Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS04835

Experiment: Atlantic

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Atlantic
1,001,745	+		DZA65_RS04830	0.43	+0.9
1,001,746	-		DZA65_RS04830	0.43	+1.3
1,001,746	-		DZA65_RS04830	0.43	+0.5
1,001,746	-		DZA65_RS04830	0.43	-0.0
1,001,746	-		DZA65_RS04830	0.43	+0.9
1,001,776	+		DZA65_RS04830	0.45	+1.2
1,001,776	+				+0.5
1,001,776	+		DZA65_RS04830	0.45	-0.8
1,001,776	+		DZA65_RS04830	0.45	-0.2
1,001,776	+		DZA65_RS04830	0.45	-0.3
1,001,776	+		DZA65_RS04830	0.45	-1.1
1,001,776	+		DZA65_RS04830	0.45	-1.5
1,001,776	+		DZA65_RS04830	0.45	-0.1
1,001,776	+		DZA65_RS04830	0.45	-0.1
1,001,776	+		DZA65_RS04830	0.45	-0.0
1,001,777	-		DZA65_RS04830	0.45	+1.6
1,001,777	-		DZA65_RS04830	0.45	+0.7
1,001,777	-		DZA65_RS04830	0.45	-3.2
1,001,777	-		DZA65_RS04830	0.45	-0.0
1,001,777	-		DZA65_RS04830	0.45	-1.5
1,001,777	-		DZA65_RS04830	0.45	+0.5
1,001,784	-		DZA65_RS04830	0.45	-0.6
1,001,784	-		DZA65_RS04830	0.45	+0.2
1,001,816	+		DZA65_RS04830	0.47	-1.7
1,001,816	+		DZA65_RS04830	0.47	+0.4
1,001,817	-		DZA65_RS04830	0.47	+0.1
1,001,817	-		DZA65_RS04830	0.47	+0.0
1,001,817	-		DZA65_RS04830	0.47	-0.4
1,001,817	-		DZA65_RS04830	0.47	+0.5
1,001,817	-		DZA65_RS04830	0.47	-1.5
1,001,817	-		DZA65_RS04830	0.47	+1.4
1,001,819	+		DZA65_RS04830	0.47	+1.9
1,001,819	+		DZA65_RS04830	0.47	-1.0
1,001,848	+		DZA65_RS04830	0.49	+0.8
1,001,849	-		DZA65_RS04830	0.49	+0.0
1,001,900	+		DZA65_RS04830	0.52	-0.8
1,001,900	+		DZA65_RS04830	0.52	-1.0
1,001,900	+		DZA65_RS04830	0.52	-1.8
1,001,900	+		DZA65_RS04830	0.52	-1.2
1,001,901	-		DZA65_RS04830	0.52	+0.5
1,001,922	+		DZA65_RS04830	0.53	-1.0
1,001,958	+		DZA65_RS04830	0.55	-0.8
1,001,959	-		DZA65_RS04830	0.55	+0.8
1,001,975	+		DZA65_RS04830	0.56	-0.3
1,001,975	+		DZA65_RS04830	0.56	-0.5
1,001,975	+		DZA65_RS04830	0.56	-1.0
1,001,976	-		DZA65_RS04830	0.56	+1.8
1,001,976	-		DZA65_RS04830	0.56	+0.9
1,001,976	-		DZA65_RS04830	0.56	-1.5
1,001,976	-		DZA65_RS04830	0.56	+0.7
1,001,976	-				+1.5
1,001,994	+		DZA65_RS04830	0.57	-1.8
1,001,994	+		DZA65_RS04830	0.57	+0.7
1,002,042	-		DZA65_RS04830	0.60	-2.9
1,002,067	-		DZA65_RS04830	0.61	+1.0
1,002,105	-		DZA65_RS04830	0.63	-0.6
1,002,179	+		DZA65_RS04830	0.67	+0.8
1,002,180	-		DZA65_RS04830	0.68	-0.2
1,002,180	-		DZA65_RS04830	0.68	+1.2
1,002,180	-		DZA65_RS04830	0.68	-0.5
1,002,180	-		DZA65_RS04830	0.68	+0.8
1,002,234	+		DZA65_RS04830	0.71	-0.8
1,002,234	+		DZA65_RS04830	0.71	-0.9
1,002,234	+		DZA65_RS04830	0.71	-0.5
1,002,234	+		DZA65_RS04830	0.71	+0.5
1,002,234	+		DZA65_RS04830	0.71	+0.4
1,002,234	+		DZA65_RS04830	0.71	-0.9
1,002,234	+		DZA65_RS04830	0.71	-1.0
1,002,234	+		DZA65_RS04830	0.71	+0.5
1,002,234	+		DZA65_RS04830	0.71	-0.3
1,002,234	+		DZA65_RS04830	0.71	+1.7
1,002,234	+		DZA65_RS04830	0.71	+1.5
1,002,234	+		DZA65_RS04830	0.71	+0.1
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.3
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	+1.1
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.3
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-1.5
