Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS20570

Experiment: Atlantic

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Atlantic
4,437,046	-		DZA65_RS20565	0.39	+0.5
4,437,076	+		DZA65_RS20565	0.41	+0.3
4,437,076	+		DZA65_RS20565	0.41	-0.6
4,437,076	+		DZA65_RS20565	0.41	-0.0
4,437,077	-		DZA65_RS20565	0.41	-0.4
4,437,206	-		DZA65_RS20565	0.49	+0.8
4,437,206	-		DZA65_RS20565	0.49	-0.8
4,437,206	-		DZA65_RS20565	0.49	+0.6
4,437,215	+		DZA65_RS20565	0.49	-0.9
4,437,216	-		DZA65_RS20565	0.50	+1.4
4,437,216	-		DZA65_RS20565	0.50	+0.5
4,437,216	-		DZA65_RS20565	0.50	+0.3
4,437,216	-		DZA65_RS20565	0.50	+0.5
4,437,216	-		DZA65_RS20565	0.50	+0.7
4,437,297	-		DZA65_RS20565	0.54	-0.1
4,437,364	+		DZA65_RS20565	0.59	-2.2
4,437,503	+		DZA65_RS20565	0.67	-0.5
4,437,504	-		DZA65_RS20565	0.67	+0.2
4,437,504	-		DZA65_RS20565	0.67	+0.4
4,437,504	-		DZA65_RS20565	0.67	-1.1
4,437,504	-		DZA65_RS20565	0.67	-0.8
4,437,504	-		DZA65_RS20565	0.67	-1.5
4,437,504	-		DZA65_RS20565	0.67	+0.2
4,437,504	-				-0.8
4,437,508	+		DZA65_RS20565	0.67	+1.3
4,437,509	-		DZA65_RS20565	0.67	-1.9
4,437,509	-		DZA65_RS20565	0.67	+0.9
4,437,544	+		DZA65_RS20565	0.69	+0.6
4,437,544	+		DZA65_RS20565	0.69	+0.8
4,437,544	+		DZA65_RS20565	0.69	-2.5
4,437,545	-		DZA65_RS20565	0.70	+0.7
4,437,545	-		DZA65_RS20565	0.70	-0.5
4,437,545	-		DZA65_RS20565	0.70	+1.6
4,437,545	-		DZA65_RS20565	0.70	+1.4
4,437,545	-		DZA65_RS20565	0.70	+0.2
4,437,569	+		DZA65_RS20565	0.71	+0.3
4,437,570	-		DZA65_RS20565	0.71	+0.6
4,437,570	-		DZA65_RS20565	0.71	-0.2
4,437,572	+		DZA65_RS20565	0.71	+0.3
4,437,573	-		DZA65_RS20565	0.71	+1.0
4,437,573	-		DZA65_RS20565	0.71	-1.5
4,437,573	-		DZA65_RS20565	0.71	-2.0
4,437,655	-		DZA65_RS20565	0.76	+1.2
4,437,661	+		DZA65_RS20565	0.77	-1.7
4,437,661	+		DZA65_RS20565	0.77	+1.8
4,437,661	+		DZA65_RS20565	0.77	-1.2
4,437,661	+		DZA65_RS20565	0.77	+0.0
4,437,661	+		DZA65_RS20565	0.77	+0.8
4,437,662	-		DZA65_RS20565	0.77	-1.4
4,437,662	-		DZA65_RS20565	0.77	+1.2
4,437,665	+		DZA65_RS20565	0.77	+0.3
4,437,665	+		DZA65_RS20565	0.77	-1.2
4,437,666	-		DZA65_RS20565	0.77	+0.6
4,437,666	-		DZA65_RS20565	0.77	-0.2
4,437,666	-		DZA65_RS20565	0.77	-0.2
4,437,670	+		DZA65_RS20565	0.77	+1.1
4,437,673	+		DZA65_RS20565	0.77	+0.1
4,437,673	+		DZA65_RS20565	0.77	+1.7
4,437,674	-		DZA65_RS20565	0.77	-0.2
4,437,674	-		DZA65_RS20565	0.77	+1.2
4,437,674	-				+2.1
4,437,687	+		DZA65_RS20565	0.78	+1.6
