,595,822	-		DZA65_RS21270	0.76	-0.6
4,595,822	-		DZA65_RS21270	0.76	-0.1
4,595,822	-		DZA65_RS21270	0.76	-1.7
4,595,829	+		DZA65_RS21270	0.77	-1.4
4,595,829	+		DZA65_RS21270	0.77	-1.3
4,595,830	-		DZA65_RS21270	0.77	-2.6
4,595,830	-		DZA65_RS21270	0.77	-1.9
4,595,830	-		DZA65_RS21270	0.77	-2.4
4,595,830	-		DZA65_RS21270	0.77	-3.0
4,595,830	-		DZA65_RS21270	0.77	+0.3
4,595,830	-		DZA65_RS21270	0.77	+0.1
4,595,856	+		DZA65_RS21270	0.79	-2.6
4,595,856	+		DZA65_RS21270	0.79	-0.2
4,595,856	+		DZA65_RS21270	0.79	-1.8
4,595,856	+		DZA65_RS21270	0.79	-1.8
4,595,856	+		DZA65_RS21270	0.79	-0.4
4,595,856	+		DZA65_RS21270	0.79	+0.1
4,595,857	-		DZA65_RS21270	0.79	-0.7
4,595,857	-		DZA65_RS21270	0.79	-1.1
4,595,857	-		DZA65_RS21270	0.79	-1.8
4,595,857	-		DZA65_RS21270	0.79	+0.7
4,595,901	+		DZA65_RS21270	0.83	+1.2
4,595,902	-		DZA65_RS21270	0.83	-2.2
4,595,902	-		DZA65_RS21270	0.83	-0.7
4,595,928	+		DZA65_RS21270	0.85	-1.1
4,595,928	+		DZA65_RS21270	0.85	+0.4
4,595,928	+		DZA65_RS21270	0.85	+0.1
4,595,928	+		DZA65_RS21270	0.85	-0.8
4,595,929	-		DZA65_RS21270	0.85	-0.5
4,595,929	-		DZA65_RS21270	0.85	-2.7
4,595,929	-		DZA65_RS21270	0.85	-1.4
4,595,958	+		DZA65_RS21270	0.87	-1.4
4,595,958	+		DZA65_RS21270	0.87	-0.9
4,595,958	+		DZA65_RS21270	0.87	+0.5
4,595,959	-		DZA65_RS21270	0.87	-0.9
4,595,959	-		DZA65_RS21270	0.87	-0.9
4,595,959	-		DZA65_RS21270	0.87	-0.1
4,595,959	-		DZA65_RS21270	0.87	-0.9
4,595,959	-		DZA65_RS21270	0.87	-1.7
4,595,959	-		DZA65_RS21270	0.87	-1.6
4,595,959	-		DZA65_RS21270	0.87	+0.9
4,595,972	+		DZA65_RS21270	0.88	-0.7
4,595,972	+		DZA65_RS21270	0.88	+0.1
4,595,972	+		DZA65_RS21270	0.88	-2.4
4,595,973	-		DZA65_RS21270	0.88	-1.9
4,595,988	+		DZA65_RS21270	0.89	-1.7
4,595,988	+		DZA65_RS21270	0.89	-0.1
4,595,988	+		DZA65_RS21270	0.89	-0.9
4,595,988	+		DZA65_RS21270	0.89	-1.4
4,595,989	-		DZA65_RS21270	0.89	-1.1
4,595,989	-		DZA65_RS21270	0.89	-0.6
4,595,989	-		DZA65_RS21270	0.89	-0.3
4,595,989	-		DZA65_RS21270	0.89	-3.7
4,595,989	-		DZA65_RS21270	0.89	-2.1
4,595,989	-		DZA65_RS21270	0.89	-0.3
4,595,989	-		DZA65_RS21270	0.89	-0.1
4,595,989	-		DZA65_RS21270	0.89	-1.1
4,596,102	-				-0.9
4,596,110	+				-0.7
4,596,110	+				-0.7
4,596,154	+				-2.3
4,596,154	+				-1.1
4,596,154	+				-0.9
4,596,170	+				-0.7
4,596,221	+				-0.1
4,596,221	+				-1.0
4,596,221	+				-1.1
4,596,222	-				+0.3
4,596,246	+				-1.6
4,596,369	-		DZA65_RS21275	0.16	-0.9
4,596,369	-		DZA65_RS21275	0.16	-0.9
4,596,489	+		DZA65_RS21275	0.24	-1.9
4,596,489	+		DZA65_RS21275	0.24	+0.9
4,596,489	+		DZA65_RS21275	0.24	-2.2
4,596,489	+		DZA65_RS21275	0.24	-2.3
4,596,490	-		DZA65_RS21275	0.24	-0.4
4,596,490	-		DZA65_RS21275	0.24	-0.9