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	+0.2
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.3
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.9
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	+0.2
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	+2.1
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	+0.1
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.6
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	+0.9
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.5
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-1.6
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-1.3
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.0
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	+1.6
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	+0.2
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	+0.2
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	+1.1
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.7
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.3
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.7
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	+0.8
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	+1.4
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.2
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	+1.5
1,002,235	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.3
1,002,238	+		DZA65_RS04830	0.71	-0.6
1,002,238	+		DZA65_RS04830	0.71	-0.7
1,002,238	+		DZA65_RS04830	0.71	+1.5
1,002,238	+		DZA65_RS04830	0.71	-1.0
1,002,238	+		DZA65_RS04830	0.71	+0.1
1,002,238	+		DZA65_RS04830	0.71	-1.8
1,002,238	+		DZA65_RS04830	0.71	-0.7
1,002,238	+		DZA65_RS04830	0.71	-0.9
1,002,238	+		DZA65_RS04830	0.71	+0.9
1,002,238	+		DZA65_RS04830	0.71	-0.2
1,002,238	+		DZA65_RS04830	0.71	-0.8
1,002,238	+		DZA65_RS04830	0.71	-1.0
1,002,238	+		DZA65_RS04830	0.71	+1.7
1,002,238	+		DZA65_RS04830	0.71	+1.1
1,002,239	-		DZA65_RS04830	0.71	+1.1
1,002,239	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.3
1,002,239	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.5
1,002,239	-		DZA65_RS04830	0.71	-1.0
1,002,239	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.3
1,002,239	-		DZA65_RS04830	0.71	+0.5
1,002,239	-		DZA65_RS04830	0.71	+1.0
1,002,239	-		DZA65_RS04830	0.71	+0.5
1,002,239	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.5
1,002,239	-		DZA65_RS04830	0.71	+1.1
1,002,239	-		DZA65_RS04830	0.71	+0.5
1,002,239	-		DZA65_RS04830	0.71	-0.1
1,002,239	-		DZA65_RS04830	0.71	-2.0
1,002,239	-		DZA65_RS04830	0.71	+1.0
1,002,300	+		DZA65_RS04830	0.74	+0.3
1,002,300	+		DZA65_RS04830	0.74	-0.8
1,002,300	+		DZA65_RS04830	0.74	-0.6
1,002,300	+		DZA65_RS04830	0.74	+0.8
1,002,300	+		DZA65_RS04830	0.74	+0.4
1,002,300	+		DZA65_RS04830	0.74	+0.9
1,002,300	+		DZA65_RS04830	0.74	-1.2
1,002,300	+		DZA65_RS04830	0.74	-0.2
1,002,300	+		DZA65_RS04830	0.74	-0.1
1,002,300	+				-0.5
1,002,300	+		DZA65_RS04830	0.74	+2.5
1,002,301	-		DZA65_RS04830	0.74	+0.0
1,002,301	-		DZA65_RS04830	0.74	-1.7
1,002,301	-		DZA65_RS04830	0.74	-1.8