4,437,687	+		DZA65_RS20565	0.78	+2.4
4,437,687	+		DZA65_RS20565	0.78	+0.5
4,437,688	-		DZA65_RS20565	0.78	-0.5
4,437,688	-		DZA65_RS20565	0.78	-0.4
4,437,688	-		DZA65_RS20565	0.78	+2.0
4,437,688	-		DZA65_RS20565	0.78	+0.1
4,437,692	+		DZA65_RS20565	0.78	-1.2
4,437,692	+		DZA65_RS20565	0.78	+0.8
4,437,692	+		DZA65_RS20565	0.78	-0.0
4,437,692	+		DZA65_RS20565	0.78	+0.9
4,437,692	+		DZA65_RS20565	0.78	-2.1
4,437,692	+		DZA65_RS20565	0.78	-0.2
4,437,693	-		DZA65_RS20565	0.79	-0.1
4,437,693	-		DZA65_RS20565	0.79	-0.6
4,437,693	-		DZA65_RS20565	0.79	+0.5
4,437,693	-		DZA65_RS20565	0.79	-0.4
4,437,693	-		DZA65_RS20565	0.79	+0.7
4,437,693	-		DZA65_RS20565	0.79	-0.6
4,437,693	-		DZA65_RS20565	0.79	+0.0
4,437,694	+		DZA65_RS20565	0.79	+0.6
4,437,695	-		DZA65_RS20565	0.79	-2.0
4,437,695	-		DZA65_RS20565	0.79	+0.8
4,437,695	-		DZA65_RS20565	0.79	-0.2
4,437,736	+		DZA65_RS20565	0.81	-1.4
4,437,743	-		DZA65_RS20565	0.82	-0.2
4,437,758	+		DZA65_RS20565	0.82	+0.0
4,437,758	+		DZA65_RS20565	0.82	-0.3
4,437,759	-		DZA65_RS20565	0.83	+1.2
4,437,800	+		DZA65_RS20565	0.85	+0.4
4,437,800	+		DZA65_RS20565	0.85	-0.7
4,437,800	+		DZA65_RS20565	0.85	+2.0
4,437,800	+		DZA65_RS20565	0.85	+1.0
4,437,800	+		DZA65_RS20565	0.85	+1.8
4,437,800	+		DZA65_RS20565	0.85	-0.3
4,437,801	-		DZA65_RS20565	0.85	-0.4
4,437,801	-		DZA65_RS20565	0.85	-0.5
4,437,801	-		DZA65_RS20565	0.85	-0.8
4,437,801	-				+0.1
4,437,962	-				+0.0
4,437,979	+				-0.1
4,437,979	+				+0.6
4,437,979	+				-0.7
4,437,998	+				+0.4
4,437,999	-				-0.9
4,437,999	-				-0.2
4,437,999	-				+1.8
4,438,016	-				-0.4
4,438,016	-				+0.1
4,438,016	-				-0.1
4,438,068	+				-0.5
4,438,068	+				-0.2
4,438,068	+				-0.2
4,438,068	+				+0.4
4,438,068	+				-1.2
4,438,068	+				-0.6
4,438,069	-				+0.4
4,438,069	-				+0.1
4,438,069	-				+1.1
4,438,069	-				-1.1
4,438,069	-				+1.1
4,438,069	-				-1.2
4,438,069	-				+1.0
4,438,076	+				-0.2
4,438,076	+				+1.2
4,438,077	-				-0.2
4,438,088	+				-0.4
4,438,114	+		DZA65_RS20570	0.11	+0.1
4,438,114	+		DZA65_RS20570	0.11	+0.3
4,438,114	+		DZA65_RS20570	0.11	+0.4
4,438,114	+		DZA65_RS20570	0.11	+0.8
4,438,115	-		DZA65_RS20570	0.11	-1.2
4,438,115	-		DZA65_RS20570	0.11	-1.2
4,438,115	-		DZA65_RS20570	0.11	-1.0
4,438,115	-		DZA65_RS20570	0.11	+1.0
4,438,115	-		DZA65_RS20570	0.11	+0.4
4,438,175	-		DZA65_RS20570	0.20	+0.4
4,438,175	-		DZA65_RS20570	0.20	+0.6
4,438,252	+		DZA65_RS20570	0.31	-0.8
4,438,268	+		DZA65_RS20570	0.34	-1.3
