Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS21685

Experiment: Atlantic

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Atlantic
4,690,305	-				-0.9
4,690,305	-				-2.8
4,690,413	-				+2.0
4,690,434	+				-1.4
4,690,435	-				-1.4
4,690,465	+				+0.4
4,690,465	+				+0.6
4,690,465	+				+1.0
4,690,465	+				-0.1
4,690,465	+				-0.3
4,690,465	+				-0.3
4,690,465	+				+0.1
4,690,465	+				-2.3
4,690,466	-				-0.1
4,690,466	-				+0.1
4,690,466	-				+1.5
4,690,466	-				-0.0
4,690,466	-				-0.4
4,690,466	-				+0.8
4,690,466	-				-0.1
4,690,466	-				-0.9
4,690,466	-				+0.8
4,690,466	-				+0.1
4,690,541	+				-0.4
4,690,542	-				+0.5
4,690,542	-				+2.1
4,690,575	+				-2.0
4,690,576	-				-0.0
4,690,589	-				-0.3
4,690,608	+				+0.2
4,690,637	+				-2.6
4,690,659	+				-0.1
4,690,699	+				-0.3
4,690,734	+				-0.6
4,690,740	+				+0.3
4,690,741	-				+3.7
4,690,741	-				+1.1
4,690,753	-				+0.4
4,690,753	-				+1.7
4,690,759	-				+1.1
4,690,759	-				-0.4
4,690,768	-				-0.3
4,690,807	-				+1.1
4,690,833	-				-0.1
4,690,842	+				+1.1
4,690,842	+				-1.1
4,690,851	-				+0.2
4,690,851	-				+0.1
4,690,908	-				-1.4
4,690,985	+				-0.4
4,691,039	+				+1.1
4,691,039	+				+0.9
4,691,094	+				-0.3
4,691,094	+				+2.1
4,691,094	+				-0.2
4,691,095	-				+1.1
4,691,107	-				-0.2
4,691,124	-				-0.8
4,691,124	-				+0.1
4,691,127	+				-1.0
4,691,127	+				-0.9
4,691,127	+				-1.0
4,691,128	-				+0.7
4,691,128	-				+0.4
4,691,128	-				-0.6
4,691,249	+				-0.7
4,691,249	+				-1.9
4,691,249	+				+0.3
4,691,258	+				+0.9
4,691,259	-				+1.1
4,691,260	+				+1.9
4,691,275	-				-0.2
4,691,281	+				+1.3
4,691,282	-				-0.1
4,691,284	-				-0.9
4,691,286	-				+0.6
4,691,326	+				+1.1
4,691,326	+				-1.3
4,691,326	+				+1.7
4,691,389	-				-0.7
4,691,417	+				+0.0
4,691,464	+				+1.7
4,691,465	-		DZA65_RS21685	0.10	-0.1
4,691,467	+		DZA65_RS21685	0.10	+1.1
4,691,564	+		DZA65_RS21685	0.16	-1.1
4,691,564	+		DZA65_RS21685	0.16	+0.0
4,691,565	-		DZA65_RS21685	0.16	+0.8
4,691,565	-		DZA65_RS21685	0.16	+1.3
4,691,565	-		DZA65_RS21685	0.16	+0.8
4,691,565	-		DZA65_RS21685	0.16	+1.1
4,691,676	+		DZA65_RS21685	0.23	+1.6
4,691,676	+		DZA65_RS21685	0.23	+0.2
4,691,676	+		DZA65_RS21685	0.23	+0.1
4,691,705	+		DZA65_RS21685	0.25	-0.8
4,691,706	-		DZA65_RS21685	0.25	+0.7
4,691,721	-		DZA65_RS21685	0.26	+0.1
4,691,809	-		DZA65_RS21685	0.31	+1.7
4,691,871	-		DZA65_RS21685	0.35	+0.2
4,691,871	-		DZA65_RS21685	0.35	-1.7
4,691,872	+		DZA65_RS21685	0.35	+0.3
4,691,872	+		DZA65_RS21685	0.35	-0.3
4,691,872	+		DZA65_RS21685	0.35	+0.3
4,691,872	+		DZA65_RS21685	0.35	-0.4
4,691,872	+		DZA65_RS21685	0.35	+0.8
4,691,872	+		DZA65_RS21685	0.35	+0.1
4,691,872	+		DZA65_RS21685	0.35	-0.1