1,002,301	-		DZA65_RS04830	0.74	-0.0
1,002,301	-		DZA65_RS04830	0.74	+2.1
1,002,360	+				-2.0
1,002,360	+		DZA65_RS04830	0.78	-0.5
1,002,360	+		DZA65_RS04830	0.78	-0.7
1,002,427	+		DZA65_RS04830	0.82	-0.7
1,002,427	+		DZA65_RS04830	0.82	+1.5
1,002,427	+		DZA65_RS04830	0.82	-0.5
1,002,427	+		DZA65_RS04830	0.82	-2.3
1,002,427	+		DZA65_RS04830	0.82	+1.1
1,002,428	-		DZA65_RS04830	0.82	+0.5
1,002,428	-		DZA65_RS04830	0.82	+0.5
1,002,428	-		DZA65_RS04830	0.82	+1.0
1,002,428	-		DZA65_RS04830	0.82	-0.1
1,002,519	+		DZA65_RS04830	0.87	+0.5
1,002,520	-		DZA65_RS04830	0.87	-3.2
1,002,594	+				+0.0
1,002,594	+				-0.2
1,002,594	+				+0.2
1,002,594	+				-1.8
1,002,594	+				+2.0
1,002,594	+				-1.2
1,002,595	-				+1.3
1,002,595	-				-0.5
1,002,595	-				-1.0
1,002,595	-				-0.0
1,002,595	-				-0.5
1,002,595	-				+0.2
1,002,595	-				-0.1
1,002,599	+				-0.2
1,002,600	-				+0.5
1,002,638	+				-0.1
1,002,639	-				-0.5
1,002,642	+				-0.5
1,002,642	+				+1.1
1,002,683	+				+0.1
1,002,684	-				+0.6
1,002,751	+				+0.5
1,002,752	-				-0.1
1,002,752	-				-0.5
1,002,752	-				-0.8
1,002,752	-				-0.0
1,002,809	-		DZA65_RS04835	0.28	-1.5
1,002,813	+		DZA65_RS04835	0.29	-1.0
1,002,813	+		DZA65_RS04835	0.29	+0.1
1,002,813	+		DZA65_RS04835	0.29	-1.8
1,002,814	-		DZA65_RS04835	0.30	-2.3
1,002,814	-		DZA65_RS04835	0.30	-1.2
1,002,814	-		DZA65_RS04835	0.30	-0.5
1,002,898	+		DZA65_RS04835	0.63	+0.3
1,002,898	+		DZA65_RS04835	0.63	+0.2
1,002,899	-		DZA65_RS04835	0.64	+3.1
1,002,899	-		DZA65_RS04835	0.64	-0.2
1,002,899	-		DZA65_RS04835	0.64	-1.3
1,003,013	+				+1.9
1,003,014	-				-0.0
1,003,014	-				-1.0
1,003,075	+		DZA65_RS04840	0.13	+0.2
1,003,198	+		DZA65_RS04840	0.29	-0.5
1,003,198	+		DZA65_RS04840	0.29	+0.3
1,003,198	+		DZA65_RS04840	0.29	+1.4
1,003,198	+		DZA65_RS04840	0.29	-0.8
1,003,198	+		DZA65_RS04840	0.29	+2.3
1,003,198	+		DZA65_RS04840	0.29	-1.2
1,003,199	-		DZA65_RS04840	0.29	-0.2
1,003,199	-		DZA65_RS04840	0.29	-2.8
1,003,199	-		DZA65_RS04840	0.29	-0.6
1,003,199	-		DZA65_RS04840	0.29	+0.1
1,003,199	-		DZA65_RS04840	0.29	+2.9
1,003,224	-		DZA65_RS04840	0.32	+0.0
1,003,257	+		DZA65_RS04840	0.37	+0.1
1,003,257	+		DZA65_RS04840	0.37	-2.6
1,003,258	-		DZA65_RS04840	0.37	+0.1
1,003,258	-		DZA65_RS04840	0.37	+0.7
1,003,258	-		DZA65_RS04840	0.37	+0.1
1,003,258	-		DZA65_RS04840	0.37	-1.5
1,003,258	-		DZA65_RS04840	0.37	-1.0
1,003,258	-		DZA65_RS04840	0.37	-0.5
1,003,259	+		DZA65_RS04840	0.37	-0.5
1,003,298	+		DZA65_RS04840	0.42	+0.3
1,003,298	+		DZA65_RS04840	0.42	+1.0
1,003,299	-		DZA65_RS04840	0.42	+1.0
1,003,299	-		DZA65_RS04840	0.42	-0.3
1,003,299	-		DZA65_RS04840	0.42	+1.1
1,003,344	+		DZA65_RS04840	0.48	+0.1
1,003,345	-		DZA65_RS04840	0.49	+0.9
1,003,461	+		DZA65_RS04840	0.64	+0.1
1,003,462	-		DZA65_RS04840	0.64	+0.7
1,003,462	-		DZA65_RS04840	0.64	+1.0
1,003,462	-		DZA65_RS04840	0.64	-1.0
1,003,462	-		DZA65_RS04840	0.64	+0.0
1,003,462	-		DZA65_RS04840	0.64	-0.7
1,003,498	+		DZA65_RS04840	0.69	-1.5
1,003,498	+		DZA65_RS04840	0.69	-0.6
1,003,498	+		DZA65_RS04840	0.69	+1.0
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