4,438,268	+		DZA65_RS20570	0.34	+1.1
4,438,269	-		DZA65_RS20570	0.34	-0.0
4,438,333	+		DZA65_RS20570	0.43	+2.0
4,438,333	+		DZA65_RS20570	0.43	-1.8
4,438,333	+		DZA65_RS20570	0.43	-0.2
4,438,333	+		DZA65_RS20570	0.43	-1.2
4,438,333	+		DZA65_RS20570	0.43	+0.9
4,438,333	+		DZA65_RS20570	0.43	+2.9
4,438,333	+		DZA65_RS20570	0.43	+1.5
4,438,333	+		DZA65_RS20570	0.43	-0.2
4,438,333	+		DZA65_RS20570	0.43	+0.1
4,438,333	+		DZA65_RS20570	0.43	+0.8
4,438,333	+		DZA65_RS20570	0.43	+0.1
4,438,334	-		DZA65_RS20570	0.44	+0.3
4,438,334	-		DZA65_RS20570	0.44	+1.6
4,438,334	-		DZA65_RS20570	0.44	-0.5
4,438,334	-		DZA65_RS20570	0.44	+2.0
4,438,334	-		DZA65_RS20570	0.44	+0.2
4,438,334	-		DZA65_RS20570	0.44	+0.5
4,438,334	-		DZA65_RS20570	0.44	+0.8
4,438,334	-		DZA65_RS20570	0.44	+0.0
4,438,334	-		DZA65_RS20570	0.44	-0.5
4,438,340	+		DZA65_RS20570	0.45	+1.0
4,438,340	+		DZA65_RS20570	0.45	+0.4
4,438,340	+		DZA65_RS20570	0.45	-0.2
4,438,340	+				+0.1
4,438,341	-		DZA65_RS20570	0.45	-0.2
4,438,341	-		DZA65_RS20570	0.45	+0.1
4,438,341	-		DZA65_RS20570	0.45	+0.1
4,438,427	+		DZA65_RS20570	0.58	+1.1
4,438,476	+		DZA65_RS20570	0.65	+0.3
4,438,547	+		DZA65_RS20570	0.75	+0.8
4,438,547	+		DZA65_RS20570	0.75	-0.1
4,438,547	+		DZA65_RS20570	0.75	-0.9
4,438,548	-		DZA65_RS20570	0.76	-1.2
4,438,548	-		DZA65_RS20570	0.76	+0.2
4,438,576	+		DZA65_RS20570	0.80	-1.3
4,438,576	+		DZA65_RS20570	0.80	-0.4
4,438,577	-		DZA65_RS20570	0.80	+0.7
4,438,577	-		DZA65_RS20570	0.80	-0.4
4,438,577	-		DZA65_RS20570	0.80	+0.5
4,438,577	-		DZA65_RS20570	0.80	+0.7
4,438,577	-		DZA65_RS20570	0.80	-0.5
4,438,577	-		DZA65_RS20570	0.80	+0.2
4,438,577	-		DZA65_RS20570	0.80	-0.5
4,438,620	+		DZA65_RS20570	0.86	-2.1
4,438,620	+		DZA65_RS20570	0.86	-2.2
4,438,620	+		DZA65_RS20570	0.86	+0.2
4,438,659	+				-1.0
4,438,659	+				+0.2
4,438,660	-				+1.4
4,438,660	-				+0.5
4,438,681	+				-0.5
4,438,681	+				+0.1
4,438,682	-				-0.1
4,438,682	-				-0.3
4,438,814	+				+0.0
4,438,814	+				-0.2
4,438,814	+				+1.8
4,438,814	+				-1.8
4,438,814	+				+1.6
4,438,815	-				+1.1
4,438,815	-				-0.3
4,438,815	-				-2.2
4,438,815	-				-0.1
4,438,957	+		DZA65_RS20575	0.22	+1.7
4,438,957	+		DZA65_RS20575	0.22	-1.4
4,438,988	-		DZA65_RS20575	0.25	-0.2
4,439,014	+		DZA65_RS20575	0.27	+1.1
4,439,014	+		DZA65_RS20575	0.27	+1.7
4,439,014	+		DZA65_RS20575	0.27	-3.1
4,439,015	-		DZA65_RS20575	0.27	-2.0
4,439,015	-		DZA65_RS20575	0.27	-2.1
4,439,015	-		DZA65_RS20575	0.27	-1.4