4,596,490	-		DZA65_RS21275	0.24	+0.0
4,596,490	-		DZA65_RS21275	0.24	+0.6
4,596,493	+		DZA65_RS21275	0.24	-0.7
4,596,493	+		DZA65_RS21275	0.24	-3.4
4,596,493	+		DZA65_RS21275	0.24	-1.3
4,596,493	+		DZA65_RS21275	0.24	-1.8
4,596,494	-		DZA65_RS21275	0.24	+1.5
4,596,494	-		DZA65_RS21275	0.24	-0.9
4,596,594	+		DZA65_RS21275	0.31	-0.7
4,596,594	+		DZA65_RS21275	0.31	-3.0
4,596,595	-		DZA65_RS21275	0.31	-1.1
4,596,649	-		DZA65_RS21275	0.34	+0.3
4,596,820	+		DZA65_RS21275	0.46	-2.4
4,596,820	+		DZA65_RS21275	0.46	-0.5
4,596,820	+		DZA65_RS21275	0.46	-0.4
4,596,820	+		DZA65_RS21275	0.46	-0.1
4,596,820	+		DZA65_RS21275	0.46	-0.7
4,596,820	+		DZA65_RS21275	0.46	+1.9
4,596,820	+		DZA65_RS21275	0.46	-0.4
4,596,820	+		DZA65_RS21275	0.46	-0.6
4,596,820	+		DZA65_RS21275	0.46	+0.7
4,596,820	+		DZA65_RS21275	0.46	-1.3
4,596,820	+		DZA65_RS21275	0.46	-0.1
4,596,821	-		DZA65_RS21275	0.46	-0.1
4,596,821	-		DZA65_RS21275	0.46	-1.6
4,596,821	-		DZA65_RS21275	0.46	-0.7
4,596,821	-		DZA65_RS21275	0.46	-1.1
4,596,821	-		DZA65_RS21275	0.46	-1.9
4,596,821	-		DZA65_RS21275	0.46	-1.2
4,596,821	-		DZA65_RS21275	0.46	+0.9
4,596,821	-		DZA65_RS21275	0.46	+0.3
4,596,821	-		DZA65_RS21275	0.46	-2.4
4,596,821	-		DZA65_RS21275	0.46	-1.3
4,596,821	-		DZA65_RS21275	0.46	-2.4
4,596,835	-		DZA65_RS21275	0.47	-1.4
4,597,022	-		DZA65_RS21275	0.59	+0.6
4,597,091	-		DZA65_RS21275	0.64	-0.7
4,597,155	-		DZA65_RS21275	0.68	-1.3
4,597,267	+		DZA65_RS21275	0.76	-1.7
4,597,268	-		DZA65_RS21275	0.76	-0.9
4,597,271	+		DZA65_RS21275	0.76	-0.7
4,597,271	+		DZA65_RS21275	0.76	+1.9
4,597,271	+		DZA65_RS21275	0.76	+1.5
4,597,271	+		DZA65_RS21275	0.76	-0.2
4,597,271	+		DZA65_RS21275	0.76	-0.2
4,597,272	-		DZA65_RS21275	0.76	-1.4
4,597,272	-		DZA65_RS21275	0.76	+0.1
4,597,272	-		DZA65_RS21275	0.76	+1.9
4,597,272	-		DZA65_RS21275	0.76	-0.6
4,597,272	-		DZA65_RS21275	0.76	+0.3
4,597,588	+				-2.2
4,597,588	+				-2.9
4,597,588	+				-1.7
4,597,588	+				-0.1
4,597,588	+				-1.9
4,597,588	+				-0.7
4,597,588	+				+0.9
4,597,588	+				-0.9
4,597,588	+				-1.7
4,597,589	-				+0.5
4,597,589	-				-0.1
4,597,589	-				-1.2
4,597,589	-				+0.1
4,597,589	-				-1.1
4,597,589	-				-0.1
4,597,589	-				-1.0
4,597,610	+				-2.1
4,597,610	+				+0.5
4,597,611	-				-1.1
4,597,611	-				+0.3
4,597,611	-				-1.0
4,597,623	+				+0.2
4,597,623	+				-0.3
4,597,624	-				-0.1
4,597,666	+				-2.7
4,597,666	+				-0.4
4,597,667	-				+0.1
4,597,678	+				-1.3
4,597,681	+				+0.2
4,597,681	+				+2.9
4,597,682	-				+0.1
4,597,682	-				+1.0
4,597,698	+				-0.2
4,597,726	-				+0.9
4,597,742	+				+0.2
4,597,748	+				+0.6
4,597,749	-				+0.1
4,597,769	+				-0.5
4,597,770	-				-2.7
4,597,780	+				-2.3