4,691,873	-		DZA65_RS21685	0.35	+0.7
4,691,873	-		DZA65_RS21685	0.35	+0.3
4,691,873	-		DZA65_RS21685	0.35	+1.4
4,691,873	-				+1.6
4,691,873	-		DZA65_RS21685	0.35	+0.4
4,691,873	-		DZA65_RS21685	0.35	-0.7
4,691,932	+				+1.1
4,691,973	+		DZA65_RS21685	0.41	+1.1
4,691,973	+		DZA65_RS21685	0.41	+0.7
4,691,973	+		DZA65_RS21685	0.41	+0.4
4,691,973	+		DZA65_RS21685	0.41	+1.0
4,691,973	+		DZA65_RS21685	0.41	-0.6
4,691,973	+		DZA65_RS21685	0.41	-0.7
4,691,974	-		DZA65_RS21685	0.41	+0.5
4,691,974	-		DZA65_RS21685	0.41	+0.1
4,691,974	-		DZA65_RS21685	0.41	-2.1
4,691,974	-		DZA65_RS21685	0.41	-0.5
4,691,974	-		DZA65_RS21685	0.41	-0.7
4,692,096	-		DZA65_RS21685	0.49	-0.4
4,692,155	+		DZA65_RS21685	0.53	-1.1
4,692,155	+		DZA65_RS21685	0.53	+0.6
4,692,156	-		DZA65_RS21685	0.53	+0.1
4,692,205	+		DZA65_RS21685	0.56	+1.6
4,692,321	-		DZA65_RS21685	0.63	+0.1
4,692,321	-		DZA65_RS21685	0.63	+0.4
4,692,508	+		DZA65_RS21685	0.74	-0.2
4,692,508	+		DZA65_RS21685	0.74	-0.6
4,692,508	+		DZA65_RS21685	0.74	-0.0
4,692,509	-		DZA65_RS21685	0.74	-0.5
4,692,509	-		DZA65_RS21685	0.74	-0.9
4,692,509	-		DZA65_RS21685	0.74	-0.1
4,692,509	-		DZA65_RS21685	0.74	-0.0
4,692,509	-		DZA65_RS21685	0.74	+0.1
4,692,623	+		DZA65_RS21685	0.81	+1.4
4,692,718	+		DZA65_RS21685	0.87	+1.3
4,692,719	-		DZA65_RS21685	0.87	+0.1
4,692,901	+				-0.4
4,692,901	+				+1.5
4,692,902	-				+0.1
4,692,902	-				-0.9
4,692,924	+				-0.3
4,692,925	-				-0.1
4,692,942	-				+0.6
4,692,944	+				+1.0
4,692,944	+				-0.1
4,692,945	-				+0.5
4,692,945	-				+0.2
4,692,981	-				-0.5
4,692,981	-				+0.1
4,692,993	+				+1.8
4,692,993	+				-0.2
4,692,993	+				+0.1
4,692,993	+				-1.4
4,692,994	-				-0.3
4,692,994	-				-1.4
4,692,994	-				+0.9
4,692,994	-				-0.7
4,692,994	-				+0.1
4,692,994	-				+1.1
4,692,994	-				+0.3
4,692,994	-				+0.3
4,693,003	+				-0.8
4,693,004	-				+1.0
4,693,046	+				-0.9
4,693,046	+				+0.2
4,693,047	-				+2.4
4,693,047	-				+0.7
4,693,051	-				+1.6
4,693,105	+				+0.1
4,693,116	+				+0.1
4,693,138	+				-1.9
4,693,246	+				-0.7
4,693,249	+				+0.2
4,693,249	+				-1.1
4,693,250	-				+0.9
4,693,255	+				+0.3
4,693,291	-				-0.2
4,693,318	+				-0.3
4,693,337	-				-0.4
4,693,337	-				-0.4
4,693,389	-				-0.7
4,693,442	-				-0.7
4,693,442	-				-1.2
4,693,448	+				+1.8
4,693,448	+				+0.6
4,693,458	+				-0.7
4,693,458	+				+2.7
4,693,459	-				+1.3
4,693,493	+		DZA65_RS21690	0.10	-2.2
4,693,504	+		DZA65_RS21690	0.11	-0.4
4,693,505	-		DZA65_RS21690	0.11	+0.0
4,693,505	-		DZA65_RS21690	0.11	+1.1
4,693,616	+		DZA65_RS21690	0.18	+1.4
4,693,648	+		DZA65_RS21690	0.20	+0.3
4,693,686	-		DZA65_RS21690	0.22	+0.1
4,693,686	-		DZA65_RS21690	0.22	-3.1
4,693,686	-		DZA65_RS21690	0.22	-0.3
4,693,686	-		DZA65_RS21690	0.22	+0.7