4,439,123	+		DZA65_RS20575	0.37	+0.5
4,439,224	+		DZA65_RS20575	0.46	+0.4
4,439,224	+		DZA65_RS20575	0.46	-0.4
4,439,224	+		DZA65_RS20575	0.46	+0.2
4,439,224	+		DZA65_RS20575	0.46	-0.2
4,439,225	-		DZA65_RS20575	0.46	-0.9
4,439,225	-		DZA65_RS20575	0.46	-1.1
4,439,225	-		DZA65_RS20575	0.46	+0.8
4,439,225	-		DZA65_RS20575	0.46	-0.3
4,439,225	-		DZA65_RS20575	0.46	-1.2
4,439,236	+		DZA65_RS20575	0.47	+0.2
4,439,236	+		DZA65_RS20575	0.47	+0.8
4,439,236	+		DZA65_RS20575	0.47	-0.2
4,439,236	+		DZA65_RS20575	0.47	-2.4
4,439,236	+		DZA65_RS20575	0.47	+0.8
4,439,237	-		DZA65_RS20575	0.47	-2.0
4,439,237	-		DZA65_RS20575	0.47	-1.2
4,439,237	-		DZA65_RS20575	0.47	+1.1
4,439,237	-		DZA65_RS20575	0.47	-2.2
4,439,237	-		DZA65_RS20575	0.47	+0.3
4,439,237	-		DZA65_RS20575	0.47	+0.8
4,439,237	-		DZA65_RS20575	0.47	-0.2
4,439,237	-		DZA65_RS20575	0.47	+0.8
4,439,237	-		DZA65_RS20575	0.47	+0.4
4,439,243	+		DZA65_RS20575	0.47	-1.8
4,439,305	+		DZA65_RS20575	0.53	-1.0
4,439,305	+		DZA65_RS20575	0.53	-0.6
4,439,305	+		DZA65_RS20575	0.53	+0.2
4,439,305	+		DZA65_RS20575	0.53	+2.0
4,439,306	-		DZA65_RS20575	0.53	+0.8
4,439,306	-		DZA65_RS20575	0.53	-1.5
4,439,346	+		DZA65_RS20575	0.56	-1.1
4,439,379	-		DZA65_RS20575	0.59	-0.4
4,439,464	+		DZA65_RS20575	0.67	-0.5
4,439,465	-		DZA65_RS20575	0.67	+0.7
4,439,494	+		DZA65_RS20575	0.70	-0.5
4,439,494	+		DZA65_RS20575	0.70	+0.0
4,439,494	+		DZA65_RS20575	0.70	-1.2
4,439,495	-		DZA65_RS20575	0.70	+0.5
4,439,495	-		DZA65_RS20575	0.70	-1.2
4,439,495	-		DZA65_RS20575	0.70	+0.2
4,439,495	-		DZA65_RS20575	0.70	-0.3
4,439,495	-		DZA65_RS20575	0.70	+0.3
4,439,495	-		DZA65_RS20575	0.70	-0.3
4,439,497	+				-0.8
4,439,497	+		DZA65_RS20575	0.70	-0.0
4,439,497	+		DZA65_RS20575	0.70	+0.8
4,439,498	-		DZA65_RS20575	0.70	+0.1
4,439,546	+		DZA65_RS20575	0.74	-0.1
4,439,546	+		DZA65_RS20575	0.74	+1.1
4,439,546	+		DZA65_RS20575	0.74	-2.0
4,439,546	+		DZA65_RS20575	0.74	+1.3
4,439,546	+		DZA65_RS20575	0.74	+1.3
4,439,546	+		DZA65_RS20575	0.74	-0.2
4,439,547	-		DZA65_RS20575	0.74	+0.2
4,439,547	-		DZA65_RS20575	0.74	-0.3
4,439,547	-		DZA65_RS20575	0.74	+0.5
4,439,547	-		DZA65_RS20575	0.74	+0.5
4,439,547	-		DZA65_RS20575	0.74	-0.8
4,439,547	-		DZA65_RS20575	0.74	+1.8
4,439,547	-		DZA65_RS20575	0.74	-0.8
4,439,547	-		DZA65_RS20575	0.74	-0.7
4,439,547	-		DZA65_RS20575	0.74	+2.6
4,439,547	-		DZA65_RS20575	0.74	+0.5
4,439,547	-		DZA65_RS20575	0.74	+0.2
4,439,549	+		DZA65_RS20575	0.74	-0.4