4,597,780	+				-0.8
4,597,780	+				-0.2
4,597,781	-				-1.7
4,597,781	-				-1.8
4,597,781	-				-2.4
4,597,781	-				-0.6
4,597,781	-				+0.6
4,597,805	-				-0.1
4,597,805	-				-0.1
4,597,864	+				+2.0
4,597,864	+				-0.3
4,597,864	+				+1.6
4,597,864	+				+0.9
4,597,864	+				-2.1
4,597,864	+				-0.3
4,597,864	+				-0.7
4,597,864	+				-0.7
4,597,864	+				+0.5
4,597,865	-				+0.9
4,597,865	-				-1.3
4,597,865	-				+1.1
4,597,865	-				-0.1
4,597,865	-				+0.1
4,597,865	-				+0.4
4,597,865	-				+0.3
4,597,865	-				-0.2
4,597,865	-				-1.8
4,597,865	-				+2.9
4,597,865	-				+0.3
4,597,866	+				+0.3
4,597,866	+				-0.1
4,597,866	+				+0.6
4,597,866	+				-0.4
4,597,866	+				+0.6
4,597,866	+				-0.2
4,597,866	+				+0.9
4,597,866	+				-0.0
4,597,866	+				+0.2
4,597,867	-				-1.9
4,597,867	-				-0.1
4,597,867	-				+0.6
4,597,867	-				-0.5
4,597,867	-				+0.1
4,597,867	-				+0.7
4,597,867	-				-1.4
4,597,867	-				-0.4
4,597,870	+				+0.9
4,597,870	+				+0.3
4,597,870	+				-0.2
4,597,870	+				-0.4
4,597,870	+				+0.6
4,597,871	-				+0.3
4,597,871	-				-0.1
4,597,871	-				+1.9
4,597,871	-				-0.7
4,597,871	-				-0.5
4,597,871	-				+0.7
4,597,871	-				-1.1
4,597,893	-				+1.3
4,597,924	+				+0.4
4,597,924	+				+0.7
4,597,924	+				+0.5
4,597,925	-				+0.6
4,597,925	-				-0.3
4,597,944	-				-1.4
4,597,944	-				-0.8
4,597,966	+				-0.1
4,597,967	-				+0.1
4,597,967	-				+0.1
4,597,988	+				+0.8
4,597,988	+				-1.4
4,597,988	+				+1.5
4,597,988	+				+1.0
4,597,988	+				-0.3
4,597,988	+				-3.4
4,597,988	+				-1.3
4,597,989	-				-0.1
4,597,989	-				-0.7
4,597,989	-				+0.1
4,597,989	-				-0.1
4,597,989	-				-0.5
4,597,989	-				-1.0
4,597,989	-				+0.9
4,597,989	-				-1.1
4,598,054	+		DZA65_RS21280	0.13	-1.6
4,598,054	+		DZA65_RS21280	0.13	+1.7
4,598,055	-		DZA65_RS21280	0.13	+0.1
4,598,055	-		DZA65_RS21280	0.13	+0.3
4,598,082	+		DZA65_RS21280	0.15	-0.2
4,598,082	+		DZA65_RS21280	0.15	+0.1
4,598,082	+		DZA65_RS21280	0.15	-0.3
4,598,082	+		DZA65_RS21280	0.15	-0.0
4,598,082	+		DZA65_RS21280	0.15	+2.3
4,598,083	-		DZA65_RS21280	0.15	-2.7
4,598,083	-		DZA65_RS21280	0.15	-0.0
4,598,083	-		DZA65_RS21280	0.15	-0.4
4,598,083	-		DZA65_RS21280	0.15	-1.2
4,598,083	-		DZA65_RS21280	0.15	-1.3
4,598,083	-		DZA65_RS21280	0.15	-0.4
4,598,083	-		DZA65_RS21280	0.15	-0.1
4,598,083	-		DZA65_RS21280	0.15	+1.2
4,598,084	+		DZA65_RS21280	0.15	+1.6
4,598,084	+		DZA65_RS21280	0.15	-0.6
4,598,085	-		DZA65_RS21280	0.15	-1.9
4,598,098	-		DZA65_RS21280	0.16	-1.9
4,598,099	+		DZA65_RS21280	0.16	-1.0
4,598,161	+		DZA65_RS21280	0.19	-1.0
4,598,161	+		DZA65_RS21280	0.19	+2.1
4,598,161	+		DZA65_RS21280	0.19	+0.3
4,598,161	+		DZA65_RS21280	0.19	+0.4
4,598,161	+		DZA65_RS21280	0.19	-0.4
4,598,161	+		DZA65_RS21280	0.19	+1.5
4,598,162	-		DZA65_RS21280	0.19	+0.6
4,598,162	-		DZA65_RS21280	0.19	+0.2
4,598,162	-		DZA65_RS21280	0.19	-1.1
4,598,162	-		DZA65_RS21280	0.19	-1.7
4,598,162	-		DZA65_RS21280	0.19	+0.6
4,598,162	-		DZA65_RS21280	0.19	+1.1
4,598,162	-		DZA65_RS21280	0.19	-1.7
4,598,162	-		DZA65_RS21280	0.19	-0.8
4,598,162	-		DZA65_RS21280	0.19	+1.5
4,598,172	-		DZA65_RS21280	0.20	-0.1
4,598,178	+		DZA65_RS21280	0.20	+0.1
4,598,178	+		DZA65_RS21280	0.20	-2.3
4,598,186	+		DZA65_RS21280	0.21	+0.9
4,598,186	+		DZA65_RS21280	0.21	-1.0
4,598,202	+		DZA65_RS21280	0.21	-1.4
4,598,202	+		DZA65_RS21280	0.21	+0.1
4,598,202	+		DZA65_RS21280	0.21	+0.0
4,598,202	+		DZA65_RS21280	0.21	-1.0
4,598,202	+		DZA65_RS21280	0.21	+0.3
4,598,202	+		DZA65_RS21280	0.21	-0.4
4,598,202	+		DZA65_RS21280	0.21	+0.2
4,598,202	+		DZA65_RS21280	0.21	+0.7
4,598,203	-		DZA65_RS21280	0.22	-0.5
4,598,260	+		DZA65_RS21280	0.25	+0.6
4,598,260	+		DZA65_RS21280	0.25	+0.0
4,598,261	-		DZA65_RS21280	0.25	-0.3
4,598,287	-		DZA65_RS21280	0.26	-0.1
4,598,319	-		DZA65_RS21280	0.28	+0.6
4,598,374	+		DZA65_RS21280	0.31	+1.3
4,598,374	+		DZA65_RS21280	0.31	-0.1
4,598,386	+		DZA65_RS21280	0.32	-0.5
4,598,387	-		DZA65_RS21280	0.32	-0.1
4,598,388	+		DZA65_RS21280	0.32	+1.2
4,598,388	+		DZA65_RS21280	0.32	+0.9
4,598,389	-		DZA65_RS21280	0.32	-2.3
4,598,490	+		DZA65_RS21280	0.37	-2.6
4,598,490	+		DZA65_RS21280	0.37	+1.6
4,598,490	+		DZA65_RS21280	0.37	+0.5
4,598,490	+		DZA65_RS21280	0.37	-0.7
4,598,490	+		DZA65_RS21280	0.37	-0.9
4,598,490	+		DZA65_RS21280	0.37	-0.1
4,598,491	-		DZA65_RS21280	0.37	-1.4
4,598,491	-		DZA65_RS21280	0.37	+1.2
4,598,491	-		DZA65_RS21280	0.37	+1.5
4,598,491	-		DZA65_RS21280	0.37	+0.4
4,598,491	-		DZA65_RS21280	0.37	-0.4
4,598,491	-		DZA65_RS21280	0.37	-1.9
4,598,491	-		DZA65_RS21280	0.37	-0.4
4,598,504	+		DZA65_RS21280	0.38	-0.2
4,598,504	+		DZA65_RS21280	0.38	+1.2
4,598,504	+		DZA65_RS21280	0.38	-0.4
4,598,505	-		DZA65_RS21280	0.38	-2.1
4,598,505	-		DZA65_RS21280	0.38	-0.1
4,598,536	+		DZA65_RS21280	0.40	-1.3
4,598,536	+				+2.5
4,598,549	+		DZA65_RS21280	0.41	-1.7
4,598,550	-		DZA65_RS21280	0.41	-0.3
4,598,561	+		DZA65_RS21280	0.41	-0.5
4,598,561	+		DZA65_RS21280	0.41	-0.1
4,598,561	+		DZA65_RS21280	0.41	+0.3
4,598,561	+		DZA65_RS21280	0.41	-1.0
4,598,577	+		DZA65_RS21280	0.42	-0.3
4,598,577	+		DZA65_RS21280	0.42	-0.1
4,598,577	+		DZA65_RS21280	0.42	-2.6
4,598,577	+		DZA65_RS21280	0.42	-0.7
4,598,577	+		DZA65_RS21280	0.42	-0.3
4,598,578	-		DZA65_RS21280	0.42	+0.1
4,598,578	-		DZA65_RS21280	0.42	-1.2
4,598,600	+		DZA65_RS21280	0.43	+0.2
4,598,601	-		DZA65_RS21280	0.43	-0.0